MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_009443	GTTCA	2	10	1304435	1304444	20 %	40 %	20 %	20 %	146321226
23003	NC_009443	TAT	2	6	1304453	1304458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321226
23004	NC_009443	CCAT	2	8	1304492	1304499	25 %	25 %	0 %	50 %	146321226
23005	NC_009443	ATC	2	6	1304642	1304647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321226
23006	NC_009443	TTC	2	6	1304673	1304678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321226
23007	NC_009443	ACCA	2	8	1304687	1304694	50 %	0 %	0 %	50 %	146321226
23008	NC_009443	AGT	2	6	1304695	1304700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321226
23009	NC_009443	TTAA	2	8	1304705	1304712	50 %	50 %	0 %	0 %	146321226
23010	NC_009443	TGC	2	6	1304812	1304817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321226
23011	NC_009443	TCA	2	6	1304829	1304834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321226
23012	NC_009443	GAA	2	6	1304870	1304875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321226
23013	NC_009443	CAT	2	6	1305042	1305047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321227
23014	NC_009443	TCT	2	6	1305140	1305145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321227
23015	NC_009443	CTG	2	6	1305170	1305175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321227
23016	NC_009443	GTG	2	6	1305227	1305232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321227
23017	NC_009443	ATC	2	6	1305310	1305315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321227
23018	NC_009443	TGC	2	6	1305338	1305343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321227
23019	NC_009443	CAT	2	6	1305348	1305353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321227
23020	NC_009443	CT	3	6	1305476	1305481	0 %	50 %	0 %	50 %	146321227
23021	NC_009443	TTTA	2	8	1305643	1305650	25 %	75 %	0 %	0 %	146321228
23022	NC_009443	GCT	2	6	1305655	1305660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321228
23023	NC_009443	CGA	2	6	1305751	1305756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321228
23024	NC_009443	TCT	2	6	1305848	1305853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321228
23025	NC_009443	CCAA	2	8	1305971	1305978	50 %	0 %	0 %	50 %	146321228
23026	NC_009443	TCAA	2	8	1306003	1306010	50 %	25 %	0 %	25 %	146321228
23027	NC_009443	CTC	2	6	1306071	1306076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321228
23028	NC_009443	GCT	2	6	1306204	1306209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321228
23029	NC_009443	AGT	2	6	1306226	1306231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321228
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23031	NC_009443	T	6	6	1306398	1306403	0 %	100 %	0 %	0 %	146321228
23032	NC_009443	CTT	2	6	1306409	1306414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321228
23033	NC_009443	CGT	2	6	1306445	1306450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321228
23034	NC_009443	CAT	2	6	1306512	1306517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321228
23035	NC_009443	TGTGG	2	10	1306583	1306592	0 %	40 %	60 %	0 %	146321228
23036	NC_009443	GAA	2	6	1306607	1306612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321228
23037	NC_009443	TCT	2	6	1306654	1306659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321228
23038	NC_009443	TGG	2	6	1306710	1306715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321228
23039	NC_009443	ACG	2	6	1306776	1306781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321228
23040	NC_009443	CTT	2	6	1306826	1306831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321228
23041	NC_009443	GGT	2	6	1306871	1306876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321228
23042	NC_009443	TCTT	2	8	1306921	1306928	0 %	75 %	0 %	25 %	146321228
23043	NC_009443	CAT	2	6	1306959	1306964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321228
23044	NC_009443	TCA	2	6	1307107	1307112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321228
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23049	NC_009443	TAG	2	6	1307290	1307295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321228
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23051	NC_009443	CAAA	2	8	1307363	1307370	75 %	0 %	0 %	25 %	146321228
23052	NC_009443	GCT	2	6	1307374	1307379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321228
23053	NC_009443	TCG	2	6	1307404	1307409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321228
23054	NC_009443	AGT	2	6	1307457	1307462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321228
23055	NC_009443	TCAA	2	8	1307464	1307471	50 %	25 %	0 %	25 %	146321228
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23057	NC_009443	CT	3	6	1307524	1307529	0 %	50 %	0 %	50 %	146321228
23058	NC_009443	AGT	2	6	1307541	1307546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321228
