MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21003	NC_009442	ATC	2	6	1204311	1204316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318916
21004	NC_009442	ACC	2	6	1204332	1204337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318916
21005	NC_009442	ACG	2	6	1204374	1204379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318916
21006	NC_009442	ATA	2	6	1204417	1204422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318916
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21009	NC_009442	CAG	2	6	1204771	1204776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318917
21010	NC_009442	AAC	2	6	1204932	1204937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318917
21011	NC_009442	TTC	2	6	1204992	1204997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318917
21012	NC_009442	AGT	2	6	1205063	1205068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318917
21013	NC_009442	CTT	2	6	1205108	1205113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318917
21014	NC_009442	ACT	2	6	1205185	1205190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318917
21015	NC_009442	ATC	2	6	1205238	1205243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318917
21016	NC_009442	AGA	2	6	1205248	1205253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318917
21017	NC_009442	CAA	2	6	1205270	1205275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318917
21018	NC_009442	ATA	2	6	1205335	1205340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318917
21019	NC_009442	ACT	2	6	1205344	1205349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318917
21020	NC_009442	TAC	2	6	1205392	1205397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318918
21021	NC_009442	TCA	2	6	1205400	1205405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318918
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21023	NC_009442	ATA	2	6	1205535	1205540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318918
21024	NC_009442	GTTT	2	8	1205610	1205617	0 %	75 %	25 %	0 %	146318918
21025	NC_009442	CAT	2	6	1205656	1205661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318918
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21027	NC_009442	GTG	2	6	1205720	1205725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146318918
21028	NC_009442	GCA	3	9	1205826	1205834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318918
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21033	NC_009442	CAT	2	6	1205950	1205955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318918
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21050	NC_009442	TCA	2	6	1206423	1206428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318918
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21054	NC_009442	AGACT	2	10	1206670	1206679	40 %	20 %	20 %	20 %	146318919
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21060	NC_009442	TA	3	6	1206835	1206840	50 %	50 %	0 %	0 %	146318919
21061	NC_009442	TAGCG	2	10	1206860	1206869	20 %	20 %	40 %	20 %	146318919
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21069	NC_009442	AT	3	6	1207333	1207338	50 %	50 %	0 %	0 %	146318920
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21115	NC_009442	CAT	2	6	1209913	1209918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318921
21116	NC_009442	TTGG	2	8	1209939	1209946	0 %	50 %	50 %	0 %	146318921
21117	NC_009442	TTG	2	6	1210052	1210057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318921
21118	NC_009442	TCC	2	6	1210086	1210091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318921
21119	NC_009442	ATA	2	6	1210115	1210120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318921
21120	NC_009442	CT	3	6	1210123	1210128	0 %	50 %	0 %	50 %	146318921
21121	NC_009442	T	7	7	1210132	1210138	0 %	100 %	0 %	0 %	146318921
21122	NC_009442	ATC	2	6	1210349	1210354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318921
21123	NC_009442	TAA	2	6	1210571	1210576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318921
21124	NC_009442	TG	4	8	1210584	1210591	0 %	50 %	50 %	0 %	146318921
21125	NC_009442	AGT	2	6	1210678	1210683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318921
21126	NC_009442	CTT	2	6	1210727	1210732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318921
21127	NC_009442	AATC	2	8	1210903	1210910	50 %	25 %	0 %	25 %	146318921
21128	NC_009442	GAC	2	6	1210957	1210962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318921
21129	NC_009442	TG	3	6	1210981	1210986	0 %	50 %	50 %	0 %	146318921
21130	NC_009442	GAA	2	6	1211145	1211150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318921
21131	NC_009442	T	7	7	1211154	1211160	0 %	100 %	0 %	0 %	146318921
21132	NC_009442	AAT	2	6	1211249	1211254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318921
21133	NC_009442	T	6	6	1211266	1211271	0 %	100 %	0 %	0 %	146318921
21134	NC_009442	TCA	2	6	1211286	1211291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318921
