MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_009482	CAC	2	6	1416663	1416668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242711
31003	NC_009482	CAGC	2	8	1416692	1416699	25 %	0 %	25 %	50 %	148242711
31004	NC_009482	CA	3	6	1416738	1416743	50 %	0 %	0 %	50 %	148242711
31005	NC_009482	CAC	2	6	1416753	1416758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242711
31006	NC_009482	CAG	2	6	1416771	1416776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242711
31007	NC_009482	GCC	2	6	1416799	1416804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242711
31008	NC_009482	ACC	2	6	1416805	1416810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242711
31009	NC_009482	GAGC	2	8	1416865	1416872	25 %	0 %	50 %	25 %	148242711
31010	NC_009482	CCG	2	6	1416906	1416911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242711
31011	NC_009482	ACC	2	6	1416937	1416942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242711
31012	NC_009482	CAG	2	6	1416945	1416950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242711
31013	NC_009482	GCA	2	6	1416959	1416964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242711
31014	NC_009482	GC	3	6	1417020	1417025	0 %	0 %	50 %	50 %	148242711
31015	NC_009482	CAA	2	6	1417041	1417046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242711
31016	NC_009482	CAC	2	6	1417047	1417052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242711
31017	NC_009482	AGC	2	6	1417087	1417092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242711
31018	NC_009482	GCA	2	6	1417130	1417135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242711
31019	NC_009482	AGC	2	6	1417165	1417170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242711
31020	NC_009482	CCA	2	6	1417187	1417192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242711
31021	NC_009482	AAAG	3	12	1417242	1417253	75 %	0 %	25 %	0 %	148242711
31022	NC_009482	GCA	2	6	1417259	1417264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242711
31023	NC_009482	TGC	2	6	1417271	1417276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242711
31024	NC_009482	C	6	6	1417285	1417290	0 %	0 %	0 %	100 %	148242711
31025	NC_009482	CAC	2	6	1417307	1417312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242711
31026	NC_009482	GCT	2	6	1417356	1417361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242711
31027	NC_009482	GTG	2	6	1417388	1417393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242712
31028	NC_009482	GGC	2	6	1417467	1417472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242712
31029	NC_009482	GCA	2	6	1417478	1417483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242712
31030	NC_009482	GCG	2	6	1417520	1417525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242712
31031	NC_009482	GCT	2	6	1417582	1417587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242712
31032	NC_009482	CAG	2	6	1417609	1417614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242712
31033	NC_009482	TCA	2	6	1417641	1417646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242712
31034	NC_009482	CAG	2	6	1417652	1417657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242712
31035	NC_009482	CAG	2	6	1417685	1417690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242712
31036	NC_009482	CCG	2	6	1417707	1417712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242712
31037	NC_009482	GGC	3	9	1417729	1417737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242712
31038	NC_009482	AGC	2	6	1417766	1417771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242712
31039	NC_009482	GGT	2	6	1417786	1417791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242712
31040	NC_009482	CAGCC	2	10	1417806	1417815	20 %	0 %	20 %	60 %	148242712
31041	NC_009482	TCAC	2	8	1417824	1417831	25 %	25 %	0 %	50 %	148242712
31042	NC_009482	AGC	2	6	1417854	1417859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242712
31043	NC_009482	CT	3	6	1417895	1417900	0 %	50 %	0 %	50 %	148242712
31044	NC_009482	CAA	2	6	1417934	1417939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242712
31045	NC_009482	C	6	6	1417950	1417955	0 %	0 %	0 %	100 %	148242712
31046	NC_009482	CCA	2	6	1417972	1417977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242712
31047	NC_009482	GCCC	2	8	1418000	1418007	0 %	0 %	25 %	75 %	148242712
31048	NC_009482	ACC	2	6	1418067	1418072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242712
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31050	NC_009482	CAG	2	6	1418111	1418116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242712
31051	NC_009482	TGG	2	6	1418136	1418141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242713
31052	NC_009482	GCG	2	6	1418161	1418166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242713
31053	NC_009482	GCA	2	6	1418276	1418281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242713
31054	NC_009482	CCA	2	6	1418288	1418293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242713
31055	NC_009482	TGT	2	6	1418316	1418321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242713
31056	NC_009482	TCA	2	6	1418396	1418401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242713
31057	NC_009482	GCG	2	6	1418413	1418418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242713
31058	NC_009482	CAC	2	6	1418449	1418454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242713
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31061	NC_009482	GCC	2	6	1418606	1418611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242713
31062	NC_009482	CA	3	6	1418627	1418632	50 %	0 %	0 %	50 %	148242713
31063	NC_009482	CTT	2	6	1418646	1418651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242713
31064	NC_009482	GTGATG	2	12	1418680	1418691	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148242713
31065	NC_009482	TCC	2	6	1418711	1418716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242713
31066	NC_009482	GCT	2	6	1418746	1418751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242713
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31082	NC_009482	GTG	2	6	1419525	1419530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242714
