MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_009482	GCA	2	6	1631622	1631627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242970
36003	NC_009482	GCT	2	6	1631757	1631762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242970
36004	NC_009482	GCCT	2	8	1631845	1631852	0 %	25 %	25 %	50 %	148242970
36005	NC_009482	TCA	2	6	1631972	1631977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242971
36006	NC_009482	ACC	2	6	1632049	1632054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242971
36007	NC_009482	CGC	2	6	1632093	1632098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242971
36008	NC_009482	CAAC	2	8	1632230	1632237	50 %	0 %	0 %	50 %	148242971
36009	NC_009482	CGCCA	2	10	1632299	1632308	20 %	0 %	20 %	60 %	148242972
36010	NC_009482	CGCTG	2	10	1632322	1632331	0 %	20 %	40 %	40 %	148242972
36011	NC_009482	CAC	2	6	1632346	1632351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242972
36012	NC_009482	GCA	3	9	1632365	1632373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242972
36013	NC_009482	TGC	2	6	1632396	1632401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242972
36014	NC_009482	TCC	2	6	1632451	1632456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242972
36015	NC_009482	CCA	2	6	1632474	1632479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242972
36016	NC_009482	CCA	2	6	1632561	1632566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242972
36017	NC_009482	CAG	2	6	1632600	1632605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242972
36018	NC_009482	GC	3	6	1632608	1632613	0 %	0 %	50 %	50 %	148242972
36019	NC_009482	GCG	2	6	1632639	1632644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242972
36020	NC_009482	CAC	2	6	1632732	1632737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242972
36021	NC_009482	TCA	2	6	1632776	1632781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242972
36022	NC_009482	CCA	2	6	1632792	1632797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242972
36023	NC_009482	GCT	2	6	1632858	1632863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242972
36024	NC_009482	GCT	2	6	1632877	1632882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242972
36025	NC_009482	GCC	2	6	1632971	1632976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242972
36026	NC_009482	AGC	2	6	1632998	1633003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242972
36027	NC_009482	GCCGCA	2	12	1633056	1633067	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148242972
36028	NC_009482	GCC	2	6	1633139	1633144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242972
36029	NC_009482	TCA	2	6	1633149	1633154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242972
36030	NC_009482	TCGC	2	8	1633178	1633185	0 %	25 %	25 %	50 %	148242972
36031	NC_009482	CAGC	2	8	1633188	1633195	25 %	0 %	25 %	50 %	148242972
36032	NC_009482	C	6	6	1633229	1633234	0 %	0 %	0 %	100 %	148242972
36033	NC_009482	CAG	2	6	1633264	1633269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242972
36034	NC_009482	GCTC	2	8	1633281	1633288	0 %	25 %	25 %	50 %	148242972
36035	NC_009482	CAG	2	6	1633293	1633298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242972
36036	NC_009482	GCT	2	6	1633334	1633339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242973
36037	NC_009482	GGC	2	6	1633391	1633396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242973
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36039	NC_009482	TTG	2	6	1633413	1633418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242973
36040	NC_009482	TCT	2	6	1633506	1633511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242974
36041	NC_009482	CAG	2	6	1633520	1633525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242974
36042	NC_009482	CA	4	8	1633550	1633557	50 %	0 %	0 %	50 %	148242974
36043	NC_009482	CTT	2	6	1633585	1633590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242974
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36048	NC_009482	TTCCAA	2	12	1633754	1633765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242974
36049	NC_009482	CGCCAT	2	12	1633784	1633795	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148242974
36050	NC_009482	CTGG	2	8	1633834	1633841	0 %	25 %	50 %	25 %	148242975
36051	NC_009482	CGG	2	6	1633861	1633866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242975
36052	NC_009482	GCT	2	6	1633927	1633932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242975
36053	NC_009482	AAC	2	6	1633970	1633975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242975
36054	NC_009482	AGC	2	6	1633976	1633981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242975
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36058	NC_009482	GCC	2	6	1634056	1634061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242975
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36062	NC_009482	CAC	2	6	1634221	1634226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242975
36063	NC_009482	GGCGTG	2	12	1634290	1634301	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148242975
36064	NC_009482	CCA	2	6	1634316	1634321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242975
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36066	NC_009482	GCTGCA	2	12	1634466	1634477	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148242975
36067	NC_009482	AGCA	2	8	1634528	1634535	50 %	0 %	25 %	25 %	148242975
36068	NC_009482	CAC	2	6	1634623	1634628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242976
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36070	NC_009482	GCA	3	9	1634805	1634813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242976
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36073	NC_009482	TTGG	2	8	1634872	1634879	0 %	50 %	50 %	0 %	148242976
36074	NC_009482	GCT	2	6	1634884	1634889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242976
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36076	NC_009482	TCG	2	6	1634936	1634941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242976
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36080	NC_009482	TGA	2	6	1635252	1635257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242976
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36082	NC_009482	GCA	2	6	1635336	1635341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242976
36083	NC_009482	CTG	2	6	1635351	1635356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242976
36084	NC_009482	GGC	2	6	1635417	1635422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242976
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36086	NC_009482	CAG	2	6	1635569	1635574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242977
36087	NC_009482	ACC	2	6	1635582	1635587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242977
36088	NC_009482	TCA	2	6	1635628	1635633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242977
36089	NC_009482	TGA	2	6	1635655	1635660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242977
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36092	NC_009482	GCTT	2	8	1635804	1635811	0 %	50 %	25 %	25 %	148242977
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36097	NC_009482	CCAC	2	8	1635969	1635976	25 %	0 %	0 %	75 %	148242977
36098	NC_009482	GAT	2	6	1636115	1636120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242977
