MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_009442	ATC	2	6	1366985	1366990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319073
24002	NC_009442	TCA	2	6	1367087	1367092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319073
24003	NC_009442	AGA	2	6	1367110	1367115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319073
24004	NC_009442	TCCTTC	2	12	1367187	1367198	0 %	50 %	0 %	50 %	146319074
24005	NC_009442	T	6	6	1367207	1367212	0 %	100 %	0 %	0 %	146319074
24006	NC_009442	AAAC	2	8	1367514	1367521	75 %	0 %	0 %	25 %	146319075
24007	NC_009442	CT	4	8	1367528	1367535	0 %	50 %	0 %	50 %	146319075
24008	NC_009442	AAC	2	6	1367564	1367569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319075
24009	NC_009442	AGC	2	6	1367589	1367594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319075
24010	NC_009442	AAG	2	6	1367627	1367632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319075
24011	NC_009442	CTA	2	6	1367766	1367771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319075
24012	NC_009442	GAA	2	6	1367842	1367847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319075
24013	NC_009442	CTG	2	6	1367873	1367878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319075
24014	NC_009442	ACA	2	6	1367892	1367897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319075
24015	NC_009442	CAT	2	6	1367907	1367912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319075
24016	NC_009442	TCTA	2	8	1367944	1367951	25 %	50 %	0 %	25 %	146319075
24017	NC_009442	AAG	2	6	1368062	1368067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319075
24018	NC_009442	CGG	2	6	1368153	1368158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146319075
24019	NC_009442	ATA	2	6	1368218	1368223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319075
24020	NC_009442	TTC	2	6	1368388	1368393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319075
24021	NC_009442	GAA	2	6	1368432	1368437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319075
24022	NC_009442	CA	3	6	1368439	1368444	50 %	0 %	0 %	50 %	146319075
24023	NC_009442	TTC	2	6	1368458	1368463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319075
24024	NC_009442	AAG	2	6	1368468	1368473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319075
24025	NC_009442	AGG	2	6	1368494	1368499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319075
24026	NC_009442	CTT	2	6	1368542	1368547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319075
24027	NC_009442	ATT	2	6	1368657	1368662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319075
24028	NC_009442	GTAT	2	8	1369566	1369573	25 %	50 %	25 %	0 %	146319076
24029	NC_009442	A	6	6	1369584	1369589	100 %	0 %	0 %	0 %	146319076
24030	NC_009442	ATT	2	6	1369742	1369747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319076
24031	NC_009442	ATT	2	6	1369763	1369768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319076
24032	NC_009442	TGT	2	6	1369786	1369791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319076
24033	NC_009442	TGG	2	6	1369814	1369819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319076
24034	NC_009442	TTCT	2	8	1369823	1369830	0 %	75 %	0 %	25 %	146319076
24035	NC_009442	GTA	2	6	1369854	1369859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319076
24036	NC_009442	TCG	2	6	1369879	1369884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319076
24037	NC_009442	GAAA	2	8	1369890	1369897	75 %	0 %	25 %	0 %	146319076
24038	NC_009442	ATA	2	6	1369953	1369958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319076
24039	NC_009442	GTG	2	6	1370021	1370026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319076
24040	NC_009442	TAT	2	6	1370065	1370070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319076
24041	NC_009442	TTACT	2	10	1370073	1370082	20 %	60 %	0 %	20 %	146319076
24042	NC_009442	CTT	2	6	1370113	1370118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319076
24043	NC_009442	GCA	2	6	1370143	1370148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319076
24044	NC_009442	AAC	2	6	1371016	1371021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319077
24045	NC_009442	ATTG	2	8	1371034	1371041	25 %	50 %	25 %	0 %	146319077
24046	NC_009442	ATG	2	6	1371111	1371116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319077
24047	NC_009442	TGT	2	6	1371217	1371222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319077
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24049	NC_009442	ATT	2	6	1371285	1371290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319078
24050	NC_009442	TGAGG	2	10	1371424	1371433	20 %	20 %	60 %	0 %	146319078
24051	NC_009442	ACT	2	6	1371435	1371440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319078
24052	NC_009442	A	6	6	1371488	1371493	100 %	0 %	0 %	0 %	146319078
24053	NC_009442	TCA	2	6	1371540	1371545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319078
24054	NC_009442	GTT	2	6	1371605	1371610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319078
24055	NC_009442	ATTG	2	8	1371639	1371646	25 %	50 %	25 %	0 %	146319078
24056	NC_009442	GCT	2	6	1371695	1371700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319079
24057	NC_009442	ATG	2	6	1371746	1371751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319079
24058	NC_009442	CCG	2	6	1371778	1371783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319079
24059	NC_009442	AAC	2	6	1371786	1371791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319079
24060	NC_009442	GGA	2	6	1371811	1371816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319079
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24066	NC_009442	T	7	7	1372270	1372276	0 %	100 %	0 %	0 %	146319080
24067	NC_009442	T	6	6	1372313	1372318	0 %	100 %	0 %	0 %	146319081
