MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_009482	G	6	6	1522716	1522721	0 %	0 %	100 %	0 %	148242839
33502	NC_009482	AGC	2	6	1522772	1522777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242840
33503	NC_009482	GGA	2	6	1522789	1522794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242840
33504	NC_009482	GGAGGC	2	12	1522819	1522830	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148242840
33505	NC_009482	AGC	2	6	1522872	1522877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242840
33506	NC_009482	A	6	6	1522898	1522903	100 %	0 %	0 %	0 %	148242840
33507	NC_009482	GTG	2	6	1522961	1522966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242840
33508	NC_009482	GCT	2	6	1523005	1523010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242840
33509	NC_009482	AAG	2	6	1523034	1523039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242840
33510	NC_009482	CGAT	2	8	1523070	1523077	25 %	25 %	25 %	25 %	148242840
33511	NC_009482	GCC	2	6	1523086	1523091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242840
33512	NC_009482	AC	3	6	1523097	1523102	50 %	0 %	0 %	50 %	148242840
33513	NC_009482	CCG	2	6	1523103	1523108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242840
33514	NC_009482	GCCATC	2	12	1523109	1523120	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148242840
33515	NC_009482	GCT	2	6	1523122	1523127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242840
33516	NC_009482	CAC	2	6	1523131	1523136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242840
33517	NC_009482	TCG	2	6	1523145	1523150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242840
33518	NC_009482	TCT	2	6	1523154	1523159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242840
33519	NC_009482	GTG	2	6	1523177	1523182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242840
33520	NC_009482	ACT	2	6	1523205	1523210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242840
33521	NC_009482	GAG	2	6	1523237	1523242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242840
33522	NC_009482	CCCG	2	8	1523246	1523253	0 %	0 %	25 %	75 %	148242840
33523	NC_009482	CTG	2	6	1523291	1523296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242840
33524	NC_009482	C	6	6	1523341	1523346	0 %	0 %	0 %	100 %	148242840
33525	NC_009482	CCG	2	6	1523380	1523385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242840
33526	NC_009482	CCAC	2	8	1523400	1523407	25 %	0 %	0 %	75 %	148242840
33527	NC_009482	CCA	2	6	1523419	1523424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242840
33528	NC_009482	TGA	2	6	1523443	1523448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242840
33529	NC_009482	T	6	6	1523501	1523506	0 %	100 %	0 %	0 %	148242840
33530	NC_009482	GCTG	2	8	1523589	1523596	0 %	25 %	50 %	25 %	148242840
33531	NC_009482	CCG	2	6	1523625	1523630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242840
33532	NC_009482	CGA	2	6	1523722	1523727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242840
33533	NC_009482	CCG	2	6	1523731	1523736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242840
33534	NC_009482	CG	5	10	1523860	1523869	0 %	0 %	50 %	50 %	148242841
33535	NC_009482	CG	3	6	1523878	1523883	0 %	0 %	50 %	50 %	148242841
33536	NC_009482	TCCT	2	8	1523906	1523913	0 %	50 %	0 %	50 %	148242841
33537	NC_009482	CTC	2	6	1523921	1523926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242841
33538	NC_009482	GCT	2	6	1524022	1524027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33539	NC_009482	CCCG	2	8	1524033	1524040	0 %	0 %	25 %	75 %	148242841
33540	NC_009482	CTG	2	6	1524044	1524049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33541	NC_009482	CAG	2	6	1524073	1524078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33542	NC_009482	CGC	2	6	1524190	1524195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242841
33543	NC_009482	GCA	2	6	1524198	1524203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33544	NC_009482	ACA	2	6	1524234	1524239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242841
33545	NC_009482	TGC	2	6	1524258	1524263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33546	NC_009482	AAG	2	6	1524288	1524293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242841
33547	NC_009482	TGC	2	6	1524303	1524308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33548	NC_009482	TGC	2	6	1524381	1524386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33549	NC_009482	CCAG	2	8	1524516	1524523	25 %	0 %	25 %	50 %	148242841
33550	NC_009482	GGTGCT	2	12	1524526	1524537	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148242841
33551	NC_009482	GAG	2	6	1524569	1524574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242841
33552	NC_009482	AGC	2	6	1524580	1524585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33553	NC_009482	GCC	2	6	1524614	1524619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242841
33554	NC_009482	CTT	2	6	1524667	1524672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242841
33555	NC_009482	GATGGC	2	12	1524707	1524718	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148242841
33556	NC_009482	TCA	2	6	1524720	1524725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242841
