MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_009443	GCT	2	6	1655421	1655426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321615
29002	NC_009443	GCA	2	6	1655496	1655501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321615
29003	NC_009443	ACCGAT	2	12	1655540	1655551	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146321615
29004	NC_009443	CTT	2	6	1655590	1655595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321615
29005	NC_009443	CAT	2	6	1655603	1655608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321615
29006	NC_009443	TAG	2	6	1655620	1655625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321615
29007	NC_009443	GCA	2	6	1655715	1655720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321615
29008	NC_009443	CAG	3	9	1655752	1655760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321615
29009	NC_009443	ATG	2	6	1655821	1655826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321615
29010	NC_009443	AGA	2	6	1655910	1655915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321615
29011	NC_009443	AGA	2	6	1656001	1656006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321615
29012	NC_009443	AGTAG	2	10	1656025	1656034	40 %	20 %	40 %	0 %	146321615
29013	NC_009443	AAG	2	6	1656093	1656098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321615
29014	NC_009443	CAT	2	6	1656136	1656141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321615
29015	NC_009443	CGC	2	6	1656166	1656171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146321615
29016	NC_009443	TGC	2	6	1656179	1656184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321615
29017	NC_009443	AAT	2	6	1656185	1656190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321615
29018	NC_009443	CTGT	2	8	1656211	1656218	0 %	50 %	25 %	25 %	146321615
29019	NC_009443	GCT	2	6	1656222	1656227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321615
29020	NC_009443	TTC	2	6	1656260	1656265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321615
29021	NC_009443	TAGG	2	8	1656417	1656424	25 %	25 %	50 %	0 %	146321615
29022	NC_009443	GAC	2	6	1656430	1656435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321615
29023	NC_009443	TGA	2	6	1656437	1656442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321615
29024	NC_009443	TCT	2	6	1656456	1656461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321615
29025	NC_009443	T	6	6	1656503	1656508	0 %	100 %	0 %	0 %	146321615
29026	NC_009443	CAA	2	6	1656577	1656582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321615
29027	NC_009443	TCAA	2	8	1656642	1656649	50 %	25 %	0 %	25 %	146321615
29028	NC_009443	ATC	2	6	1656657	1656662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321615
29029	NC_009443	TCA	2	6	1656723	1656728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321615
29030	NC_009443	CTG	2	6	1656781	1656786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321615
29031	NC_009443	CAC	2	6	1656850	1656855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321615
29032	NC_009443	ACT	2	6	1656903	1656908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321615
29033	NC_009443	CAA	2	6	1656931	1656936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321615
29034	NC_009443	T	6	6	1656968	1656973	0 %	100 %	0 %	0 %	146321615
29035	NC_009443	ATCA	2	8	1657070	1657077	50 %	25 %	0 %	25 %	146321615
29036	NC_009443	GCT	2	6	1657128	1657133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321615
29037	NC_009443	TTCT	2	8	1657759	1657766	0 %	75 %	0 %	25 %	146321616
29038	NC_009443	TAC	2	6	1657775	1657780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321616
29039	NC_009443	GCT	2	6	1657832	1657837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321616
29040	NC_009443	ACCT	2	8	1657838	1657845	25 %	25 %	0 %	50 %	146321616
29041	NC_009443	ATC	2	6	1657875	1657880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321616
29042	NC_009443	AAAT	2	8	1657901	1657908	75 %	25 %	0 %	0 %	146321616
29043	NC_009443	T	7	7	1658147	1658153	0 %	100 %	0 %	0 %	146321617
29044	NC_009443	ATC	2	6	1658303	1658308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321617
29045	NC_009443	TG	3	6	1658332	1658337	0 %	50 %	50 %	0 %	146321617
29046	NC_009443	ATG	2	6	1658398	1658403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321617
29047	NC_009443	TGG	2	6	1658415	1658420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321617
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29050	NC_009443	TTTA	2	8	1658640	1658647	25 %	75 %	0 %	0 %	146321617
29051	NC_009443	CAT	2	6	1658712	1658717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321617
29052	NC_009443	AACAT	2	10	1658743	1658752	60 %	20 %	0 %	20 %	146321617
29053	NC_009443	ATT	2	6	1658764	1658769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321617
29054	NC_009443	GGTTT	2	10	1658790	1658799	0 %	60 %	40 %	0 %	146321617
29055	NC_009443	AAC	2	6	1658926	1658931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321617
29056	NC_009443	CTA	2	6	1658936	1658941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321617
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29058	NC_009443	GAT	2	6	1659072	1659077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321617
29059	NC_009443	CGG	2	6	1659105	1659110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146321617
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29062	NC_009443	ACTAT	2	10	1659538	1659547	40 %	40 %	0 %	20 %	146321618
29063	NC_009443	TAC	2	6	1659575	1659580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321618