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23064	NC_009443	CT	3	6	1307878	1307883	0 %	50 %	0 %	50 %	146321229
23065	NC_009443	ACG	2	6	1307890	1307895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321229
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23068	NC_009443	CAT	2	6	1307932	1307937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321229
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23083	NC_009443	ACT	3	9	1308661	1308669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321231
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23101	NC_009443	ATA	2	6	1309630	1309635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321231
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23103	NC_009443	A	7	7	1309710	1309716	100 %	0 %	0 %	0 %	146321231
23104	NC_009443	GTC	2	6	1309774	1309779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321231
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23106	NC_009443	CAATC	2	10	1309881	1309890	40 %	20 %	0 %	40 %	146321231
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23109	NC_009443	ATC	2	6	1310034	1310039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321232
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23111	NC_009443	TGA	2	6	1310116	1310121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321232
23112	NC_009443	AAC	2	6	1310139	1310144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321232
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23114	NC_009443	CGCTC	2	10	1310187	1310196	0 %	20 %	20 %	60 %	146321232
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23116	NC_009443	CAA	2	6	1310264	1310269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321232
23117	NC_009443	AT	3	6	1310278	1310283	50 %	50 %	0 %	0 %	146321232
23118	NC_009443	ATTG	2	8	1310301	1310308	25 %	50 %	25 %	0 %	146321232
23119	NC_009443	ACA	2	6	1310401	1310406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321232
23120	NC_009443	CTT	2	6	1310417	1310422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321232
23121	NC_009443	CTT	2	6	1310466	1310471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321232
23122	NC_009443	T	7	7	1310541	1310547	0 %	100 %	0 %	0 %	146321232
23123	NC_009443	TGA	2	6	1310564	1310569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321232
23124	NC_009443	TGCT	2	8	1310591	1310598	0 %	50 %	25 %	25 %	146321232
23125	NC_009443	CTTC	2	8	1310657	1310664	0 %	50 %	0 %	50 %	146321232
23126	NC_009443	CATG	2	8	1310675	1310682	25 %	25 %	25 %	25 %	146321232
23127	NC_009443	T	6	6	1310689	1310694	0 %	100 %	0 %	0 %	146321232
23128	NC_009443	ATGA	2	8	1310751	1310758	50 %	25 %	25 %	0 %	146321232
23129	NC_009443	CAG	2	6	1310772	1310777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321232
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23135	NC_009443	A	6	6	1311771	1311776	100 %	0 %	0 %	0 %	146321233
23136	NC_009443	TGG	2	6	1311891	1311896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321233
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23140	NC_009443	TAA	2	6	1312323	1312328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321233
23141	NC_009443	ATA	2	6	1312337	1312342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321233
23142	NC_009443	TAA	2	6	1312413	1312418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321233
23143	NC_009443	ATA	2	6	1312427	1312432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321233
23144	NC_009443	TAA	2	6	1312503	1312508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321233
23145	NC_009443	TAA	2	6	1312593	1312598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321233
23146	NC_009443	TAA	2	6	1312683	1312688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321233
23147	NC_009443	A	6	6	1312714	1312719	100 %	0 %	0 %	0 %	146321233
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23152	NC_009443	TAT	2	6	1312893	1312898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321233
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23154	NC_009443	TAA	2	6	1312939	1312944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321233
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23217	NC_009443	TC	3	6	1317290	1317295	0 %	50 %	0 %	50 %	146321237
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23220	NC_009443	ATC	2	6	1317430	1317435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321237
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23224	NC_009443	AT	3	6	1317759	1317764	50 %	50 %	0 %	0 %	146321237
23225	NC_009443	GAA	2	6	1317787	1317792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321237
23226	NC_009443	TGA	2	6	1317833	1317838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321237
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23230	NC_009443	TATG	2	8	1317928	1317935	25 %	50 %	25 %	0 %	146321237
23231	NC_009443	TGC	2	6	1317948	1317953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321237
