MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_009442	TTTCTT	2	12	1337014	1337025	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	146319045
23503	NC_009442	T	6	6	1337029	1337034	0 %	100 %	0 %	0 %	146319045
23504	NC_009442	CAG	2	6	1337088	1337093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319045
23505	NC_009442	CTT	2	6	1337094	1337099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319045
23506	NC_009442	ATC	2	6	1337134	1337139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319045
23507	NC_009442	CCGC	2	8	1337250	1337257	0 %	0 %	25 %	75 %	146319045
23508	NC_009442	GTA	2	6	1337344	1337349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319045
23509	NC_009442	CAA	2	6	1337400	1337405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319045
23510	NC_009442	CAA	2	6	1337454	1337459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319045
23511	NC_009442	CTT	2	6	1337479	1337484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319045
23512	NC_009442	CAG	2	6	1337626	1337631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319045
23513	NC_009442	CGG	2	6	1337642	1337647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146319045
23514	NC_009442	CAT	2	6	1337743	1337748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319045
23515	NC_009442	GCTG	2	8	1337821	1337828	0 %	25 %	50 %	25 %	146319045
23516	NC_009442	CTC	2	6	1337896	1337901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319045
23517	NC_009442	GATA	2	8	1337910	1337917	50 %	25 %	25 %	0 %	146319045
23518	NC_009442	ATC	2	6	1337984	1337989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319045
23519	NC_009442	TTG	2	6	1338041	1338046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319045
23520	NC_009442	GAT	2	6	1338049	1338054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319045
23521	NC_009442	GGT	2	6	1338226	1338231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319045
23522	NC_009442	ACC	2	6	1338263	1338268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319045
23523	NC_009442	ATA	2	6	1338290	1338295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319045
23524	NC_009442	GCA	2	6	1338360	1338365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319045
23525	NC_009442	CAC	2	6	1338370	1338375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319045
23526	NC_009442	CGGT	2	8	1338377	1338384	0 %	25 %	50 %	25 %	146319045
23527	NC_009442	TAG	2	6	1338446	1338451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319045
23528	NC_009442	GCT	2	6	1338498	1338503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319045
23529	NC_009442	CAT	2	6	1338516	1338521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319045
23530	NC_009442	GAT	2	6	1338556	1338561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319045
23531	NC_009442	CAT	2	6	1338702	1338707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319045
23532	NC_009442	CAC	2	6	1338718	1338723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319045
23533	NC_009442	CAA	2	6	1338738	1338743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319045
23534	NC_009442	TTCCG	2	10	1338793	1338802	0 %	40 %	20 %	40 %	146319045
23535	NC_009442	CTT	2	6	1338820	1338825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319045
23536	NC_009442	TCT	2	6	1338834	1338839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319045
23537	NC_009442	CTTCCG	2	12	1338951	1338962	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146319045
23538	NC_009442	ATC	2	6	1339060	1339065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319045
23539	NC_009442	TCA	2	6	1339073	1339078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319045
23540	NC_009442	GAC	2	6	1339197	1339202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319045
23541	NC_009442	CTT	2	6	1339302	1339307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319045
23542	NC_009442	TACT	2	8	1339768	1339775	25 %	50 %	0 %	25 %	146319046
23543	NC_009442	AGA	2	6	1339893	1339898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319046
23544	NC_009442	T	6	6	1339921	1339926	0 %	100 %	0 %	0 %	146319046
23545	NC_009442	GCTG	2	8	1339927	1339934	0 %	25 %	50 %	25 %	146319046
23546	NC_009442	TAA	2	6	1339983	1339988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319046
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23548	NC_009442	CAT	2	6	1340322	1340327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319047
23549	NC_009442	CAA	2	6	1340333	1340338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319047
23550	NC_009442	ATT	2	6	1340349	1340354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319047
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23552	NC_009442	CTT	2	6	1340390	1340395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319047
23553	NC_009442	CAA	2	6	1340469	1340474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319047
23554	NC_009442	CAA	2	6	1340642	1340647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319047
23555	NC_009442	TCTG	2	8	1340659	1340666	0 %	50 %	25 %	25 %	146319047
23556	NC_009442	AAC	2	6	1340700	1340705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319047
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23560	NC_009442	AAG	2	6	1340874	1340879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319047
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23564	NC_009442	A	6	6	1341093	1341098	100 %	0 %	0 %	0 %	146319048
23565	NC_009442	ACC	2	6	1341118	1341123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319048
23566	NC_009442	CAT	2	6	1341157	1341162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319048
23567	NC_009442	ATA	2	6	1341253	1341258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319048
23568	NC_009442	CCAA	2	8	1341351	1341358	50 %	0 %	0 %	50 %	146319048
23569	NC_009442	ACT	2	6	1341385	1341390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319048
