MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23005	NC_009442	GGT	2	6	1307409	1307414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319020
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23102	NC_009442	CAT	2	6	1311846	1311851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319025
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23117	NC_009442	TAA	2	6	1312956	1312961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319025
23118	NC_009442	ATA	2	6	1312970	1312975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319025
23119	NC_009442	TAA	2	6	1313046	1313051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319025
23120	NC_009442	TAA	2	6	1313136	1313141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319025
23121	NC_009442	TAA	2	6	1313226	1313231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319025
23122	NC_009442	A	6	6	1313257	1313262	100 %	0 %	0 %	0 %	146319025
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23144	NC_009442	CAA	2	6	1315171	1315176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319027
23145	NC_009442	TCT	2	6	1315191	1315196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319027
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23148	NC_009442	ACT	2	6	1315288	1315293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319027
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23164	NC_009442	ACCGTA	2	12	1316278	1316289	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146319028
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23180	NC_009442	ACC	2	6	1317103	1317108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319028
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23182	NC_009442	ACC	2	6	1317154	1317159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319028
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23220	NC_009442	TCA	2	6	1319535	1319540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319031
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23225	NC_009442	C	6	6	1319778	1319783	0 %	0 %	0 %	100 %	146319031
23226	NC_009442	CAT	2	6	1319857	1319862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319031
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23228	NC_009442	TCG	2	6	1319952	1319957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319031
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23231	NC_009442	GTA	2	6	1320021	1320026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319031
23232	NC_009442	GGT	2	6	1320053	1320058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319031
23233	NC_009442	GAA	2	6	1320075	1320080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319031
23234	NC_009442	TCT	2	6	1320097	1320102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319031
23235	NC_009442	AGA	2	6	1320129	1320134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319031
23236	NC_009442	AATT	2	8	1320155	1320162	50 %	50 %	0 %	0 %	146319031
23237	NC_009442	T	6	6	1320161	1320166	0 %	100 %	0 %	0 %	146319031
23238	NC_009442	CAAT	2	8	1320224	1320231	50 %	25 %	0 %	25 %	146319031
23239	NC_009442	ACAG	2	8	1320235	1320242	50 %	0 %	25 %	25 %	146319032
23240	NC_009442	GTTC	2	8	1320445	1320452	0 %	50 %	25 %	25 %	146319032
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23242	NC_009442	TTA	2	6	1320643	1320648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319032
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23245	NC_009442	GAC	2	6	1320971	1320976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319032
23246	NC_009442	TCT	2	6	1321021	1321026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319032
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23248	NC_009442	AAC	2	6	1321101	1321106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319032
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23253	NC_009442	TCT	2	6	1321420	1321425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319032
23254	NC_009442	TCAA	2	8	1321453	1321460	50 %	25 %	0 %	25 %	146319032
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23260	NC_009442	T	6	6	1322201	1322206	0 %	100 %	0 %	0 %	146319032
23261	NC_009442	T	6	6	1322294	1322299	0 %	100 %	0 %	0 %	146319032
23262	NC_009442	TTC	2	6	1322322	1322327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319032
23263	NC_009442	TCA	2	6	1322371	1322376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319032
23264	NC_009442	TGTC	2	8	1322429	1322436	0 %	50 %	25 %	25 %	146319032
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23266	NC_009442	TCA	2	6	1322666	1322671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319032
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23268	NC_009442	AGA	2	6	1322781	1322786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319032
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23270	NC_009442	T	8	8	1322809	1322816	0 %	100 %	0 %	0 %	146319032
23271	NC_009442	ATA	2	6	1322913	1322918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319033
23272	NC_009442	ACT	2	6	1322932	1322937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319033
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23297	NC_009442	CT	3	6	1324633	1324638	0 %	50 %	0 %	50 %	146319034
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23300	NC_009442	CTG	2	6	1324833	1324838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319034
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23326	NC_009442	TCT	2	6	1326257	1326262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319034