21135	NC_009442	A	6	6	1211298	1211303	100 %	0 %	0 %	0 %	146318921
21136	NC_009442	CAT	2	6	1211305	1211310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318921
21137	NC_009442	TTG	2	6	1211395	1211400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318921
21138	NC_009442	T	6	6	1211401	1211406	0 %	100 %	0 %	0 %	146318921
21139	NC_009442	CT	3	6	1211420	1211425	0 %	50 %	0 %	50 %	146318921
21140	NC_009442	TC	3	6	1211522	1211527	0 %	50 %	0 %	50 %	146318921
21141	NC_009442	ATT	2	6	1211538	1211543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318921
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21143	NC_009442	GCT	2	6	1211884	1211889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318922
21144	NC_009442	AGCA	2	8	1211910	1211917	50 %	0 %	25 %	25 %	146318922
21145	NC_009442	AGC	2	6	1211991	1211996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318922
21146	NC_009442	T	6	6	1212036	1212041	0 %	100 %	0 %	0 %	146318922
21147	NC_009442	CGG	2	6	1212046	1212051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146318922
21148	NC_009442	TAG	2	6	1212064	1212069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318922
21149	NC_009442	GTA	2	6	1212123	1212128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318922
21150	NC_009442	AAC	2	6	1212171	1212176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318922
21151	NC_009442	TTGAT	2	10	1212262	1212271	20 %	60 %	20 %	0 %	146318923
21152	NC_009442	GAC	2	6	1212316	1212321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318923
21153	NC_009442	GTT	2	6	1212322	1212327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318923
21154	NC_009442	T	6	6	1212326	1212331	0 %	100 %	0 %	0 %	146318923
21155	NC_009442	CCA	2	6	1212381	1212386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318923
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21157	NC_009442	T	6	6	1212472	1212477	0 %	100 %	0 %	0 %	146318924
21158	NC_009442	CGTC	2	8	1212512	1212519	0 %	25 %	25 %	50 %	146318924
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21162	NC_009442	ACA	2	6	1212740	1212745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318924
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21164	NC_009442	GTT	2	6	1212759	1212764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318924
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21171	NC_009442	GATA	2	8	1213225	1213232	50 %	25 %	25 %	0 %	146318925
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21173	NC_009442	CAT	2	6	1213257	1213262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318925
21174	NC_009442	CTG	2	6	1213263	1213268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318925
21175	NC_009442	GTCT	2	8	1213342	1213349	0 %	50 %	25 %	25 %	146318925
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21178	NC_009442	CCAT	2	8	1213463	1213470	25 %	25 %	0 %	50 %	146318925
21179	NC_009442	CCA	2	6	1213478	1213483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318925
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21184	NC_009442	GCAA	2	8	1213661	1213668	50 %	0 %	25 %	25 %	146318925
21185	NC_009442	TAAG	2	8	1213753	1213760	50 %	25 %	25 %	0 %	146318925
21186	NC_009442	AAT	2	6	1213780	1213785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318925
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21197	NC_009442	AAT	2	6	1214221	1214226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318926
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21201	NC_009442	CTT	2	6	1214307	1214312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318926
21202	NC_009442	ATT	2	6	1214333	1214338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318926
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21204	NC_009442	TTGC	2	8	1214416	1214423	0 %	50 %	25 %	25 %	146318927
21205	NC_009442	ATG	2	6	1214458	1214463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318927
21206	NC_009442	ACG	2	6	1214464	1214469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318927
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21209	NC_009442	GAC	2	6	1214487	1214492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318927
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21212	NC_009442	AAT	2	6	1214609	1214614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318928
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21215	NC_009442	T	7	7	1214691	1214697	0 %	100 %	0 %	0 %	146318928
21216	NC_009442	ATA	2	6	1214712	1214717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318928
21217	NC_009442	T	6	6	1214777	1214782	0 %	100 %	0 %	0 %	146318928
21218	NC_009442	CAATTT	2	12	1214792	1214803	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	146318928
21219	NC_009442	CTGCA	2	10	1214805	1214814	20 %	20 %	20 %	40 %	146318928
21220	NC_009442	ACT	2	6	1214881	1214886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318928
