MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 36625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_009443	TCT	2	6	1034932	1034937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320922
18003	NC_009443	CAC	2	6	1035069	1035074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320922
18004	NC_009443	ATT	2	6	1035105	1035110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320922
18005	NC_009443	CTT	2	6	1035170	1035175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320922
18006	NC_009443	GTC	2	6	1035180	1035185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320922
18007	NC_009443	T	6	6	1035269	1035274	0 %	100 %	0 %	0 %	146320922
18008	NC_009443	TTC	2	6	1035414	1035419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320922
18009	NC_009443	ACC	2	6	1035528	1035533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320923
18010	NC_009443	TTC	2	6	1035612	1035617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320923
18011	NC_009443	AAAC	2	8	1035618	1035625	75 %	0 %	0 %	25 %	146320923
18012	NC_009443	CAG	2	6	1035804	1035809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320923
18013	NC_009443	ATT	2	6	1035824	1035829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320923
18014	NC_009443	GATGCA	2	12	1035980	1035991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146320923
18015	NC_009443	TGA	2	6	1036006	1036011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320923
18016	NC_009443	AAG	2	6	1036019	1036024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320923
18017	NC_009443	TCAAT	2	10	1036028	1036037	40 %	40 %	0 %	20 %	146320923
18018	NC_009443	TAG	2	6	1036048	1036053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320923
18019	NC_009443	CTG	2	6	1036068	1036073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320923
18020	NC_009443	ATT	2	6	1036457	1036462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320924
18021	NC_009443	CTA	2	6	1036708	1036713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320925
18022	NC_009443	GTC	2	6	1036742	1036747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320925
18023	NC_009443	CG	4	8	1036778	1036785	0 %	0 %	50 %	50 %	146320925
18024	NC_009443	GAT	2	6	1036838	1036843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320925
18025	NC_009443	TAT	2	6	1036864	1036869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320925
18026	NC_009443	A	6	6	1036886	1036891	100 %	0 %	0 %	0 %	146320925
18027	NC_009443	TGG	2	6	1036899	1036904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320925
18028	NC_009443	AAG	2	6	1036956	1036961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320925
18029	NC_009443	GTG	2	6	1036962	1036967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320925
18030	NC_009443	GCCA	2	8	1036988	1036995	25 %	0 %	25 %	50 %	146320925
18031	NC_009443	GCAA	2	8	1037072	1037079	50 %	0 %	25 %	25 %	146320925
18032	NC_009443	ATTT	2	8	1037223	1037230	25 %	75 %	0 %	0 %	146320926
18033	NC_009443	GCA	2	6	1037238	1037243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320926
18034	NC_009443	GAT	2	6	1037276	1037281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320926
18035	NC_009443	TCA	2	6	1037321	1037326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320926
18036	NC_009443	CAAT	2	8	1037342	1037349	50 %	25 %	0 %	25 %	146320926
18037	NC_009443	GTC	2	6	1037362	1037367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320926
18038	NC_009443	TC	3	6	1037384	1037389	0 %	50 %	0 %	50 %	146320926
18039	NC_009443	ATT	2	6	1037406	1037411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320926
18040	NC_009443	TAC	2	6	1037495	1037500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320926
18041	NC_009443	TCC	2	6	1037521	1037526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320926
18042	NC_009443	TCAA	2	8	1037584	1037591	50 %	25 %	0 %	25 %	146320926
18043	NC_009443	CAA	2	6	1037604	1037609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320926
18044	NC_009443	ATC	2	6	1037716	1037721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320926
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18046	NC_009443	CGG	2	6	1037885	1037890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146320926
18047	NC_009443	TGC	2	6	1037939	1037944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320926
18048	NC_009443	CAT	2	6	1037988	1037993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320926
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18051	NC_009443	TAT	2	6	1038048	1038053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320926
18052	NC_009443	AAC	2	6	1038118	1038123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320926
18053	NC_009443	TATG	2	8	1038215	1038222	25 %	50 %	25 %	0 %	146320926
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18056	NC_009443	ATC	2	6	1038303	1038308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320926
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18063	NC_009443	TTGA	2	8	1038646	1038653	25 %	50 %	25 %	0 %	146320927
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18066	NC_009443	TAT	2	6	1038791	1038796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320928
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18088	NC_009443	TCCGA	2	10	1040140	1040149	20 %	20 %	20 %	40 %	146320930
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18100	NC_009443	ATC	2	6	1040690	1040695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320931
18101	NC_009443	TC	3	6	1040725	1040730	0 %	50 %	0 %	50 %	146320931
18102	NC_009443	TGAT	3	12	1040746	1040757	25 %	50 %	25 %	0 %	146320931
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18106	NC_009443	T	7	7	1040911	1040917	0 %	100 %	0 %	0 %	146320931
18107	NC_009443	TAA	2	6	1040928	1040933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320931
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18115	NC_009443	TTTCC	2	10	1041495	1041504	0 %	60 %	0 %	40 %	146320932
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18230	NC_009443	TCG	2	6	1046933	1046938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320937
18231	NC_009443	AGC	2	6	1046952	1046957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320937
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18233	NC_009443	CCT	2	6	1046977	1046982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320937
18234	NC_009443	TAA	2	6	1046994	1046999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320937