23232	NC_009443	GAA	2	6	1317970	1317975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321237
23233	NC_009443	GAT	2	6	1317982	1317987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321237
23234	NC_009443	TTA	2	6	1318307	1318312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321238
23235	NC_009443	TTTCA	2	10	1318322	1318331	20 %	60 %	0 %	20 %	146321238
23236	NC_009443	CCTG	2	8	1318377	1318384	0 %	25 %	25 %	50 %	146321238
23237	NC_009443	CTT	2	6	1318402	1318407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321238
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23335	NC_009443	CTGA	2	8	1324728	1324735	25 %	25 %	25 %	25 %	146321242
23336	NC_009443	CCA	3	9	1324785	1324793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321242
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23340	NC_009443	CGA	2	6	1325069	1325074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321242
23341	NC_009443	CCA	2	6	1325076	1325081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321242
23342	NC_009443	TAA	2	6	1325184	1325189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321242
23343	NC_009443	TAT	2	6	1325227	1325232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321242
23344	NC_009443	GCC	2	6	1325258	1325263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146321242
23345	NC_009443	TGG	2	6	1325364	1325369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321242
23346	NC_009443	AAC	2	6	1325401	1325406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321242
23347	NC_009443	GCA	2	6	1325426	1325431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321242
23348	NC_009443	GTA	2	6	1325456	1325461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321242
23349	NC_009443	CTTA	2	8	1325521	1325528	25 %	50 %	0 %	25 %	146321242
23350	NC_009443	CCT	2	6	1325637	1325642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321242
23351	NC_009443	TTC	2	6	1325653	1325658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321242
23352	NC_009443	TCT	2	6	1325711	1325716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321242
23353	NC_009443	CCTG	2	8	1325783	1325790	0 %	25 %	25 %	50 %	146321242
23354	NC_009443	GTTTG	2	10	1325844	1325853	0 %	60 %	40 %	0 %	146321242
23355	NC_009443	TTGG	2	8	1325881	1325888	0 %	50 %	50 %	0 %	146321242
23356	NC_009443	CAA	2	6	1325956	1325961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321242
23357	NC_009443	CTT	2	6	1325988	1325993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321242
23358	NC_009443	CTTG	2	8	1326108	1326115	0 %	50 %	25 %	25 %	146321242
23359	NC_009443	CTG	2	6	1326127	1326132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321242
23360	NC_009443	TTC	2	6	1326223	1326228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321242
23361	NC_009443	T	6	6	1326242	1326247	0 %	100 %	0 %	0 %	146321242
23362	NC_009443	TTGGGC	2	12	1326253	1326264	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	146321242
23363	NC_009443	CTC	2	6	1326340	1326345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321242
23364	NC_009443	CTGAGC	2	12	1326385	1326396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146321242
23365	NC_009443	TCTG	2	8	1326422	1326429	0 %	50 %	25 %	25 %	146321242
23366	NC_009443	CTGA	2	8	1326435	1326442	25 %	25 %	25 %	25 %	146321242
23367	NC_009443	GTT	2	6	1326456	1326461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321242
23368	NC_009443	CAT	2	6	1326462	1326467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321242
23369	NC_009443	TCT	2	6	1326491	1326496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321242
23370	NC_009443	ATC	2	6	1326553	1326558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321242
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23372	NC_009443	CTG	2	6	1326681	1326686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321242
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23375	NC_009443	CAT	2	6	1327105	1327110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321242
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23384	NC_009443	TCG	2	6	1327723	1327728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321243
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23407	NC_009443	TTTTA	2	10	1329528	1329537	20 %	80 %	0 %	0 %	146321247
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23412	NC_009443	TCTGC	2	10	1329689	1329698	0 %	40 %	20 %	40 %	146321247
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23414	NC_009443	TCTG	2	8	1329766	1329773	0 %	50 %	25 %	25 %	146321247
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23417	NC_009443	TAG	2	6	1329860	1329865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321247
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23422	NC_009443	AAG	2	6	1330114	1330119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321247
23423	NC_009443	AG	3	6	1330139	1330144	50 %	0 %	50 %	0 %	146321247
