MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_009482	GC	3	6	1438919	1438924	0 %	0 %	50 %	50 %	148242741
31502	NC_009482	CCA	2	6	1438941	1438946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242741
31503	NC_009482	TGGC	2	8	1438973	1438980	0 %	25 %	50 %	25 %	148242741
31504	NC_009482	GCC	2	6	1439062	1439067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242741
31505	NC_009482	GCC	2	6	1439081	1439086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242741
31506	NC_009482	GA	3	6	1439142	1439147	50 %	0 %	50 %	0 %	148242741
31507	NC_009482	CCA	2	6	1439151	1439156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242741
31508	NC_009482	ACC	2	6	1439192	1439197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242741
31509	NC_009482	GCG	2	6	1439228	1439233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242741
31510	NC_009482	CGG	2	6	1439244	1439249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242741
31511	NC_009482	GAG	2	6	1439250	1439255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242741
31512	NC_009482	CCG	2	6	1439268	1439273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242741
31513	NC_009482	CGCTG	2	10	1439281	1439290	0 %	20 %	40 %	40 %	148242742
31514	NC_009482	GCG	2	6	1439342	1439347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242742
31515	NC_009482	TTGCAA	2	12	1439396	1439407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148242742
31516	NC_009482	GCT	2	6	1439443	1439448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242742
31517	NC_009482	ACC	2	6	1439460	1439465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242742
31518	NC_009482	TCT	2	6	1439472	1439477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242742
31519	NC_009482	CACG	2	8	1439503	1439510	25 %	0 %	25 %	50 %	148242742
31520	NC_009482	CTC	2	6	1439555	1439560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242742
31521	NC_009482	CAC	2	6	1439591	1439596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242742
31522	NC_009482	TGG	2	6	1439646	1439651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242742
31523	NC_009482	GGC	2	6	1439654	1439659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242742
31524	NC_009482	CAC	2	6	1439678	1439683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242742
31525	NC_009482	CGC	2	6	1439743	1439748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242742
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31527	NC_009482	G	6	6	1439829	1439834	0 %	0 %	100 %	0 %	148242742
31528	NC_009482	GCA	2	6	1439929	1439934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242742
31529	NC_009482	CAACC	2	10	1439957	1439966	40 %	0 %	0 %	60 %	148242742
31530	NC_009482	TTGGC	2	10	1440007	1440016	0 %	40 %	40 %	20 %	148242743
31531	NC_009482	TGG	3	9	1440042	1440050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242743
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31533	NC_009482	GCA	2	6	1440106	1440111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242743
31534	NC_009482	GGC	2	6	1440134	1440139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242743
31535	NC_009482	TGA	2	6	1440152	1440157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242743
31536	NC_009482	ACT	2	6	1440170	1440175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242743
31537	NC_009482	GCT	2	6	1440218	1440223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242743
31538	NC_009482	GCT	2	6	1440266	1440271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242743
31539	NC_009482	ACG	4	12	1440295	1440306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242743
31540	NC_009482	GCA	2	6	1440419	1440424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242743
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31542	NC_009482	GCA	2	6	1440497	1440502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242743
31543	NC_009482	GCG	2	6	1440549	1440554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242743
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31545	NC_009482	CTG	2	6	1440579	1440584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242743
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31548	NC_009482	AACTC	2	10	1440657	1440666	40 %	20 %	0 %	40 %	148242743
31549	NC_009482	GCT	2	6	1440696	1440701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242743
31550	NC_009482	ATCG	2	8	1440870	1440877	25 %	25 %	25 %	25 %	148242744
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31552	NC_009482	GCA	2	6	1440920	1440925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242744
31553	NC_009482	GGTT	2	8	1441004	1441011	0 %	50 %	50 %	0 %	148242744
31554	NC_009482	CGC	2	6	1441029	1441034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242744
31555	NC_009482	CAG	3	9	1441041	1441049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242744
31556	NC_009482	CAA	2	6	1441065	1441070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242744
31557	NC_009482	CTG	2	6	1441176	1441181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242745
31558	NC_009482	GCTG	2	8	1441183	1441190	0 %	25 %	50 %	25 %	148242745
31559	NC_009482	GAA	2	6	1441266	1441271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242745
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31565	NC_009482	CTGGC	2	10	1441509	1441518	0 %	20 %	40 %	40 %	148242745
31566	NC_009482	GCCT	2	8	1441680	1441687	0 %	25 %	25 %	50 %	148242745
31567	NC_009482	TGG	2	6	1441746	1441751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242745
31568	NC_009482	GAG	2	6	1441815	1441820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242745
31569	NC_009482	GCA	2	6	1441823	1441828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242745
31570	NC_009482	TGA	2	6	1441913	1441918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242745
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31615	NC_009482	GC	3	6	1443917	1443922	0 %	0 %	50 %	50 %	148242747
31616	NC_009482	GCT	2	6	1443958	1443963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242747
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31961	NC_009482	CAC	2	6	1459211	1459216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242766
31962	NC_009482	CCA	2	6	1459240	1459245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242766
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31990	NC_009482	TGG	2	6	1460785	1460790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242768
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31992	NC_009482	GCG	2	6	1460851	1460856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242768
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31995	NC_009482	CTG	2	6	1461009	1461014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242768
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32000	NC_009482	CTAC	2	8	1461323	1461330	25 %	25 %	0 %	50 %	148242768

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