MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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22118	NC_009443	GAA	2	6	1254363	1254368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321174
22119	NC_009443	TAC	2	6	1254419	1254424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321174
22120	NC_009443	TTA	2	6	1254446	1254451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321174
22121	NC_009443	CAT	2	6	1254542	1254547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321174
22122	NC_009443	CT	3	6	1254601	1254606	0 %	50 %	0 %	50 %	146321174
22123	NC_009443	AAG	2	6	1254609	1254614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321174
22124	NC_009443	TGC	2	6	1254701	1254706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321174
22125	NC_009443	ATC	2	6	1254819	1254824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321174
22126	NC_009443	GGT	2	6	1254828	1254833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321174
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22128	NC_009443	TGG	2	6	1254899	1254904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321174
22129	NC_009443	TAT	2	6	1254929	1254934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321174
22130	NC_009443	TGA	2	6	1254935	1254940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321174
22131	NC_009443	ATT	2	6	1255057	1255062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321174
22132	NC_009443	TGG	2	6	1255074	1255079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321174
22133	NC_009443	CAA	2	6	1255165	1255170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321174
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22137	NC_009443	ACT	2	6	1255318	1255323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321175
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22142	NC_009443	TA	3	6	1255390	1255395	50 %	50 %	0 %	0 %	146321175
22143	NC_009443	TAAAT	2	10	1255508	1255517	60 %	40 %	0 %	0 %	146321176
22144	NC_009443	AGT	2	6	1255531	1255536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321176
22145	NC_009443	AG	3	6	1255552	1255557	50 %	0 %	50 %	0 %	146321176
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22148	NC_009443	TCT	2	6	1255633	1255638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321176
22149	NC_009443	GCA	2	6	1255657	1255662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321176
22150	NC_009443	CT	3	6	1255677	1255682	0 %	50 %	0 %	50 %	146321176
22151	NC_009443	CTA	2	6	1255915	1255920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321176
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22153	NC_009443	CTG	2	6	1255973	1255978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321176
22154	NC_009443	ATC	2	6	1255997	1256002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321176
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22175	NC_009443	TA	4	8	1257203	1257210	50 %	50 %	0 %	0 %	146321178
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22184	NC_009443	GCT	2	6	1257610	1257615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321178
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22188	NC_009443	TTC	2	6	1257828	1257833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321179
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22202	NC_009443	ATG	2	6	1258630	1258635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321179
22203	NC_009443	CCAA	2	8	1258642	1258649	50 %	0 %	0 %	50 %	146321179
22204	NC_009443	TTG	2	6	1258810	1258815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321179
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22206	NC_009443	TCTG	2	8	1258993	1259000	0 %	50 %	25 %	25 %	146321179
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22211	NC_009443	ATCCT	2	10	1259084	1259093	20 %	40 %	0 %	40 %	146321180
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22215	NC_009443	CTT	2	6	1259202	1259207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321180
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22221	NC_009443	T	6	6	1259440	1259445	0 %	100 %	0 %	0 %	146321180
22222	NC_009443	CCTG	2	8	1259498	1259505	0 %	25 %	25 %	50 %	146321180
22223	NC_009443	GCCC	2	8	1259586	1259593	0 %	0 %	25 %	75 %	146321180
22224	NC_009443	CAAG	2	8	1259607	1259614	50 %	0 %	25 %	25 %	146321180
22225	NC_009443	CCCA	2	8	1259635	1259642	25 %	0 %	0 %	75 %	146321180
22226	NC_009443	ATA	2	6	1259645	1259650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321180
22227	NC_009443	ATCA	2	8	1259743	1259750	50 %	25 %	0 %	25 %	146321180
22228	NC_009443	TGA	2	6	1259753	1259758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321180
22229	NC_009443	GCA	2	6	1259762	1259767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321180
22230	NC_009443	T	6	6	1259957	1259962	0 %	100 %	0 %	0 %	146321181
22231	NC_009443	TAT	2	6	1259973	1259978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321181
22232	NC_009443	TTCT	2	8	1260040	1260047	0 %	75 %	0 %	25 %	146321181
22233	NC_009443	GCA	2	6	1260060	1260065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321181
22234	NC_009443	AGA	2	6	1260104	1260109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321181
