MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32503	NC_009482	TGC	2	6	1482804	1482809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242797
32504	NC_009482	TGC	2	6	1482868	1482873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242797
32505	NC_009482	CAAC	2	8	1482929	1482936	50 %	0 %	0 %	50 %	148242797
32506	NC_009482	GCC	2	6	1482962	1482967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242797
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32512	NC_009482	CGC	2	6	1483112	1483117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242798
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32516	NC_009482	AGTGA	2	10	1483286	1483295	40 %	20 %	40 %	0 %	148242798
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32600	NC_009482	GGCC	2	8	1486355	1486362	0 %	0 %	50 %	50 %	148242802
32601	NC_009482	GCA	2	6	1486385	1486390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242802
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32847	NC_009482	GAT	2	6	1496110	1496115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242810
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32961	NC_009482	GCA	2	6	1500820	1500825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242813
32962	NC_009482	AGC	2	6	1500879	1500884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242813
32963	NC_009482	GTG	2	6	1500886	1500891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242813
32964	NC_009482	CTGATC	2	12	1500903	1500914	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148242813
32965	NC_009482	TCA	2	6	1500958	1500963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242813
32966	NC_009482	CA	3	6	1501018	1501023	50 %	0 %	0 %	50 %	148242813
32967	NC_009482	GAAC	2	8	1501037	1501044	50 %	0 %	25 %	25 %	148242813
32968	NC_009482	GC	3	6	1501045	1501050	0 %	0 %	50 %	50 %	148242813
32969	NC_009482	AC	3	6	1501103	1501108	50 %	0 %	0 %	50 %	148242813
32970	NC_009482	GCT	2	6	1501221	1501226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242814
32971	NC_009482	GC	3	6	1501232	1501237	0 %	0 %	50 %	50 %	148242814
32972	NC_009482	TGGGA	2	10	1501243	1501252	20 %	20 %	60 %	0 %	148242814
32973	NC_009482	TCA	2	6	1501291	1501296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242814
32974	NC_009482	GCT	2	6	1501297	1501302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242814
32975	NC_009482	CAG	2	6	1501319	1501324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242814
32976	NC_009482	GCT	2	6	1501327	1501332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242814
32977	NC_009482	CAG	2	6	1501367	1501372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242814
32978	NC_009482	CAG	2	6	1501379	1501384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242814
32979	NC_009482	GGT	2	6	1501436	1501441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242814
32980	NC_009482	CAG	2	6	1501445	1501450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242814
32981	NC_009482	CCA	2	6	1501479	1501484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242814
32982	NC_009482	CAG	2	6	1501508	1501513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242814
32983	NC_009482	AG	3	6	1501512	1501517	50 %	0 %	50 %	0 %	148242814
32984	NC_009482	ACCTGC	2	12	1501635	1501646	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148242815
32985	NC_009482	GA	3	6	1501698	1501703	50 %	0 %	50 %	0 %	148242815
32986	NC_009482	TGC	2	6	1501716	1501721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242815
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32988	NC_009482	TGG	2	6	1501791	1501796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242815
32989	NC_009482	GGC	2	6	1501808	1501813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242815
32990	NC_009482	TCGGCA	2	12	1501851	1501862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148242815
32991	NC_009482	AGC	2	6	1501869	1501874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242815
32992	NC_009482	CTG	2	6	1501906	1501911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242815
32993	NC_009482	GC	4	8	1501916	1501923	0 %	0 %	50 %	50 %	148242815
32994	NC_009482	CG	3	6	1501940	1501945	0 %	0 %	50 %	50 %	148242815
32995	NC_009482	CTG	2	6	1501947	1501952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242815
32996	NC_009482	CCAC	2	8	1501977	1501984	25 %	0 %	0 %	75 %	148242815
32997	NC_009482	CAG	2	6	1501994	1501999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242815
32998	NC_009482	TTTG	2	8	1502074	1502081	0 %	75 %	25 %	0 %	148242815
32999	NC_009482	CAA	2	6	1502194	1502199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242815
33000	NC_009482	CAC	2	6	1502239	1502244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242815

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