MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009442	CTGG	2	8	179312	179319	0 %	25 %	50 %	25 %	146317849
3002	NC_009442	CTA	2	6	179351	179356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317849
3003	NC_009442	AGT	2	6	179360	179365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317849
3004	NC_009442	ATG	2	6	179376	179381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317849
3005	NC_009442	CCT	2	6	179393	179398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146317849
3006	NC_009442	AAC	2	6	179407	179412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317849
3007	NC_009442	CCG	2	6	179423	179428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146317849
3008	NC_009442	TCA	2	6	179441	179446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317849
3009	NC_009442	TCTGG	2	10	179472	179481	0 %	40 %	40 %	20 %	146317849
3010	NC_009442	GATG	2	8	179633	179640	25 %	25 %	50 %	0 %	146317849
3011	NC_009442	CATG	2	8	179672	179679	25 %	25 %	25 %	25 %	146317849
3012	NC_009442	CTT	2	6	179788	179793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317849
3013	NC_009442	TGA	2	6	179795	179800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317849
3014	NC_009442	ATT	2	6	179834	179839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317849
3015	NC_009442	A	7	7	179894	179900	100 %	0 %	0 %	0 %	146317849
3016	NC_009442	TAT	2	6	179957	179962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317849
3017	NC_009442	CTT	2	6	179996	180001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317849
3018	NC_009442	TTC	2	6	180004	180009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317849
3019	NC_009442	TTCAA	2	10	180012	180021	40 %	40 %	0 %	20 %	146317849
3020	NC_009442	CGA	2	6	180028	180033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317849
3021	NC_009442	GAA	2	6	180135	180140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317849
3022	NC_009442	TGC	2	6	180160	180165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317849
3023	NC_009442	ATC	2	6	180180	180185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317849
3024	NC_009442	ACA	2	6	180190	180195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317849
3025	NC_009442	GACC	2	8	180197	180204	25 %	0 %	25 %	50 %	146317849
3026	NC_009442	GGA	2	6	180218	180223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317849
3027	NC_009442	T	6	6	180373	180378	0 %	100 %	0 %	0 %	146317850
3028	NC_009442	GTC	2	6	180451	180456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317850
3029	NC_009442	AGC	2	6	180559	180564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317850
3030	NC_009442	CAT	2	6	180616	180621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317850
3031	NC_009442	TCA	2	6	180633	180638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317850
3032	NC_009442	T	7	7	180947	180953	0 %	100 %	0 %	0 %	146317851
3033	NC_009442	C	6	6	180975	180980	0 %	0 %	0 %	100 %	146317851
3034	NC_009442	GGAA	2	8	180988	180995	50 %	0 %	50 %	0 %	146317851
3035	NC_009442	T	7	7	181007	181013	0 %	100 %	0 %	0 %	146317851
3036	NC_009442	A	6	6	181024	181029	100 %	0 %	0 %	0 %	146317851
3037	NC_009442	ATCA	2	8	181046	181053	50 %	25 %	0 %	25 %	146317851
3038	NC_009442	GTT	2	6	181077	181082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317851
3039	NC_009442	TTG	2	6	181108	181113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317851
3040	NC_009442	GCA	2	6	181281	181286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317851
3041	NC_009442	CTC	2	6	181470	181475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146317851
3042	NC_009442	TCT	2	6	181477	181482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317851
3043	NC_009442	AAG	2	6	181495	181500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317851
3044	NC_009442	GCT	2	6	181506	181511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317851
3045	NC_009442	GGT	2	6	181617	181622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317851
3046	NC_009442	CAG	2	6	181669	181674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317851
3047	NC_009442	CAC	2	6	181699	181704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317851
3048	NC_009442	TCA	2	6	181732	181737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317851
3049	NC_009442	ATG	2	6	181792	181797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317851
3050	NC_009442	AGC	2	6	181880	181885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317851
3051	NC_009442	TAT	2	6	181970	181975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317851
3052	NC_009442	CAA	2	6	181991	181996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317851
3053	NC_009442	GTG	2	6	182037	182042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317851
3054	NC_009442	ATC	2	6	182052	182057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317851
3055	NC_009442	A	6	6	182220	182225	100 %	0 %	0 %	0 %	146317852
3056	NC_009442	CGA	2	6	182323	182328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317852
3057	NC_009442	GAA	2	6	182373	182378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317852
3058	NC_009442	ATT	2	6	182455	182460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317852
3059	NC_009442	ATA	2	6	182506	182511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317852
3060	NC_009442	GAAA	2	8	182632	182639	75 %	0 %	25 %	0 %	146317852
3061	NC_009442	ATA	2	6	182650	182655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317852
3062	NC_009442	GAA	2	6	182664	182669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317852
3063	NC_009442	TAGC	2	8	182707	182714	25 %	25 %	25 %	25 %	146317852
3064	NC_009442	AAC	2	6	182809	182814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317852
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3066	NC_009442	GAA	2	6	182859	182864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317852
3067	NC_009442	AGG	2	6	182881	182886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317852
