MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19505	NC_009443	TGA	2	6	1117388	1117393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321035
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19508	NC_009443	TG	3	6	1117665	1117670	0 %	50 %	50 %	0 %	146321035
19509	NC_009443	AGA	2	6	1117695	1117700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321035
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19511	NC_009443	TCAT	2	8	1117782	1117789	25 %	50 %	0 %	25 %	146321035
19512	NC_009443	T	6	6	1117810	1117815	0 %	100 %	0 %	0 %	146321035
19513	NC_009443	ACC	2	6	1117898	1117903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321035
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19520	NC_009443	TA	3	6	1118329	1118334	50 %	50 %	0 %	0 %	146321035
19521	NC_009443	GTT	2	6	1118345	1118350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321035
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19617	NC_009443	GAA	2	6	1122710	1122715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321042
19618	NC_009443	CCA	2	6	1122808	1122813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321042
19619	NC_009443	TCA	2	6	1123027	1123032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321043
19620	NC_009443	TTC	2	6	1123044	1123049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321043
19621	NC_009443	TCT	2	6	1123069	1123074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321043
19622	NC_009443	CCA	2	6	1123183	1123188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321043
19623	NC_009443	CCA	2	6	1123294	1123299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321043
19624	NC_009443	CAT	2	6	1123373	1123378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321043
19625	NC_009443	AATTG	2	10	1123416	1123425	40 %	40 %	20 %	0 %	146321043
19626	NC_009443	CAA	2	6	1123433	1123438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321043
19627	NC_009443	TCA	2	6	1123471	1123476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321043
19628	NC_009443	TAC	2	6	1123530	1123535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321043
19629	NC_009443	GCA	2	6	1123609	1123614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321043
19630	NC_009443	AAT	2	6	1123625	1123630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321043
19631	NC_009443	TGA	2	6	1123636	1123641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321043
19632	NC_009443	T	7	7	1123648	1123654	0 %	100 %	0 %	0 %	146321043
19633	NC_009443	CTG	2	6	1123689	1123694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321043
19634	NC_009443	GCT	2	6	1123711	1123716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321043
19635	NC_009443	TGG	2	6	1123763	1123768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321043
19636	NC_009443	ATG	2	6	1123780	1123785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321043
19637	NC_009443	GAC	2	6	1123824	1123829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321043
19638	NC_009443	ATTG	2	8	1123833	1123840	25 %	50 %	25 %	0 %	146321043
19639	NC_009443	CCA	2	6	1123849	1123854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321043
19640	NC_009443	CAG	2	6	1123922	1123927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321043
19641	NC_009443	TTC	2	6	1123993	1123998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321043
19642	NC_009443	TA	3	6	1124024	1124029	50 %	50 %	0 %	0 %	146321043
19643	NC_009443	TCTT	2	8	1124046	1124053	0 %	75 %	0 %	25 %	146321043
19644	NC_009443	CT	3	6	1124075	1124080	0 %	50 %	0 %	50 %	146321044
19645	NC_009443	CTGC	2	8	1124135	1124142	0 %	25 %	25 %	50 %	146321044
19646	NC_009443	T	7	7	1124169	1124175	0 %	100 %	0 %	0 %	146321044
19647	NC_009443	TTTGGC	2	12	1124215	1124226	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	146321044
19648	NC_009443	TTCGT	2	10	1124227	1124236	0 %	60 %	20 %	20 %	146321044
19649	NC_009443	CAGT	2	8	1124256	1124263	25 %	25 %	25 %	25 %	146321044
19650	NC_009443	GCA	2	6	1124285	1124290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321044
19651	NC_009443	CTA	2	6	1124298	1124303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321044
19652	NC_009443	GTT	2	6	1124355	1124360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321044
19653	NC_009443	A	7	7	1124377	1124383	100 %	0 %	0 %	0 %	146321044
19654	NC_009443	CTT	2	6	1124436	1124441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321044
19655	NC_009443	CTA	2	6	1124481	1124486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321044
19656	NC_009443	TAC	2	6	1124502	1124507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321044
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19658	NC_009443	CTG	2	6	1124544	1124549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321044
19659	NC_009443	TCA	2	6	1124627	1124632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321044
19660	NC_009443	TCA	2	6	1124757	1124762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321044
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19662	NC_009443	CTG	2	6	1124904	1124909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321044
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19665	NC_009443	TTC	2	6	1125166	1125171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321044