23424	NC_009443	GAC	2	6	1330155	1330160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321247
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23433	NC_009443	CTT	2	6	1330664	1330669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321247
23434	NC_009443	GAA	2	6	1330679	1330684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321247
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23447	NC_009443	T	7	7	1331781	1331787	0 %	100 %	0 %	0 %	146321248
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23450	NC_009443	T	6	6	1331883	1331888	0 %	100 %	0 %	0 %	146321248
23451	NC_009443	ACT	2	6	1331920	1331925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321248
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23454	NC_009443	GACT	2	8	1331980	1331987	25 %	25 %	25 %	25 %	146321248
23455	NC_009443	TGA	2	6	1332015	1332020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321248
23456	NC_009443	TAC	2	6	1332047	1332052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321248
23457	NC_009443	TGA	2	6	1332054	1332059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321248
23458	NC_009443	GTT	2	6	1332064	1332069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321248
23459	NC_009443	GCT	2	6	1332070	1332075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321248
23460	NC_009443	CAT	2	6	1332087	1332092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321248
23461	NC_009443	CTG	2	6	1332128	1332133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321248
23462	NC_009443	TCT	2	6	1332184	1332189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321248
23463	NC_009443	AAG	2	6	1332350	1332355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321248
23464	NC_009443	CTA	2	6	1332475	1332480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321248
23465	NC_009443	TACCT	2	10	1332582	1332591	20 %	40 %	0 %	40 %	146321248
23466	NC_009443	CGA	2	6	1332670	1332675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321248
23467	NC_009443	CAT	2	6	1332837	1332842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321248
23468	NC_009443	CTT	2	6	1332866	1332871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321248
23469	NC_009443	AGTA	2	8	1332929	1332936	50 %	25 %	25 %	0 %	146321248
23470	NC_009443	TCT	2	6	1332958	1332963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321248
23471	NC_009443	TCA	2	6	1333066	1333071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321248
23472	NC_009443	AATT	2	8	1333083	1333090	50 %	50 %	0 %	0 %	146321248
23473	NC_009443	GAA	2	6	1333121	1333126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321248
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23475	NC_009443	C	6	6	1333156	1333161	0 %	0 %	0 %	100 %	146321248
23476	NC_009443	T	6	6	1333191	1333196	0 %	100 %	0 %	0 %	146321248
23477	NC_009443	AC	3	6	1333229	1333234	50 %	0 %	0 %	50 %	146321248
23478	NC_009443	GTG	2	6	1333331	1333336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321248
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23480	NC_009443	ATT	2	6	1333425	1333430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321248
23481	NC_009443	TGG	2	6	1333431	1333436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321248
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23483	NC_009443	T	6	6	1333789	1333794	0 %	100 %	0 %	0 %	146321249
23484	NC_009443	GTA	2	6	1333900	1333905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321249
23485	NC_009443	TCT	2	6	1333961	1333966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321249
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23488	NC_009443	ATA	2	6	1334030	1334035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321249
23489	NC_009443	CCCGCT	2	12	1334043	1334054	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	146321249
23490	NC_009443	TCT	2	6	1334150	1334155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321249
23491	NC_009443	CAG	2	6	1334205	1334210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321249
23492	NC_009443	CTG	2	6	1334224	1334229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321249
23493	NC_009443	TCT	2	6	1334357	1334362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321249
23494	NC_009443	CAT	2	6	1334448	1334453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321249
23495	NC_009443	ATC	2	6	1334491	1334496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321249
23496	NC_009443	TACC	2	8	1334550	1334557	25 %	25 %	0 %	50 %	146321249
23497	NC_009443	A	6	6	1334576	1334581	100 %	0 %	0 %	0 %	146321249
23498	NC_009443	TC	3	6	1334646	1334651	0 %	50 %	0 %	50 %	146321249
23499	NC_009443	ATA	2	6	1334753	1334758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321249
23500	NC_009443	ATCA	2	8	1334765	1334772	50 %	25 %	0 %	25 %	146321249

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