MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 124575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009380	CGGG	2	8	42528	42535	0 %	0 %	75 %	25 %	145592601
1002	NC_009380	GCG	2	6	42586	42591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592601
1003	NC_009380	CTG	2	6	42617	42622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592601
1004	NC_009380	CCG	2	6	42635	42640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592601
1005	NC_009380	GAGCCA	2	12	42680	42691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592601
1006	NC_009380	CGT	2	6	42694	42699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592601
1007	NC_009380	GGA	2	6	42745	42750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592601
1008	NC_009380	CGC	2	6	42761	42766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592601
1009	NC_009380	GGA	2	6	42817	42822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592601
1010	NC_009380	CGG	2	6	42828	42833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592601
1011	NC_009380	GTG	2	6	42880	42885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592601
1012	NC_009380	CCG	2	6	42888	42893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592601
1013	NC_009380	GGA	3	9	42940	42948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592601
1014	NC_009380	GGC	2	6	43072	43077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592601
1015	NC_009380	CCA	2	6	43101	43106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592601
1016	NC_009380	CCG	3	9	43108	43116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592601
1017	NC_009380	GCG	2	6	43235	43240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592602
1018	NC_009380	CCG	2	6	43253	43258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592602
1019	NC_009380	CCG	2	6	43280	43285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592602
1020	NC_009380	GTCG	2	8	43316	43323	0 %	25 %	50 %	25 %	145592602
1021	NC_009380	AGC	2	6	43327	43332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592602
1022	NC_009380	CAC	2	6	43376	43381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592602
1023	NC_009380	GTG	2	6	43425	43430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592602
1024	NC_009380	CGA	2	6	43442	43447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592602
1025	NC_009380	TCGC	2	8	43459	43466	0 %	25 %	25 %	50 %	145592602
1026	NC_009380	GTG	2	6	43484	43489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592602
1027	NC_009380	AGC	2	6	43535	43540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592602
1028	NC_009380	AGC	2	6	43564	43569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592602
1029	NC_009380	GAG	2	6	43596	43601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592602
1030	NC_009380	CAC	2	6	43640	43645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592602
1031	NC_009380	CGTGTC	2	12	43662	43673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592602
1032	NC_009380	GTC	2	6	43681	43686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592602
1033	NC_009380	GAT	2	6	43704	43709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592602
1034	NC_009380	GTG	2	6	43725	43730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592602
1035	NC_009380	GTG	2	6	43743	43748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592602
1036	NC_009380	GGTG	2	8	43757	43764	0 %	25 %	75 %	0 %	145592602
1037	NC_009380	TG	3	6	43777	43782	0 %	50 %	50 %	0 %	145592602
1038	NC_009380	TGT	2	6	43919	43924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592602
1039	NC_009380	CG	3	6	44007	44012	0 %	0 %	50 %	50 %	145592602
1040	NC_009380	GAG	2	6	44028	44033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592602
1041	NC_009380	CA	3	6	44041	44046	50 %	0 %	0 %	50 %	145592602
1042	NC_009380	CCGGC	2	10	44217	44226	0 %	0 %	40 %	60 %	145592603
1043	NC_009380	TGGC	2	8	44245	44252	0 %	25 %	50 %	25 %	145592603
1044	NC_009380	GGT	2	6	44662	44667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592604
1045	NC_009380	CGG	2	6	44686	44691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592604
1046	NC_009380	AACG	2	8	44715	44722	50 %	0 %	25 %	25 %	145592604
1047	NC_009380	GTC	2	6	44794	44799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592604
1048	NC_009380	TGC	2	6	44832	44837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592604
1049	NC_009380	CCA	2	6	44858	44863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592604
1050	NC_009380	CCG	3	9	44876	44884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592604
1051	NC_009380	TGG	2	6	45279	45284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592605
1052	NC_009380	G	6	6	45337	45342	0 %	0 %	100 %	0 %	145592605
1053	NC_009380	TGG	2	6	45429	45434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592605
1054	NC_009380	GCC	3	9	45509	45517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592605
1055	NC_009380	CGG	2	6	45534	45539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592605
1056	NC_009380	ACC	2	6	45558	45563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592605