33557	NC_009482	TGG	2	6	1524744	1524749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242841
33558	NC_009482	CAC	2	6	1524772	1524777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242841
33559	NC_009482	CGC	2	6	1524852	1524857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242841
33560	NC_009482	CAG	2	6	1524858	1524863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33561	NC_009482	CGG	2	6	1524878	1524883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242841
33562	NC_009482	CAA	2	6	1524902	1524907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242841
33563	NC_009482	CAG	2	6	1524916	1524921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33564	NC_009482	GCT	2	6	1524970	1524975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33565	NC_009482	CAA	2	6	1524985	1524990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242841
33566	NC_009482	CCG	2	6	1525089	1525094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242841
33567	NC_009482	TGG	2	6	1525107	1525112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242841
33568	NC_009482	GCT	2	6	1525117	1525122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33569	NC_009482	TGC	3	9	1525134	1525142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33570	NC_009482	GAT	2	6	1525153	1525158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242841
33571	NC_009482	GCGCC	2	10	1525196	1525205	0 %	0 %	40 %	60 %	148242841
33572	NC_009482	CAGC	2	8	1525210	1525217	25 %	0 %	25 %	50 %	148242841
33573	NC_009482	TGC	2	6	1525218	1525223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33574	NC_009482	CAG	2	6	1525231	1525236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33575	NC_009482	TGG	2	6	1525329	1525334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242841
33576	NC_009482	CTG	2	6	1525340	1525345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242841
33577	NC_009482	CAG	2	6	1525376	1525381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242841
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33579	NC_009482	TCA	2	6	1525413	1525418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242841
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33581	NC_009482	ACG	2	6	1525571	1525576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242842
33582	NC_009482	GC	3	6	1525647	1525652	0 %	0 %	50 %	50 %	148242842
33583	NC_009482	CAG	2	6	1525653	1525658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242842
33584	NC_009482	CGG	2	6	1525662	1525667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242842
33585	NC_009482	TGG	2	6	1525670	1525675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242842
33586	NC_009482	GCT	2	6	1525704	1525709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242842
33587	NC_009482	GCC	2	6	1525728	1525733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242842
33588	NC_009482	GCG	2	6	1525795	1525800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242842
33589	NC_009482	AGC	2	6	1525901	1525906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242842
33590	NC_009482	GAA	2	6	1525930	1525935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242842
33591	NC_009482	TGC	2	6	1525958	1525963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242842
33592	NC_009482	GCG	2	6	1525964	1525969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242842
33593	NC_009482	GCG	2	6	1525974	1525979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242842
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33597	NC_009482	TGG	2	6	1526282	1526287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242842
33598	NC_009482	GTT	2	6	1526303	1526308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242842
33599	NC_009482	GGA	2	6	1526319	1526324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242842
33600	NC_009482	CGC	2	6	1526338	1526343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242842
33601	NC_009482	GCC	2	6	1526353	1526358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242842
33602	NC_009482	GCTGG	2	10	1526409	1526418	0 %	20 %	60 %	20 %	148242842
33603	NC_009482	TGC	2	6	1526476	1526481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242843
33604	NC_009482	GC	3	6	1526492	1526497	0 %	0 %	50 %	50 %	148242843
33605	NC_009482	GGT	2	6	1526639	1526644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242843
33606	NC_009482	TGC	2	6	1526650	1526655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242843
33607	NC_009482	GCG	2	6	1526665	1526670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242843
33608	NC_009482	GCT	2	6	1526687	1526692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242843
33609	NC_009482	GCC	2	6	1526718	1526723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242843
33610	NC_009482	GCCC	2	8	1526773	1526780	0 %	0 %	25 %	75 %	148242843
33611	NC_009482	CTG	2	6	1526787	1526792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242843
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33615	NC_009482	CTG	3	9	1526970	1526978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242843
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