23327	NC_009442	CCTG	2	8	1326329	1326336	0 %	25 %	25 %	50 %	146319034
23328	NC_009442	GTTTG	2	10	1326390	1326399	0 %	60 %	40 %	0 %	146319034
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23330	NC_009442	CAA	2	6	1326502	1326507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319034
23331	NC_009442	CTT	2	6	1326534	1326539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319034
23332	NC_009442	CTTG	2	8	1326654	1326661	0 %	50 %	25 %	25 %	146319034
23333	NC_009442	CTG	2	6	1326673	1326678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319034
23334	NC_009442	TTC	2	6	1326769	1326774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319034
23335	NC_009442	T	6	6	1326788	1326793	0 %	100 %	0 %	0 %	146319034
23336	NC_009442	TTGGGC	2	12	1326799	1326810	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	146319034
23337	NC_009442	CTC	2	6	1326886	1326891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319034
23338	NC_009442	CTGAGC	2	12	1326931	1326942	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146319034
23339	NC_009442	TCTG	2	8	1326968	1326975	0 %	50 %	25 %	25 %	146319034
23340	NC_009442	CTGA	2	8	1326981	1326988	25 %	25 %	25 %	25 %	146319034
23341	NC_009442	GTT	2	6	1327002	1327007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319034
23342	NC_009442	CAT	2	6	1327008	1327013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319034
23343	NC_009442	TCT	2	6	1327037	1327042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319034
23344	NC_009442	ATC	2	6	1327099	1327104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319034
23345	NC_009442	CAC	2	6	1327185	1327190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319034
23346	NC_009442	CTG	2	6	1327227	1327232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319034
23347	NC_009442	AAG	2	6	1327338	1327343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319034
23348	NC_009442	CTA	2	6	1327386	1327391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319034
23349	NC_009442	CAT	2	6	1327651	1327656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319034
23350	NC_009442	A	6	6	1327673	1327678	100 %	0 %	0 %	0 %	146319034
23351	NC_009442	GAA	2	6	1327688	1327693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319034
23352	NC_009442	GCAAA	2	10	1327965	1327974	60 %	0 %	20 %	20 %	146319035
23353	NC_009442	GTT	3	9	1328015	1328023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319035
23354	NC_009442	ATT	2	6	1328049	1328054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319035
23355	NC_009442	CCT	2	6	1328087	1328092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319035
23356	NC_009442	CTG	2	6	1328120	1328125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319035
23357	NC_009442	CAT	2	6	1328192	1328197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319035
23358	NC_009442	TCG	2	6	1328269	1328274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319035
23359	NC_009442	ATG	2	6	1328338	1328343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319035
23360	NC_009442	AC	3	6	1328372	1328377	50 %	0 %	0 %	50 %	146319035
23361	NC_009442	CAT	2	6	1328378	1328383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319035
23362	NC_009442	GTA	2	6	1328412	1328417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319035
23363	NC_009442	GCCT	2	8	1328624	1328631	0 %	25 %	25 %	50 %	146319036
23364	NC_009442	CCAA	2	8	1328664	1328671	50 %	0 %	0 %	50 %	146319036
23365	NC_009442	A	6	6	1328670	1328675	100 %	0 %	0 %	0 %	146319036
23366	NC_009442	GTC	2	6	1328751	1328756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319036
23367	NC_009442	GTT	2	6	1328779	1328784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319036
23368	NC_009442	AAT	2	6	1328855	1328860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319036
23369	NC_009442	TTTA	2	8	1328969	1328976	25 %	75 %	0 %	0 %	146319037
23370	NC_009442	CAT	2	6	1328993	1328998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319037
23371	NC_009442	CTG	2	6	1329209	1329214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319037
23372	NC_009442	TAA	2	6	1329221	1329226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319037
23373	NC_009442	TGA	2	6	1329314	1329319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319037
23374	NC_009442	AT	3	6	1329476	1329481	50 %	50 %	0 %	0 %	146319037
23375	NC_009442	A	7	7	1329501	1329507	100 %	0 %	0 %	0 %	146319038
23376	NC_009442	T	6	6	1329514	1329519	0 %	100 %	0 %	0 %	146319038
23377	NC_009442	GAC	2	6	1329570	1329575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319038
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23379	NC_009442	CCA	2	6	1329631	1329636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319038
23380	NC_009442	AGA	2	6	1329695	1329700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319039
23381	NC_009442	TTTG	2	8	1329703	1329710	0 %	75 %	25 %	0 %	146319039
23382	NC_009442	CCA	2	6	1329877	1329882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319039
23383	NC_009442	ACTTG	2	10	1329913	1329922	20 %	40 %	20 %	20 %	146319039
23384	NC_009442	CTGA	2	8	1329947	1329954	25 %	25 %	25 %	25 %	146319039
23385	NC_009442	T	6	6	1329997	1330002	0 %	100 %	0 %	0 %	146319039
23386	NC_009442	TTTTA	2	10	1330076	1330085	20 %	80 %	0 %	0 %	146319039
23387	NC_009442	GCAATG	2	12	1330089	1330100	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146319039
23388	NC_009442	CTT	2	6	1330111	1330116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319039
23389	NC_009442	GCTG	2	8	1330117	1330124	0 %	25 %	50 %	25 %	146319039
