MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_009443	CCG	2	6	1857750	1857755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146321809
32502	NC_009443	GCT	2	6	1857815	1857820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321809
32503	NC_009443	TCA	2	6	1857846	1857851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321809
32504	NC_009443	ACT	2	6	1857855	1857860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321809
32505	NC_009443	CAT	2	6	1857868	1857873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321809
32506	NC_009443	CGT	2	6	1857980	1857985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321809
32507	NC_009443	CAA	2	6	1858032	1858037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321809
32508	NC_009443	AAGA	2	8	1858211	1858218	75 %	0 %	25 %	0 %	146321809
32509	NC_009443	GAA	2	6	1858247	1858252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321809
32510	NC_009443	CTC	2	6	1858332	1858337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321809
32511	NC_009443	ACG	2	6	1858362	1858367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321809
32512	NC_009443	A	6	6	1858385	1858390	100 %	0 %	0 %	0 %	146321809
32513	NC_009443	AGA	2	6	1858474	1858479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321809
32514	NC_009443	TGGA	2	8	1858566	1858573	25 %	25 %	50 %	0 %	146321810
32515	NC_009443	CAA	2	6	1858580	1858585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321810
32516	NC_009443	A	7	7	1858584	1858590	100 %	0 %	0 %	0 %	146321810
32517	NC_009443	ATT	2	6	1858606	1858611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321810
32518	NC_009443	TGAG	2	8	1858612	1858619	25 %	25 %	50 %	0 %	146321810
32519	NC_009443	GGAGAT	2	12	1858635	1858646	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	146321810
32520	NC_009443	CTG	2	6	1858714	1858719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321810
32521	NC_009443	GGT	2	6	1858733	1858738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321810
32522	NC_009443	CT	3	6	1858780	1858785	0 %	50 %	0 %	50 %	146321810
32523	NC_009443	TGC	2	6	1859003	1859008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321810
32524	NC_009443	CG	3	6	1859019	1859024	0 %	0 %	50 %	50 %	146321810
32525	NC_009443	A	6	6	1859149	1859154	100 %	0 %	0 %	0 %	146321811
32526	NC_009443	ATC	2	6	1859168	1859173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321811
32527	NC_009443	AGA	2	6	1859227	1859232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321811
32528	NC_009443	CTG	2	6	1859286	1859291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321811
32529	NC_009443	CCT	2	6	1859296	1859301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321811
32530	NC_009443	TGC	2	6	1859344	1859349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321811
32531	NC_009443	ACAA	2	8	1859361	1859368	75 %	0 %	0 %	25 %	146321811
32532	NC_009443	GTC	2	6	1859390	1859395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321811
32533	NC_009443	CT	3	6	1859418	1859423	0 %	50 %	0 %	50 %	146321811
32534	NC_009443	CAAT	2	8	1859475	1859482	50 %	25 %	0 %	25 %	146321811
32535	NC_009443	AGG	2	6	1859487	1859492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146321811
32536	NC_009443	CT	3	6	1859573	1859578	0 %	50 %	0 %	50 %	146321812
32537	NC_009443	GGCT	2	8	1859600	1859607	0 %	25 %	50 %	25 %	146321812
32538	NC_009443	CATC	2	8	1859781	1859788	25 %	25 %	0 %	50 %	146321812
32539	NC_009443	CA	3	6	1859879	1859884	50 %	0 %	0 %	50 %	146321812
32540	NC_009443	ATC	2	6	1859981	1859986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321812
32541	NC_009443	CATG	2	8	1860076	1860083	25 %	25 %	25 %	25 %	146321812
32542	NC_009443	CTA	2	6	1860191	1860196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321812
32543	NC_009443	CGA	2	6	1860482	1860487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321813
32544	NC_009443	GCT	2	6	1860496	1860501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321813
32545	NC_009443	GTC	2	6	1860579	1860584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321813
32546	NC_009443	ACCA	2	8	1860606	1860613	50 %	0 %	0 %	50 %	146321813
32547	NC_009443	CGC	2	6	1860645	1860650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146321813
32548	NC_009443	GTT	2	6	1860773	1860778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321813
32549	NC_009443	CCTT	2	8	1860970	1860977	0 %	50 %	0 %	50 %	146321813
32550	NC_009443	TTC	2	6	1861075	1861080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321813
32551	NC_009443	AAT	2	6	1861104	1861109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321813
32552	NC_009443	CAT	2	6	1861232	1861237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321813
32553	NC_009443	CAA	2	6	1861253	1861258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321813
32554	NC_009443	CAA	2	6	1861265	1861270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321813
32555	NC_009443	TTC	2	6	1861314	1861319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321813
