MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009442	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319849
2	NC_009442	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	146319849
3	NC_009442	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	146319849
4	NC_009442	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	146319849
5	NC_009442	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319849
6	NC_009442	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319849
7	NC_009442	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319849
8	NC_009442	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319849
9	NC_009442	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319849
10	NC_009442	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319849
11	NC_009442	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319849
12	NC_009442	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	146319849
13	NC_009442	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	146319849
14	NC_009442	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319849
15	NC_009442	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	146319849
16	NC_009442	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319849
17	NC_009442	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319849
18	NC_009442	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319849
19	NC_009442	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	146319849
20	NC_009442	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319849
21	NC_009442	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	146319849
22	NC_009442	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	146319849
23	NC_009442	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319849
24	NC_009442	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	146319849
25	NC_009442	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	146319849
26	NC_009442	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	146319849
27	NC_009442	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	146319849
28	NC_009442	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	146319849
29	NC_009442	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319849
30	NC_009442	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319849
31	NC_009442	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	146319849
32	NC_009442	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317664
33	NC_009442	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	146317664
34	NC_009442	A	6	6	1599	1604	100 %	0 %	0 %	0 %	146317664
35	NC_009442	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317664
36	NC_009442	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317664
37	NC_009442	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	146317664
38	NC_009442	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317664
39	NC_009442	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317664
40	NC_009442	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317664
41	NC_009442	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	146317664
42	NC_009442	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317664
43	NC_009442	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317664
44	NC_009442	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317664
45	NC_009442	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317664
46	NC_009442	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	146317664
47	NC_009442	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	146317664
48	NC_009442	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317664
49	NC_009442	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317664
50	NC_009442	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317664
51	NC_009442	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317664
52	NC_009442	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	146317664
53	NC_009442	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317664
54	NC_009442	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	146317664
55	NC_009442	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317664
56	NC_009442	TA	4	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	146317665
57	NC_009442	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317665
58	NC_009442	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	146317665
59	NC_009442	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	146317665
60	NC_009442	A	6	6	2883	2888	100 %	0 %	0 %	0 %	146317665
61	NC_009442	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317665
62	NC_009442	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317665
63	NC_009442	TA	3	6	3063	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	146317665
64	NC_009442	AG	3	6	3088	3093	50 %	0 %	50 %	0 %	146317665
65	NC_009442	AT	3	6	3107	3112	50 %	50 %	0 %	0 %	146317665
66	NC_009442	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	146317665
67	NC_009442	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317665
68	NC_009442	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317665
69	NC_009442	T	6	6	3335	3340	0 %	100 %	0 %	0 %	146317665
70	NC_009442	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317665
71	NC_009442	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	146317665
72	NC_009442	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317665
73	NC_009442	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317665
74	NC_009442	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317665
75	NC_009442	GA	3	6	3576	3581	50 %	0 %	50 %	0 %	146317665
76	NC_009442	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	146317665
77	NC_009442	AGG	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317665
78	NC_009442	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317666
79	NC_009442	TAA	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317666
80	NC_009442	ATG	2	6	3790	3795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317666
81	NC_009442	TGG	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317667
82	NC_009442	AAC	2	6	4176	4181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317667
83	NC_009442	AATG	2	8	4189	4196	50 %	25 %	25 %	0 %	146317667
84	NC_009442	TGT	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317667
85	NC_009442	TCA	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317668
86	NC_009442	AAAT	2	8	4660	4667	75 %	25 %	0 %	0 %	146317668
87	NC_009442	AG	3	6	4822	4827	50 %	0 %	50 %	0 %	146317668
88	NC_009442	CAA	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317668
89	NC_009442	A	6	6	4854	4859	100 %	0 %	0 %	0 %	146317668
90	NC_009442	A	6	6	4911	4916	100 %	0 %	0 %	0 %	146317668
91	NC_009442	AGA	2	6	4930	4935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317668
92	NC_009442	GAA	2	6	4970	4975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317668
93	NC_009442	A	6	6	4977	4982	100 %	0 %	0 %	0 %	146317668
94	NC_009442	TGA	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317668
95	NC_009442	GCA	2	6	5099	5104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317668
96	NC_009442	GTG	3	9	5120	5128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317668
97	NC_009442	GAA	3	9	5144	5152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317668
98	NC_009442	CGA	2	6	5164	5169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317668
99	NC_009442	CTTG	2	8	5248	5255	0 %	50 %	25 %	25 %	146317668
100	NC_009442	CAG	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317668
101	NC_009442	AGG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317668
102	NC_009442	CTC	2	6	5325	5330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146317668
103	NC_009442	GAT	2	6	5396	5401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317668
104	NC_009442	AAG	2	6	5433	5438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317668
105	NC_009442	GAA	2	6	5453	5458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317668
106	NC_009442	CAT	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317668
107	NC_009442	A	6	6	5668	5673	100 %	0 %	0 %	0 %	146317669
108	NC_009442	GATT	2	8	5680	5687	25 %	50 %	25 %	0 %	146317669
109	NC_009442	AAACA	2	10	5722	5731	80 %	0 %	0 %	20 %	146317669
110	NC_009442	TGC	2	6	5746	5751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317669
111	NC_009442	A	6	6	5839	5844	100 %	0 %	0 %	0 %	146317669
112	NC_009442	ATGA	2	8	5871	5878	50 %	25 %	25 %	0 %	146317669
113	NC_009442	TTA	2	6	5909	5914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317669
114	NC_009442	TAG	2	6	5938	5943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317669
115	NC_009442	GAC	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317669
116	NC_009442	TGG	2	6	6002	6007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317669
117	NC_009442	TGTCT	2	10	6113	6122	0 %	60 %	20 %	20 %	146317669
118	NC_009442	GAA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317669
119	NC_009442	GAT	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317669
120	NC_009442	ATCA	2	8	6278	6285	50 %	25 %	0 %	25 %	146317670
121	NC_009442	AATC	2	8	6302	6309	50 %	25 %	0 %	25 %	146317670
122	NC_009442	TTA	3	9	6320	6328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317670
123	NC_009442	ATG	2	6	6417	6422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
124	NC_009442	ATT	2	6	6452	6457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317670
125	NC_009442	T	6	6	6479	6484	0 %	100 %	0 %	0 %	146317670
126	NC_009442	GAT	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
127	NC_009442	GTTT	2	8	6508	6515	0 %	75 %	25 %	0 %	146317670
128	NC_009442	TCAA	2	8	6535	6542	50 %	25 %	0 %	25 %	146317670
129	NC_009442	A	6	6	6725	6730	100 %	0 %	0 %	0 %	146317670
130	NC_009442	T	6	6	6824	6829	0 %	100 %	0 %	0 %	146317670
131	NC_009442	GAGAT	2	10	6831	6840	40 %	20 %	40 %	0 %	146317670
132	NC_009442	TC	3	6	6906	6911	0 %	50 %	0 %	50 %	146317670
133	NC_009442	AGA	2	6	6937	6942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317670
134	NC_009442	TAG	2	6	6946	6951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
135	NC_009442	CTTA	2	8	7008	7015	25 %	50 %	0 %	25 %	146317670
136	NC_009442	TTG	2	6	7103	7108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317670
137	NC_009442	GAT	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
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139	NC_009442	GAT	2	6	7208	7213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
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500	NC_009442	ATT	2	6	30968	30973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317686

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