21221	NC_009442	AATA	2	8	1214913	1214920	75 %	25 %	0 %	0 %	146318928
21222	NC_009442	ATG	2	6	1214995	1215000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318928
21223	NC_009442	ATT	2	6	1215242	1215247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318929
21224	NC_009442	AAC	2	6	1215306	1215311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318929
21225	NC_009442	TCT	2	6	1215327	1215332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318929
21226	NC_009442	GTC	2	6	1215363	1215368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318929
21227	NC_009442	GAT	2	6	1215388	1215393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318929
21228	NC_009442	T	7	7	1215429	1215435	0 %	100 %	0 %	0 %	146318929
21229	NC_009442	TTC	2	6	1215479	1215484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318929
21230	NC_009442	TTC	2	6	1215507	1215512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318929
21231	NC_009442	CCTT	2	8	1215657	1215664	0 %	50 %	0 %	50 %	146318929
21232	NC_009442	ATT	2	6	1215717	1215722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318929
21233	NC_009442	T	6	6	1215721	1215726	0 %	100 %	0 %	0 %	146318929
21234	NC_009442	TAAA	2	8	1215740	1215747	75 %	25 %	0 %	0 %	146318929
21235	NC_009442	ATC	2	6	1215749	1215754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318929
21236	NC_009442	TGA	2	6	1215756	1215761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318929
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21340	NC_009442	T	6	6	1220636	1220641	0 %	100 %	0 %	0 %	146318934
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21349	NC_009442	TCT	2	6	1220975	1220980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318934
21350	NC_009442	AC	3	6	1220982	1220987	50 %	0 %	0 %	50 %	146318934
21351	NC_009442	TAA	2	6	1221043	1221048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318934
21352	NC_009442	TGA	2	6	1221051	1221056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318934
21353	NC_009442	T	6	6	1221065	1221070	0 %	100 %	0 %	0 %	146318934
21354	NC_009442	CAT	2	6	1221091	1221096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318934
21355	NC_009442	GATA	2	8	1221121	1221128	50 %	25 %	25 %	0 %	146318934
21356	NC_009442	TCA	2	6	1221144	1221149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318934
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21359	NC_009442	TCCA	2	8	1221209	1221216	25 %	25 %	0 %	50 %	146318934
21360	NC_009442	AAATA	2	10	1221218	1221227	80 %	20 %	0 %	0 %	146318934
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21467	NC_009442	GTT	2	6	1225558	1225563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318939
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21469	NC_009442	A	6	6	1225632	1225637	100 %	0 %	0 %	0 %	146318939
21470	NC_009442	AAT	2	6	1225662	1225667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318939
21471	NC_009442	TTTG	3	12	1225693	1225704	0 %	75 %	25 %	0 %	146318939
21472	NC_009442	GTT	2	6	1225743	1225748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318939
21473	NC_009442	A	7	7	1225758	1225764	100 %	0 %	0 %	0 %	146318939
21474	NC_009442	TC	3	6	1225821	1225826	0 %	50 %	0 %	50 %	146318939
21475	NC_009442	TAC	2	6	1225832	1225837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318939
21476	NC_009442	TTA	2	6	1225868	1225873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318939
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21479	NC_009442	TAA	2	6	1226090	1226095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318939
21480	NC_009442	TAA	2	6	1226100	1226105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318939
21481	NC_009442	TCTG	2	8	1226115	1226122	0 %	50 %	25 %	25 %	146318939
21482	NC_009442	ATT	2	6	1226160	1226165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318939
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21490	NC_009442	TCAT	2	8	1226539	1226546	25 %	50 %	0 %	25 %	146318939
21491	NC_009442	CTT	2	6	1226591	1226596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318939
21492	NC_009442	A	7	7	1226637	1226643	100 %	0 %	0 %	0 %	146318939
21493	NC_009442	AATA	2	8	1226720	1226727	75 %	25 %	0 %	0 %	146318939
21494	NC_009442	AT	3	6	1226755	1226760	50 %	50 %	0 %	0 %	146318939
21495	NC_009442	AAC	2	6	1226766	1226771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318939
21496	NC_009442	TATT	2	8	1226776	1226783	25 %	75 %	0 %	0 %	146318939
21497	NC_009442	CAA	2	6	1226799	1226804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318939
21498	NC_009442	TTA	2	6	1226831	1226836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318939
21499	NC_009442	AGC	2	6	1226841	1226846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318939
21500	NC_009442	TGC	2	6	1226879	1226884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318940

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