MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_009482	CAG	2	6	1502293	1502298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242815
33003	NC_009482	GGC	2	6	1502300	1502305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242815
33004	NC_009482	GCG	2	6	1502412	1502417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242815
33005	NC_009482	CGC	2	6	1502422	1502427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242815
33006	NC_009482	AAGC	2	8	1502446	1502453	50 %	0 %	25 %	25 %	148242815
33007	NC_009482	TGG	2	6	1502560	1502565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242816
33008	NC_009482	GCT	2	6	1502591	1502596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242816
33009	NC_009482	TGG	2	6	1502605	1502610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242816
33010	NC_009482	ACC	2	6	1502646	1502651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242816
33011	NC_009482	CAC	2	6	1502675	1502680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242816
33012	NC_009482	GCTGGT	2	12	1502693	1502704	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148242816
33013	NC_009482	CG	3	6	1502762	1502767	0 %	0 %	50 %	50 %	148242816
33014	NC_009482	GATG	2	8	1502804	1502811	25 %	25 %	50 %	0 %	148242816
33015	NC_009482	GGT	2	6	1502876	1502881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242816
33016	NC_009482	CAA	2	6	1502891	1502896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242816
33017	NC_009482	AGC	2	6	1502917	1502922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242816
33018	NC_009482	CCT	2	6	1502938	1502943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242816
33019	NC_009482	TGG	2	6	1503013	1503018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242816
33020	NC_009482	CTG	3	9	1503093	1503101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242816
33021	NC_009482	TGC	2	6	1503124	1503129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242816
33022	NC_009482	GAA	2	6	1503141	1503146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242816
33023	NC_009482	GTG	2	6	1503180	1503185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242816
33024	NC_009482	TGG	2	6	1503223	1503228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242816
33025	NC_009482	GCA	2	6	1503232	1503237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242816
33026	NC_009482	GC	3	6	1503295	1503300	0 %	0 %	50 %	50 %	148242816
33027	NC_009482	TGAT	2	8	1503319	1503326	25 %	50 %	25 %	0 %	148242816
33028	NC_009482	GGT	2	6	1503356	1503361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242816
33029	NC_009482	CATC	2	8	1503638	1503645	25 %	25 %	0 %	50 %	148242817
33030	NC_009482	TTC	2	6	1503649	1503654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242817
33031	NC_009482	ATC	2	6	1503673	1503678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242817
33032	NC_009482	CAAAA	2	10	1503741	1503750	80 %	0 %	0 %	20 %	148242817
33033	NC_009482	AATC	2	8	1503767	1503774	50 %	25 %	0 %	25 %	148242817
33034	NC_009482	A	7	7	1503786	1503792	100 %	0 %	0 %	0 %	148242817
33035	NC_009482	T	6	6	1503817	1503822	0 %	100 %	0 %	0 %	148242817
33036	NC_009482	TCTTGG	2	12	1503832	1503843	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148242817
33037	NC_009482	GCAT	2	8	1503873	1503880	25 %	25 %	25 %	25 %	148242817
33038	NC_009482	TGG	2	6	1503930	1503935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242817
33039	NC_009482	ATG	2	6	1504039	1504044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242817
33040	NC_009482	AGT	2	6	1504051	1504056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242817
33041	NC_009482	GCT	2	6	1504059	1504064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242817
33042	NC_009482	ATT	2	6	1504074	1504079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148242817
33043	NC_009482	ATG	2	6	1504127	1504132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242817
33044	NC_009482	GTG	2	6	1504166	1504171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242817
33045	NC_009482	CA	3	6	1504172	1504177	50 %	0 %	0 %	50 %	148242817
33046	NC_009482	TCA	2	6	1504217	1504222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242817
33047	NC_009482	ATC	2	6	1504278	1504283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242817
33048	NC_009482	TTGT	2	8	1504456	1504463	0 %	75 %	25 %	0 %	148242817
33049	NC_009482	A	6	6	1504487	1504492	100 %	0 %	0 %	0 %	148242818
33050	NC_009482	ATA	2	6	1504577	1504582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148242818
33051	NC_009482	TTG	2	6	1504616	1504621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242818
33052	NC_009482	TTGA	2	8	1504639	1504646	25 %	50 %	25 %	0 %	148242818
33053	NC_009482	ATTG	2	8	1504714	1504721	25 %	50 %	25 %	0 %	148242818
33054	NC_009482	GATT	2	8	1504764	1504771	25 %	50 %	25 %	0 %	148242818
33055	NC_009482	CTTC	2	8	1504839	1504846	0 %	50 %	0 %	50 %	148242818
33056	NC_009482	CTTG	2	8	1504912	1504919	0 %	50 %	25 %	25 %	148242818
33057	NC_009482	A	6	6	1504952	1504957	100 %	0 %	0 %	0 %	148242818
33058	NC_009482	CAG	2	6	1504966	1504971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242818
33059	NC_009482	AGC	2	6	1505007	1505012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242818
33060	NC_009482	TGA	2	6	1505036	1505041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242818
33061	NC_009482	AAGA	2	8	1505044	1505051	75 %	0 %	25 %	0 %	148242818
33062	NC_009482	TTG	2	6	1505086	1505091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242818
33063	NC_009482	ATA	2	6	1505095	1505100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148242818