24068	NC_009442	CAT	2	6	1372388	1372393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319081
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24070	NC_009442	ATA	2	6	1372504	1372509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319081
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24073	NC_009442	AATC	2	8	1372765	1372772	50 %	25 %	0 %	25 %	146319082
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24085	NC_009442	GCCAAT	2	12	1373509	1373520	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146319082
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24088	NC_009442	TTC	2	6	1373619	1373624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319082
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24101	NC_009442	TCA	2	6	1374060	1374065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319083
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24104	NC_009442	TCT	2	6	1374204	1374209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319083
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24111	NC_009442	CTT	2	6	1374616	1374621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319083
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24114	NC_009442	CT	3	6	1374794	1374799	0 %	50 %	0 %	50 %	146319083
24115	NC_009442	AGC	2	6	1374851	1374856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319083
24116	NC_009442	CTT	2	6	1374899	1374904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319083
24117	NC_009442	TAC	2	6	1374964	1374969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319083
24118	NC_009442	TTC	2	6	1375010	1375015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319083
24119	NC_009442	AAT	2	6	1375073	1375078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319083
24120	NC_009442	ATAA	2	8	1375097	1375104	75 %	25 %	0 %	0 %	146319083
24121	NC_009442	TAT	2	6	1375105	1375110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319083
24122	NC_009442	TTC	2	6	1375148	1375153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319083
24123	NC_009442	CAT	2	6	1375231	1375236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319083
24124	NC_009442	TCA	2	6	1375291	1375296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319083
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24126	NC_009442	TGA	2	6	1375374	1375379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319083
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24128	NC_009442	CTT	2	6	1375459	1375464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319083
24129	NC_009442	ATC	2	6	1375971	1375976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319084
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24136	NC_009442	A	6	6	1376217	1376222	100 %	0 %	0 %	0 %	146319084
24137	NC_009442	TTA	2	6	1376384	1376389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319085
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24143	NC_009442	ATT	2	6	1376732	1376737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319086
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24148	NC_009442	GAG	2	6	1376958	1376963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319086
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24154	NC_009442	TTTACG	2	12	1377462	1377473	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146319087
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24172	NC_009442	CTG	2	6	1378279	1378284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319088
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24225	NC_009442	GTCG	2	8	1381796	1381803	0 %	25 %	50 %	25 %	146319095
24226	NC_009442	T	6	6	1381804	1381809	0 %	100 %	0 %	0 %	146319095
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24228	NC_009442	A	6	6	1382324	1382329	100 %	0 %	0 %	0 %	146319096
24229	NC_009442	TC	3	6	1382333	1382338	0 %	50 %	0 %	50 %	146319096
24230	NC_009442	TTC	2	6	1382375	1382380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319096
24231	NC_009442	CTT	2	6	1382392	1382397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319096
24232	NC_009442	A	6	6	1382495	1382500	100 %	0 %	0 %	0 %	146319096
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24234	NC_009442	GAA	2	6	1382698	1382703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319097
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24237	NC_009442	TCAA	2	8	1382909	1382916	50 %	25 %	0 %	25 %	146319097
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24331	NC_009442	GAT	2	6	1388549	1388554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319103
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24337	NC_009442	T	7	7	1388720	1388726	0 %	100 %	0 %	0 %	146319103
24338	NC_009442	T	6	6	1388759	1388764	0 %	100 %	0 %	0 %	146319103
24339	NC_009442	CAC	2	6	1388917	1388922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319103
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24342	NC_009442	T	6	6	1389003	1389008	0 %	100 %	0 %	0 %	146319103
24343	NC_009442	CTT	2	6	1389079	1389084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319103
24344	NC_009442	CGG	2	6	1389093	1389098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146319103
24345	NC_009442	CAA	2	6	1389145	1389150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319103
24346	NC_009442	CGTC	2	8	1389157	1389164	0 %	25 %	25 %	50 %	146319103
24347	NC_009442	CCG	2	6	1389172	1389177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319103
24348	NC_009442	ATC	2	6	1389207	1389212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319103
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24352	NC_009442	AAT	2	6	1389609	1389614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319104
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