MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20012	NC_009442	TAG	2	6	1147807	1147812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318856
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20014	NC_009442	TTTA	2	8	1147859	1147866	25 %	75 %	0 %	0 %	146318856
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20118	NC_009442	CTT	2	6	1153459	1153464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318861
20119	NC_009442	TCC	2	6	1153476	1153481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318861
20120	NC_009442	AGA	2	6	1153531	1153536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318861
20121	NC_009442	ATC	2	6	1153583	1153588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318861
20122	NC_009442	GCT	2	6	1153640	1153645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318861
20123	NC_009442	ACG	2	6	1153680	1153685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318861
20124	NC_009442	TAC	2	6	1153691	1153696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318861
20125	NC_009442	CGA	2	6	1153750	1153755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318861
20126	NC_009442	CCAG	2	8	1153801	1153808	25 %	0 %	25 %	50 %	146318861
20127	NC_009442	CGT	2	6	1153841	1153846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318861
20128	NC_009442	CTCTG	2	10	1153915	1153924	0 %	40 %	20 %	40 %	146318861
20129	NC_009442	GGT	3	9	1153940	1153948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146318861
20130	NC_009442	GTT	2	6	1154021	1154026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318861
20131	NC_009442	ATT	2	6	1154126	1154131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318861
20132	NC_009442	TCCT	2	8	1154132	1154139	0 %	50 %	0 %	50 %	146318861
20133	NC_009442	AAGA	2	8	1154147	1154154	75 %	0 %	25 %	0 %	146318861
20134	NC_009442	AGTTG	2	10	1154269	1154278	20 %	40 %	40 %	0 %	146318861
20135	NC_009442	ACG	2	6	1154322	1154327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318861
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20137	NC_009442	TGA	2	6	1154604	1154609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318861
20138	NC_009442	CA	3	6	1154676	1154681	50 %	0 %	0 %	50 %	146318861
20139	NC_009442	TTGA	2	8	1154774	1154781	25 %	50 %	25 %	0 %	146318861
20140	NC_009442	CTG	2	6	1154796	1154801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318861
20141	NC_009442	CTC	2	6	1154828	1154833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318861
20142	NC_009442	ACT	2	6	1154835	1154840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318861
20143	NC_009442	ACCA	2	8	1154955	1154962	50 %	0 %	0 %	50 %	146318861
20144	NC_009442	ATC	2	6	1155060	1155065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318861
20145	NC_009442	ACG	2	6	1155111	1155116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318861
20146	NC_009442	CA	3	6	1155139	1155144	50 %	0 %	0 %	50 %	146318861
20147	NC_009442	GAA	2	6	1155152	1155157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318861
20148	NC_009442	AGA	2	6	1155165	1155170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318861
20149	NC_009442	CTA	2	6	1155184	1155189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318861
20150	NC_009442	CAG	2	6	1155192	1155197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318861
20151	NC_009442	ACA	2	6	1155206	1155211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318861
20152	NC_009442	CCATT	2	10	1155216	1155225	20 %	40 %	0 %	40 %	146318861
20153	NC_009442	GATATG	2	12	1155242	1155253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318861
20154	NC_009442	TGC	2	6	1155274	1155279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318861
20155	NC_009442	TCC	2	6	1155321	1155326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318861
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20157	NC_009442	AACA	2	8	1155368	1155375	75 %	0 %	0 %	25 %	146318861
20158	NC_009442	CT	3	6	1155389	1155394	0 %	50 %	0 %	50 %	146318861
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20164	NC_009442	A	7	7	1155616	1155622	100 %	0 %	0 %	0 %	146318862
20165	NC_009442	A	6	6	1155638	1155643	100 %	0 %	0 %	0 %	146318862
20166	NC_009442	ATA	2	6	1155648	1155653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318862
20167	NC_009442	A	7	7	1155659	1155665	100 %	0 %	0 %	0 %	146318862
20168	NC_009442	CGAC	2	8	1155670	1155677	25 %	0 %	25 %	50 %	146318862
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20188	NC_009442	ATC	2	6	1156612	1156617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318863
20189	NC_009442	CTT	2	6	1156653	1156658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318863
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20219	NC_009442	T	6	6	1158541	1158546	0 %	100 %	0 %	0 %	146318865
20220	NC_009442	CTA	2	6	1158564	1158569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318865
20221	NC_009442	GTTG	2	8	1158570	1158577	0 %	50 %	50 %	0 %	146318865
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20223	NC_009442	TA	3	6	1158624	1158629	50 %	50 %	0 %	0 %	146318865
20224	NC_009442	TAA	2	6	1158858	1158863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318865
20225	NC_009442	TCA	2	6	1158917	1158922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318865
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20227	NC_009442	CTT	2	6	1159107	1159112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318865
20228	NC_009442	AAG	2	6	1159211	1159216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318865
