MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19003	NC_009443	TC	3	6	1089589	1089594	0 %	50 %	0 %	50 %	146321001
19004	NC_009443	GCTG	2	8	1089659	1089666	0 %	25 %	50 %	25 %	146321001
19005	NC_009443	TGGA	2	8	1089729	1089736	25 %	25 %	50 %	0 %	146321001
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19009	NC_009443	ATG	2	6	1090131	1090136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321001
19010	NC_009443	GTG	2	6	1090150	1090155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321001
19011	NC_009443	T	6	6	1090176	1090181	0 %	100 %	0 %	0 %	146321001
19012	NC_009443	AATA	2	8	1090189	1090196	75 %	25 %	0 %	0 %	146321001
19013	NC_009443	TCTAT	2	10	1090256	1090265	20 %	60 %	0 %	20 %	146321002
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19015	NC_009443	GCAA	2	8	1090334	1090341	50 %	0 %	25 %	25 %	146321003
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19119	NC_009443	ATT	2	6	1096429	1096434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321013
19120	NC_009443	CTG	2	6	1096470	1096475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321013
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19228	NC_009443	ACC	2	6	1102328	1102333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321017
19229	NC_009443	CAA	2	6	1102355	1102360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321017
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19231	NC_009443	CTT	2	6	1102441	1102446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321017
19232	NC_009443	CTT	3	9	1102489	1102497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321017
19233	NC_009443	GAC	3	9	1102516	1102524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321017
19234	NC_009443	ACG	2	6	1102568	1102573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321017
19235	NC_009443	CAT	2	6	1102579	1102584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321017
19236	NC_009443	CTT	2	6	1102621	1102626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321017
19237	NC_009443	TCT	3	9	1102641	1102649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321017
19238	NC_009443	GAA	2	6	1102658	1102663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321017
19239	NC_009443	ACG	2	6	1102709	1102714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321017
19240	NC_009443	TTTC	2	8	1102861	1102868	0 %	75 %	0 %	25 %	146321017
19241	NC_009443	AATG	2	8	1102882	1102889	50 %	25 %	25 %	0 %	146321017
19242	NC_009443	ATA	2	6	1102899	1102904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321017
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19245	NC_009443	TCGT	2	8	1103006	1103013	0 %	50 %	25 %	25 %	146321017
19246	NC_009443	GATTG	2	10	1103138	1103147	20 %	40 %	40 %	0 %	146321017
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19252	NC_009443	CAG	2	6	1103422	1103427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321017
19253	NC_009443	TCT	2	6	1103463	1103468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321017
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19334	NC_009443	GTTGCA	2	12	1108092	1108103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146321022
19335	NC_009443	TCA	2	6	1108222	1108227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321022
19336	NC_009443	ATC	2	6	1108256	1108261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321022
19337	NC_009443	CTC	2	6	1108268	1108273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321022
19338	NC_009443	GCGA	2	8	1108355	1108362	25 %	0 %	50 %	25 %	146321022
19339	NC_009443	TCT	2	6	1108374	1108379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321022
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19342	NC_009443	TGC	2	6	1108660	1108665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321023
19343	NC_009443	GATT	2	8	1108770	1108777	25 %	50 %	25 %	0 %	146321024
19344	NC_009443	CAGC	2	8	1108822	1108829	25 %	0 %	25 %	50 %	146321024
19345	NC_009443	CAG	2	6	1108872	1108877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321025
19346	NC_009443	TCT	2	6	1108907	1108912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321025
19347	NC_009443	CAAA	2	8	1108989	1108996	75 %	0 %	0 %	25 %	146321025
19348	NC_009443	GTC	2	6	1109000	1109005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321025
19349	NC_009443	TCC	2	6	1109053	1109058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321025
19350	NC_009443	T	6	6	1109059	1109064	0 %	100 %	0 %	0 %	146321025
19351	NC_009443	TCC	2	6	1109283	1109288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321025
19352	NC_009443	GTA	2	6	1109527	1109532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321026
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19457	NC_009443	CTA	2	6	1114967	1114972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321032
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19459	NC_009443	TCT	2	6	1115021	1115026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321032
19460	NC_009443	AGC	2	6	1115056	1115061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321033
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19463	NC_009443	TGA	2	6	1115217	1115222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321033
19464	NC_009443	ATCC	2	8	1115254	1115261	25 %	25 %	0 %	50 %	146321033
19465	NC_009443	TTC	2	6	1115269	1115274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321033
19466	NC_009443	CGAA	2	8	1115428	1115435	50 %	0 %	25 %	25 %	146321033
19467	NC_009443	CTT	2	6	1115451	1115456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321033
19468	NC_009443	CCA	2	6	1115540	1115545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321033
19469	NC_009443	CCA	2	6	1115559	1115564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321033
19470	NC_009443	CAC	2	6	1115593	1115598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321033
19471	NC_009443	TTC	2	6	1115620	1115625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321033
19472	NC_009443	GTAATC	2	12	1115633	1115644	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146321033
19473	NC_009443	CAA	2	6	1115703	1115708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321033
19474	NC_009443	CAT	2	6	1115767	1115772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321033
19475	NC_009443	AGAT	2	8	1115807	1115814	50 %	25 %	25 %	0 %	146321033
19476	NC_009443	GTT	2	6	1115862	1115867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321033
19477	NC_009443	GAC	2	6	1115916	1115921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321033
19478	NC_009443	CCT	2	6	1115936	1115941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321033
19479	NC_009443	GC	3	6	1116002	1116007	0 %	0 %	50 %	50 %	146321033
19480	NC_009443	ACA	2	6	1116116	1116121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321033
19481	NC_009443	TGC	2	6	1116196	1116201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321033
19482	NC_009443	TTC	2	6	1116221	1116226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321033
19483	NC_009443	TAC	2	6	1116264	1116269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321033
19484	NC_009443	TAA	3	9	1116273	1116281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321033
19485	NC_009443	CTT	2	6	1116688	1116693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321034
19486	NC_009443	CG	3	6	1116707	1116712	0 %	0 %	50 %	50 %	146321034
19487	NC_009443	AATATC	2	12	1116737	1116748	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146321034
19488	NC_009443	TAA	2	6	1116781	1116786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321034
19489	NC_009443	TTG	2	6	1116792	1116797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321034
19490	NC_009443	CCA	2	6	1116810	1116815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321034
19491	NC_009443	TCA	3	9	1116843	1116851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321034
19492	NC_009443	ACG	2	6	1116854	1116859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321034
19493	NC_009443	TTTCA	2	10	1116863	1116872	20 %	60 %	0 %	20 %	146321034
19494	NC_009443	TTC	2	6	1116896	1116901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321034
19495	NC_009443	TGC	2	6	1116953	1116958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321034
19496	NC_009443	ATG	2	6	1116959	1116964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321034
19497	NC_009443	AGC	2	6	1117040	1117045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321035
19498	NC_009443	TCT	2	6	1117089	1117094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321035
19499	NC_009443	GA	3	6	1117207	1117212	50 %	0 %	50 %	0 %	146321035
19500	NC_009443	GAA	2	6	1117214	1117219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321035

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