MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_009442	A	6	6	1541621	1541626	100 %	0 %	0 %	0 %	146319277
27003	NC_009442	CTTC	2	8	1541813	1541820	0 %	50 %	0 %	50 %	146319277
27004	NC_009442	CTTTG	2	10	1541919	1541928	0 %	60 %	20 %	20 %	146319277
27005	NC_009442	A	6	6	1542016	1542021	100 %	0 %	0 %	0 %	146319277
27006	NC_009442	TCAT	2	8	1542028	1542035	25 %	50 %	0 %	25 %	146319277
27007	NC_009442	CTG	2	6	1542334	1542339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319278
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27009	NC_009442	ATC	2	6	1542523	1542528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319278
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27011	NC_009442	ACG	2	6	1542563	1542568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319278
27012	NC_009442	TCC	2	6	1542808	1542813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319278
27013	NC_009442	GT	3	6	1542870	1542875	0 %	50 %	50 %	0 %	146319278
27014	NC_009442	ACC	2	6	1542937	1542942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319278
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27017	NC_009442	AT	3	6	1543154	1543159	50 %	50 %	0 %	0 %	146319279
27018	NC_009442	AG	5	10	1543171	1543180	50 %	0 %	50 %	0 %	146319279
27019	NC_009442	TC	3	6	1543341	1543346	0 %	50 %	0 %	50 %	146319279
27020	NC_009442	GGT	2	6	1543511	1543516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319279
27021	NC_009442	TC	4	8	1543534	1543541	0 %	50 %	0 %	50 %	146319279
27022	NC_009442	AGCTGC	2	12	1543582	1543593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146319279
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27038	NC_009442	GCA	2	6	1544721	1544726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319281
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27040	NC_009442	AACC	2	8	1544737	1544744	50 %	0 %	0 %	50 %	146319281
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27052	NC_009442	CGT	2	6	1545641	1545646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319281
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27055	NC_009442	TTG	2	6	1545816	1545821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319281
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27059	NC_009442	TA	3	6	1546090	1546095	50 %	50 %	0 %	0 %	146319281
27060	NC_009442	TCGCA	2	10	1546291	1546300	20 %	20 %	20 %	40 %	146319282
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27070	NC_009442	CCATA	2	10	1546868	1546877	40 %	20 %	0 %	40 %	146319283
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27084	NC_009442	TTGG	2	8	1547669	1547676	0 %	50 %	50 %	0 %	146319285
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27090	NC_009442	TCT	2	6	1547904	1547909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319285
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27092	NC_009442	TGATA	2	10	1547976	1547985	40 %	40 %	20 %	0 %	146319285
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27102	NC_009442	CTG	3	9	1548393	1548401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319286
27103	NC_009442	TTTC	2	8	1548452	1548459	0 %	75 %	0 %	25 %	146319286
27104	NC_009442	TGT	2	6	1548472	1548477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319286
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27108	NC_009442	GCT	2	6	1548635	1548640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319286
27109	NC_009442	GGT	2	6	1548704	1548709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319286
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27114	NC_009442	GAA	2	6	1549115	1549120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319287
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27118	NC_009442	GGAC	2	8	1549282	1549289	25 %	0 %	50 %	25 %	146319288
27119	NC_009442	GCCTA	2	10	1549418	1549427	20 %	20 %	20 %	40 %	146319288
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27124	NC_009442	A	7	7	1549653	1549659	100 %	0 %	0 %	0 %	146319288
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27233	NC_009442	TGC	2	6	1556207	1556212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319295
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27236	NC_009442	TAA	2	6	1556327	1556332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319295
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27340	NC_009442	CTTC	2	8	1563587	1563594	0 %	50 %	0 %	50 %	146319303
27341	NC_009442	TTAG	2	8	1563670	1563677	25 %	50 %	25 %	0 %	146319303
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27343	NC_009442	C	6	6	1563703	1563708	0 %	0 %	0 %	100 %	146319303
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27345	NC_009442	TGA	2	6	1563832	1563837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319303
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27347	NC_009442	TAT	2	6	1563899	1563904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319303
27348	NC_009442	ATG	2	6	1563953	1563958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319304
27349	NC_009442	TTCAT	2	10	1564013	1564022	20 %	60 %	0 %	20 %	146319304
27350	NC_009442	T	6	6	1564069	1564074	0 %	100 %	0 %	0 %	146319304
