MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32001	NC_009482	GCA	2	6	1461362	1461367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242768
32002	NC_009482	AGC	2	6	1461373	1461378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242768
32003	NC_009482	GAG	2	6	1461399	1461404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242768
32004	NC_009482	GCT	2	6	1461437	1461442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242768
32005	NC_009482	AAGA	2	8	1461476	1461483	75 %	0 %	25 %	0 %	148242768
32006	NC_009482	GGT	2	6	1461542	1461547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242768
32007	NC_009482	GCACC	2	10	1461563	1461572	20 %	0 %	20 %	60 %	148242768
32008	NC_009482	TGCCC	2	10	1461602	1461611	0 %	20 %	20 %	60 %	148242768
32009	NC_009482	TGG	2	6	1461616	1461621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242768
32010	NC_009482	CGGG	2	8	1461632	1461639	0 %	0 %	75 %	25 %	148242768
32011	NC_009482	CAG	2	6	1461686	1461691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242768
32012	NC_009482	GCC	2	6	1461733	1461738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242768
32013	NC_009482	CACC	2	8	1461818	1461825	25 %	0 %	0 %	75 %	148242768
32014	NC_009482	GCG	2	6	1461829	1461834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242768
32015	NC_009482	TGG	2	6	1461844	1461849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242768
32016	NC_009482	ACA	2	6	1461856	1461861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242768
32017	NC_009482	GCG	2	6	1461862	1461867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242768
32018	NC_009482	GAG	2	6	1461924	1461929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242768
32019	NC_009482	AGC	2	6	1462045	1462050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242768
32020	NC_009482	CGG	2	6	1462134	1462139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242768
32021	NC_009482	GGC	2	6	1462168	1462173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242768
32022	NC_009482	GCG	2	6	1462219	1462224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242768
32023	NC_009482	GCC	3	9	1462248	1462256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242768
32024	NC_009482	CAT	2	6	1462286	1462291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242768
32025	NC_009482	A	6	6	1462293	1462298	100 %	0 %	0 %	0 %	148242768
32026	NC_009482	TGG	2	6	1462303	1462308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242768
32027	NC_009482	GCA	2	6	1462313	1462318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242768
32028	NC_009482	GCT	3	9	1462319	1462327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242768
32029	NC_009482	CCGGC	2	10	1462341	1462350	0 %	0 %	40 %	60 %	148242768
32030	NC_009482	TGC	3	9	1462351	1462359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242768
32031	NC_009482	ACG	2	6	1462366	1462371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242768
32032	NC_009482	AGC	2	6	1462416	1462421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242768
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32034	NC_009482	TGGA	2	8	1462494	1462501	25 %	25 %	50 %	0 %	148242768
32035	NC_009482	CTG	2	6	1462641	1462646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242769
32036	NC_009482	TGC	2	6	1462709	1462714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242769
32037	NC_009482	ACG	2	6	1462739	1462744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242769
32038	NC_009482	CGA	2	6	1462773	1462778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242769
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32041	NC_009482	GGC	2	6	1462865	1462870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242769
32042	NC_009482	GCCG	2	8	1462881	1462888	0 %	0 %	50 %	50 %	148242769
32043	NC_009482	CAG	2	6	1462927	1462932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242769
32044	NC_009482	TGC	2	6	1462959	1462964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242769
32045	NC_009482	CAG	2	6	1463047	1463052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242769
32046	NC_009482	CCGCA	2	10	1463067	1463076	20 %	0 %	20 %	60 %	148242769
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32048	NC_009482	AAGG	2	8	1463134	1463141	50 %	0 %	50 %	0 %	148242769
32049	NC_009482	GGC	2	6	1463174	1463179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242769
32050	NC_009482	CATC	2	8	1463238	1463245	25 %	25 %	0 %	50 %	148242769
32051	NC_009482	GCG	3	9	1463249	1463257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242769
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32054	NC_009482	CAC	2	6	1463394	1463399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242769
32055	NC_009482	GCT	2	6	1463409	1463414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242769
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32057	NC_009482	TGC	2	6	1463453	1463458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242769