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23572	NC_009442	CCGCT	2	10	1341451	1341460	0 %	20 %	20 %	60 %	146319049
23573	NC_009442	CAC	2	6	1341470	1341475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319049
23574	NC_009442	AAAG	2	8	1341501	1341508	75 %	0 %	25 %	0 %	146319049
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23577	NC_009442	CCTG	2	8	1341709	1341716	0 %	25 %	25 %	50 %	146319049
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23581	NC_009442	TCTG	2	8	1342054	1342061	0 %	50 %	25 %	25 %	146319050
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23583	NC_009442	CCAT	2	8	1342120	1342127	25 %	25 %	0 %	50 %	146319050
23584	NC_009442	ACC	2	6	1342161	1342166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319050
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23587	NC_009442	TTC	2	6	1342377	1342382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319050
23588	NC_009442	TCC	2	6	1342396	1342401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319050
23589	NC_009442	CAG	2	6	1342458	1342463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319050
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23591	NC_009442	TGTT	2	8	1342540	1342547	0 %	75 %	25 %	0 %	146319050
23592	NC_009442	GGCA	2	8	1342548	1342555	25 %	0 %	50 %	25 %	146319050
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23596	NC_009442	CA	3	6	1342873	1342878	50 %	0 %	0 %	50 %	146319050
23597	NC_009442	T	6	6	1343466	1343471	0 %	100 %	0 %	0 %	146319051
23598	NC_009442	CTTGAC	2	12	1343487	1343498	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146319051
23599	NC_009442	ACG	2	6	1343544	1343549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319051
23600	NC_009442	GAT	3	9	1343592	1343600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319051
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23602	NC_009442	ATC	2	6	1343743	1343748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319051
23603	NC_009442	GGT	2	6	1343771	1343776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319051
23604	NC_009442	CCG	2	6	1343789	1343794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319051
23605	NC_009442	ATC	2	6	1343913	1343918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319051
23606	NC_009442	GTC	2	6	1344015	1344020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319051
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23608	NC_009442	GT	3	6	1344143	1344148	0 %	50 %	50 %	0 %	146319051
23609	NC_009442	CTT	2	6	1344167	1344172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319051
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23611	NC_009442	ATG	2	6	1344226	1344231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319051
23612	NC_009442	GAC	2	6	1344284	1344289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319051
23613	NC_009442	A	6	6	1344342	1344347	100 %	0 %	0 %	0 %	146319052
23614	NC_009442	AATC	2	8	1344376	1344383	50 %	25 %	0 %	25 %	146319052
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23616	NC_009442	ACAA	2	8	1344407	1344414	75 %	0 %	0 %	25 %	146319052
23617	NC_009442	CTG	2	6	1344423	1344428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319052
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23732	NC_009442	GAT	2	6	1351025	1351030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319058
23733	NC_009442	TTC	2	6	1351088	1351093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319058
23734	NC_009442	TAAC	2	8	1351174	1351181	50 %	25 %	0 %	25 %	146319058
23735	NC_009442	TAA	2	6	1351228	1351233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319058
23736	NC_009442	ATAATC	2	12	1351313	1351324	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146319058
23737	NC_009442	GAAAG	2	10	1351465	1351474	60 %	0 %	40 %	0 %	146319058
23738	NC_009442	ATC	2	6	1351559	1351564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319058
23739	NC_009442	TTA	2	6	1351639	1351644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319059
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23743	NC_009442	AAT	2	6	1351786	1351791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319059
23744	NC_009442	CTT	2	6	1351806	1351811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319059
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23747	NC_009442	AGAGT	2	10	1351900	1351909	40 %	20 %	40 %	0 %	146319059
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23753	NC_009442	AAT	2	6	1352157	1352162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319059
23754	NC_009442	ATCA	2	8	1352179	1352186	50 %	25 %	0 %	25 %	146319059
23755	NC_009442	CCT	2	6	1352196	1352201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319059
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23759	NC_009442	CTT	2	6	1352409	1352414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319059
23760	NC_009442	GCA	2	6	1352594	1352599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319059
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23809	NC_009442	AT	3	6	1355107	1355112	50 %	50 %	0 %	0 %	146319060
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23814	NC_009442	A	6	6	1355539	1355544	100 %	0 %	0 %	0 %	146319061
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23835	NC_009442	ACAA	2	8	1356791	1356798	75 %	0 %	0 %	25 %	146319063
23836	NC_009442	TAT	2	6	1356830	1356835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319063
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23839	NC_009442	CCCT	2	8	1357118	1357125	0 %	25 %	0 %	75 %	146319063
23840	NC_009442	GGTA	2	8	1357173	1357180	25 %	25 %	50 %	0 %	146319063
23841	NC_009442	GACT	2	8	1357188	1357195	25 %	25 %	25 %	25 %	146319063
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23846	NC_009442	A	6	6	1357689	1357694	100 %	0 %	0 %	0 %	146319063
23847	NC_009442	TGG	2	6	1357707	1357712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319063
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