27351	NC_009442	T	6	6	1564108	1564113	0 %	100 %	0 %	0 %	146319304
27352	NC_009442	ATG	2	6	1564172	1564177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319304
27353	NC_009442	ACC	2	6	1564228	1564233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319304
27354	NC_009442	T	6	6	1564278	1564283	0 %	100 %	0 %	0 %	146319304
27355	NC_009442	TCT	2	6	1564313	1564318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319304
27356	NC_009442	TGC	2	6	1564345	1564350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319304
27357	NC_009442	AGC	2	6	1564438	1564443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319304
27358	NC_009442	AAT	2	6	1564483	1564488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319304
27359	NC_009442	GGCT	2	8	1564544	1564551	0 %	25 %	50 %	25 %	146319304
27360	NC_009442	CTT	2	6	1564599	1564604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319304
27361	NC_009442	AAC	2	6	1564654	1564659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319304
27362	NC_009442	TTC	2	6	1564672	1564677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319304
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27365	NC_009442	CTT	2	6	1564920	1564925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319305
27366	NC_009442	TCG	2	6	1564961	1564966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319305
27367	NC_009442	CTT	2	6	1565139	1565144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319305
27368	NC_009442	TCC	2	6	1565191	1565196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319305
27369	NC_009442	ATA	2	6	1565351	1565356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319305
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27372	NC_009442	GCTGA	2	10	1565392	1565401	20 %	20 %	40 %	20 %	146319305
27373	NC_009442	TTCT	2	8	1565419	1565426	0 %	75 %	0 %	25 %	146319305
27374	NC_009442	ATC	2	6	1565452	1565457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319305
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27376	NC_009442	CAT	2	6	1565523	1565528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319305
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27380	NC_009442	ATA	2	6	1565662	1565667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319305
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27382	NC_009442	TTC	2	6	1565713	1565718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319305
27383	NC_009442	GTT	2	6	1565752	1565757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319305
27384	NC_009442	TTTG	2	8	1565817	1565824	0 %	75 %	25 %	0 %	146319305
27385	NC_009442	GCT	2	6	1565885	1565890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319305
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27387	NC_009442	TCT	2	6	1566035	1566040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319305
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27390	NC_009442	CTA	2	6	1566114	1566119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319305
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27424	NC_009442	CT	3	6	1568189	1568194	0 %	50 %	0 %	50 %	146319308
27425	NC_009442	TGGT	2	8	1568307	1568314	0 %	50 %	50 %	0 %	146319308
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27434	NC_009442	TC	3	6	1569047	1569052	0 %	50 %	0 %	50 %	146319310
27435	NC_009442	GTA	2	6	1569103	1569108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319310
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27456	NC_009442	AGTCA	2	10	1570531	1570540	40 %	20 %	20 %	20 %	146319311
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27469	NC_009442	CAA	2	6	1571474	1571479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319313
27470	NC_009442	ATT	2	6	1571480	1571485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319313
27471	NC_009442	ACA	2	6	1571619	1571624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319313
27472	NC_009442	AAC	2	6	1571628	1571633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319313
27473	NC_009442	CAA	2	6	1571641	1571646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319313
27474	NC_009442	GAT	2	6	1571650	1571655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319313
27475	NC_009442	CTA	2	6	1571754	1571759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319313
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27477	NC_009442	ACT	2	6	1571784	1571789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319313
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27482	NC_009442	A	7	7	1571931	1571937	100 %	0 %	0 %	0 %	146319313
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27493	NC_009442	T	7	7	1572905	1572911	0 %	100 %	0 %	0 %	146319314
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27497	NC_009442	TCA	2	6	1573137	1573142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319314
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27499	NC_009442	AAT	2	6	1573268	1573273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319314
27500	NC_009442	TGAC	2	8	1573311	1573318	25 %	25 %	25 %	25 %	146319314

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