MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_009482	CACT	2	8	1544133	1544140	25 %	25 %	0 %	50 %	148242866
34003	NC_009482	GTT	3	9	1544181	1544189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242866
34004	NC_009482	CT	4	8	1544195	1544202	0 %	50 %	0 %	50 %	148242866
34005	NC_009482	TCG	2	6	1544206	1544211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242866
34006	NC_009482	CATCG	2	10	1544242	1544251	20 %	20 %	20 %	40 %	148242866
34007	NC_009482	CGC	2	6	1544274	1544279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242866
34008	NC_009482	TGC	2	6	1544319	1544324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242866
34009	NC_009482	GCA	3	9	1544341	1544349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242866
34010	NC_009482	AGC	2	6	1544356	1544361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242866
34011	NC_009482	CCTTCA	2	12	1544758	1544769	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148242867
34012	NC_009482	CAC	2	6	1544778	1544783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242867
34013	NC_009482	TCA	2	6	1544863	1544868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242867
34014	NC_009482	CCAC	2	8	1544885	1544892	25 %	0 %	0 %	75 %	148242867
34015	NC_009482	CAA	2	6	1544901	1544906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242867
34016	NC_009482	ATCA	2	8	1544995	1545002	50 %	25 %	0 %	25 %	148242868
34017	NC_009482	GCC	2	6	1545056	1545061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242868
34018	NC_009482	GCTG	2	8	1545065	1545072	0 %	25 %	50 %	25 %	148242868
34019	NC_009482	GGGC	2	8	1545108	1545115	0 %	0 %	75 %	25 %	148242868
34020	NC_009482	TTG	2	6	1545177	1545182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242868
34021	NC_009482	TGG	2	6	1545237	1545242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242868
34022	NC_009482	TGC	2	6	1545255	1545260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242868
34023	NC_009482	AGG	2	6	1545268	1545273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242868
34024	NC_009482	GAA	2	6	1545301	1545306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242868
34025	NC_009482	ATT	2	6	1545565	1545570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148242869
34026	NC_009482	AGA	2	6	1545608	1545613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242869
34027	NC_009482	CCTGG	2	10	1545620	1545629	0 %	20 %	40 %	40 %	148242869
34028	NC_009482	AGCA	2	8	1545630	1545637	50 %	0 %	25 %	25 %	148242869
34029	NC_009482	GCCA	2	8	1545647	1545654	25 %	0 %	25 %	50 %	148242869
34030	NC_009482	CACT	2	8	1545714	1545721	25 %	25 %	0 %	50 %	148242869
34031	NC_009482	GCA	2	6	1545722	1545727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242869
34032	NC_009482	A	6	6	1545791	1545796	100 %	0 %	0 %	0 %	148242870
34033	NC_009482	CTG	2	6	1545998	1546003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242870
34034	NC_009482	CTG	2	6	1546088	1546093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242870
34035	NC_009482	CAG	2	6	1546097	1546102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242870
34036	NC_009482	AAG	2	6	1546158	1546163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242870
34037	NC_009482	GAT	2	6	1546294	1546299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242871
34038	NC_009482	GCGCCT	2	12	1546309	1546320	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148242871
34039	NC_009482	TG	3	6	1546477	1546482	0 %	50 %	50 %	0 %	148242872
34040	NC_009482	TTGG	2	8	1546486	1546493	0 %	50 %	50 %	0 %	148242872
34041	NC_009482	C	6	6	1546521	1546526	0 %	0 %	0 %	100 %	148242872
34042	NC_009482	CGG	2	6	1546572	1546577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242872
34043	NC_009482	CTGC	2	8	1546613	1546620	0 %	25 %	25 %	50 %	148242872
34044	NC_009482	GGC	2	6	1546672	1546677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242872
34045	NC_009482	TGC	2	6	1546996	1547001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242873
34046	NC_009482	CCG	2	6	1547021	1547026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242873
34047	NC_009482	TGGT	2	8	1547073	1547080	0 %	50 %	50 %	0 %	148242873
34048	NC_009482	GAA	2	6	1547122	1547127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242873
34049	NC_009482	GCC	2	6	1547249	1547254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242873
34050	NC_009482	GCT	2	6	1547255	1547260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242873
34051	NC_009482	CAC	2	6	1547704	1547709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242874
34052	NC_009482	AGGT	2	8	1547758	1547765	25 %	25 %	50 %	0 %	148242874
34053	NC_009482	GA	3	6	1547767	1547772	50 %	0 %	50 %	0 %	148242874
34054	NC_009482	AGCG	2	8	1547806	1547813	25 %	0 %	50 %	25 %	148242874
34055	NC_009482	AG	3	6	1547821	1547826	50 %	0 %	50 %	0 %	148242874
34056	NC_009482	CAG	2	6	1547953	1547958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242875
34057	NC_009482	GCG	2	6	1547967	1547972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242875
34058	NC_009482	GAT	2	6	1547991	1547996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242875
34059	NC_009482	CAG	3	9	1548007	1548015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242875
34060	NC_009482	CAA	2	6	1548046	1548051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242875
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34064	NC_009482	ACC	2	6	1548234	1548239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242876
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34066	NC_009482	GCA	2	6	1548306	1548311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242876
34067	NC_009482	GGTGAT	2	12	1548334	1548345	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148242876
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34071	NC_009482	GAA	2	6	1548448	1548453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242876
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34076	NC_009482	GTTGCT	2	12	1548724	1548735	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148242877
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34099	NC_009482	GTGC	2	8	1549691	1549698	0 %	25 %	50 %	25 %	148242879
34100	NC_009482	CGAAA	2	10	1549702	1549711	60 %	0 %	20 %	20 %	148242879
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34115	NC_009482	GCC	2	6	1550099	1550104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242879
34116	NC_009482	CCT	2	6	1550112	1550117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242880
34117	NC_009482	CAT	2	6	1550165	1550170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242880
34118	NC_009482	CTG	2	6	1550171	1550176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242880
34119	NC_009482	GATG	2	8	1550198	1550205	25 %	25 %	50 %	0 %	148242880
34120	NC_009482	GCG	2	6	1550256	1550261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242880
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34122	NC_009482	CAC	2	6	1550656	1550661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242881
34123	NC_009482	GTA	2	6	1550721	1550726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242881