23390	NC_009442	AGAT	2	8	1330227	1330234	50 %	25 %	25 %	0 %	146319039
23391	NC_009442	TCTGC	2	10	1330237	1330246	0 %	40 %	20 %	40 %	146319039
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23393	NC_009442	TCTG	2	8	1330314	1330321	0 %	50 %	25 %	25 %	146319039
23394	NC_009442	GCT	2	6	1330323	1330328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319039
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23401	NC_009442	AAG	2	6	1330662	1330667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319039
23402	NC_009442	AG	3	6	1330687	1330692	50 %	0 %	50 %	0 %	146319039
23403	NC_009442	GAC	2	6	1330703	1330708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319039
23404	NC_009442	AAT	2	6	1330787	1330792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319039
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23409	NC_009442	CTT	2	6	1331014	1331019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319039
23410	NC_009442	GCC	2	6	1331061	1331066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319039
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23419	NC_009442	TTC	2	6	1331518	1331523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319040
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23421	NC_009442	CTT	2	6	1331676	1331681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319040
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23424	NC_009442	TATT	2	8	1332318	1332325	25 %	75 %	0 %	0 %	146319041
23425	NC_009442	T	7	7	1332336	1332342	0 %	100 %	0 %	0 %	146319041
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23432	NC_009442	GACT	2	8	1332535	1332542	25 %	25 %	25 %	25 %	146319041
23433	NC_009442	TGA	2	6	1332570	1332575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319041
23434	NC_009442	TAC	2	6	1332602	1332607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319041
23435	NC_009442	TGA	2	6	1332609	1332614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319041
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23438	NC_009442	CAT	2	6	1332642	1332647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319041
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23443	NC_009442	TACCT	2	10	1333137	1333146	20 %	40 %	0 %	40 %	146319041
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23447	NC_009442	AGTA	2	8	1333484	1333491	50 %	25 %	25 %	0 %	146319041
23448	NC_009442	TCT	2	6	1333513	1333518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319041
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23450	NC_009442	AATT	2	8	1333638	1333645	50 %	50 %	0 %	0 %	146319041
23451	NC_009442	GAA	2	6	1333676	1333681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319041
23452	NC_009442	TCAA	2	8	1333687	1333694	50 %	25 %	0 %	25 %	146319041
23453	NC_009442	C	6	6	1333711	1333716	0 %	0 %	0 %	100 %	146319041
23454	NC_009442	T	6	6	1333746	1333751	0 %	100 %	0 %	0 %	146319041
23455	NC_009442	AC	3	6	1333784	1333789	50 %	0 %	0 %	50 %	146319041
23456	NC_009442	GTG	2	6	1333886	1333891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319041
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23458	NC_009442	ATT	2	6	1333980	1333985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319041
23459	NC_009442	TGG	2	6	1333986	1333991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319041
23460	NC_009442	AAT	2	6	1334052	1334057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319041
23461	NC_009442	ACAA	2	8	1334123	1334130	75 %	0 %	0 %	25 %	146319041
23462	NC_009442	T	6	6	1334343	1334348	0 %	100 %	0 %	0 %	146319042
23463	NC_009442	GTA	2	6	1334454	1334459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319042
23464	NC_009442	TCT	2	6	1334515	1334520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319042
23465	NC_009442	GCC	2	6	1334530	1334535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319042
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23467	NC_009442	ATA	2	6	1334584	1334589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319042
23468	NC_009442	CCCGCT	2	12	1334597	1334608	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	146319042
23469	NC_009442	TCT	2	6	1334704	1334709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319042
23470	NC_009442	CAG	2	6	1334759	1334764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319042
23471	NC_009442	CTG	2	6	1334778	1334783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319042
23472	NC_009442	TCT	2	6	1334911	1334916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319042
23473	NC_009442	CAT	2	6	1335002	1335007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319042
23474	NC_009442	TACC	2	8	1335104	1335111	25 %	25 %	0 %	50 %	146319042
23475	NC_009442	A	6	6	1335130	1335135	100 %	0 %	0 %	0 %	146319042
23476	NC_009442	TC	3	6	1335200	1335205	0 %	50 %	0 %	50 %	146319042
23477	NC_009442	ATA	2	6	1335307	1335312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319042
23478	NC_009442	ATCA	2	8	1335319	1335326	50 %	25 %	0 %	25 %	146319042
23479	NC_009442	TAA	2	6	1335341	1335346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319043
23480	NC_009442	GT	3	6	1335353	1335358	0 %	50 %	50 %	0 %	146319043
23481	NC_009442	AGC	2	6	1335371	1335376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319043
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23487	NC_009442	GGT	2	6	1335884	1335889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319043
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23499	NC_009442	T	6	6	1336922	1336927	0 %	100 %	0 %	0 %	146319044
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