36099	NC_009482	GGCAG	2	10	1636122	1636131	20 %	0 %	60 %	20 %	148242977
36100	NC_009482	TGC	2	6	1636135	1636140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242977
36101	NC_009482	AG	3	6	1636157	1636162	50 %	0 %	50 %	0 %	148242977
36102	NC_009482	GGC	2	6	1636166	1636171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242977
36103	NC_009482	CAG	2	6	1636178	1636183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242977
36104	NC_009482	AGA	2	6	1636198	1636203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242977
36105	NC_009482	GAC	2	6	1636234	1636239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242977
36106	NC_009482	GCA	3	9	1636240	1636248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242977
36107	NC_009482	GTC	2	6	1636286	1636291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242977
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36110	NC_009482	GGC	2	6	1636463	1636468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242977
36111	NC_009482	TGA	2	6	1636519	1636524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242977
36112	NC_009482	CGATCG	2	12	1636531	1636542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148242977
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36114	NC_009482	TGC	2	6	1636813	1636818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242977
36115	NC_009482	GTC	2	6	1636865	1636870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242977
36116	NC_009482	CACC	2	8	1636966	1636973	25 %	0 %	0 %	75 %	148242977
36117	NC_009482	TGC	2	6	1637028	1637033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242977
36118	NC_009482	TCG	2	6	1637052	1637057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242977
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36122	NC_009482	TGC	2	6	1637298	1637303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242978
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36134	NC_009482	GATCA	2	10	1637886	1637895	40 %	20 %	20 %	20 %	148242979
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36228	NC_009482	GC	3	6	1642819	1642824	0 %	0 %	50 %	50 %	148242985
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36230	NC_009482	AG	3	6	1642931	1642936	50 %	0 %	50 %	0 %	148242985
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36340	NC_009482	CCA	2	6	1648173	1648178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242990
36341	NC_009482	GCA	2	6	1648269	1648274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242990
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36343	NC_009482	CTTT	2	8	1648321	1648328	0 %	75 %	0 %	25 %	148242991
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36346	NC_009482	GCT	2	6	1648458	1648463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242991
36347	NC_009482	GTG	2	6	1648540	1648545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242991
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36452	NC_009482	ATG	2	6	1653259	1653264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242998
36453	NC_009482	TGC	2	6	1653296	1653301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242998
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36458	NC_009482	CCAG	2	8	1654171	1654178	25 %	0 %	25 %	50 %	148242999
36459	NC_009482	TCC	2	6	1654197	1654202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242999
36460	NC_009482	GCA	2	6	1654246	1654251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242999
36461	NC_009482	GTG	2	6	1654254	1654259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242999
36462	NC_009482	CTG	2	6	1654260	1654265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242999
36463	NC_009482	AAC	2	6	1654290	1654295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242999
36464	NC_009482	GCC	2	6	1654304	1654309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242999
36465	NC_009482	GTC	2	6	1654384	1654389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242999
36466	NC_009482	CAG	2	6	1654393	1654398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242999
36467	NC_009482	AACTC	2	10	1654789	1654798	40 %	20 %	0 %	40 %	148243000
36468	NC_009482	CAGG	2	8	1654902	1654909	25 %	0 %	50 %	25 %	148243000
36469	NC_009482	TCA	2	6	1654944	1654949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243000
36470	NC_009482	CCA	2	6	1654954	1654959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243000
36471	NC_009482	GCA	2	6	1654975	1654980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243000
36472	NC_009482	CGG	2	6	1655110	1655115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243000
36473	NC_009482	GCT	2	6	1655146	1655151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243000
36474	NC_009482	AGAGAA	2	12	1655209	1655220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243000
36475	NC_009482	CAACGC	2	12	1655251	1655262	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148243001
36476	NC_009482	GCA	2	6	1655293	1655298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243001
36477	NC_009482	AAC	2	6	1655301	1655306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243001
36478	NC_009482	GATC	2	8	1655368	1655375	25 %	25 %	25 %	25 %	148243001
36479	NC_009482	TGA	2	6	1655389	1655394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243001
36480	NC_009482	GAT	2	6	1655417	1655422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243001
36481	NC_009482	CAC	2	6	1655426	1655431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243001
36482	NC_009482	GCA	2	6	1655548	1655553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243001
36483	NC_009482	TCA	2	6	1655590	1655595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243001
36484	NC_009482	CAG	2	6	1655621	1655626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243001
36485	NC_009482	CAG	2	6	1655671	1655676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243001
36486	NC_009482	GCA	2	6	1655910	1655915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243002
36487	NC_009482	CAG	2	6	1655917	1655922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243002
36488	NC_009482	CAA	2	6	1655947	1655952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243002
36489	NC_009482	CAT	2	6	1655960	1655965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243002
36490	NC_009482	AGC	2	6	1656054	1656059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243003
36491	NC_009482	TGA	2	6	1656067	1656072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243003
36492	NC_009482	CCG	2	6	1656127	1656132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243003
36493	NC_009482	G	6	6	1656145	1656150	0 %	0 %	100 %	0 %	148243003
36494	NC_009482	CTT	2	6	1656181	1656186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243003
36495	NC_009482	TTGA	2	8	1656187	1656194	25 %	50 %	25 %	0 %	148243003
36496	NC_009482	GTT	2	6	1656351	1656356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243004
36497	NC_009482	AAC	2	6	1656393	1656398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243004
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36499	NC_009482	GCC	2	6	1656683	1656688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243005
36500	NC_009482	TGGCCA	2	12	1656702	1656713	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243005

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