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20230	NC_009442	T	7	7	1159377	1159383	0 %	100 %	0 %	0 %	146318865
20231	NC_009442	CTA	2	6	1159554	1159559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318865
20232	NC_009442	CAAT	2	8	1159727	1159734	50 %	25 %	0 %	25 %	146318865
20233	NC_009442	GAT	2	6	1159989	1159994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318865
20234	NC_009442	TAA	2	6	1160050	1160055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318865
20235	NC_009442	TTG	2	6	1160095	1160100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318865
20236	NC_009442	CTG	2	6	1160127	1160132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318865
20237	NC_009442	CTA	2	6	1160142	1160147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318865
20238	NC_009442	AGA	2	6	1160200	1160205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318865
20239	NC_009442	CTC	2	6	1160230	1160235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318865
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20243	NC_009442	GCA	2	6	1160634	1160639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318866
20244	NC_009442	TGA	2	6	1160640	1160645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318866
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20249	NC_009442	GTTT	2	8	1160724	1160731	0 %	75 %	25 %	0 %	146318866
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20251	NC_009442	GCGAT	2	10	1160871	1160880	20 %	20 %	40 %	20 %	146318866
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20255	NC_009442	CTT	3	9	1161154	1161162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318866
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20351	NC_009442	CACCAA	2	12	1165820	1165831	50 %	0 %	0 %	50 %	146318872
20352	NC_009442	AAAG	2	8	1165909	1165916	75 %	0 %	25 %	0 %	146318872
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20354	NC_009442	GCT	2	6	1165990	1165995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318872
20355	NC_009442	T	6	6	1166030	1166035	0 %	100 %	0 %	0 %	146318873
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20462	NC_009442	TCA	2	6	1172730	1172735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318880
20463	NC_009442	T	6	6	1172798	1172803	0 %	100 %	0 %	0 %	146318880
20464	NC_009442	TCT	2	6	1172827	1172832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318880
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20467	NC_009442	CGC	2	6	1173015	1173020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146318880
20468	NC_009442	AAG	2	6	1173051	1173056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318880
20469	NC_009442	CAAAAT	2	12	1173057	1173068	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146318880
20470	NC_009442	ACC	2	6	1173094	1173099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318880
20471	NC_009442	A	6	6	1173150	1173155	100 %	0 %	0 %	0 %	146318880
20472	NC_009442	GA	3	6	1173159	1173164	50 %	0 %	50 %	0 %	146318880
20473	NC_009442	CAT	2	6	1173210	1173215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318880
20474	NC_009442	CTA	2	6	1173231	1173236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318880
20475	NC_009442	TGT	2	6	1173386	1173391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318880
20476	NC_009442	TTC	2	6	1173398	1173403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318880
20477	NC_009442	AT	3	6	1173434	1173439	50 %	50 %	0 %	0 %	146318880
20478	NC_009442	TGAGC	2	10	1173510	1173519	20 %	20 %	40 %	20 %	146318880
20479	NC_009442	T	6	6	1173526	1173531	0 %	100 %	0 %	0 %	146318880
20480	NC_009442	TCCT	2	8	1173553	1173560	0 %	50 %	0 %	50 %	146318880
20481	NC_009442	TCA	2	6	1173561	1173566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318880
20482	NC_009442	ACG	2	6	1173685	1173690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318880
20483	NC_009442	CAT	2	6	1173763	1173768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318880
20484	NC_009442	ATA	2	6	1173772	1173777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318880
20485	NC_009442	CTTT	2	8	1173791	1173798	0 %	75 %	0 %	25 %	146318880
20486	NC_009442	ATC	2	6	1173964	1173969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318881
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20488	NC_009442	CCAA	2	8	1174041	1174048	50 %	0 %	0 %	50 %	146318881
20489	NC_009442	AAAT	2	8	1174066	1174073	75 %	25 %	0 %	0 %	146318881
20490	NC_009442	TAAA	2	8	1174112	1174119	75 %	25 %	0 %	0 %	146318881
20491	NC_009442	ATAG	2	8	1174133	1174140	50 %	25 %	25 %	0 %	146318881
20492	NC_009442	GAA	2	6	1174173	1174178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318881
20493	NC_009442	A	6	6	1174188	1174193	100 %	0 %	0 %	0 %	146318881
20494	NC_009442	TTC	2	6	1174209	1174214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318881
20495	NC_009442	ACT	2	6	1174234	1174239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318881
20496	NC_009442	GAT	2	6	1174326	1174331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318881
20497	NC_009442	TCCC	2	8	1174625	1174632	0 %	25 %	0 %	75 %	146318882
20498	NC_009442	AAT	2	6	1174647	1174652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318882
20499	NC_009442	TCA	2	6	1174723	1174728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318882
20500	NC_009442	TCC	2	6	1174955	1174960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318883

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