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34127	NC_009482	TCG	2	6	1550788	1550793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242881
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34129	NC_009482	GCA	2	6	1550837	1550842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242881
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34132	NC_009482	CAT	2	6	1551184	1551189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242882
34133	NC_009482	GC	3	6	1551254	1551259	0 %	0 %	50 %	50 %	148242882
34134	NC_009482	GCC	3	9	1551374	1551382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242882
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34137	NC_009482	GC	3	6	1551536	1551541	0 %	0 %	50 %	50 %	148242882
34138	NC_009482	CGC	2	6	1551639	1551644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242883
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34142	NC_009482	GCG	2	6	1551746	1551751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242883
34143	NC_009482	CGC	2	6	1551766	1551771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242884
34144	NC_009482	ATCA	2	8	1551794	1551801	50 %	25 %	0 %	25 %	148242884
34145	NC_009482	TGC	2	6	1551835	1551840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242884
34146	NC_009482	CGT	2	6	1551881	1551886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242884
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34152	NC_009482	GC	3	6	1552080	1552085	0 %	0 %	50 %	50 %	148242885
34153	NC_009482	CAAA	2	8	1552087	1552094	75 %	0 %	0 %	25 %	148242885
34154	NC_009482	CCA	2	6	1552189	1552194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242885
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34213	NC_009482	GTT	2	6	1553699	1553704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242886
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34217	NC_009482	TGG	2	6	1554007	1554012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242887
34218	NC_009482	CTG	2	6	1554087	1554092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242887
34219	NC_009482	GCT	2	6	1554182	1554187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242887
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34221	NC_009482	CTT	2	6	1554230	1554235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242887
34222	NC_009482	CACC	2	8	1554299	1554306	25 %	0 %	0 %	75 %	148242887
34223	NC_009482	CTG	2	6	1554321	1554326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242887
34224	NC_009482	CAC	2	6	1554329	1554334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242887
34225	NC_009482	GGCT	2	8	1554378	1554385	0 %	25 %	50 %	25 %	148242887
34226	NC_009482	GCC	2	6	1554400	1554405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242887
34227	NC_009482	GTC	2	6	1554411	1554416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242887
34228	NC_009482	AGC	2	6	1554473	1554478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242888
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34230	NC_009482	GCT	2	6	1554493	1554498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242888
34231	NC_009482	CAC	2	6	1554514	1554519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242888
34232	NC_009482	TGG	2	6	1554525	1554530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242888
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34235	NC_009482	GCT	2	6	1554644	1554649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242888
34236	NC_009482	CTG	2	6	1554692	1554697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242888
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34273	NC_009482	CTCA	2	8	1556675	1556682	25 %	25 %	0 %	50 %	148242891
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34322	NC_009482	GCT	2	6	1558324	1558329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242892
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34324	NC_009482	CAG	2	6	1558384	1558389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242892
34325	NC_009482	AGC	2	6	1558488	1558493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242892
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34328	NC_009482	GCG	2	6	1558551	1558556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242892
34329	NC_009482	CAGCAC	2	12	1558612	1558623	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148242892
34330	NC_009482	CAC	2	6	1558627	1558632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242892
34331	NC_009482	CTT	2	6	1558668	1558673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242892
34332	NC_009482	GCCCA	2	10	1558691	1558700	20 %	0 %	20 %	60 %	148242892
34333	NC_009482	CAG	2	6	1558708	1558713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242892
34334	NC_009482	TGC	2	6	1558736	1558741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242892
34335	NC_009482	CAC	3	9	1558870	1558878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242892
34336	NC_009482	GCC	3	9	1558885	1558893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242892
34337	NC_009482	CAC	2	6	1558930	1558935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242892
34338	NC_009482	GAT	2	6	1558951	1558956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242892
34339	NC_009482	GGC	2	6	1559020	1559025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242892
34340	NC_009482	GAG	2	6	1559045	1559050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242892
34341	NC_009482	CAG	2	6	1559103	1559108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242892
34342	NC_009482	GCC	2	6	1559127	1559132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242892
34343	NC_009482	CAA	2	6	1559134	1559139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242892
34344	NC_009482	GAT	2	6	1559245	1559250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242893
34345	NC_009482	GCA	2	6	1559276	1559281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242893
34346	NC_009482	GGT	2	6	1559301	1559306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242893
34347	NC_009482	GGC	2	6	1559362	1559367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242893
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34350	NC_009482	TGCT	2	8	1559504	1559511	0 %	50 %	25 %	25 %	148242893
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34352	NC_009482	GCG	2	6	1559573	1559578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242893
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34358	NC_009482	GGT	2	6	1559863	1559868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242893
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34373	NC_009482	GCA	2	6	1560363	1560368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242893
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34451	NC_009482	CAGCAA	2	12	1563582	1563593	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148242896
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34454	NC_009482	GC	3	6	1563898	1563903	0 %	0 %	50 %	50 %	148242897
34455	NC_009482	GCA	2	6	1563918	1563923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242897
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