MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_009443	GAG	2	6	1396284	1396289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146321314
24503	NC_009443	CGA	2	6	1396291	1396296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321314
24504	NC_009443	TCC	2	6	1396348	1396353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321314
24505	NC_009443	CCG	2	6	1396361	1396366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146321314
24506	NC_009443	TAT	2	6	1396400	1396405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321314
24507	NC_009443	GTC	2	6	1396408	1396413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321314
24508	NC_009443	CCT	2	6	1396445	1396450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321314
24509	NC_009443	AAC	2	6	1396487	1396492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321314
24510	NC_009443	GAA	2	6	1396506	1396511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321314
24511	NC_009443	TGAT	2	8	1396543	1396550	25 %	50 %	25 %	0 %	146321314
24512	NC_009443	CAG	2	6	1396552	1396557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321314
24513	NC_009443	GAC	2	6	1396572	1396577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321314
24514	NC_009443	A	6	6	1396585	1396590	100 %	0 %	0 %	0 %	146321314
24515	NC_009443	A	6	6	1396608	1396613	100 %	0 %	0 %	0 %	146321314
24516	NC_009443	GAG	2	6	1396620	1396625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146321314
24517	NC_009443	CAA	2	6	1396727	1396732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321314
24518	NC_009443	GACC	2	8	1396733	1396740	25 %	0 %	25 %	50 %	146321314
24519	NC_009443	GAA	2	6	1396824	1396829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321314
24520	NC_009443	A	6	6	1396828	1396833	100 %	0 %	0 %	0 %	146321314
24521	NC_009443	TCAA	2	8	1396834	1396841	50 %	25 %	0 %	25 %	146321314
24522	NC_009443	CTT	2	6	1396844	1396849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321314
24523	NC_009443	CTGGT	2	10	1396858	1396867	0 %	40 %	40 %	20 %	146321314
24524	NC_009443	ACCT	2	8	1396881	1396888	25 %	25 %	0 %	50 %	146321314
24525	NC_009443	TGC	2	6	1397036	1397041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321314
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24529	NC_009443	TGTCT	2	10	1397241	1397250	0 %	60 %	20 %	20 %	146321315
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24533	NC_009443	AAGA	2	8	1397778	1397785	75 %	0 %	25 %	0 %	146321315
24534	NC_009443	ATCT	2	8	1397859	1397866	25 %	50 %	0 %	25 %	146321315
24535	NC_009443	A	7	7	1397880	1397886	100 %	0 %	0 %	0 %	146321315
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24541	NC_009443	GCAA	2	8	1398209	1398216	50 %	0 %	25 %	25 %	146321315
24542	NC_009443	A	7	7	1398215	1398221	100 %	0 %	0 %	0 %	146321315
24543	NC_009443	TTA	2	6	1398791	1398796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321316
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24554	NC_009443	CTT	2	6	1399180	1399185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321316
24555	NC_009443	GCA	2	6	1399191	1399196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321316
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24617	NC_009443	AGA	2	6	1402454	1402459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321320
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24733	NC_009443	TTTC	2	8	1409777	1409784	0 %	75 %	0 %	25 %	146321328
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24852	NC_009443	CCT	2	6	1417054	1417059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321336
24853	NC_009443	TGGT	2	8	1417077	1417084	0 %	50 %	50 %	0 %	146321336
24854	NC_009443	TCA	2	6	1417089	1417094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321336
24855	NC_009443	GTT	3	9	1417106	1417114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321336
24856	NC_009443	GAG	2	6	1417133	1417138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146321336
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24863	NC_009443	GCA	2	6	1417497	1417502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321336
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24865	NC_009443	TGG	2	6	1417636	1417641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321336
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24966	NC_009443	TTG	2	6	1423015	1423020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321342
24967	NC_009443	T	7	7	1423033	1423039	0 %	100 %	0 %	0 %	146321342
24968	NC_009443	TCC	2	6	1423056	1423061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321342
24969	NC_009443	A	6	6	1423136	1423141	100 %	0 %	0 %	0 %	146321342
24970	NC_009443	T	6	6	1423210	1423215	0 %	100 %	0 %	0 %	146321342
24971	NC_009443	CCA	2	6	1423258	1423263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321342
24972	NC_009443	GCT	2	6	1423288	1423293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321342
24973	NC_009443	TAAA	2	8	1423313	1423320	75 %	25 %	0 %	0 %	146321342
24974	NC_009443	TTA	2	6	1423335	1423340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321342
24975	NC_009443	TGG	2	6	1423415	1423420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321342
24976	NC_009443	AAC	2	6	1423673	1423678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321343
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24980	NC_009443	GTGA	2	8	1423795	1423802	25 %	25 %	50 %	0 %	146321343
24981	NC_009443	TCAA	2	8	1423829	1423836	50 %	25 %	0 %	25 %	146321343
24982	NC_009443	CAA	2	6	1423936	1423941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321343
24983	NC_009443	ACC	2	6	1423960	1423965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321343
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24986	NC_009443	AGGGT	2	10	1424244	1424253	20 %	20 %	60 %	0 %	146321343
24987	NC_009443	TAA	2	6	1424310	1424315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321343
24988	NC_009443	TTC	2	6	1424362	1424367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321343
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24991	NC_009443	T	6	6	1424399	1424404	0 %	100 %	0 %	0 %	146321343
24992	NC_009443	CAA	2	6	1424409	1424414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321343
24993	NC_009443	ACC	2	6	1424542	1424547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321344
24994	NC_009443	ACA	2	6	1424578	1424583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321344
24995	NC_009443	CTT	2	6	1424696	1424701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321344
24996	NC_009443	GAT	2	6	1424730	1424735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321344
24997	NC_009443	GAA	2	6	1424853	1424858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321344
24998	NC_009443	CAC	2	6	1424874	1424879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321344
24999	NC_009443	ACCTAG	2	12	1424889	1424900	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146321344
25000	NC_009443	AGGA	2	8	1424928	1424935	50 %	0 %	50 %	0 %	146321344

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