18235	NC_009443	ACA	2	6	1047043	1047048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320937
18236	NC_009443	ACC	2	6	1047099	1047104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320937
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18238	NC_009443	TAA	2	6	1047235	1047240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320938
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18242	NC_009443	CTC	2	6	1047492	1047497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320938
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18244	NC_009443	AAT	2	6	1047535	1047540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320938
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18246	NC_009443	TCA	2	6	1047768	1047773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320938
18247	NC_009443	TCA	2	6	1047831	1047836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320938
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18249	NC_009443	GAA	2	6	1048033	1048038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320938
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18253	NC_009443	TATT	2	8	1048250	1048257	25 %	75 %	0 %	0 %	146320938
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18257	NC_009443	ACA	2	6	1048416	1048421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320939
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18261	NC_009443	TTC	2	6	1048625	1048630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320939
18262	NC_009443	CG	3	6	1048637	1048642	0 %	0 %	50 %	50 %	146320939
18263	NC_009443	T	6	6	1048680	1048685	0 %	100 %	0 %	0 %	146320939
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18276	NC_009443	TGG	2	6	1049464	1049469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320939
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18320	NC_009443	TGA	2	6	1051555	1051560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320943
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18331	NC_009443	GT	3	6	1051965	1051970	0 %	50 %	50 %	0 %	146320943
18332	NC_009443	GCT	2	6	1052033	1052038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320943
18333	NC_009443	T	6	6	1052103	1052108	0 %	100 %	0 %	0 %	146320943
18334	NC_009443	TGT	2	6	1052122	1052127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320943
18335	NC_009443	AT	3	6	1052153	1052158	50 %	50 %	0 %	0 %	146320943
18336	NC_009443	AAT	2	6	1052194	1052199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320944
18337	NC_009443	GAT	2	6	1052203	1052208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320944
18338	NC_009443	CTTT	2	8	1052225	1052232	0 %	75 %	0 %	25 %	146320944
18339	NC_009443	T	7	7	1052246	1052252	0 %	100 %	0 %	0 %	146320944
18340	NC_009443	TCT	2	6	1052513	1052518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320944
18341	NC_009443	CAC	2	6	1052523	1052528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320944
18342	NC_009443	TGC	2	6	1052563	1052568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320944
18343	NC_009443	CTT	2	6	1052592	1052597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320944
18344	NC_009443	TCT	2	6	1052666	1052671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320944
18345	NC_009443	CCA	2	6	1052799	1052804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320944
18346	NC_009443	CTT	2	6	1052826	1052831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320944
18347	NC_009443	AGA	2	6	1052873	1052878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320944
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18349	NC_009443	GTCAC	2	10	1052954	1052963	20 %	20 %	20 %	40 %	146320944
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18464	NC_009443	CTA	2	6	1059437	1059442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320952
18465	NC_009443	GTA	2	6	1059451	1059456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320952
18466	NC_009443	ATTTTG	2	12	1059510	1059521	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146320952
18467	NC_009443	TAG	2	6	1059534	1059539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320952
18468	NC_009443	CTT	2	6	1059566	1059571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320952
18469	NC_009443	GT	3	6	1059629	1059634	0 %	50 %	50 %	0 %	146320952
18470	NC_009443	TTC	2	6	1059687	1059692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320952
18471	NC_009443	TAAA	2	8	1059693	1059700	75 %	25 %	0 %	0 %	146320952
18472	NC_009443	TCA	2	6	1059718	1059723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320952
18473	NC_009443	TGT	2	6	1059771	1059776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320952
18474	NC_009443	AATCA	2	10	1059864	1059873	60 %	20 %	0 %	20 %	146320952
18475	NC_009443	ATC	2	6	1059939	1059944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320952
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18477	NC_009443	ATC	2	6	1060003	1060008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320952
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18481	NC_009443	ACT	2	6	1060216	1060221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320954
18482	NC_009443	T	6	6	1060259	1060264	0 %	100 %	0 %	0 %	146320954
18483	NC_009443	TCA	2	6	1060277	1060282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320954
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18489	NC_009443	TAA	2	6	1060569	1060574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320954
18490	NC_009443	CAA	2	6	1060841	1060846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320955
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18493	NC_009443	ATC	2	6	1061119	1061124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320955
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18495	NC_009443	AAG	2	6	1061215	1061220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320955
18496	NC_009443	CTCAAT	2	12	1061276	1061287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320955
18497	NC_009443	AAG	3	9	1061318	1061326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320955
18498	NC_009443	ATG	2	6	1061525	1061530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320955
18499	NC_009443	CTTA	2	8	1061588	1061595	25 %	50 %	0 %	25 %	146320955
18500	NC_009443	AATC	2	8	1061620	1061627	50 %	25 %	0 %	25 %	146320955

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