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29065	NC_009443	TCGC	2	8	1659698	1659705	0 %	25 %	25 %	50 %	146321618
29066	NC_009443	GCA	2	6	1659714	1659719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321618
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29087	NC_009443	T	6	6	1661050	1661055	0 %	100 %	0 %	0 %	146321619
29088	NC_009443	T	6	6	1661139	1661144	0 %	100 %	0 %	0 %	146321619
29089	NC_009443	GCTT	2	8	1661227	1661234	0 %	50 %	25 %	25 %	146321619
29090	NC_009443	TAT	2	6	1661257	1661262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321619
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29103	NC_009443	CGC	2	6	1661770	1661775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146321619
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29105	NC_009443	CAT	2	6	1661812	1661817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321619
29106	NC_009443	A	6	6	1661825	1661830	100 %	0 %	0 %	0 %	146321619
29107	NC_009443	AGAAA	2	10	1661853	1661862	80 %	0 %	20 %	0 %	146321619
29108	NC_009443	AGCAT	2	10	1661931	1661940	40 %	20 %	20 %	20 %	146321620
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29112	NC_009443	CAA	2	6	1662221	1662226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321620
29113	NC_009443	T	6	6	1662239	1662244	0 %	100 %	0 %	0 %	146321620
29114	NC_009443	ATC	2	6	1662714	1662719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321621
29115	NC_009443	CAT	2	6	1662779	1662784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321621
29116	NC_009443	CGA	2	6	1662797	1662802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321621
29117	NC_009443	GCAC	2	8	1662823	1662830	25 %	0 %	25 %	50 %	146321621
29118	NC_009443	CGG	2	6	1662835	1662840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146321621
29119	NC_009443	CTC	2	6	1662855	1662860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321621
29120	NC_009443	GCT	2	6	1662868	1662873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321621
29121	NC_009443	CTC	3	9	1662885	1662893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321621
29122	NC_009443	CGAT	2	8	1662937	1662944	25 %	25 %	25 %	25 %	146321621
29123	NC_009443	CCT	2	6	1662965	1662970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321622
29124	NC_009443	AG	3	6	1663031	1663036	50 %	0 %	50 %	0 %	146321622
29125	NC_009443	GAA	2	6	1663089	1663094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321622
29126	NC_009443	TCT	2	6	1663147	1663152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321622
29127	NC_009443	GCA	3	9	1663174	1663182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321622
29128	NC_009443	GCTG	2	8	1663323	1663330	0 %	25 %	50 %	25 %	146321622
29129	NC_009443	CAT	2	6	1663404	1663409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321622
29130	NC_009443	GCTG	2	8	1663444	1663451	0 %	25 %	50 %	25 %	146321622
29131	NC_009443	CCAA	2	8	1663521	1663528	50 %	0 %	0 %	50 %	146321622
29132	NC_009443	ACG	2	6	1663563	1663568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321622
29133	NC_009443	GAA	2	6	1663614	1663619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321622
29134	NC_009443	AGG	2	6	1663624	1663629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146321622
29135	NC_009443	CTG	2	6	1663691	1663696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321622
29136	NC_009443	AGT	2	6	1663706	1663711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321622
29137	NC_009443	AAG	2	6	1663752	1663757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321622
29138	NC_009443	TCA	2	6	1663789	1663794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321622
29139	NC_009443	CCG	2	6	1663838	1663843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146321622
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29141	NC_009443	CCA	2	6	1664045	1664050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321622
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29143	NC_009443	TGG	2	6	1664164	1664169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321622
29144	NC_009443	CTT	2	6	1664192	1664197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321622
29145	NC_009443	TCA	2	6	1664284	1664289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321622
29146	NC_009443	CGA	2	6	1664336	1664341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321622
29147	NC_009443	AAG	2	6	1664479	1664484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321622
29148	NC_009443	TTG	2	6	1664551	1664556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321622
29149	NC_009443	GCTG	2	8	1664629	1664636	0 %	25 %	50 %	25 %	146321622
29150	NC_009443	GTC	2	6	1664704	1664709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321622
29151	NC_009443	CAG	2	6	1664735	1664740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321622
29152	NC_009443	TCT	2	6	1664774	1664779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321622
29153	NC_009443	TCT	2	6	1664797	1664802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321622
29154	NC_009443	CTG	2	6	1664814	1664819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321622
29155	NC_009443	GGCGT	2	10	1664852	1664861	0 %	20 %	60 %	20 %	146321622
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29157	NC_009443	CCAAG	2	10	1664972	1664981	40 %	0 %	20 %	40 %	146321622
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29169	NC_009443	CCCAG	2	10	1665529	1665538	20 %	0 %	20 %	60 %	146321623
