MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 124575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009380	CGC	2	6	645	650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592567
2	NC_009380	CGAC	2	8	665	672	25 %	0 %	25 %	50 %	145592567
3	NC_009380	CGA	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592567
4	NC_009380	CAG	2	6	700	705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592567
5	NC_009380	TCG	2	6	740	745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592567
6	NC_009380	CCG	2	6	834	839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592567
7	NC_009380	GCC	2	6	896	901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592567
8	NC_009380	CGGC	2	8	902	909	0 %	0 %	50 %	50 %	145592567
9	NC_009380	ACC	2	6	961	966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592567
10	NC_009380	CCGCG	2	10	969	978	0 %	0 %	40 %	60 %	145592567
11	NC_009380	GAC	2	6	991	996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592567
12	NC_009380	GCG	2	6	1054	1059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592567
13	NC_009380	GAC	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592567
14	NC_009380	GTT	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592567
15	NC_009380	GCC	2	6	1140	1145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592567
16	NC_009380	G	6	6	1249	1254	0 %	0 %	100 %	0 %	145592567
17	NC_009380	ACC	2	6	1304	1309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592567
18	NC_009380	CGG	3	9	1353	1361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592567
19	NC_009380	CGTT	2	8	1394	1401	0 %	50 %	25 %	25 %	145592567
20	NC_009380	TCG	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592567
21	NC_009380	TGC	2	6	1517	1522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592567
22	NC_009380	ACG	2	6	1543	1548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592567
23	NC_009380	GAG	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592567
24	NC_009380	TCA	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592567
25	NC_009380	CGA	2	6	1620	1625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592567
26	NC_009380	TCC	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592567
27	NC_009380	CGA	2	6	1677	1682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592567
28	NC_009380	AGG	2	6	1715	1720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592567
29	NC_009380	TTC	2	6	1723	1728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592567
30	NC_009380	AC	3	6	1739	1744	50 %	0 %	0 %	50 %	145592567
31	NC_009380	CAA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145592567
32	NC_009380	AGC	2	6	1793	1798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592567
33	NC_009380	GGA	2	6	1809	1814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592567
34	NC_009380	GCC	2	6	1860	1865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592567
35	NC_009380	TCC	2	6	1889	1894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592567
36	NC_009380	AGA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592567
37	NC_009380	GCC	2	6	1903	1908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592567
38	NC_009380	CCG	2	6	1927	1932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592567
39	NC_009380	GAG	2	6	2053	2058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592567
40	NC_009380	TGC	2	6	2060	2065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592567
41	NC_009380	CCG	2	6	2102	2107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592567
42	NC_009380	CCG	2	6	2126	2131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592567
43	NC_009380	ACT	2	6	2132	2137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592567
44	NC_009380	GGA	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592567
45	NC_009380	CGCC	2	8	2193	2200	0 %	0 %	25 %	75 %	145592567
46	NC_009380	ACCAC	2	10	2276	2285	40 %	0 %	0 %	60 %	145592567
47	NC_009380	CAG	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592567
48	NC_009380	CGC	2	6	2395	2400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592568
49	NC_009380	ACCGG	2	10	2447	2456	20 %	0 %	40 %	40 %	145592568
50	NC_009380	GTG	2	6	2478	2483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592568
51	NC_009380	GTC	2	6	2503	2508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592568
52	NC_009380	AAG	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592568
53	NC_009380	GGGC	2	8	2654	2661	0 %	0 %	75 %	25 %	145592568
54	NC_009380	GTT	2	6	2675	2680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592568
55	NC_009380	GA	3	6	2713	2718	50 %	0 %	50 %	0 %	145592568
56	NC_009380	TGA	2	6	3149	3154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592569
57	NC_009380	CGGTGC	2	12	3227	3238	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145592569
58	NC_009380	TGC	3	9	3248	3256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592569
59	NC_009380	CCAG	2	8	3305	3312	25 %	0 %	25 %	50 %	145592569
60	NC_009380	CCGG	2	8	3359	3366	0 %	0 %	50 %	50 %	145592569
61	NC_009380	CTC	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592569
62	NC_009380	CGG	2	6	3416	3421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592569
63	NC_009380	CCA	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592569
64	NC_009380	CGC	3	9	3534	3542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592569
65	NC_009380	CGC	3	9	3546	3554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592569
66	NC_009380	GCCG	2	8	3577	3584	0 %	0 %	50 %	50 %	145592569
67	NC_009380	GAT	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592569
68	NC_009380	CGG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592569
69	NC_009380	CGG	2	6	3777	3782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592569
70	NC_009380	GCG	2	6	3811	3816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592569
71	NC_009380	CGG	2	6	3840	3845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592569
72	NC_009380	CGC	2	6	3850	3855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592569
