MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella putrefaciens CN-32 chromosome

Total Repeats: 70470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009438	CAA	2	6	165	170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291112
2	NC_009438	GAC	2	6	178	183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291112
3	NC_009438	CAG	2	6	204	209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291112
4	NC_009438	ATGG	2	8	243	250	25 %	25 %	50 %	0 %	146291112
5	NC_009438	T	6	6	330	335	0 %	100 %	0 %	0 %	146291112
6	NC_009438	GTC	2	6	385	390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291112
7	NC_009438	GCCC	2	8	410	417	0 %	0 %	25 %	75 %	146291112
8	NC_009438	TGCTAA	2	12	497	508	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	146291112
9	NC_009438	TCG	2	6	550	555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291112
10	NC_009438	TGG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291112
11	NC_009438	ATT	2	6	629	634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291112
12	NC_009438	TGG	2	6	641	646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291112
13	NC_009438	TTG	2	6	669	674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291112
14	NC_009438	ATC	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291112
15	NC_009438	AAT	2	6	702	707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291112
16	NC_009438	AAT	2	6	774	779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291112
17	NC_009438	GAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291112
18	NC_009438	TAC	2	6	801	806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291112
19	NC_009438	AAG	2	6	868	873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291112
20	NC_009438	TTC	2	6	876	881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291112
21	NC_009438	CTTG	2	8	896	903	0 %	50 %	25 %	25 %	146291112
22	NC_009438	ACC	2	6	910	915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146291112
23	NC_009438	ATT	2	6	918	923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291112
24	NC_009438	TTGG	2	8	985	992	0 %	50 %	50 %	0 %	146291112
25	NC_009438	AG	3	6	1061	1066	50 %	0 %	50 %	0 %	146291112
26	NC_009438	CTT	2	6	1094	1099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291112
27	NC_009438	CGTG	2	8	1124	1131	0 %	25 %	50 %	25 %	146291112
28	NC_009438	TAC	2	6	1284	1289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291112
29	NC_009438	TGT	2	6	1309	1314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291112
30	NC_009438	CG	3	6	1337	1342	0 %	0 %	50 %	50 %	146291112
31	NC_009438	TAAC	2	8	1378	1385	50 %	25 %	0 %	25 %	146291112
32	NC_009438	TGG	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291112
33	NC_009438	CAC	2	6	1430	1435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146291112
34	NC_009438	AG	3	6	1475	1480	50 %	0 %	50 %	0 %	146291112
35	NC_009438	AGA	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291112
36	NC_009438	TCT	2	6	1524	1529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291112
37	NC_009438	CT	3	6	1672	1677	0 %	50 %	0 %	50 %	146291113
38	NC_009438	TTG	2	6	1710	1715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291113
39	NC_009438	GAA	2	6	1742	1747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291113
40	NC_009438	ACA	2	6	1754	1759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291113
41	NC_009438	AAG	2	6	1769	1774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291113
42	NC_009438	ATA	2	6	1833	1838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291113
43	NC_009438	TGC	2	6	1845	1850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291113
44	NC_009438	AGA	2	6	1891	1896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291113
45	NC_009438	TTA	2	6	2008	2013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291113
46	NC_009438	GC	3	6	2053	2058	0 %	0 %	50 %	50 %	146291113
47	NC_009438	GTG	2	6	2388	2393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291113
48	NC_009438	GAA	2	6	2450	2455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291113
49	NC_009438	ATC	2	6	2465	2470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291113
50	NC_009438	CAAT	2	8	2485	2492	50 %	25 %	0 %	25 %	146291113
51	NC_009438	GAT	2	6	2552	2557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291113
52	NC_009438	TGAT	2	8	2571	2578	25 %	50 %	25 %	0 %	146291113
53	NC_009438	GAA	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291113
54	NC_009438	ATGT	2	8	2624	2631	25 %	50 %	25 %	0 %	146291113
55	NC_009438	ATTT	2	8	2976	2983	25 %	75 %	0 %	0 %	146291114
56	NC_009438	CGTT	2	8	2997	3004	0 %	50 %	25 %	25 %	146291114
57	NC_009438	TAA	2	6	3032	3037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291114
58	NC_009438	GC	3	6	3078	3083	0 %	0 %	50 %	50 %	146291114
59	NC_009438	TCG	2	6	3311	3316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291114
60	NC_009438	TTA	2	6	3319	3324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291114
61	NC_009438	ACT	2	6	3545	3550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291114
62	NC_009438	ATT	2	6	3674	3679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291114
63	NC_009438	ACA	2	6	3719	3724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291114
64	NC_009438	GAT	2	6	3753	3758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291114
65	NC_009438	CTG	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291114
66	NC_009438	AC	3	6	3872	3877	50 %	0 %	0 %	50 %	146291114
67	NC_009438	CCT	2	6	3879	3884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146291114
68	NC_009438	ATA	2	6	3944	3949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291115
69	NC_009438	TTC	2	6	3969	3974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291115
70	NC_009438	CGA	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291115
71	NC_009438	CAT	2	6	4060	4065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291115
72	NC_009438	AGT	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291115
73	NC_009438	TTCTGT	2	12	4152	4163	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146291115
74	NC_009438	GAT	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291115
75	NC_009438	GAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291115
76	NC_009438	GCA	2	6	4219	4224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291115
77	NC_009438	TTA	2	6	4229	4234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291115
78	NC_009438	CGG	2	6	4251	4256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146291115
79	NC_009438	GAT	2	6	4264	4269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291115
80	NC_009438	TGG	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291115
