MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 124575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009380	TGGTG	2	10	636744	636753	0 %	40 %	60 %	0 %	145593128
15002	NC_009380	TCG	2	6	636760	636765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593128
15003	NC_009380	CCGC	2	8	636794	636801	0 %	0 %	25 %	75 %	145593128
15004	NC_009380	CGGC	2	8	636810	636817	0 %	0 %	50 %	50 %	145593128
15005	NC_009380	CGC	2	6	636819	636824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593128
15006	NC_009380	CGT	2	6	637243	637248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593129
15007	NC_009380	CTG	2	6	637281	637286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593129
15008	NC_009380	GTG	2	6	637346	637351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593129
15009	NC_009380	ACA	2	6	637353	637358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145593129
15010	NC_009380	CGC	2	6	637363	637368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593129
15011	NC_009380	TGA	2	6	637422	637427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593129
15012	NC_009380	TTG	2	6	637463	637468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593129
15013	NC_009380	GGT	2	6	637573	637578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593129
15014	NC_009380	AGG	2	6	637586	637591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593129
15015	NC_009380	GCC	2	6	637592	637597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593129
15016	NC_009380	GC	3	6	637601	637606	0 %	0 %	50 %	50 %	145593129
15017	NC_009380	GAT	2	6	637618	637623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593129
15018	NC_009380	CGATCT	2	12	637624	637635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145593129
15019	NC_009380	GTT	2	6	637658	637663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145593129
15020	NC_009380	ACG	2	6	637677	637682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593129
15021	NC_009380	G	6	6	637720	637725	0 %	0 %	100 %	0 %	145593129
15022	NC_009380	GTG	2	6	637730	637735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593129
15023	NC_009380	GGC	2	6	637781	637786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593129
15024	NC_009380	ACC	2	6	637830	637835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593129
15025	NC_009380	TCC	2	6	637960	637965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593129
15026	NC_009380	CAG	2	6	638099	638104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593129
15027	NC_009380	CGA	2	6	638170	638175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593129
15028	NC_009380	CG	3	6	638188	638193	0 %	0 %	50 %	50 %	145593129
15029	NC_009380	GGC	2	6	638194	638199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593129
15030	NC_009380	GTG	2	6	638225	638230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593129
15031	NC_009380	GCC	2	6	638266	638271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593129
15032	NC_009380	GCT	2	6	638284	638289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593129
15033	NC_009380	GCGG	2	8	638317	638324	0 %	0 %	75 %	25 %	145593129
15034	NC_009380	ACG	2	6	638325	638330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593129
15035	NC_009380	TGCG	2	8	638469	638476	0 %	25 %	50 %	25 %	145593129
15036	NC_009380	CGC	2	6	638485	638490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593129
15037	NC_009380	CGC	2	6	638536	638541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593129
15038	NC_009380	ACC	2	6	638563	638568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593129
15039	NC_009380	GCAG	2	8	638637	638644	25 %	0 %	50 %	25 %	145593130
15040	NC_009380	GGTC	2	8	638645	638652	0 %	25 %	50 %	25 %	145593130
15041	NC_009380	GGC	2	6	638654	638659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593130
15042	NC_009380	CGC	2	6	638698	638703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593130
15043	NC_009380	CTG	2	6	638747	638752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593130
15044	NC_009380	GCGG	2	8	638790	638797	0 %	0 %	75 %	25 %	145593130
15045	NC_009380	TGA	2	6	638819	638824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593130
15046	NC_009380	TCC	2	6	638833	638838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593130
15047	NC_009380	TCG	2	6	638848	638853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593130
15048	NC_009380	GTC	2	6	638925	638930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593130
15049	NC_009380	GC	3	6	638958	638963	0 %	0 %	50 %	50 %	145593130
15050	NC_009380	AGC	2	6	638971	638976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593130
15051	NC_009380	CG	3	6	638982	638987	0 %	0 %	50 %	50 %	145593130
15052	NC_009380	CGA	2	6	639017	639022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593130
15053	NC_009380	TCG	2	6	639025	639030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593130
15054	NC_009380	GCT	2	6	639053	639058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593130
15055	NC_009380	GC	3	6	639154	639159	0 %	0 %	50 %	50 %	145593130
15056	NC_009380	GTC	2	6	639186	639191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593130
15057	NC_009380	CG	3	6	639379	639384	0 %	0 %	50 %	50 %	145593130
15058	NC_009380	GATG	2	8	639419	639426	25 %	25 %	50 %	0 %	145593130
15059	NC_009380	GTC	2	6	639501	639506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593130
15060	NC_009380	GTC	2	6	639513	639518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593130
15061	NC_009380	TCC	2	6	639535	639540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593130
15062	NC_009380	CAT	2	6	639570	639575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593130
15063	NC_009380	GC	3	6	639583	639588	0 %	0 %	50 %	50 %	145593130
15064	NC_009380	GTC	2	6	639591	639596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593130
15065	NC_009380	CAC	2	6	639716	639721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593130
