MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009443	TCT	2	6	234896	234901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320089
4002	NC_009443	GAA	2	6	234909	234914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320089
4003	NC_009443	TCA	2	6	234931	234936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320089
4004	NC_009443	TC	3	6	235000	235005	0 %	50 %	0 %	50 %	146320090
4005	NC_009443	TTG	2	6	235006	235011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320090
4006	NC_009443	GTA	2	6	235030	235035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320090
4007	NC_009443	AAG	2	6	235118	235123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320090
4008	NC_009443	CAAT	2	8	235172	235179	50 %	25 %	0 %	25 %	146320091
4009	NC_009443	ATG	2	6	235317	235322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320091
4010	NC_009443	T	6	6	235376	235381	0 %	100 %	0 %	0 %	146320091
4011	NC_009443	GGA	2	6	235384	235389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320091
4012	NC_009443	GTCT	2	8	235527	235534	0 %	50 %	25 %	25 %	146320091
4013	NC_009443	CTAT	2	8	235554	235561	25 %	50 %	0 %	25 %	146320091
4014	NC_009443	AGG	2	6	235570	235575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320091
4015	NC_009443	TCC	2	6	235618	235623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320091
4016	NC_009443	GAGC	2	8	235754	235761	25 %	0 %	50 %	25 %	146320091
4017	NC_009443	CAA	2	6	236240	236245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320092
4018	NC_009443	AGC	2	6	236420	236425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320092
4019	NC_009443	TCG	2	6	236446	236451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320092
4020	NC_009443	TAC	2	6	236468	236473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320092
4021	NC_009443	GGT	2	6	236475	236480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320092
4022	NC_009443	TAG	2	6	236677	236682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320092
4023	NC_009443	CT	3	6	236683	236688	0 %	50 %	0 %	50 %	146320092
4024	NC_009443	CTT	2	6	236728	236733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320092
4025	NC_009443	TTGGA	2	10	236746	236755	20 %	40 %	40 %	0 %	146320092
4026	NC_009443	TAA	2	6	236773	236778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320092
4027	NC_009443	GTT	2	6	236799	236804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320092
4028	NC_009443	TGG	2	6	236807	236812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320092
4029	NC_009443	A	6	6	236818	236823	100 %	0 %	0 %	0 %	146320092
4030	NC_009443	CAG	2	6	236956	236961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320092
4031	NC_009443	CAA	2	6	236994	236999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320092
4032	NC_009443	TGC	3	9	237065	237073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320092
4033	NC_009443	ATC	2	6	237144	237149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320092
4034	NC_009443	CTC	2	6	237214	237219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320092
4035	NC_009443	GGT	2	6	237408	237413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320092
4036	NC_009443	CT	4	8	237496	237503	0 %	50 %	0 %	50 %	146320092
4037	NC_009443	ATC	2	6	237510	237515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320092
4038	NC_009443	AGA	2	6	237541	237546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320092
4039	NC_009443	ATGA	2	8	237616	237623	50 %	25 %	25 %	0 %	146320093
4040	NC_009443	TTA	2	6	237626	237631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320093
4041	NC_009443	CAG	2	6	237671	237676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320093
4042	NC_009443	TTG	2	6	237710	237715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320093
4043	NC_009443	AAG	2	6	237730	237735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320093
4044	NC_009443	CT	3	6	237771	237776	0 %	50 %	0 %	50 %	146320093
4045	NC_009443	GTC	2	6	237800	237805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320093
4046	NC_009443	AGA	2	6	237806	237811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320093
4047	NC_009443	GTC	2	6	237818	237823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320093
4048	NC_009443	TGG	2	6	237824	237829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320093
4049	NC_009443	CTACT	2	10	237847	237856	20 %	40 %	0 %	40 %	146320093
4050	NC_009443	TCT	2	6	237906	237911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320093
4051	NC_009443	TGGGC	2	10	237942	237951	0 %	20 %	60 %	20 %	146320093
4052	NC_009443	TC	3	6	237963	237968	0 %	50 %	0 %	50 %	146320093
4053	NC_009443	GTTAA	2	10	238027	238036	40 %	40 %	20 %	0 %	146320093
4054	NC_009443	AAC	2	6	238086	238091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320093
4055	NC_009443	GTG	2	6	238147	238152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320093
4056	NC_009443	AGA	2	6	238239	238244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320093
4057	NC_009443	GA	3	6	238254	238259	50 %	0 %	50 %	0 %	146320093
4058	NC_009443	ATC	2	6	238379	238384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320093
4059	NC_009443	TTTTAT	2	12	238605	238616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	146320094
