MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_009482	TGA	2	6	1588879	1588884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242923
35002	NC_009482	TCC	2	6	1588896	1588901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242923
35003	NC_009482	GAT	2	6	1588928	1588933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242923
35004	NC_009482	TGG	2	6	1588981	1588986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242923
35005	NC_009482	GCA	2	6	1588993	1588998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242923
35006	NC_009482	TTG	2	6	1589043	1589048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242923
35007	NC_009482	TCC	2	6	1589058	1589063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242923
35008	NC_009482	GAT	2	6	1589117	1589122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242923
35009	NC_009482	GAA	2	6	1589132	1589137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242923
35010	NC_009482	CCG	2	6	1589142	1589147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242923
35011	NC_009482	GAG	2	6	1589193	1589198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242923
35012	NC_009482	GTG	2	6	1589283	1589288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242923
35013	NC_009482	GCG	4	12	1589315	1589326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242923
35014	NC_009482	CAC	2	6	1589354	1589359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242923
35015	NC_009482	CTC	2	6	1589375	1589380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242923
35016	NC_009482	AGCG	2	8	1589389	1589396	25 %	0 %	50 %	25 %	148242923
35017	NC_009482	TCG	2	6	1589409	1589414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242923
35018	NC_009482	GTC	2	6	1589424	1589429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242923
35019	NC_009482	CGC	2	6	1589484	1589489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242923
35020	NC_009482	CGT	2	6	1589503	1589508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242923
35021	NC_009482	CTG	2	6	1589510	1589515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242923
35022	NC_009482	GA	3	6	1589598	1589603	50 %	0 %	50 %	0 %	148242923
35023	NC_009482	TCAGGG	2	12	1589631	1589642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148242923
35024	NC_009482	CCA	2	6	1589674	1589679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242923
35025	NC_009482	GGA	2	6	1589716	1589721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242923
35026	NC_009482	TCA	2	6	1589763	1589768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242923
35027	NC_009482	GCC	2	6	1589864	1589869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242923
35028	NC_009482	TCA	2	6	1589880	1589885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242923
35029	NC_009482	ATC	2	6	1590014	1590019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242924
35030	NC_009482	GGC	2	6	1590102	1590107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242924
35031	NC_009482	GGGT	2	8	1590121	1590128	0 %	25 %	75 %	0 %	148242924
35032	NC_009482	TCC	2	6	1590144	1590149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242924
35033	NC_009482	CAGC	2	8	1590151	1590158	25 %	0 %	25 %	50 %	148242924
35034	NC_009482	CTC	2	6	1590319	1590324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242925
35035	NC_009482	CT	3	6	1590374	1590379	0 %	50 %	0 %	50 %	148242925
35036	NC_009482	CA	3	6	1590405	1590410	50 %	0 %	0 %	50 %	148242925
35037	NC_009482	CAG	2	6	1590427	1590432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242925
35038	NC_009482	ACCA	2	8	1590492	1590499	50 %	0 %	0 %	50 %	148242925
35039	NC_009482	AGA	2	6	1590549	1590554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242925
35040	NC_009482	GCT	2	6	1590590	1590595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242925
35041	NC_009482	AGC	2	6	1590617	1590622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242925
35042	NC_009482	CAG	2	6	1590652	1590657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242925
35043	NC_009482	TCA	2	6	1590668	1590673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242925
35044	NC_009482	AGA	2	6	1590714	1590719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242925
35045	NC_009482	GCC	2	6	1590759	1590764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242925
35046	NC_009482	GCA	2	6	1590845	1590850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242925
35047	NC_009482	GCT	2	6	1590867	1590872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242925
35048	NC_009482	CGT	2	6	1590903	1590908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242925
35049	NC_009482	CAC	2	6	1590940	1590945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242925
35050	NC_009482	GCA	2	6	1590951	1590956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242925
35051	NC_009482	CAAGGC	2	12	1591351	1591362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242926
35052	NC_009482	AG	3	6	1591375	1591380	50 %	0 %	50 %	0 %	148242926
35053	NC_009482	GCG	2	6	1591404	1591409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242926
35054	NC_009482	CAG	2	6	1591442	1591447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242926
35055	NC_009482	TAC	2	6	1591469	1591474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242926
35056	NC_009482	AGA	3	9	1591647	1591655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242926
35057	NC_009482	CGC	2	6	1591664	1591669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242926
35058	NC_009482	GAC	2	6	1591957	1591962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242927
35059	NC_009482	TGG	2	6	1591976	1591981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242927
35060	NC_009482	CGC	2	6	1592008	1592013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242927
35061	NC_009482	GCG	2	6	1592063	1592068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242928
35062	NC_009482	CAG	2	6	1592096	1592101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242928
35063	NC_009482	TGT	2	6	1592141	1592146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242928
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35065	NC_009482	AGC	2	6	1592178	1592183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242928
35066	NC_009482	CAG	3	9	1592189	1592197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242928
35067	NC_009482	CCAG	2	8	1592218	1592225	25 %	0 %	25 %	50 %	148242928