31083	NC_009482	CAC	2	6	1419545	1419550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242714
31084	NC_009482	TGC	2	6	1419553	1419558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242714
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31088	NC_009482	CTG	2	6	1419639	1419644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242714
31089	NC_009482	CAAC	2	8	1419668	1419675	50 %	0 %	0 %	50 %	148242714
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31099	NC_009482	TGG	2	6	1420066	1420071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242714
31100	NC_009482	TGC	2	6	1420105	1420110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242714
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31102	NC_009482	CGGC	2	8	1420177	1420184	0 %	0 %	50 %	50 %	148242715
31103	NC_009482	CTG	2	6	1420190	1420195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242715
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31105	NC_009482	GGCTG	2	10	1420252	1420261	0 %	20 %	60 %	20 %	148242715
31106	NC_009482	GC	3	6	1420265	1420270	0 %	0 %	50 %	50 %	148242715
31107	NC_009482	CGC	2	6	1420283	1420288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242715
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31111	NC_009482	GA	3	6	1420426	1420431	50 %	0 %	50 %	0 %	148242716
31112	NC_009482	TGC	2	6	1420456	1420461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242716
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31115	NC_009482	GGC	2	6	1420564	1420569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242717
31116	NC_009482	GCA	3	9	1420573	1420581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242717
31117	NC_009482	CCA	2	6	1420598	1420603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242717
31118	NC_009482	GCC	2	6	1420628	1420633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242717
31119	NC_009482	GCCG	2	8	1420668	1420675	0 %	0 %	50 %	50 %	148242717
31120	NC_009482	ATGG	2	8	1420676	1420683	25 %	25 %	50 %	0 %	148242717
31121	NC_009482	CCG	2	6	1420713	1420718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242717
31122	NC_009482	CTG	2	6	1420733	1420738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242717
31123	NC_009482	CAC	2	6	1420774	1420779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242717
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31125	NC_009482	CAATGG	2	12	1420850	1420861	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148242717
31126	NC_009482	GCCG	3	12	1420887	1420898	0 %	0 %	50 %	50 %	148242717
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31129	NC_009482	GGT	2	6	1421110	1421115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242717
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31133	NC_009482	GGT	2	6	1421281	1421286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242717
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31135	NC_009482	GCC	2	6	1421320	1421325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242717
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31142	NC_009482	CTG	2	6	1421537	1421542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242717
31143	NC_009482	GC	3	6	1421671	1421676	0 %	0 %	50 %	50 %	148242717
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31152	NC_009482	GCC	2	6	1421852	1421857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242717
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31214	NC_009482	GAG	2	6	1425413	1425418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242723
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31217	NC_009482	TGA	2	6	1425556	1425561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242723
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31219	NC_009482	CCGT	2	8	1425667	1425674	0 %	25 %	25 %	50 %	148242724
31220	NC_009482	GCT	2	6	1425714	1425719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242724
31221	NC_009482	ATC	2	6	1425836	1425841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242725
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31223	NC_009482	TTC	2	6	1425908	1425913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242725
31224	NC_009482	ATG	2	6	1425946	1425951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242725
31225	NC_009482	CAC	2	6	1426019	1426024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242725
31226	NC_009482	ACA	2	6	1426034	1426039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242725
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31228	NC_009482	CCA	2	6	1426088	1426093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242725
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31230	NC_009482	CAC	2	6	1426154	1426159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242725
31231	NC_009482	GTG	2	6	1426329	1426334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242725
31232	NC_009482	GCT	2	6	1426401	1426406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242725
31233	NC_009482	TGG	2	6	1426453	1426458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242725
31234	NC_009482	TGG	2	6	1426462	1426467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242725
31235	NC_009482	CAC	2	6	1426548	1426553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242725
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31238	NC_009482	CAG	2	6	1426691	1426696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242726
31239	NC_009482	CGA	2	6	1426732	1426737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242726
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31254	NC_009482	GAG	2	6	1427474	1427479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242727
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31258	NC_009482	CAC	2	6	1427798	1427803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242727
31259	NC_009482	ACG	2	6	1427814	1427819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242727
31260	NC_009482	TTCCG	2	10	1427849	1427858	0 %	40 %	20 %	40 %	148242727
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31262	NC_009482	AGCG	2	8	1427954	1427961	25 %	0 %	50 %	25 %	148242727
