MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19234	NC_009442	ATT	2	6	1105324	1105329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318810
19235	NC_009442	CTT	2	6	1105392	1105397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318810
19236	NC_009442	CCT	2	6	1105445	1105450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318810
19237	NC_009442	CAA	2	6	1105455	1105460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318810
19238	NC_009442	TCA	2	6	1105463	1105468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318810
19239	NC_009442	GCT	3	9	1105481	1105489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318810
19240	NC_009442	ACA	2	6	1105580	1105585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318810
19241	NC_009442	CCT	2	6	1105625	1105630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318811
19242	NC_009442	AAGT	2	8	1105711	1105718	50 %	25 %	25 %	0 %	146318811
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19246	NC_009442	CAT	2	6	1105976	1105981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318811
19247	NC_009442	AC	3	6	1106008	1106013	50 %	0 %	0 %	50 %	146318811
19248	NC_009442	CTT	2	6	1106066	1106071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318811
19249	NC_009442	TAA	2	6	1106078	1106083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318811
19250	NC_009442	TCA	2	6	1106116	1106121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318811
19251	NC_009442	CCT	2	6	1106147	1106152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318811
19252	NC_009442	TCT	2	6	1106203	1106208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318811
19253	NC_009442	AAT	2	6	1106235	1106240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318811
19254	NC_009442	TTC	2	6	1106250	1106255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318811
19255	NC_009442	ATC	2	6	1106292	1106297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318811
19256	NC_009442	GTGG	2	8	1106363	1106370	0 %	25 %	75 %	0 %	146318811
19257	NC_009442	AAC	2	6	1106418	1106423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318811
19258	NC_009442	T	7	7	1106567	1106573	0 %	100 %	0 %	0 %	146318811
19259	NC_009442	T	6	6	1106688	1106693	0 %	100 %	0 %	0 %	146318811
19260	NC_009442	A	6	6	1106744	1106749	100 %	0 %	0 %	0 %	146318812
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19262	NC_009442	CTT	2	6	1106815	1106820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318812
19263	NC_009442	CAA	2	6	1106824	1106829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318812
19264	NC_009442	AAT	2	6	1106866	1106871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318812
19265	NC_009442	GATAA	2	10	1106881	1106890	60 %	20 %	20 %	0 %	146318812
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19269	NC_009442	TAA	2	6	1107545	1107550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318813
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19302	NC_009442	GACA	2	8	1110059	1110066	50 %	0 %	25 %	25 %	146318817
19303	NC_009442	ATA	2	6	1110112	1110117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318817
19304	NC_009442	CAA	2	6	1110224	1110229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318817
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19309	NC_009442	CTT	2	6	1110332	1110337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318817
19310	NC_009442	CTG	2	6	1110389	1110394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318817
19311	NC_009442	TCA	2	6	1110400	1110405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318817
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19315	NC_009442	TGA	2	6	1110548	1110553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318817
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19319	NC_009442	CTT	2	6	1111016	1111021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318817
19320	NC_009442	ATT	2	6	1111062	1111067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318817
19321	NC_009442	CGT	2	6	1111097	1111102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318817
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19324	NC_009442	TCA	3	9	1111225	1111233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318817
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19329	NC_009442	CAT	2	6	1111367	1111372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318817
19330	NC_009442	ACA	2	6	1111442	1111447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318817
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19332	NC_009442	AGCAA	2	10	1111498	1111507	60 %	0 %	20 %	20 %	146318818
19333	NC_009442	TGA	2	6	1111520	1111525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318818
19334	NC_009442	TTGAA	2	10	1111552	1111561	40 %	40 %	20 %	0 %	146318818
19335	NC_009442	T	6	6	1111598	1111603	0 %	100 %	0 %	0 %	146318818
19336	NC_009442	CTG	2	6	1111628	1111633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318818
19337	NC_009442	ATT	2	6	1111737	1111742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318818
19338	NC_009442	ACC	2	6	1111807	1111812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318818
19339	NC_009442	CAA	2	6	1111815	1111820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318818
19340	NC_009442	CTT	2	6	1111823	1111828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318818
19341	NC_009442	CTT	2	6	1111958	1111963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318818
19342	NC_009442	AGA	2	6	1111968	1111973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318818
19343	NC_009442	CTT	2	6	1112141	1112146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318818
19344	NC_009442	AAT	2	6	1112168	1112173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318818
19345	NC_009442	AG	3	6	1112203	1112208	50 %	0 %	50 %	0 %	146318818
19346	NC_009442	ATA	3	9	1112220	1112228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318818
19347	NC_009442	CCTT	2	8	1112238	1112245	0 %	50 %	0 %	50 %	146318818
19348	NC_009442	T	7	7	1112244	1112250	0 %	100 %	0 %	0 %	146318818
19349	NC_009442	CAACT	2	10	1112337	1112346	40 %	20 %	0 %	40 %	146318818
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19352	NC_009442	T	7	7	1112483	1112489	0 %	100 %	0 %	0 %	146318818
19353	NC_009442	CCT	2	6	1112497	1112502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318818
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19466	NC_009442	ACC	2	6	1118231	1118236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318826
19467	NC_009442	CAC	2	6	1118296	1118301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318826
19468	NC_009442	ACC	2	6	1118318	1118323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318826
19469	NC_009442	AGG	2	6	1118340	1118345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146318826
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19472	NC_009442	ATC	2	6	1118651	1118656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318826
19473	NC_009442	TA	3	6	1118662	1118667	50 %	50 %	0 %	0 %	146318826
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19492	NC_009442	GA	3	6	1119648	1119653	50 %	0 %	50 %	0 %	146318827
19493	NC_009442	ATT	2	6	1119661	1119666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146318827
19494	NC_009442	AGAC	2	8	1119682	1119689	50 %	0 %	25 %	25 %	146318828
19495	NC_009442	AGC	2	6	1119710	1119715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318828
19496	NC_009442	ATTCA	2	10	1119716	1119725	40 %	40 %	0 %	20 %	146318828
19497	NC_009442	TGT	2	6	1119746	1119751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318828
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19499	NC_009442	ATC	2	6	1119824	1119829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318828
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