22235	NC_009443	AAAG	2	8	1260110	1260117	75 %	0 %	25 %	0 %	146321181
22236	NC_009443	A	6	6	1260141	1260146	100 %	0 %	0 %	0 %	146321181
22237	NC_009443	GCT	2	6	1260147	1260152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321181
22238	NC_009443	ATA	2	6	1260280	1260285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321182
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22241	NC_009443	TGC	2	6	1260408	1260413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321182
22242	NC_009443	CAT	2	6	1260495	1260500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321182
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22246	NC_009443	TAG	2	6	1260787	1260792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321182
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22332	NC_009443	ATC	2	6	1266342	1266347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321188
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22337	NC_009443	TCGC	2	8	1266553	1266560	0 %	25 %	25 %	50 %	146321188
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22341	NC_009443	CTTG	2	8	1266739	1266746	0 %	50 %	25 %	25 %	146321188
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22343	NC_009443	GTCA	2	8	1266980	1266987	25 %	25 %	25 %	25 %	146321188
22344	NC_009443	TAA	2	6	1267010	1267015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321188
22345	NC_009443	TCAT	2	8	1267017	1267024	25 %	50 %	0 %	25 %	146321188
22346	NC_009443	TCT	2	6	1267030	1267035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321188
22347	NC_009443	C	6	6	1267071	1267076	0 %	0 %	0 %	100 %	146321188
22348	NC_009443	CAA	2	6	1267165	1267170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321189
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22464	NC_009443	TTC	2	6	1273322	1273327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321196
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22466	NC_009443	AGA	2	6	1273817	1273822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321197
22467	NC_009443	T	7	7	1273829	1273835	0 %	100 %	0 %	0 %	146321197
22468	NC_009443	ATC	2	6	1273845	1273850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321197
22469	NC_009443	TGA	2	6	1273991	1273996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321197
22470	NC_009443	T	6	6	1274019	1274024	0 %	100 %	0 %	0 %	146321197
22471	NC_009443	T	7	7	1274044	1274050	0 %	100 %	0 %	0 %	146321197
22472	NC_009443	ATG	2	6	1274142	1274147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321197
22473	NC_009443	ATT	2	6	1274164	1274169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321197
22474	NC_009443	GCT	2	6	1274223	1274228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321198
22475	NC_009443	CGT	2	6	1274277	1274282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321198
22476	NC_009443	TCC	2	6	1274351	1274356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321198
22477	NC_009443	TCA	2	6	1274415	1274420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321198
22478	NC_009443	ATCTGC	2	12	1274423	1274434	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146321198
22479	NC_009443	CAT	3	9	1274467	1274475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321198
22480	NC_009443	TCA	2	6	1274514	1274519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321198
22481	NC_009443	CTGT	2	8	1274589	1274596	0 %	50 %	25 %	25 %	146321198
22482	NC_009443	CTG	2	6	1274701	1274706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321198
22483	NC_009443	AAT	2	6	1274729	1274734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321198
22484	NC_009443	CAT	2	6	1274762	1274767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321198
22485	NC_009443	TCT	2	6	1274823	1274828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321198
22486	NC_009443	TTC	2	6	1274843	1274848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321198
22487	NC_009443	AAC	2	6	1274895	1274900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321198
22488	NC_009443	ACT	2	6	1274925	1274930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321198
22489	NC_009443	AGC	2	6	1274945	1274950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321198
22490	NC_009443	ATC	2	6	1275030	1275035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321198
22491	NC_009443	AACTT	2	10	1275039	1275048	40 %	40 %	0 %	20 %	146321198
22492	NC_009443	GAT	2	6	1275080	1275085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321198
22493	NC_009443	CCA	2	6	1275127	1275132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321198
22494	NC_009443	ACGG	2	8	1275164	1275171	25 %	0 %	50 %	25 %	146321198
22495	NC_009443	ATC	2	6	1275356	1275361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321198
22496	NC_009443	CTG	2	6	1275397	1275402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321198
22497	NC_009443	GCTC	2	8	1275441	1275448	0 %	25 %	25 %	50 %	146321198
22498	NC_009443	ACT	2	6	1275450	1275455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321198
22499	NC_009443	TCT	2	6	1275483	1275488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321198
22500	NC_009443	GACT	2	8	1275528	1275535	25 %	25 %	25 %	25 %	146321198

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