MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009443	TCTAC	2	10	205954	205963	20 %	40 %	0 %	40 %	146320063
3502	NC_009443	TGA	2	6	206013	206018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320063
3503	NC_009443	TTG	2	6	206027	206032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320063
3504	NC_009443	GTT	2	6	206053	206058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320063
3505	NC_009443	CAA	2	6	206062	206067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320063
3506	NC_009443	ATT	2	6	206073	206078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320063
3507	NC_009443	TAC	2	6	206093	206098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320063
3508	NC_009443	AATGT	2	10	206101	206110	40 %	40 %	20 %	0 %	146320063
3509	NC_009443	ACTA	2	8	206316	206323	50 %	25 %	0 %	25 %	146320063
3510	NC_009443	TTGA	2	8	206344	206351	25 %	50 %	25 %	0 %	146320063
3511	NC_009443	A	6	6	206369	206374	100 %	0 %	0 %	0 %	146320063
3512	NC_009443	T	6	6	206379	206384	0 %	100 %	0 %	0 %	146320063
3513	NC_009443	A	7	7	206516	206522	100 %	0 %	0 %	0 %	146320063
3514	NC_009443	AT	3	6	206543	206548	50 %	50 %	0 %	0 %	146320063
3515	NC_009443	A	6	6	206579	206584	100 %	0 %	0 %	0 %	146320063
3516	NC_009443	AT	3	6	206627	206632	50 %	50 %	0 %	0 %	146320064
3517	NC_009443	GCA	2	6	206662	206667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320064
3518	NC_009443	TCTT	2	8	206684	206691	0 %	75 %	0 %	25 %	146320064
3519	NC_009443	CCT	2	6	206710	206715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320064
3520	NC_009443	AT	3	6	206756	206761	50 %	50 %	0 %	0 %	146320064
3521	NC_009443	AGG	2	6	206821	206826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320064
3522	NC_009443	ATTG	2	8	206840	206847	25 %	50 %	25 %	0 %	146320064
3523	NC_009443	GTT	2	6	206955	206960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320064
3524	NC_009443	ATTG	2	8	206990	206997	25 %	50 %	25 %	0 %	146320064
3525	NC_009443	TCGG	2	8	206999	207006	0 %	25 %	50 %	25 %	146320064
3526	NC_009443	GAAA	2	8	207040	207047	75 %	0 %	25 %	0 %	146320064
3527	NC_009443	CAG	2	6	207070	207075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320064
3528	NC_009443	GCTT	2	8	207089	207096	0 %	50 %	25 %	25 %	146320064
3529	NC_009443	ATT	2	6	207132	207137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320064
3530	NC_009443	TGT	2	6	207169	207174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320064
3531	NC_009443	A	7	7	207328	207334	100 %	0 %	0 %	0 %	146320064
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3533	NC_009443	GAAG	2	8	207401	207408	50 %	0 %	50 %	0 %	146320064
3534	NC_009443	ACA	2	6	207545	207550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320064
3535	NC_009443	A	7	7	207550	207556	100 %	0 %	0 %	0 %	146320064
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3537	NC_009443	TAG	2	6	207788	207793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320065
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3539	NC_009443	AAT	2	6	207816	207821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320065
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3541	NC_009443	A	8	8	207879	207886	100 %	0 %	0 %	0 %	146320065
3542	NC_009443	GATT	2	8	207965	207972	25 %	50 %	25 %	0 %	146320065
3543	NC_009443	TTA	2	6	208102	208107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320065
3544	NC_009443	GAA	2	6	208113	208118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320065
3545	NC_009443	TGG	2	6	208199	208204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320065
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3547	NC_009443	ATT	2	6	208363	208368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320065
3548	NC_009443	A	7	7	208404	208410	100 %	0 %	0 %	0 %	146320065
3549	NC_009443	CAT	2	6	208437	208442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320065
3550	NC_009443	TCTA	3	12	208521	208532	25 %	50 %	0 %	25 %	146320065
3551	NC_009443	ATTGCC	2	12	209060	209071	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320066
3552	NC_009443	TGC	2	6	209225	209230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320066
3553	NC_009443	ACCA	2	8	209268	209275	50 %	0 %	0 %	50 %	146320066
3554	NC_009443	TGA	2	6	209404	209409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320066
3555	NC_009443	AAG	2	6	209449	209454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320066
3556	NC_009443	ATA	2	6	209532	209537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320066
3557	NC_009443	TGA	2	6	209558	209563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320066
3558	NC_009443	A	7	7	209595	209601	100 %	0 %	0 %	0 %	146320066
3559	NC_009443	TCAA	2	8	209631	209638	50 %	25 %	0 %	25 %	146320066
3560	NC_009443	ATT	2	6	209696	209701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320066
3561	NC_009443	TGG	2	6	209706	209711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320066
3562	NC_009443	AAG	2	6	209712	209717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320066
3563	NC_009443	CAG	2	6	209763	209768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320066
3564	NC_009443	CTTG	2	8	209810	209817	0 %	50 %	25 %	25 %	146320067
3565	NC_009443	CTT	2	6	209821	209826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320067
3566	NC_009443	TGCC	2	8	209881	209888	0 %	25 %	25 %	50 %	146320068
3567	NC_009443	GT	3	6	209890	209895	0 %	50 %	50 %	0 %	146320068
3568	NC_009443	GACA	2	8	210055	210062	50 %	0 %	25 %	25 %	146320068
3569	NC_009443	CTA	2	6	210075	210080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320068
3570	NC_009443	GCA	2	6	210107	210112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320068
3571	NC_009443	CAG	2	6	210162	210167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320068