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19669	NC_009443	T	6	6	1125246	1125251	0 %	100 %	0 %	0 %	146321044
19670	NC_009443	TCA	2	6	1125269	1125274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321044
19671	NC_009443	TGGT	2	8	1125299	1125306	0 %	50 %	50 %	0 %	146321044
19672	NC_009443	TGAC	2	8	1125343	1125350	25 %	25 %	25 %	25 %	146321044
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19674	NC_009443	CTG	3	9	1125441	1125449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321044
19675	NC_009443	CCT	2	6	1125483	1125488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321044
19676	NC_009443	TGTT	2	8	1125494	1125501	0 %	75 %	25 %	0 %	146321044
19677	NC_009443	CAC	2	6	1125633	1125638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321044
19678	NC_009443	AGAC	2	8	1125685	1125692	50 %	0 %	25 %	25 %	146321044
19679	NC_009443	CCCGA	2	10	1125847	1125856	20 %	0 %	20 %	60 %	146321044
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19681	NC_009443	ATA	2	6	1125967	1125972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321044
19682	NC_009443	ATTG	2	8	1125984	1125991	25 %	50 %	25 %	0 %	146321044
19683	NC_009443	CTAA	2	8	1125998	1126005	50 %	25 %	0 %	25 %	146321044
19684	NC_009443	GAT	2	6	1126173	1126178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321045
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19686	NC_009443	GAA	2	6	1126221	1126226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321045
19687	NC_009443	AAC	2	6	1126269	1126274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321045
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19689	NC_009443	TACC	2	8	1126316	1126323	25 %	25 %	0 %	50 %	146321046
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19693	NC_009443	CTG	2	6	1126574	1126579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321046
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19698	NC_009443	T	6	6	1126840	1126845	0 %	100 %	0 %	0 %	146321046
19699	NC_009443	TGA	2	6	1126958	1126963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321046
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19704	NC_009443	ATT	2	6	1127111	1127116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321046
19705	NC_009443	GTA	2	6	1127194	1127199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321046
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19712	NC_009443	GATA	2	8	1127634	1127641	50 %	25 %	25 %	0 %	146321047
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19715	NC_009443	TAT	2	6	1127804	1127809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321047
19716	NC_009443	CT	3	6	1127844	1127849	0 %	50 %	0 %	50 %	146321047
19717	NC_009443	CA	3	6	1127919	1127924	50 %	0 %	0 %	50 %	146321047
19718	NC_009443	AGC	2	6	1127977	1127982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321047
19719	NC_009443	TAA	2	6	1128012	1128017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321047
19720	NC_009443	TCA	2	6	1128097	1128102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321048
19721	NC_009443	ATCC	2	8	1128158	1128165	25 %	25 %	0 %	50 %	146321048
19722	NC_009443	AGGC	2	8	1128182	1128189	25 %	0 %	50 %	25 %	146321048
19723	NC_009443	T	6	6	1128247	1128252	0 %	100 %	0 %	0 %	146321048
19724	NC_009443	AC	3	6	1128290	1128295	50 %	0 %	0 %	50 %	146321048
19725	NC_009443	CTA	2	6	1128327	1128332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321048
19726	NC_009443	GAC	2	6	1128388	1128393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321048
19727	NC_009443	TG	3	6	1128395	1128400	0 %	50 %	50 %	0 %	146321048
19728	NC_009443	AATAC	2	10	1128404	1128413	60 %	20 %	0 %	20 %	146321048
19729	NC_009443	CAA	2	6	1128420	1128425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321048
19730	NC_009443	TCT	2	6	1128428	1128433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321048
19731	NC_009443	CT	3	6	1128436	1128441	0 %	50 %	0 %	50 %	146321048
19732	NC_009443	ATG	2	6	1128572	1128577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321048
19733	NC_009443	GCA	2	6	1128583	1128588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321048
19734	NC_009443	CTA	2	6	1128765	1128770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321048
19735	NC_009443	AGCC	2	8	1128845	1128852	25 %	0 %	25 %	50 %	146321048
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19738	NC_009443	GCA	2	6	1128958	1128963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321048
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19745	NC_009443	CT	3	6	1129231	1129236	0 %	50 %	0 %	50 %	146321048
19746	NC_009443	CTA	2	6	1129370	1129375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321048
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19761	NC_009443	GTT	2	6	1130437	1130442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321049
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19773	NC_009443	TGA	2	6	1131319	1131324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321051
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19847	NC_009443	TTC	2	6	1134855	1134860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321054
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19849	NC_009443	TCTG	2	8	1134973	1134980	0 %	50 %	25 %	25 %	146321054
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