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31267	NC_009482	GCTG	2	8	1428132	1428139	0 %	25 %	50 %	25 %	148242728
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31282	NC_009482	GCTG	2	8	1428668	1428675	0 %	25 %	50 %	25 %	148242728
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31330	NC_009482	GCG	2	6	1430817	1430822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242732
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31333	NC_009482	ACA	2	6	1430880	1430885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242732
31334	NC_009482	GTG	2	6	1430909	1430914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242732
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31338	NC_009482	TGA	2	6	1431165	1431170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242732
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31340	NC_009482	GCC	2	6	1431276	1431281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242733
31341	NC_009482	GT	3	6	1431283	1431288	0 %	50 %	50 %	0 %	148242733
31342	NC_009482	GCT	2	6	1431360	1431365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242733
31343	NC_009482	TGA	2	6	1431368	1431373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242733
31344	NC_009482	CAG	2	6	1431374	1431379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242733
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31346	NC_009482	AACC	2	8	1431395	1431402	50 %	0 %	0 %	50 %	148242733
31347	NC_009482	ACA	2	6	1431434	1431439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242733
31348	NC_009482	AGC	2	6	1431446	1431451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242733
31349	NC_009482	CTG	2	6	1431493	1431498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242733
31350	NC_009482	TGC	3	9	1431515	1431523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242733
31351	NC_009482	GCA	2	6	1431542	1431547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242733
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31353	NC_009482	GTC	2	6	1431733	1431738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242733
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31365	NC_009482	TGC	2	6	1432510	1432515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242734
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31460	NC_009482	AGC	2	6	1437426	1437431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242740
31461	NC_009482	GCC	2	6	1437532	1437537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242740
31462	NC_009482	GC	3	6	1437568	1437573	0 %	0 %	50 %	50 %	148242740
31463	NC_009482	GCT	2	6	1437590	1437595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242740
31464	NC_009482	GCT	2	6	1437618	1437623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242740
31465	NC_009482	CCA	2	6	1437633	1437638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242740
31466	NC_009482	AGC	2	6	1437685	1437690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242740
31467	NC_009482	T	6	6	1437705	1437710	0 %	100 %	0 %	0 %	148242740
31468	NC_009482	GTC	2	6	1437795	1437800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242740
31469	NC_009482	TGC	2	6	1437811	1437816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242740
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31471	NC_009482	GGT	2	6	1437946	1437951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242740
31472	NC_009482	CCAC	2	8	1437965	1437972	25 %	0 %	0 %	75 %	148242740
31473	NC_009482	CAA	2	6	1437978	1437983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242740
31474	NC_009482	GTT	2	6	1438000	1438005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242740
31475	NC_009482	TGC	2	6	1438028	1438033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242740
31476	NC_009482	CGG	3	9	1438131	1438139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242740
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31478	NC_009482	GCC	2	6	1438246	1438251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242740
31479	NC_009482	GGCTTC	2	12	1438266	1438277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242740
31480	NC_009482	GGC	2	6	1438329	1438334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242740
31481	NC_009482	GCG	3	9	1438373	1438381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242740
31482	NC_009482	CAA	3	9	1438397	1438405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242740
31483	NC_009482	GCT	2	6	1438406	1438411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242740
31484	NC_009482	AGCTG	2	10	1438425	1438434	20 %	20 %	40 %	20 %	148242740
31485	NC_009482	GCT	2	6	1438437	1438442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242740
31486	NC_009482	GCT	2	6	1438458	1438463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242740
31487	NC_009482	TGC	2	6	1438476	1438481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242740
31488	NC_009482	TCA	2	6	1438489	1438494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242740
31489	NC_009482	GCG	2	6	1438528	1438533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242740
31490	NC_009482	GCA	2	6	1438602	1438607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242741
31491	NC_009482	GC	3	6	1438694	1438699	0 %	0 %	50 %	50 %	148242741
31492	NC_009482	ATC	2	6	1438768	1438773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242741
31493	NC_009482	GCC	2	6	1438777	1438782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242741
31494	NC_009482	GCC	2	6	1438789	1438794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242741
31495	NC_009482	CAC	2	6	1438798	1438803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242741
31496	NC_009482	CAG	2	6	1438825	1438830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242741
31497	NC_009482	GCG	2	6	1438843	1438848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242741
31498	NC_009482	CTC	2	6	1438852	1438857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242741
31499	NC_009482	GGA	2	6	1438870	1438875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242741
31500	NC_009482	GTG	2	6	1438892	1438897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242741

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