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15067	NC_009380	CCGGT	2	10	639783	639792	0 %	20 %	40 %	40 %	145593130
15068	NC_009380	CGG	2	6	639798	639803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593130
15069	NC_009380	CGA	2	6	639884	639889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593130
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15071	NC_009380	CGG	3	9	639995	640003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593130
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15074	NC_009380	CAG	2	6	640146	640151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593130
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15085	NC_009380	GCCG	2	8	641126	641133	0 %	0 %	50 %	50 %	145593132
15086	NC_009380	CGA	2	6	641146	641151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593132
15087	NC_009380	GCC	2	6	641158	641163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593132
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15089	NC_009380	GCCA	2	8	641245	641252	25 %	0 %	25 %	50 %	145593132
15090	NC_009380	CGC	2	6	641351	641356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593132
15091	NC_009380	TGC	2	6	641406	641411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593132
15092	NC_009380	GCA	2	6	641470	641475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593132
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15099	NC_009380	TCT	2	6	641644	641649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145593132
15100	NC_009380	CGGC	2	8	641733	641740	0 %	0 %	50 %	50 %	145593132
15101	NC_009380	CAGC	2	8	641827	641834	25 %	0 %	25 %	50 %	145593132
15102	NC_009380	TCG	2	6	641841	641846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593132
15103	NC_009380	ACA	2	6	641854	641859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145593132
15104	NC_009380	GCC	2	6	641860	641865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593132
15105	NC_009380	TCGGA	2	10	641872	641881	20 %	20 %	40 %	20 %	145593132
15106	NC_009380	GACCG	2	10	641885	641894	20 %	0 %	40 %	40 %	145593132
15107	NC_009380	CAC	2	6	641941	641946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593132
15108	NC_009380	CTGCCG	2	12	642002	642013	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145593132
15109	NC_009380	CTGA	2	8	642029	642036	25 %	25 %	25 %	25 %	145593132
15110	NC_009380	TGAC	2	8	642093	642100	25 %	25 %	25 %	25 %	145593132
15111	NC_009380	CGC	2	6	642103	642108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593132
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15113	NC_009380	GCTG	2	8	642669	642676	0 %	25 %	50 %	25 %	145593133
15114	NC_009380	CGAC	2	8	642752	642759	25 %	0 %	25 %	50 %	145593133
15115	NC_009380	CTA	2	6	642786	642791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593133
15116	NC_009380	CGA	3	9	642804	642812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593133
15117	NC_009380	GGC	2	6	642840	642845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593133
15118	NC_009380	TCC	2	6	642910	642915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593133
15119	NC_009380	GTCGA	2	10	642961	642970	20 %	20 %	40 %	20 %	145593133
15120	NC_009380	CTGGTG	2	12	642976	642987	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145593133
15121	NC_009380	CG	3	6	642993	642998	0 %	0 %	50 %	50 %	145593133
15122	NC_009380	GGC	2	6	643040	643045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593133
15123	NC_009380	CAA	2	6	643101	643106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145593133
15124	NC_009380	CGG	2	6	643133	643138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593133
15125	NC_009380	C	6	6	643157	643162	0 %	0 %	0 %	100 %	145593133
15126	NC_009380	ACT	2	6	643175	643180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593133
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15128	NC_009380	ACA	2	6	643346	643351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145593133
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15130	NC_009380	CGT	2	6	643417	643422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593133
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15133	NC_009380	CCA	2	6	643470	643475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593133
15134	NC_009380	GTCGAC	2	12	643492	643503	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145593133
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15137	NC_009380	GAC	2	6	643552	643557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593133
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15140	NC_009380	GCC	2	6	643789	643794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593133
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15142	NC_009380	AGA	2	6	643886	643891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145593133
15143	NC_009380	TGG	2	6	643961	643966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593133
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15147	NC_009380	TCA	2	6	644174	644179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593133
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15149	NC_009380	TCG	2	6	644291	644296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593133
15150	NC_009380	GACC	2	8	644355	644362	25 %	0 %	25 %	50 %	145593133
15151	NC_009380	CGC	2	6	644364	644369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593133
15152	NC_009380	CCG	2	6	644456	644461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593133
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15157	NC_009380	CAGC	2	8	644911	644918	25 %	0 %	25 %	50 %	145593134
15158	NC_009380	CG	3	6	644932	644937	0 %	0 %	50 %	50 %	145593134
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15168	NC_009380	CTGG	3	12	645309	645320	0 %	25 %	50 %	25 %	145593134
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15182	NC_009380	CTG	2	6	645957	645962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593134
