MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25004	NC_009442	CTG	2	6	1425671	1425676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319140
25005	NC_009442	CTC	2	6	1425731	1425736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319140
25006	NC_009442	GTC	2	6	1425757	1425762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319140
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25008	NC_009442	CAT	2	6	1425909	1425914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319141
25009	NC_009442	ACA	2	6	1425956	1425961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319141
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25012	NC_009442	TAC	2	6	1426212	1426217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319141
25013	NC_009442	AGCC	2	8	1426281	1426288	25 %	0 %	25 %	50 %	146319141
25014	NC_009442	TCT	2	6	1426289	1426294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319141
25015	NC_009442	GCT	2	6	1426295	1426300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319141
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25042	NC_009442	TAT	2	6	1428176	1428181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319143
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25101	NC_009442	T	6	6	1430932	1430937	0 %	100 %	0 %	0 %	146319145
25102	NC_009442	CT	3	6	1431042	1431047	0 %	50 %	0 %	50 %	146319145
25103	NC_009442	CTT	2	6	1431054	1431059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319145
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25109	NC_009442	GTA	2	6	1431156	1431161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319145
25110	NC_009442	TTGA	2	8	1431174	1431181	25 %	50 %	25 %	0 %	146319145
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25112	NC_009442	AAT	2	6	1431204	1431209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319145
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25116	NC_009442	ATG	2	6	1431343	1431348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319145
25117	NC_009442	T	6	6	1431357	1431362	0 %	100 %	0 %	0 %	146319145
25118	NC_009442	CTC	2	6	1431375	1431380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319145
25119	NC_009442	ACT	2	6	1431424	1431429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319145
25120	NC_009442	CCTT	2	8	1431430	1431437	0 %	50 %	0 %	50 %	146319145
25121	NC_009442	TCA	2	6	1431490	1431495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319145
25122	NC_009442	TAT	2	6	1431528	1431533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319145
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25124	NC_009442	T	6	6	1431623	1431628	0 %	100 %	0 %	0 %	146319145
25125	NC_009442	GAA	2	6	1431634	1431639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319145
25126	NC_009442	CTT	2	6	1431660	1431665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319145
25127	NC_009442	ACA	2	6	1431689	1431694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319145
25128	NC_009442	TTA	2	6	1431709	1431714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319145
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25130	NC_009442	AT	3	6	1431812	1431817	50 %	50 %	0 %	0 %	146319145
25131	NC_009442	T	8	8	1432082	1432089	0 %	100 %	0 %	0 %	146319146
25132	NC_009442	GCA	2	6	1432185	1432190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319146
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25142	NC_009442	AGCCT	2	10	1432758	1432767	20 %	20 %	20 %	40 %	146319146
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25145	NC_009442	CTG	2	6	1432844	1432849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319146
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25214	NC_009442	CAA	2	6	1436297	1436302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319150
25215	NC_009442	GAA	2	6	1436353	1436358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319150
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25217	NC_009442	TCCA	2	8	1436623	1436630	25 %	25 %	0 %	50 %	146319150
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25221	NC_009442	AAAT	2	8	1436741	1436748	75 %	25 %	0 %	0 %	146319150
25222	NC_009442	A	6	6	1436755	1436760	100 %	0 %	0 %	0 %	146319150
25223	NC_009442	TCC	2	6	1436848	1436853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319150
25224	NC_009442	T	6	6	1436902	1436907	0 %	100 %	0 %	0 %	146319151
25225	NC_009442	ATCA	2	8	1436964	1436971	50 %	25 %	0 %	25 %	146319151
25226	NC_009442	CTAT	2	8	1436996	1437003	25 %	50 %	0 %	25 %	146319151
25227	NC_009442	GAA	2	6	1437097	1437102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319151
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25229	NC_009442	AGG	2	6	1437171	1437176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319151
25230	NC_009442	TACTC	2	10	1437201	1437210	20 %	40 %	0 %	40 %	146319151
25231	NC_009442	TGT	2	6	1437216	1437221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319151
25232	NC_009442	CAC	2	6	1437233	1437238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319151
25233	NC_009442	ACT	2	6	1437303	1437308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319151
25234	NC_009442	ACG	2	6	1437623	1437628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319151
25235	NC_009442	AGA	2	6	1437672	1437677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319151
25236	NC_009442	ATTT	2	8	1437729	1437736	25 %	75 %	0 %	0 %	146319151
25237	NC_009442	CAA	2	6	1437818	1437823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319151
25238	NC_009442	CTC	2	6	1437833	1437838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319151
25239	NC_009442	TGA	2	6	1437858	1437863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319151
25240	NC_009442	TTG	2	6	1437875	1437880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319151
25241	NC_009442	AGG	2	6	1438044	1438049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319152
25242	NC_009442	ATTG	2	8	1438095	1438102	25 %	50 %	25 %	0 %	146319152
25243	NC_009442	CAAA	2	8	1438103	1438110	75 %	0 %	0 %	25 %	146319152
25244	NC_009442	GAA	2	6	1438138	1438143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319152
