MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_009442	CAT	2	6	1656200	1656205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319411
29003	NC_009442	TAG	2	6	1656217	1656222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319411
29004	NC_009442	GCA	2	6	1656312	1656317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319411
29005	NC_009442	CAG	3	9	1656349	1656357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319411
29006	NC_009442	ATG	2	6	1656418	1656423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319411
29007	NC_009442	AGA	2	6	1656507	1656512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319411
29008	NC_009442	AGA	2	6	1656598	1656603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319411
29009	NC_009442	AGTAG	2	10	1656622	1656631	40 %	20 %	40 %	0 %	146319411
29010	NC_009442	AAG	2	6	1656690	1656695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319411
29011	NC_009442	CAT	2	6	1656733	1656738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319411
29012	NC_009442	CGC	2	6	1656763	1656768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319411
29013	NC_009442	TGC	2	6	1656776	1656781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319411
29014	NC_009442	AAT	2	6	1656782	1656787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319411
29015	NC_009442	CTGT	2	8	1656808	1656815	0 %	50 %	25 %	25 %	146319411
29016	NC_009442	GCT	2	6	1656819	1656824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319411
29017	NC_009442	TTC	2	6	1656857	1656862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319411
29018	NC_009442	TAGG	2	8	1657014	1657021	25 %	25 %	50 %	0 %	146319411
29019	NC_009442	GAC	2	6	1657027	1657032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319411
29020	NC_009442	TGA	2	6	1657034	1657039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319411
29021	NC_009442	TCT	2	6	1657053	1657058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319411
29022	NC_009442	T	6	6	1657100	1657105	0 %	100 %	0 %	0 %	146319411
29023	NC_009442	CAA	2	6	1657174	1657179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319411
29024	NC_009442	TCAA	2	8	1657239	1657246	50 %	25 %	0 %	25 %	146319411
29025	NC_009442	ATC	2	6	1657254	1657259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319411
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29027	NC_009442	CTG	2	6	1657378	1657383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319411
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29031	NC_009442	T	6	6	1657565	1657570	0 %	100 %	0 %	0 %	146319411
29032	NC_009442	ATCA	2	8	1657667	1657674	50 %	25 %	0 %	25 %	146319411
29033	NC_009442	TTA	2	6	1657988	1657993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319412
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29036	NC_009442	TCA	2	6	1658039	1658044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319412
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29038	NC_009442	TTTGCT	2	12	1658053	1658064	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146319412
29039	NC_009442	CCCT	2	8	1658117	1658124	0 %	25 %	0 %	75 %	146319412
29040	NC_009442	ACT	2	6	1658218	1658223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319412
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29045	NC_009442	GCT	2	6	1658425	1658430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319412
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29049	NC_009442	T	7	7	1658740	1658746	0 %	100 %	0 %	0 %	146319413
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29052	NC_009442	ATG	2	6	1658991	1658996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319413
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29114	NC_009442	AGCAT	2	10	1662524	1662533	40 %	20 %	20 %	20 %	146319416
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29116	NC_009442	ACT	2	6	1662628	1662633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319416
29117	NC_009442	AAT	2	6	1662756	1662761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319416
29118	NC_009442	CAA	2	6	1662814	1662819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319416
29119	NC_009442	T	6	6	1662832	1662837	0 %	100 %	0 %	0 %	146319416
29120	NC_009442	ATC	2	6	1663307	1663312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319417
29121	NC_009442	CAT	2	6	1663372	1663377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319417
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29222	NC_009442	CAC	2	6	1669244	1669249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319423
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29224	NC_009442	CTG	2	6	1669418	1669423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319423
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29228	NC_009442	GA	3	6	1669498	1669503	50 %	0 %	50 %	0 %	146319423
29229	NC_009442	CTT	2	6	1669522	1669527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319423
29230	NC_009442	TTCA	2	8	1669625	1669632	25 %	50 %	0 %	25 %	146319423
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29232	NC_009442	GTT	2	6	1669747	1669752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319423
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29465	NC_009442	A	6	6	1682111	1682116	100 %	0 %	0 %	0 %	146319434
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