32556	NC_009443	AAG	2	6	1861330	1861335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321813
32557	NC_009443	GCA	2	6	1861336	1861341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321813
32558	NC_009443	TCG	2	6	1861345	1861350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321813
32559	NC_009443	TCT	2	6	1861387	1861392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321813
32560	NC_009443	CTG	2	6	1861403	1861408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321813
32561	NC_009443	CCAAG	2	10	1861500	1861509	40 %	0 %	20 %	40 %	146321813
32562	NC_009443	AAG	2	6	1861556	1861561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321813
32563	NC_009443	ACC	2	6	1861641	1861646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321813
32564	NC_009443	CAC	2	6	1861652	1861657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321813
32565	NC_009443	ATA	2	6	1861666	1861671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321813
32566	NC_009443	GCC	2	6	1861714	1861719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146321813
32567	NC_009443	TCA	2	6	1861828	1861833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321813
32568	NC_009443	TTC	2	6	1861917	1861922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321813
32569	NC_009443	GTC	2	6	1861977	1861982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321813
32570	NC_009443	CTC	2	6	1862073	1862078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321813
32571	NC_009443	T	6	6	1862089	1862094	0 %	100 %	0 %	0 %	146321813
32572	NC_009443	CAG	2	6	1862141	1862146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321813
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32577	NC_009443	TGGAAT	2	12	1862695	1862706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321814
32578	NC_009443	AAACC	2	10	1862760	1862769	60 %	0 %	0 %	40 %	146321814
32579	NC_009443	GCT	2	6	1862777	1862782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321814
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32581	NC_009443	C	6	6	1862813	1862818	0 %	0 %	0 %	100 %	146321814
32582	NC_009443	TTC	2	6	1862849	1862854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321814
32583	NC_009443	CTT	2	6	1862889	1862894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321814
32584	NC_009443	ACC	2	6	1862899	1862904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321814
32585	NC_009443	CAG	2	6	1862976	1862981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321814
32586	NC_009443	CAT	2	6	1863006	1863011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321814
32587	NC_009443	TGT	2	6	1863040	1863045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321814
32588	NC_009443	TGC	2	6	1863055	1863060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321814
32589	NC_009443	TAA	2	6	1863066	1863071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321814
32590	NC_009443	CTGT	2	8	1863092	1863099	0 %	50 %	25 %	25 %	146321814
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32592	NC_009443	CAC	2	6	1863159	1863164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321814
32593	NC_009443	TACT	2	8	1863174	1863181	25 %	50 %	0 %	25 %	146321814
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32599	NC_009443	CATT	2	8	1863456	1863463	25 %	50 %	0 %	25 %	146321814
32600	NC_009443	TTCA	2	8	1863523	1863530	25 %	50 %	0 %	25 %	146321814
32601	NC_009443	AAATAT	2	12	1863760	1863771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321814
32602	NC_009443	CCT	2	6	1863797	1863802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321815
32603	NC_009443	AAT	2	6	1863806	1863811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321815
32604	NC_009443	AAG	2	6	1863815	1863820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321815
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32607	NC_009443	CTA	2	6	1863933	1863938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321815
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32610	NC_009443	ACC	2	6	1864049	1864054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321815
32611	NC_009443	AGAA	2	8	1864057	1864064	75 %	0 %	25 %	0 %	146321815
32612	NC_009443	AAT	2	6	1864112	1864117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321815
32613	NC_009443	GAC	2	6	1864134	1864139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321815
32614	NC_009443	AGA	2	6	1864188	1864193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321815
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32616	NC_009443	ACA	2	6	1864274	1864279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321815
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32731	NC_009443	GTA	2	6	1871873	1871878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321820
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32842	NC_009443	TCG	2	6	1878340	1878345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321825
32843	NC_009443	TGA	2	6	1878397	1878402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321825
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