73	NC_009380	ACC	2	6	3856	3861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592569
74	NC_009380	CCG	2	6	3889	3894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592569
75	NC_009380	GC	3	6	3947	3952	0 %	0 %	50 %	50 %	145592569
76	NC_009380	GTC	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592569
77	NC_009380	TCG	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592569
78	NC_009380	CAC	2	6	3993	3998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592569
79	NC_009380	TGC	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592569
80	NC_009380	CGA	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592569
81	NC_009380	TGG	2	6	4031	4036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592569
82	NC_009380	GAG	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592569
83	NC_009380	GC	4	8	4060	4067	0 %	0 %	50 %	50 %	145592569
84	NC_009380	TC	3	6	4143	4148	0 %	50 %	0 %	50 %	145592569
85	NC_009380	TCGT	2	8	4177	4184	0 %	50 %	25 %	25 %	145592569
86	NC_009380	CGG	2	6	4199	4204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592569
87	NC_009380	TCA	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592569
88	NC_009380	GGC	2	6	4358	4363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592570
89	NC_009380	GC	3	6	4381	4386	0 %	0 %	50 %	50 %	145592570
90	NC_009380	GAA	2	6	4459	4464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592570
91	NC_009380	GCC	2	6	4502	4507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592570
92	NC_009380	CGA	2	6	4513	4518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592570
93	NC_009380	CAT	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592570
94	NC_009380	CGG	2	6	4570	4575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592570
95	NC_009380	CGA	2	6	4591	4596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592570
96	NC_009380	CG	3	6	4602	4607	0 %	0 %	50 %	50 %	145592570
97	NC_009380	CGG	2	6	4699	4704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592570
98	NC_009380	GCCG	2	8	4753	4760	0 %	0 %	50 %	50 %	145592570
99	NC_009380	GCCGG	2	10	4781	4790	0 %	0 %	60 %	40 %	145592570
100	NC_009380	GTC	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592570
101	NC_009380	GCT	2	6	4951	4956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592570
102	NC_009380	CCT	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592570
103	NC_009380	CGA	2	6	4978	4983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592570
104	NC_009380	GGA	2	6	5017	5022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592570
105	NC_009380	CGC	3	9	5086	5094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592570
106	NC_009380	GAC	2	6	5123	5128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592570
107	NC_009380	CGC	2	6	5149	5154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592570
108	NC_009380	CAG	2	6	5162	5167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592570
109	NC_009380	CGG	2	6	5170	5175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592570
110	NC_009380	TCG	2	6	5236	5241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592571
111	NC_009380	GGTC	2	8	5297	5304	0 %	25 %	50 %	25 %	145592571
112	NC_009380	GCC	2	6	5406	5411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592571
113	NC_009380	GTG	2	6	5433	5438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592571
114	NC_009380	GGGC	2	8	5481	5488	0 %	0 %	75 %	25 %	145592571
115	NC_009380	TCGG	2	8	5503	5510	0 %	25 %	50 %	25 %	145592571
116	NC_009380	CGG	2	6	5520	5525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592571
117	NC_009380	GCG	2	6	5606	5611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592571
118	NC_009380	CGA	2	6	5621	5626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592571
119	NC_009380	CTG	2	6	5628	5633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592571
120	NC_009380	GGT	2	6	5681	5686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592571
121	NC_009380	CTG	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592571
122	NC_009380	GC	3	6	5724	5729	0 %	0 %	50 %	50 %	145592571
123	NC_009380	CGG	2	6	5747	5752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592571
124	NC_009380	GAC	2	6	5778	5783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592571
125	NC_009380	CG	3	6	5789	5794	0 %	0 %	50 %	50 %	145592571
126	NC_009380	TCG	2	6	5830	5835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592571
127	NC_009380	C	6	6	5845	5850	0 %	0 %	0 %	100 %	145592571
128	NC_009380	ACG	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592571
129	NC_009380	GTC	2	6	5912	5917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592571
130	NC_009380	CGC	2	6	5981	5986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592571
131	NC_009380	ACC	2	6	6015	6020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592571
132	NC_009380	GCCA	2	8	6084	6091	25 %	0 %	25 %	50 %	145592571
133	NC_009380	CTG	2	6	6141	6146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592571
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262	NC_009380	GCG	2	6	11725	11730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592575
263	NC_009380	GCG	2	6	11748	11753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592575
264	NC_009380	GAC	2	6	11768	11773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592575
265	NC_009380	TTC	2	6	11786	11791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592575
266	NC_009380	TTC	2	6	11819	11824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592575
267	NC_009380	CAA	2	6	11827	11832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145592575
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272	NC_009380	CAT	2	6	12055	12060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592575
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301	NC_009380	GCC	2	6	12927	12932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592576
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