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32062	NC_009482	GGA	2	6	1463613	1463618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242769
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32100	NC_009482	GCT	2	6	1465010	1465015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242772
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32225	NC_009482	GAGGAA	2	12	1469656	1469667	50 %	0 %	50 %	0 %	148242779
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32227	NC_009482	AGCC	2	8	1469865	1469872	25 %	0 %	25 %	50 %	148242780
32228	NC_009482	T	9	9	1469913	1469921	0 %	100 %	0 %	0 %	148242780
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32346	NC_009482	GCA	2	6	1476339	1476344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242789
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32459	NC_009482	TCT	2	6	1480685	1480690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242795
32460	NC_009482	ATG	2	6	1480702	1480707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242795
32461	NC_009482	CTT	2	6	1480833	1480838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242795
32462	NC_009482	TGG	2	6	1480841	1480846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242795
32463	NC_009482	TGC	2	6	1480850	1480855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242795
32464	NC_009482	GGC	2	6	1480885	1480890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242795
32465	NC_009482	ACT	2	6	1480928	1480933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242795
32466	NC_009482	TTC	2	6	1480939	1480944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242795
32467	NC_009482	CAT	2	6	1480980	1480985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242795
32468	NC_009482	TTC	2	6	1481000	1481005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242795
32469	NC_009482	CTG	3	9	1481020	1481028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242795
32470	NC_009482	TTC	2	6	1481044	1481049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242795
32471	NC_009482	GT	3	6	1481054	1481059	0 %	50 %	50 %	0 %	148242795
32472	NC_009482	GGT	2	6	1481077	1481082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242795
32473	NC_009482	GGC	2	6	1481158	1481163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242795
32474	NC_009482	ATC	2	6	1481173	1481178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242795
32475	NC_009482	CAT	2	6	1481199	1481204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242795
32476	NC_009482	GGC	2	6	1481206	1481211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242795
32477	NC_009482	CAA	2	6	1481379	1481384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242795
32478	NC_009482	CCA	2	6	1481414	1481419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242795
32479	NC_009482	ATC	2	6	1481548	1481553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242795
32480	NC_009482	TGG	2	6	1481556	1481561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242795
32481	NC_009482	CGC	2	6	1481671	1481676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242795
32482	NC_009482	GCT	2	6	1481677	1481682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242795
32483	NC_009482	CAT	2	6	1481730	1481735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242795
32484	NC_009482	TTC	2	6	1481794	1481799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242795
32485	NC_009482	CTT	3	9	1481805	1481813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242795
32486	NC_009482	TGC	4	12	1481850	1481861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242795
32487	NC_009482	CAA	2	6	1482096	1482101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242796
32488	NC_009482	AGC	2	6	1482139	1482144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242796
32489	NC_009482	CCA	3	9	1482157	1482165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242796
32490	NC_009482	C	6	6	1482191	1482196	0 %	0 %	0 %	100 %	148242796
32491	NC_009482	CTGC	2	8	1482241	1482248	0 %	25 %	25 %	50 %	148242796
32492	NC_009482	GCT	3	9	1482289	1482297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242796
32493	NC_009482	GCAG	2	8	1482307	1482314	25 %	0 %	50 %	25 %	148242796
32494	NC_009482	TGC	2	6	1482351	1482356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242796
32495	NC_009482	TCA	2	6	1482456	1482461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242796
32496	NC_009482	CAG	2	6	1482481	1482486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242796
32497	NC_009482	GC	3	6	1482608	1482613	0 %	0 %	50 %	50 %	148242796
32498	NC_009482	GCCCT	2	10	1482711	1482720	0 %	20 %	20 %	60 %	148242797
32499	NC_009482	CGC	2	6	1482746	1482751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242797
32500	NC_009482	GCA	2	6	1482758	1482763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242797

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