33064	NC_009482	CTG	2	6	1505125	1505130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242818
33065	NC_009482	ATG	2	6	1505147	1505152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242818
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33067	NC_009482	ATTG	2	8	1505272	1505279	25 %	50 %	25 %	0 %	148242818
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33073	NC_009482	TG	3	6	1505625	1505630	0 %	50 %	50 %	0 %	148242818
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33088	NC_009482	AGC	2	6	1506447	1506452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242819
33089	NC_009482	GCA	2	6	1506462	1506467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242819
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33101	NC_009482	TTCA	2	8	1506823	1506830	25 %	50 %	0 %	25 %	148242819
33102	NC_009482	TGATC	2	10	1506846	1506855	20 %	40 %	20 %	20 %	148242819
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33116	NC_009482	ACT	2	6	1507532	1507537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242820
33117	NC_009482	CAG	2	6	1507591	1507596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242820
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33120	NC_009482	C	9	9	1507666	1507674	0 %	0 %	0 %	100 %	148242820
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33128	NC_009482	CTT	2	6	1508055	1508060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242820
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33144	NC_009482	TGA	2	6	1509170	1509175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242823
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33220	NC_009482	CGG	2	6	1512731	1512736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242824
33221	NC_009482	TGAC	2	8	1512804	1512811	25 %	25 %	25 %	25 %	148242825
33222	NC_009482	CCCA	2	8	1512817	1512824	25 %	0 %	0 %	75 %	148242825
33223	NC_009482	TGC	2	6	1512829	1512834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242825
33224	NC_009482	GCTC	2	8	1512841	1512848	0 %	25 %	25 %	50 %	148242825
33225	NC_009482	AGCTG	2	10	1512939	1512948	20 %	20 %	40 %	20 %	148242825
33226	NC_009482	GCC	2	6	1513038	1513043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242825
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33228	NC_009482	GTC	2	6	1513092	1513097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242825
33229	NC_009482	CTG	2	6	1513178	1513183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242825
33230	NC_009482	AGC	2	6	1513197	1513202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242825
33231	NC_009482	CCG	2	6	1513231	1513236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242825
33232	NC_009482	AGC	2	6	1513258	1513263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242825
33233	NC_009482	CGG	3	9	1513425	1513433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242826
33234	NC_009482	GCC	2	6	1513468	1513473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242826
33235	NC_009482	CGG	2	6	1513501	1513506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242826
33236	NC_009482	TGC	2	6	1513508	1513513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242826
33237	NC_009482	TGA	2	6	1513514	1513519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242826
33238	NC_009482	GCAAG	2	10	1513524	1513533	40 %	0 %	40 %	20 %	148242826
33239	NC_009482	GCA	2	6	1513539	1513544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242826
33240	NC_009482	CGC	2	6	1513555	1513560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242826
33241	NC_009482	TGA	2	6	1513614	1513619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242826
33242	NC_009482	TGA	2	6	1513638	1513643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242826
33243	NC_009482	CGG	2	6	1513674	1513679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242826
33244	NC_009482	ATC	2	6	1513699	1513704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242826
33245	NC_009482	TGCGGC	2	12	1513715	1513726	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148242826
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33248	NC_009482	GCT	2	6	1513779	1513784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242826
33249	NC_009482	CGG	2	6	1513835	1513840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242826
33250	NC_009482	TGC	2	6	1513841	1513846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242826
33251	NC_009482	GCG	2	6	1513850	1513855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242826
33252	NC_009482	GC	3	6	1513878	1513883	0 %	0 %	50 %	50 %	148242826
33253	NC_009482	AGC	2	6	1513886	1513891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242826
33254	NC_009482	GCC	2	6	1513913	1513918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242826
33255	NC_009482	GGCA	2	8	1513937	1513944	25 %	0 %	50 %	25 %	148242826
33256	NC_009482	CTG	3	9	1513975	1513983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242827
33257	NC_009482	CCA	2	6	1514028	1514033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242827
33258	NC_009482	GCC	2	6	1514044	1514049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242827
33259	NC_009482	GCCCAT	2	12	1514071	1514082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148242827
33260	NC_009482	CACT	2	8	1514084	1514091	25 %	25 %	0 %	50 %	148242827
33261	NC_009482	CAG	3	9	1514095	1514103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242827
33262	NC_009482	CAG	2	6	1514157	1514162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242827
33263	NC_009482	GCT	2	6	1514187	1514192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242827
33264	NC_009482	TGC	2	6	1514195	1514200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242827
