MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 36610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_009442	CAAGA	2	10	951991	952000	60 %	0 %	20 %	20 %	146318623
16503	NC_009442	TCA	2	6	952042	952047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318623
16504	NC_009442	AAG	2	6	952066	952071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318623
16505	NC_009442	CCA	2	6	952105	952110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318623
16506	NC_009442	ATA	2	6	952123	952128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318623
16507	NC_009442	CAA	2	6	952148	952153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318623
16508	NC_009442	TAA	2	6	952154	952159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318623
16509	NC_009442	GAT	2	6	952197	952202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318623
16510	NC_009442	TGA	2	6	952289	952294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146318623
16511	NC_009442	TGAT	2	8	952309	952316	25 %	50 %	25 %	0 %	146318623
16512	NC_009442	TTC	2	6	952420	952425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318623
16513	NC_009442	AGC	2	6	952449	952454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146318623
16514	NC_009442	AAT	2	6	952479	952484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318623
16515	NC_009442	CTTG	2	8	952505	952512	0 %	50 %	25 %	25 %	146318623
16516	NC_009442	ATA	2	6	952513	952518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318623
16517	NC_009442	GAA	2	6	952613	952618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318623
16518	NC_009442	TGT	2	6	952637	952642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318623
16519	NC_009442	TGT	2	6	952696	952701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318623
16520	NC_009442	TCT	2	6	952730	952735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318623
16521	NC_009442	ATC	2	6	952792	952797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318623
16522	NC_009442	TAA	2	6	952878	952883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318623
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16524	NC_009442	CTC	2	6	953037	953042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146318623
16525	NC_009442	CCA	2	6	953044	953049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318623
16526	NC_009442	GAAA	2	8	953158	953165	75 %	0 %	25 %	0 %	146318623
16527	NC_009442	GTT	2	6	953181	953186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146318623
16528	NC_009442	CATC	2	8	953207	953214	25 %	25 %	0 %	50 %	146318623
16529	NC_009442	ATTCA	2	10	953220	953229	40 %	40 %	0 %	20 %	146318623
16530	NC_009442	TTGA	2	8	953304	953311	25 %	50 %	25 %	0 %	146318623
16531	NC_009442	ATC	2	6	953337	953342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318623
16532	NC_009442	ATC	2	6	953388	953393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318623
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16534	NC_009442	T	6	6	953595	953600	0 %	100 %	0 %	0 %	146318623
16535	NC_009442	TTC	2	6	953616	953621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146318624
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16537	NC_009442	GT	3	6	953904	953909	0 %	50 %	50 %	0 %	146318624
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16540	NC_009442	CCA	2	6	954051	954056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318625
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16543	NC_009442	ATC	2	6	954261	954266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318625
16544	NC_009442	ACCA	2	8	954330	954337	50 %	0 %	0 %	50 %	146318625
16545	NC_009442	A	6	6	954350	954355	100 %	0 %	0 %	0 %	146318625
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16549	NC_009442	CGT	2	6	954494	954499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318625
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16553	NC_009442	TCA	3	9	954820	954828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318625
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16562	NC_009442	GTTT	2	8	955434	955441	0 %	75 %	25 %	0 %	146318627
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16565	NC_009442	ATCA	2	8	955862	955869	50 %	25 %	0 %	25 %	146318627
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16569	NC_009442	GGA	2	6	956142	956147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146318627
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16593	NC_009442	T	6	6	957910	957915	0 %	100 %	0 %	0 %	146318629
16594	NC_009442	AGA	2	6	958027	958032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318629
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16602	NC_009442	GACA	2	8	958431	958438	50 %	0 %	25 %	25 %	146318631
16603	NC_009442	ATC	2	6	958487	958492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318631
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16608	NC_009442	AG	3	6	958897	958902	50 %	0 %	50 %	0 %	146318632
16609	NC_009442	TCAT	2	8	958980	958987	25 %	50 %	0 %	25 %	146318632
16610	NC_009442	ATC	2	6	959000	959005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146318632
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16620	NC_009442	GTC	2	6	959428	959433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318633
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16981	NC_009442	GCTT	2	8	978274	978281	0 %	50 %	25 %	25 %	146318657
16982	NC_009442	GAA	2	6	978284	978289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146318657
16983	NC_009442	ACA	2	6	978399	978404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146318657
16984	NC_009442	ACC	2	6	978423	978428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146318657
16985	NC_009442	TAA	2	6	978430	978435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146318657
16986	NC_009442	CTG	2	6	978487	978492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146318657
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