MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_009443	ATCA	2	8	1540503	1540510	50 %	25 %	0 %	25 %	146321480
27003	NC_009443	CT	3	6	1540613	1540618	0 %	50 %	0 %	50 %	146321480
27004	NC_009443	TTG	2	6	1540685	1540690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321480
27005	NC_009443	CCA	2	6	1540718	1540723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321481
27006	NC_009443	CTGTG	2	10	1540746	1540755	0 %	40 %	40 %	20 %	146321481
27007	NC_009443	CAA	2	6	1540763	1540768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321481
27008	NC_009443	GAC	2	6	1540802	1540807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321481
27009	NC_009443	ATTA	2	8	1540845	1540852	50 %	50 %	0 %	0 %	146321481
27010	NC_009443	CCA	2	6	1540937	1540942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321481
27011	NC_009443	CTTG	2	8	1540968	1540975	0 %	50 %	25 %	25 %	146321481
27012	NC_009443	CCAA	2	8	1540982	1540989	50 %	0 %	0 %	50 %	146321481
27013	NC_009443	A	6	6	1541036	1541041	100 %	0 %	0 %	0 %	146321481
27014	NC_009443	CTTC	2	8	1541228	1541235	0 %	50 %	0 %	50 %	146321481
27015	NC_009443	CTTTG	2	10	1541334	1541343	0 %	60 %	20 %	20 %	146321481
27016	NC_009443	A	6	6	1541431	1541436	100 %	0 %	0 %	0 %	146321481
27017	NC_009443	TCAT	2	8	1541443	1541450	25 %	50 %	0 %	25 %	146321481
27018	NC_009443	CTG	2	6	1541749	1541754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321482
27019	NC_009443	ACC	2	6	1541795	1541800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321482
27020	NC_009443	ATC	2	6	1541938	1541943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321482
27021	NC_009443	GAC	2	6	1541949	1541954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321482
27022	NC_009443	ACG	2	6	1541978	1541983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321482
27023	NC_009443	TCC	2	6	1542223	1542228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321482
27024	NC_009443	GT	3	6	1542285	1542290	0 %	50 %	50 %	0 %	146321482
27025	NC_009443	ACC	2	6	1542352	1542357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321482
27026	NC_009443	ATA	2	6	1542416	1542421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321482
27027	NC_009443	CGT	2	6	1542424	1542429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321482
27028	NC_009443	AT	3	6	1542569	1542574	50 %	50 %	0 %	0 %	146321483
27029	NC_009443	AG	5	10	1542586	1542595	50 %	0 %	50 %	0 %	146321483
27030	NC_009443	TC	3	6	1542756	1542761	0 %	50 %	0 %	50 %	146321483
27031	NC_009443	GGT	2	6	1542926	1542931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321483
27032	NC_009443	TC	4	8	1542949	1542956	0 %	50 %	0 %	50 %	146321483
27033	NC_009443	AGCTGC	2	12	1542997	1543008	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146321483
27034	NC_009443	TGT	2	6	1543009	1543014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321483
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27039	NC_009443	CTT	2	6	1543279	1543284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321483
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27045	NC_009443	A	7	7	1543636	1543642	100 %	0 %	0 %	0 %	146321484
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27050	NC_009443	CTGG	2	8	1544143	1544150	0 %	25 %	50 %	25 %	146321485
27051	NC_009443	AACC	2	8	1544152	1544159	50 %	0 %	0 %	50 %	146321485
27052	NC_009443	CTT	2	6	1544303	1544308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321485
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27063	NC_009443	CGT	2	6	1545056	1545061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321485
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27085	NC_009443	T	7	7	1546685	1546691	0 %	100 %	0 %	0 %	146321488
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27226	NC_009443	AT	3	6	1554924	1554929	50 %	50 %	0 %	0 %	146321499
27227	NC_009443	AAAT	2	8	1555020	1555027	75 %	25 %	0 %	0 %	146321499
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27340	NC_009443	T	6	6	1563181	1563186	0 %	100 %	0 %	0 %	146321506
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27343	NC_009443	TAT	2	6	1563307	1563312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321506
27344	NC_009443	ATG	2	6	1563361	1563366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321507
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27346	NC_009443	T	6	6	1563477	1563482	0 %	100 %	0 %	0 %	146321507
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27348	NC_009443	ATG	2	6	1563580	1563585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321507
27349	NC_009443	ACC	2	6	1563636	1563641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321507
27350	NC_009443	T	6	6	1563686	1563691	0 %	100 %	0 %	0 %	146321507
27351	NC_009443	TCT	2	6	1563721	1563726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321507
27352	NC_009443	TGC	2	6	1563753	1563758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321507
27353	NC_009443	AGC	2	6	1563846	1563851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321507
27354	NC_009443	AAT	2	6	1563891	1563896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321507
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27357	NC_009443	AAC	2	6	1564062	1564067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321507
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27364	NC_009443	TCC	2	6	1564599	1564604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321508
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27383	NC_009443	TCT	2	6	1565443	1565448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321508
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27421	NC_009443	TGGT	2	8	1567715	1567722	0 %	50 %	50 %	0 %	146321511
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27468	NC_009443	AAC	2	6	1571036	1571041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321516
27469	NC_009443	CAA	2	6	1571049	1571054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321516
27470	NC_009443	GAT	2	6	1571058	1571063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321516
27471	NC_009443	CTA	2	6	1571162	1571167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321516
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27473	NC_009443	ACT	2	6	1571192	1571197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321516
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27475	NC_009443	TAA	2	6	1571242	1571247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321516
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27479	NC_009443	A	7	7	1571357	1571363	100 %	0 %	0 %	0 %	146321516
27480	NC_009443	CCT	2	6	1571376	1571381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321516
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27499	NC_009443	TCA	2	6	1572866	1572871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321517
27500	NC_009443	ATAA	2	8	1572883	1572890	75 %	25 %	0 %	0 %	146321517

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