15183	NC_009380	TCC	2	6	645964	645969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593134
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15189	NC_009380	ACC	2	6	646164	646169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593135
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15219	NC_009380	GAGCA	2	10	647287	647296	40 %	0 %	40 %	20 %	145593136
15220	NC_009380	CAA	2	6	647322	647327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145593136
15221	NC_009380	CCG	2	6	647330	647335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593136
15222	NC_009380	CGC	2	6	647338	647343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593136
15223	NC_009380	GCG	2	6	647344	647349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593136
15224	NC_009380	CGC	2	6	647355	647360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593136
15225	NC_009380	GTCATC	2	12	647428	647439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145593136
15226	NC_009380	CGA	2	6	647442	647447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593136
15227	NC_009380	GAG	2	6	647452	647457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593136
15228	NC_009380	GTC	2	6	647578	647583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593136
15229	NC_009380	ACCCG	2	10	647602	647611	20 %	0 %	20 %	60 %	145593136
15230	NC_009380	GTC	2	6	647635	647640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593136
15231	NC_009380	CGT	2	6	647679	647684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593136
15232	NC_009380	CAC	2	6	647733	647738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593136
15233	NC_009380	TGC	2	6	647744	647749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593136
15234	NC_009380	GC	3	6	647748	647753	0 %	0 %	50 %	50 %	145593136
15235	NC_009380	TG	3	6	647783	647788	0 %	50 %	50 %	0 %	145593136
15236	NC_009380	C	6	6	647816	647821	0 %	0 %	0 %	100 %	145593136
15237	NC_009380	CGTC	2	8	647877	647884	0 %	25 %	25 %	50 %	145593136
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15356	NC_009380	CGG	3	9	655128	655136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593142
15357	NC_009380	GC	3	6	655146	655151	0 %	0 %	50 %	50 %	145593142
15358	NC_009380	TCT	2	6	655191	655196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145593142
15359	NC_009380	GAT	2	6	655462	655467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593143
15360	NC_009380	CTC	2	6	655534	655539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593143
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15388	NC_009380	CGAC	2	8	656508	656515	25 %	0 %	25 %	50 %	145593144
15389	NC_009380	CG	4	8	656554	656561	0 %	0 %	50 %	50 %	145593144
15390	NC_009380	CGG	2	6	656574	656579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593144
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15459	NC_009380	GCG	2	6	659509	659514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593146
15460	NC_009380	CGA	2	6	659570	659575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593146
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15466	NC_009380	GGC	2	6	659735	659740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593146
15467	NC_009380	GC	3	6	659739	659744	0 %	0 %	50 %	50 %	145593146
15468	NC_009380	CGCAT	2	10	659787	659796	20 %	20 %	20 %	40 %	145593146
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15472	NC_009380	TCCC	2	8	659913	659920	0 %	25 %	0 %	75 %	145593146
15473	NC_009380	AAG	2	6	660164	660169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145593147
15474	NC_009380	CGG	3	9	660195	660203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593147
15475	NC_009380	GCA	2	6	660217	660222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593147
15476	NC_009380	CTC	2	6	660275	660280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593147
15477	NC_009380	CGA	2	6	660355	660360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593147
15478	NC_009380	CCGG	2	8	660366	660373	0 %	0 %	50 %	50 %	145593147
15479	NC_009380	CGGG	2	8	660455	660462	0 %	0 %	75 %	25 %	145593147
15480	NC_009380	GAC	2	6	660550	660555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593147
15481	NC_009380	GGC	2	6	660657	660662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593147
15482	NC_009380	GGT	2	6	660688	660693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593147
15483	NC_009380	GGCAGG	2	12	660723	660734	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	145593147
15484	NC_009380	GTG	2	6	660755	660760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593147
15485	NC_009380	ACGTG	2	10	660784	660793	20 %	20 %	40 %	20 %	145593147
15486	NC_009380	CGG	2	6	660814	660819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593147
15487	NC_009380	CAG	2	6	660956	660961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593147
15488	NC_009380	CGT	2	6	660964	660969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593147
15489	NC_009380	AGA	2	6	661017	661022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145593147
15490	NC_009380	GCC	2	6	661067	661072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593147
15491	NC_009380	GAG	2	6	661085	661090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593147
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15493	NC_009380	CAT	2	6	661213	661218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593147
15494	NC_009380	GCC	2	6	661247	661252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593147
15495	NC_009380	AGCA	2	8	661278	661285	50 %	0 %	25 %	25 %	145593147
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15497	NC_009380	CAG	2	6	661317	661322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593147
15498	NC_009380	CCGG	2	8	661348	661355	0 %	0 %	50 %	50 %	145593147
15499	NC_009380	CTG	2	6	661484	661489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593147
15500	NC_009380	GGCT	2	8	661525	661532	0 %	25 %	50 %	25 %	145593147

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