35068	NC_009482	GCAATC	2	12	1592238	1592249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148242928
35069	NC_009482	CAG	3	9	1592282	1592290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242928
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35071	NC_009482	CAC	2	6	1592321	1592326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242928
35072	NC_009482	CAG	2	6	1592333	1592338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242928
35073	NC_009482	GCA	2	6	1592365	1592370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242928
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35078	NC_009482	GAT	3	9	1592456	1592464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242928
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35082	NC_009482	GAA	2	6	1592617	1592622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242929
35083	NC_009482	CAG	2	6	1592632	1592637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242929
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35086	NC_009482	AGC	2	6	1592775	1592780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242929
35087	NC_009482	GCT	2	6	1592802	1592807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242929
35088	NC_009482	CCA	2	6	1592850	1592855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242929
35089	NC_009482	GCT	2	6	1592986	1592991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242929
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35096	NC_009482	TGCCC	2	10	1593286	1593295	0 %	20 %	20 %	60 %	148242929
35097	NC_009482	AGCC	2	8	1593336	1593343	25 %	0 %	25 %	50 %	148242929
35098	NC_009482	GCT	2	6	1593472	1593477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242930
35099	NC_009482	GGC	2	6	1593491	1593496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242930
35100	NC_009482	GAC	2	6	1593542	1593547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242930
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35102	NC_009482	CAA	2	6	1593638	1593643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242930
35103	NC_009482	GCC	2	6	1593646	1593651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242930
35104	NC_009482	CGGCG	2	10	1593701	1593710	0 %	0 %	60 %	40 %	148242930
35105	NC_009482	GCT	3	9	1593715	1593723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242930
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35108	NC_009482	GCG	3	9	1593864	1593872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242930
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35110	NC_009482	GAG	2	6	1594010	1594015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242930
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35112	NC_009482	AGC	2	6	1594065	1594070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242930
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35114	NC_009482	TGC	2	6	1594092	1594097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242930
35115	NC_009482	TGC	2	6	1594146	1594151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242930
35116	NC_009482	GCC	2	6	1594172	1594177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242930
35117	NC_009482	GAT	2	6	1594179	1594184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242930
35118	NC_009482	GCT	3	9	1594212	1594220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242931
35119	NC_009482	TGC	2	6	1594232	1594237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242931
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35126	NC_009482	TGC	2	6	1594545	1594550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242931
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35143	NC_009482	GC	3	6	1595076	1595081	0 %	0 %	50 %	50 %	148242932
35144	NC_009482	GAG	2	6	1595128	1595133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242932
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35213	NC_009482	GCT	2	6	1597867	1597872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242935
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35222	NC_009482	CAG	3	9	1598528	1598536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242935
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35225	NC_009482	GCTGGT	2	12	1598706	1598717	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148242935
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35227	NC_009482	CTTGG	2	10	1598763	1598772	0 %	40 %	40 %	20 %	148242935
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35342	NC_009482	GCG	2	6	1603106	1603111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242938
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35345	NC_009482	CCA	2	6	1603285	1603290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242938
35346	NC_009482	GGC	2	6	1603298	1603303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242938
35347	NC_009482	GCA	2	6	1603328	1603333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242938
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35351	NC_009482	CTG	2	6	1603609	1603614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242939
35352	NC_009482	TGC	2	6	1603631	1603636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242939
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35442	NC_009482	GCC	2	6	1608030	1608035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242944
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35444	NC_009482	ATG	2	6	1608073	1608078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242945
35445	NC_009482	CCGCG	2	10	1608079	1608088	0 %	0 %	40 %	60 %	148242945
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35450	NC_009482	CGCTGG	2	12	1608338	1608349	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148242945
35451	NC_009482	GGC	2	6	1608402	1608407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242945
35452	NC_009482	CAGCA	2	10	1608418	1608427	40 %	0 %	20 %	40 %	148242945
35453	NC_009482	GCCAG	2	10	1608584	1608593	20 %	0 %	40 %	40 %	148242945
35454	NC_009482	CAG	3	9	1608591	1608599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242945
35455	NC_009482	GCA	2	6	1608671	1608676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242945
35456	NC_009482	GTG	2	6	1608724	1608729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242945
35457	NC_009482	GGGGC	2	10	1608777	1608786	0 %	0 %	80 %	20 %	148242945
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