81	NC_009438	TCG	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291115
82	NC_009438	TGAT	2	8	4562	4569	25 %	50 %	25 %	0 %	146291115
83	NC_009438	TCG	2	6	4622	4627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291115
84	NC_009438	ATT	2	6	4628	4633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291115
85	NC_009438	TAA	2	6	4641	4646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291115
86	NC_009438	GAC	2	6	4690	4695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291115
87	NC_009438	CAA	2	6	4761	4766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291115
88	NC_009438	TGG	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291115
89	NC_009438	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291115
90	NC_009438	GAT	2	6	4888	4893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291115
91	NC_009438	CTG	2	6	5032	5037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291115
92	NC_009438	TTG	2	6	5075	5080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291115
93	NC_009438	GCG	2	6	5101	5106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146291115
94	NC_009438	GGT	2	6	5152	5157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291115
95	NC_009438	CTG	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291115
96	NC_009438	TGT	2	6	5333	5338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291115
97	NC_009438	AAG	2	6	5345	5350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291115
98	NC_009438	CGA	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291115
99	NC_009438	CAT	4	12	5427	5438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291115
100	NC_009438	CTT	3	9	5487	5495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291115
101	NC_009438	ATTG	2	8	5511	5518	25 %	50 %	25 %	0 %	146291115
102	NC_009438	GCC	2	6	5544	5549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146291115
103	NC_009438	TTG	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291115
104	NC_009438	AGC	2	6	5744	5749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291115
105	NC_009438	TGA	2	6	5814	5819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291115
106	NC_009438	TGG	2	6	5861	5866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291115
107	NC_009438	GTATT	2	10	5884	5893	20 %	60 %	20 %	0 %	146291115
108	NC_009438	ACTA	2	8	5968	5975	50 %	25 %	0 %	25 %	146291115
109	NC_009438	TTC	2	6	5992	5997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146291115
110	NC_009438	GCG	2	6	6034	6039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146291115
111	NC_009438	GAA	2	6	6055	6060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291115
112	NC_009438	GGC	2	6	6061	6066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146291115
113	NC_009438	GTG	2	6	6077	6082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291115
114	NC_009438	AAG	2	6	6092	6097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146291115
115	NC_009438	TGA	2	6	6252	6257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291115
116	NC_009438	GTT	2	6	6276	6281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291115
117	NC_009438	TAA	2	6	6585	6590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291116
118	NC_009438	ATT	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291116
119	NC_009438	A	6	6	6678	6683	100 %	0 %	0 %	0 %	146291116
120	NC_009438	CAG	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291116
121	NC_009438	GTT	2	6	6715	6720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291116
122	NC_009438	T	6	6	6740	6745	0 %	100 %	0 %	0 %	146291116
123	NC_009438	ATG	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291116
124	NC_009438	TGG	2	6	6780	6785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146291116
125	NC_009438	CAA	2	6	6792	6797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291116
126	NC_009438	GCTG	2	8	6906	6913	0 %	25 %	50 %	25 %	146291116
127	NC_009438	ACA	2	6	7038	7043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291116
128	NC_009438	CAC	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146291116
129	NC_009438	ATTT	2	8	7126	7133	25 %	75 %	0 %	0 %	146291116
130	NC_009438	CGT	2	6	7135	7140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291116
131	NC_009438	T	6	6	7221	7226	0 %	100 %	0 %	0 %	146291116
132	NC_009438	CTC	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146291116
133	NC_009438	GAC	2	6	7341	7346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291116
134	NC_009438	TTGC	2	8	7369	7376	0 %	50 %	25 %	25 %	146291116
135	NC_009438	TGC	2	6	7458	7463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291116
136	NC_009438	GGCG	2	8	7472	7479	0 %	0 %	75 %	25 %	146291116
137	NC_009438	TGC	2	6	7502	7507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291116
138	NC_009438	GCA	2	6	7551	7556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291116
139	NC_009438	GCT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291116
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141	NC_009438	ATT	2	6	7750	7755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146291117
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256	NC_009438	TTCA	2	8	15331	15338	25 %	50 %	0 %	25 %	146291121
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259	NC_009438	GTT	2	6	15532	15537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146291122
260	NC_009438	ATC	2	6	15543	15548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291122
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262	NC_009438	CAG	2	6	15572	15577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146291122
263	NC_009438	CAT	2	6	15603	15608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146291122
264	NC_009438	CGT	2	6	15668	15673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291122
265	NC_009438	GAT	2	6	15903	15908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291123
266	NC_009438	CGT	2	6	16007	16012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146291123
267	NC_009438	AAC	2	6	16030	16035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146291123
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281	NC_009438	ATA	2	6	16728	16733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291123
282	NC_009438	CGC	2	6	16766	16771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146291123
283	NC_009438	TGA	2	6	16790	16795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146291123
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387	NC_009438	TAA	2	6	23247	23252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146291128
388	NC_009438	A	6	6	23292	23297	100 %	0 %	0 %	0 %	146291128
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