33265	NC_009482	GCTTCG	2	12	1514201	1514212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242827
33266	NC_009482	CTT	2	6	1514229	1514234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242827
33267	NC_009482	GCCC	2	8	1514267	1514274	0 %	0 %	25 %	75 %	148242827
33268	NC_009482	CTG	2	6	1514353	1514358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242827
33269	NC_009482	CTG	2	6	1514368	1514373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242827
33270	NC_009482	GCA	2	6	1514457	1514462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242827
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33273	NC_009482	GATCGA	2	12	1514499	1514510	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148242827
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33282	NC_009482	C	6	6	1514828	1514833	0 %	0 %	0 %	100 %	148242827
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33325	NC_009482	GAG	2	6	1516160	1516165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242830
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33327	NC_009482	GC	3	6	1516350	1516355	0 %	0 %	50 %	50 %	148242831
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33329	NC_009482	CAG	2	6	1516492	1516497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242831
33330	NC_009482	CAG	2	6	1516507	1516512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242831
33331	NC_009482	GCTG	2	8	1516601	1516608	0 %	25 %	50 %	25 %	148242831
33332	NC_009482	CGG	2	6	1516668	1516673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242831
33333	NC_009482	TGC	2	6	1516682	1516687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242831
33334	NC_009482	GGC	2	6	1516726	1516731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242831
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33336	NC_009482	GCT	2	6	1516818	1516823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242831
33337	NC_009482	GGC	2	6	1516838	1516843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242831
33338	NC_009482	CTG	2	6	1516861	1516866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242831
33339	NC_009482	CCA	2	6	1516874	1516879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242831
33340	NC_009482	TC	3	6	1516914	1516919	0 %	50 %	0 %	50 %	148242831
33341	NC_009482	GCA	2	6	1516929	1516934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242831
33342	NC_009482	CAA	2	6	1516939	1516944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242831
33343	NC_009482	CAG	4	12	1516963	1516974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242831
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33345	NC_009482	TGAG	2	8	1517050	1517057	25 %	25 %	50 %	0 %	148242831
33346	NC_009482	GCG	2	6	1517075	1517080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242832
33347	NC_009482	ATC	2	6	1517136	1517141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242832
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33460	NC_009482	CAC	2	6	1520970	1520975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242837
33461	NC_009482	GCA	2	6	1520999	1521004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242837
33462	NC_009482	CTG	2	6	1521006	1521011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242837
33463	NC_009482	GCT	2	6	1521034	1521039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242837
33464	NC_009482	GCACCA	2	12	1521056	1521067	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148242837
33465	NC_009482	GCT	2	6	1521068	1521073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242837
33466	NC_009482	CGG	2	6	1521195	1521200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242837
33467	NC_009482	GCC	2	6	1521205	1521210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242837
33468	NC_009482	GC	4	8	1521220	1521227	0 %	0 %	50 %	50 %	148242837
33469	NC_009482	ACC	2	6	1521567	1521572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242838
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33472	NC_009482	CTG	2	6	1521702	1521707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242838
33473	NC_009482	TGG	2	6	1521715	1521720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242838
33474	NC_009482	TGC	2	6	1521731	1521736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242838
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33480	NC_009482	GCG	2	6	1521993	1521998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242839
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33483	NC_009482	GCCA	2	8	1522094	1522101	25 %	0 %	25 %	50 %	148242839
33484	NC_009482	GTA	2	6	1522102	1522107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242839
33485	NC_009482	CG	3	6	1522116	1522121	0 %	0 %	50 %	50 %	148242839
33486	NC_009482	TCA	2	6	1522133	1522138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242839
33487	NC_009482	GCG	2	6	1522153	1522158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242839
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33489	NC_009482	GGC	2	6	1522199	1522204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242839
33490	NC_009482	CCG	2	6	1522206	1522211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242839
33491	NC_009482	GTTGAG	2	12	1522216	1522227	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148242839
33492	NC_009482	CAG	2	6	1522228	1522233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242839
33493	NC_009482	GCC	2	6	1522246	1522251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242839
33494	NC_009482	GCT	2	6	1522324	1522329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242839
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