3572	NC_009443	GCCA	2	8	210191	210198	25 %	0 %	25 %	50 %	146320068
3573	NC_009443	AGCAG	2	10	210241	210250	40 %	0 %	40 %	20 %	146320068
3574	NC_009443	ATCT	2	8	210254	210261	25 %	50 %	0 %	25 %	146320068
3575	NC_009443	AGCC	2	8	210361	210368	25 %	0 %	25 %	50 %	146320068
3576	NC_009443	CATTGC	2	12	210388	210399	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146320068
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3580	NC_009443	AGC	2	6	210781	210786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320068
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3589	NC_009443	ACT	2	6	211004	211009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320069
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3591	NC_009443	T	6	6	211081	211086	0 %	100 %	0 %	0 %	146320069
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3594	NC_009443	TGGA	2	8	211328	211335	25 %	25 %	50 %	0 %	146320069
3595	NC_009443	AGGA	2	8	211444	211451	50 %	0 %	50 %	0 %	146320069
3596	NC_009443	ATGA	2	8	211510	211517	50 %	25 %	25 %	0 %	146320069
3597	NC_009443	CTGG	2	8	211801	211808	0 %	25 %	50 %	25 %	146320069
3598	NC_009443	ATC	2	6	211828	211833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320069
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3602	NC_009443	GAT	2	6	212026	212031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320069
3603	NC_009443	ATC	2	6	212050	212055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320069
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3605	NC_009443	TGG	2	6	212103	212108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320069
3606	NC_009443	ATTC	2	8	212127	212134	25 %	50 %	0 %	25 %	146320069
3607	NC_009443	AGG	2	6	212168	212173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320069
3608	NC_009443	TTC	2	6	212182	212187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320069
3609	NC_009443	GTT	2	6	212252	212257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320069
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3611	NC_009443	GA	3	6	212344	212349	50 %	0 %	50 %	0 %	146320069
3612	NC_009443	T	6	6	212414	212419	0 %	100 %	0 %	0 %	146320069
3613	NC_009443	TGT	2	6	212472	212477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320069
3614	NC_009443	CTT	2	6	212493	212498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320069
3615	NC_009443	GTC	2	6	212509	212514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320069
3616	NC_009443	CAG	2	6	212544	212549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320069
3617	NC_009443	CAG	2	6	212581	212586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320069
3618	NC_009443	ATGA	2	8	212650	212657	50 %	25 %	25 %	0 %	146320069
3619	NC_009443	AAT	2	6	212788	212793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320069
3620	NC_009443	T	6	6	212802	212807	0 %	100 %	0 %	0 %	146320069
3621	NC_009443	T	6	6	213015	213020	0 %	100 %	0 %	0 %	146320069
3622	NC_009443	GACCA	2	10	213070	213079	40 %	0 %	20 %	40 %	146320069
3623	NC_009443	TGC	2	6	213093	213098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320069
3624	NC_009443	GCT	2	6	213120	213125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320069
3625	NC_009443	TCT	2	6	213170	213175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320069
3626	NC_009443	AAT	2	6	213208	213213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320069
3627	NC_009443	TCA	2	6	213221	213226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320069
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3629	NC_009443	AAT	2	6	213292	213297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320069
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3637	NC_009443	CTGT	2	8	213972	213979	0 %	50 %	25 %	25 %	146320070
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3653	NC_009443	TCT	2	6	214543	214548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320071
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3659	NC_009443	T	7	7	214732	214738	0 %	100 %	0 %	0 %	146320071
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3730	NC_009443	T	7	7	220188	220194	0 %	100 %	0 %	0 %	146320075
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3739	NC_009443	CAAT	2	8	220598	220605	50 %	25 %	0 %	25 %	146320075
3740	NC_009443	GAT	2	6	220782	220787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320075
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3743	NC_009443	AGA	2	6	220853	220858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320075
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3989	NC_009443	TTATGG	2	12	234013	234024	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146320089
3990	NC_009443	TGG	2	6	234043	234048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320089
3991	NC_009443	TAT	2	6	234075	234080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320089
3992	NC_009443	CAG	2	6	234114	234119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320089
3993	NC_009443	GGA	2	6	234227	234232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320089
3994	NC_009443	ATT	2	6	234352	234357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320089
3995	NC_009443	AAG	2	6	234409	234414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320089
3996	NC_009443	A	6	6	234557	234562	100 %	0 %	0 %	0 %	146320089
3997	NC_009443	ATC	2	6	234586	234591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320089
3998	NC_009443	CTG	2	6	234667	234672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320089
3999	NC_009443	TGAA	2	8	234682	234689	50 %	25 %	25 %	0 %	146320089
4000	NC_009443	AGT	2	6	234780	234785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320089

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