25245	NC_009442	T	6	6	1438282	1438287	0 %	100 %	0 %	0 %	146319153
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25247	NC_009442	GCAG	2	8	1438417	1438424	25 %	0 %	50 %	25 %	146319153
25248	NC_009442	TGTT	2	8	1438475	1438482	0 %	75 %	25 %	0 %	146319153
25249	NC_009442	T	6	6	1438481	1438486	0 %	100 %	0 %	0 %	146319153
25250	NC_009442	GCAAG	2	10	1438487	1438496	40 %	0 %	40 %	20 %	146319153
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25255	NC_009442	TCGG	2	8	1438714	1438721	0 %	25 %	50 %	25 %	146319153
25256	NC_009442	CGAA	2	8	1438740	1438747	50 %	0 %	25 %	25 %	146319153
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25259	NC_009442	CTT	2	6	1438830	1438835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319153
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25261	NC_009442	TA	3	6	1438848	1438853	50 %	50 %	0 %	0 %	146319153
25262	NC_009442	AGC	2	6	1438863	1438868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319153
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25264	NC_009442	ATC	2	6	1438915	1438920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319153
25265	NC_009442	ATC	2	6	1439137	1439142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319154
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25269	NC_009442	TGA	2	6	1439421	1439426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319155
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25272	NC_009442	T	6	6	1439882	1439887	0 %	100 %	0 %	0 %	146319156
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25303	NC_009442	GAAA	2	8	1441273	1441280	75 %	0 %	25 %	0 %	146319157
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25338	NC_009442	ATC	2	6	1443522	1443527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319160
25339	NC_009442	GAA	2	6	1443537	1443542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319160
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25343	NC_009442	TGA	2	6	1443739	1443744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319160
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25346	NC_009442	ACA	2	6	1443897	1443902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319160
25347	NC_009442	AGA	2	6	1443907	1443912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319160
25348	NC_009442	TGAC	2	8	1444514	1444521	25 %	25 %	25 %	25 %	146319161
25349	NC_009442	TTGAT	2	10	1444649	1444658	20 %	60 %	20 %	0 %	146319161
25350	NC_009442	AAT	2	6	1444696	1444701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319161
25351	NC_009442	TTG	2	6	1444704	1444709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319161
25352	NC_009442	GTC	2	6	1444712	1444717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319161
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25357	NC_009442	ATTGAG	2	12	1445226	1445237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319161
25358	NC_009442	CTT	2	6	1445293	1445298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319161
25359	NC_009442	ATC	2	6	1445338	1445343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319161
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25366	NC_009442	ATTT	2	8	1445866	1445873	25 %	75 %	0 %	0 %	146319162
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25370	NC_009442	CTA	2	6	1446084	1446089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319162
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25466	NC_009442	CCA	2	6	1451894	1451899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319166
25467	NC_009442	T	6	6	1451912	1451917	0 %	100 %	0 %	0 %	146319166
25468	NC_009442	CTA	2	6	1451931	1451936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319166
25469	NC_009442	GTAC	2	8	1451985	1451992	25 %	25 %	25 %	25 %	146319166
25470	NC_009442	A	6	6	1452041	1452046	100 %	0 %	0 %	0 %	146319166
25471	NC_009442	ACCA	2	8	1452085	1452092	50 %	0 %	0 %	50 %	146319166
25472	NC_009442	ACA	2	6	1452098	1452103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319166
25473	NC_009442	AG	3	6	1452135	1452140	50 %	0 %	50 %	0 %	146319166
25474	NC_009442	AAT	2	6	1452142	1452147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319166
25475	NC_009442	TAA	2	6	1452157	1452162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319166
25476	NC_009442	A	8	8	1452161	1452168	100 %	0 %	0 %	0 %	146319166
25477	NC_009442	AGT	2	6	1452186	1452191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319166
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25479	NC_009442	TAA	2	6	1453828	1453833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319167
25480	NC_009442	CGG	2	6	1453924	1453929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146319167
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25482	NC_009442	ATG	2	6	1453971	1453976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319167
25483	NC_009442	T	6	6	1454054	1454059	0 %	100 %	0 %	0 %	146319167
25484	NC_009442	TA	3	6	1454157	1454162	50 %	50 %	0 %	0 %	146319167
25485	NC_009442	CATT	2	8	1454237	1454244	25 %	50 %	0 %	25 %	146319167
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25487	NC_009442	TTC	2	6	1454257	1454262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319167
25488	NC_009442	T	6	6	1454716	1454721	0 %	100 %	0 %	0 %	146319168
25489	NC_009442	ACT	2	6	1454899	1454904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319168
25490	NC_009442	ACC	2	6	1454949	1454954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319168
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25494	NC_009442	CCA	2	6	1455335	1455340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319168
25495	NC_009442	TCG	2	6	1455392	1455397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319168
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25497	NC_009442	ATT	2	6	1455442	1455447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319168
25498	NC_009442	TAAA	2	8	1455636	1455643	75 %	25 %	0 %	0 %	146319168
25499	NC_009442	AGCC	2	8	1455650	1455657	25 %	0 %	25 %	50 %	146319168
25500	NC_009442	TAT	2	6	1455793	1455798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319168

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