3068	NC_009442	CAGCTC	2	12	182911	182922	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146317852
3069	NC_009442	CTCCAA	2	12	182944	182955	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146317852
3070	NC_009442	AGA	2	6	183068	183073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317852
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3072	NC_009442	AGA	2	6	183119	183124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317852
3073	NC_009442	AACTCC	2	12	183125	183136	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146317852
3074	NC_009442	GAA	2	6	183213	183218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317852
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3077	NC_009442	CAG	2	6	183403	183408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317852
3078	NC_009442	CAA	2	6	183457	183462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317852
3079	NC_009442	AGA	2	6	183476	183481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317852
3080	NC_009442	AGA	2	6	183497	183502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317852
3081	NC_009442	ATG	2	6	183511	183516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317852
3082	NC_009442	CTT	2	6	183543	183548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317852
3083	NC_009442	AAG	2	6	183550	183555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317852
3084	NC_009442	A	6	6	183567	183572	100 %	0 %	0 %	0 %	146317852
3085	NC_009442	CAAC	2	8	183616	183623	50 %	0 %	0 %	50 %	146317852
3086	NC_009442	TAT	2	6	183625	183630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317852
3087	NC_009442	TGT	2	6	183638	183643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317852
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3089	NC_009442	AGA	2	6	183692	183697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317852
3090	NC_009442	AAC	2	6	183704	183709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317852
3091	NC_009442	CAAA	2	8	183760	183767	75 %	0 %	0 %	25 %	146317852
3092	NC_009442	TAG	2	6	183811	183816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317852
3093	NC_009442	A	6	6	183867	183872	100 %	0 %	0 %	0 %	146317852
3094	NC_009442	T	6	6	184284	184289	0 %	100 %	0 %	0 %	146317853
3095	NC_009442	CAC	2	6	184344	184349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317853
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3099	NC_009442	TGATT	2	10	184643	184652	20 %	60 %	20 %	0 %	146317853
3100	NC_009442	TGG	2	6	184675	184680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317853
3101	NC_009442	TCT	2	6	184714	184719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317853
3102	NC_009442	GTC	2	6	184801	184806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317853
3103	NC_009442	TGT	2	6	184823	184828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317853
3104	NC_009442	GTT	2	6	184857	184862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317853
3105	NC_009442	AGT	2	6	184873	184878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317853
3106	NC_009442	CTGA	2	8	184881	184888	25 %	25 %	25 %	25 %	146317853
3107	NC_009442	GTT	2	6	184929	184934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317853
3108	NC_009442	GAA	2	6	184959	184964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317853
3109	NC_009442	CTT	2	6	184971	184976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317853
3110	NC_009442	TAGG	2	8	184985	184992	25 %	25 %	50 %	0 %	146317853
3111	NC_009442	ACC	2	6	185056	185061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317853
3112	NC_009442	ATTG	2	8	185111	185118	25 %	50 %	25 %	0 %	146317853
3113	NC_009442	GCA	2	6	185143	185148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317853
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3115	NC_009442	GGA	2	6	185189	185194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317853
3116	NC_009442	CCA	2	6	185263	185268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317853
3117	NC_009442	GTA	2	6	185295	185300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317853
3118	NC_009442	GAT	2	6	185331	185336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317853
3119	NC_009442	GTT	2	6	185359	185364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317853
3120	NC_009442	CGT	2	6	185403	185408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317853
3121	NC_009442	AGCG	2	8	185446	185453	25 %	0 %	50 %	25 %	146317853
3122	NC_009442	CGAG	2	8	185599	185606	25 %	0 %	50 %	25 %	146317853
3123	NC_009442	AGT	2	6	185609	185614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317853
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3125	NC_009442	TGA	2	6	185800	185805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317853
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3145	NC_009442	A	6	6	186915	186920	100 %	0 %	0 %	0 %	146317854
3146	NC_009442	CTTT	2	8	186960	186967	0 %	75 %	0 %	25 %	146317854
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3233	NC_009442	GGAAA	2	10	192130	192139	60 %	0 %	40 %	0 %	146317857
3234	NC_009442	CTT	2	6	192154	192159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317857
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3237	NC_009442	TA	3	6	192311	192316	50 %	50 %	0 %	0 %	146317857
3238	NC_009442	GAA	2	6	192361	192366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317857
3239	NC_009442	GCCA	2	8	192499	192506	25 %	0 %	25 %	50 %	146317858
3240	NC_009442	GAAAAA	2	12	192535	192546	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	146317858
3241	NC_009442	GCAG	2	8	192565	192572	25 %	0 %	50 %	25 %	146317858
3242	NC_009442	AGG	2	6	192621	192626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317858
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3492	NC_009442	GA	3	6	204873	204878	50 %	0 %	50 %	0 %	146317871
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