4060	NC_009443	TGA	2	6	238674	238679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320094
4061	NC_009443	GTAACA	2	12	238741	238752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146320094
4062	NC_009443	CTA	2	6	238791	238796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320094
4063	NC_009443	TGT	2	6	238809	238814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320094
4064	NC_009443	TGA	2	6	238857	238862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320094
4065	NC_009443	ATG	2	6	238925	238930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320094
4066	NC_009443	GA	3	6	238958	238963	50 %	0 %	50 %	0 %	146320094
4067	NC_009443	AAAC	2	8	239000	239007	75 %	0 %	0 %	25 %	146320094
4068	NC_009443	CAG	2	6	239395	239400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320095
4069	NC_009443	ATG	2	6	239430	239435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320095
4070	NC_009443	CTT	2	6	239455	239460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320095
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4072	NC_009443	CA	3	6	239618	239623	50 %	0 %	0 %	50 %	146320095
4073	NC_009443	T	6	6	239634	239639	0 %	100 %	0 %	0 %	146320095
4074	NC_009443	GCA	2	6	239646	239651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320095
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4080	NC_009443	ACC	2	6	240035	240040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320095
4081	NC_009443	ACC	2	6	240125	240130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320095
4082	NC_009443	CAG	2	6	240145	240150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320095
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4084	NC_009443	ACC	2	6	240263	240268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320095
4085	NC_009443	TGAAC	2	10	240391	240400	40 %	20 %	20 %	20 %	146320095
4086	NC_009443	TGA	2	6	240460	240465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320095
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4093	NC_009443	GCA	2	6	240925	240930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320096
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4095	NC_009443	CG	3	6	241021	241026	0 %	0 %	50 %	50 %	146320096
4096	NC_009443	GGCTT	2	10	241096	241105	0 %	40 %	40 %	20 %	146320096
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4100	NC_009443	AGG	2	6	241322	241327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320096
4101	NC_009443	ACTT	2	8	241333	241340	25 %	50 %	0 %	25 %	146320096
4102	NC_009443	ACC	2	6	241365	241370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320096
4103	NC_009443	AGC	3	9	241398	241406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320096
4104	NC_009443	TCA	2	6	241490	241495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320096
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4106	NC_009443	TTG	2	6	241598	241603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320096
4107	NC_009443	TGG	2	6	241608	241613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320096
4108	NC_009443	AAC	2	6	241677	241682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320096
4109	NC_009443	AAGG	2	8	241690	241697	50 %	0 %	50 %	0 %	146320096
4110	NC_009443	CAT	2	6	241737	241742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320096
4111	NC_009443	GA	3	6	242142	242147	50 %	0 %	50 %	0 %	146320097
4112	NC_009443	T	6	6	242205	242210	0 %	100 %	0 %	0 %	146320097
4113	NC_009443	TAT	2	6	242228	242233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320097
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4115	NC_009443	CAT	2	6	242318	242323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320097
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4122	NC_009443	AGG	2	6	242773	242778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320097
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4126	NC_009443	GGA	2	6	242906	242911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320097
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4135	NC_009443	AG	3	6	243449	243454	50 %	0 %	50 %	0 %	146320098
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4229	NC_009443	TGGCA	2	10	248834	248843	20 %	20 %	40 %	20 %	146320103
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4239	NC_009443	CTCAG	2	10	249339	249348	20 %	20 %	20 %	40 %	146320103
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4241	NC_009443	GTC	2	6	249366	249371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320103
4242	NC_009443	AGA	2	6	249377	249382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320103
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4489	NC_009443	T	6	6	263134	263139	0 %	100 %	0 %	0 %	146320118
4490	NC_009443	TAT	2	6	263212	263217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320119
4491	NC_009443	AGC	2	6	263226	263231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320119
4492	NC_009443	GTA	2	6	263253	263258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320119
4493	NC_009443	AGT	2	6	263298	263303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320119
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4500	NC_009443	TAC	2	6	263706	263711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320120

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