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29172	NC_009443	TGG	2	6	1665684	1665689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321623
29173	NC_009443	CTG	2	6	1665730	1665735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321623
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29178	NC_009443	CTG	2	6	1666343	1666348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321624
29179	NC_009443	TGA	2	6	1666387	1666392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321624
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29184	NC_009443	ATA	2	6	1666644	1666649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321624
29185	NC_009443	TCGG	2	8	1666686	1666693	0 %	25 %	50 %	25 %	146321624
29186	NC_009443	TAG	2	6	1667009	1667014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321625
29187	NC_009443	TAC	2	6	1667027	1667032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321625
29188	NC_009443	TCT	2	6	1667085	1667090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321625
29189	NC_009443	ATC	2	6	1667201	1667206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321625
29190	NC_009443	ATT	2	6	1667237	1667242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321625
29191	NC_009443	TCA	2	6	1667247	1667252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321625
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29201	NC_009443	CTAT	2	8	1667865	1667872	25 %	50 %	0 %	25 %	146321626
29202	NC_009443	GAT	2	6	1667919	1667924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321626
29203	NC_009443	CAT	2	6	1667957	1667962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321626
29204	NC_009443	TAT	2	6	1667963	1667968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321626
29205	NC_009443	GTAG	2	8	1667972	1667979	25 %	25 %	50 %	0 %	146321626
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29207	NC_009443	GTC	2	6	1668067	1668072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321626
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29210	NC_009443	GCC	2	6	1668241	1668246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146321626
29211	NC_009443	CAA	2	6	1668266	1668271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321626
29212	NC_009443	GCC	2	6	1668295	1668300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146321626
29213	NC_009443	ATA	2	6	1668307	1668312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321626
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29216	NC_009443	CAC	2	6	1668651	1668656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321627
29217	NC_009443	CCGTAT	2	12	1668752	1668763	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146321627
29218	NC_009443	CTG	2	6	1668825	1668830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321627
29219	NC_009443	TCA	2	6	1668850	1668855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321627
29220	NC_009443	TGA	2	6	1668872	1668877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321627
29221	NC_009443	TTC	2	6	1668891	1668896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321627
29222	NC_009443	GA	3	6	1668905	1668910	50 %	0 %	50 %	0 %	146321627
29223	NC_009443	CTT	2	6	1668929	1668934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321627
29224	NC_009443	TTCA	2	8	1669032	1669039	25 %	50 %	0 %	25 %	146321627
29225	NC_009443	GTT	2	6	1669069	1669074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321627
29226	NC_009443	GTT	2	6	1669154	1669159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321627
29227	NC_009443	ACC	2	6	1669164	1669169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321627
29228	NC_009443	CAA	2	6	1669221	1669226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321627
29229	NC_009443	TCTT	2	8	1669240	1669247	0 %	75 %	0 %	25 %	146321627
29230	NC_009443	TCT	2	6	1669294	1669299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321627
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29465	NC_009443	TCT	2	6	1681704	1681709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321637
29466	NC_009443	ATC	2	6	1681781	1681786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321637
29467	NC_009443	TTC	2	6	1681787	1681792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321637
29468	NC_009443	CAT	2	6	1681804	1681809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321637
29469	NC_009443	TGG	2	6	1681882	1681887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321637
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29473	NC_009443	TGG	2	6	1682394	1682399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321638
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29492	NC_009443	A	6	6	1683816	1683821	100 %	0 %	0 %	0 %	146321639
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29494	NC_009443	AGA	2	6	1683985	1683990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321639
29495	NC_009443	TCG	2	6	1684000	1684005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321639
29496	NC_009443	TGC	2	6	1684027	1684032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321639
29497	NC_009443	TGGG	2	8	1684167	1684174	0 %	25 %	75 %	0 %	146321639
29498	NC_009443	TTG	2	6	1684273	1684278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321640
29499	NC_009443	ATCTT	2	10	1684283	1684292	20 %	60 %	0 %	20 %	146321640
29500	NC_009443	TGC	2	6	1684328	1684333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321640

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