1057	NC_009380	C	6	6	45592	45597	0 %	0 %	0 %	100 %	145592605
1058	NC_009380	CAC	2	6	45709	45714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592605
1059	NC_009380	CCA	2	6	45715	45720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592605
1060	NC_009380	CGG	2	6	45727	45732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592605
1061	NC_009380	CCG	2	6	45756	45761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592605
1062	NC_009380	ACA	2	6	45762	45767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145592605
1063	NC_009380	GCACG	2	10	45787	45796	20 %	0 %	40 %	40 %	145592605
1064	NC_009380	AGG	2	6	45840	45845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592605
1065	NC_009380	TGG	2	6	45852	45857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592605
1066	NC_009380	GC	3	6	45984	45989	0 %	0 %	50 %	50 %	145592605
1067	NC_009380	TCGA	2	8	46010	46017	25 %	25 %	25 %	25 %	145592605
1068	NC_009380	GGC	2	6	46039	46044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592605
1069	NC_009380	CAG	2	6	46051	46056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592605
1070	NC_009380	ACT	2	6	46071	46076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592605
1071	NC_009380	TCG	2	6	46184	46189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592605
1072	NC_009380	CGC	2	6	46254	46259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592605
1073	NC_009380	GCA	2	6	46312	46317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592605
1074	NC_009380	CTC	2	6	46391	46396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592605
1075	NC_009380	CGG	2	6	46408	46413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592605
1076	NC_009380	CAC	2	6	46414	46419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592605
1077	NC_009380	CCG	2	6	46424	46429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592605
1078	NC_009380	CCG	3	9	46433	46441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592605
1079	NC_009380	GCT	2	6	46443	46448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592605
1080	NC_009380	CGC	3	9	46534	46542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592605
1081	NC_009380	CCGTGG	2	12	46551	46562	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145592605
1082	NC_009380	CAA	2	6	46639	46644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145592605
1083	NC_009380	CCG	2	6	46656	46661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592605
1084	NC_009380	GGC	2	6	46900	46905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592606
1085	NC_009380	TCT	2	6	46925	46930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592606
1086	NC_009380	GCG	2	6	46933	46938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592606
1087	NC_009380	GCC	2	6	47006	47011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592606
1088	NC_009380	GGCC	2	8	47024	47031	0 %	0 %	50 %	50 %	145592606
1089	NC_009380	GGC	2	6	47047	47052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592606
1090	NC_009380	GCA	2	6	47057	47062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592606
1091	NC_009380	CAG	2	6	47112	47117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592606
1092	NC_009380	CAGCC	2	10	47155	47164	20 %	0 %	20 %	60 %	145592606
1093	NC_009380	CTC	2	6	47319	47324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592606
1094	NC_009380	TCG	2	6	47356	47361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592606
1095	NC_009380	GTG	2	6	47424	47429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592606
1096	NC_009380	TG	3	6	47501	47506	0 %	50 %	50 %	0 %	145592606
1097	NC_009380	TCA	2	6	47525	47530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592606
1098	NC_009380	GCC	2	6	47578	47583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592606
1099	NC_009380	CGGTGG	2	12	47597	47608	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145592606
1100	NC_009380	CGT	2	6	47725	47730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592607
1101	NC_009380	TTCG	2	8	47768	47775	0 %	50 %	25 %	25 %	145592607
1102	NC_009380	CCA	2	6	47783	47788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592607
1103	NC_009380	CTG	2	6	47849	47854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592607
1104	NC_009380	CGG	3	9	47917	47925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592607
1105	NC_009380	GAA	2	6	47939	47944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592607
1106	NC_009380	GGC	2	6	48080	48085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592607
1107	NC_009380	CCG	2	6	48169	48174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592607
1108	NC_009380	GCAG	2	8	48202	48209	25 %	0 %	50 %	25 %	145592607
1109	NC_009380	TCGA	2	8	48213	48220	25 %	25 %	25 %	25 %	145592607
1110	NC_009380	TTG	2	6	48324	48329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592607
1111	NC_009380	GCCG	2	8	48395	48402	0 %	0 %	50 %	50 %	145592607
1112	NC_009380	GCG	2	6	48459	48464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592607
1113	NC_009380	CAC	2	6	48473	48478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592607
1114	NC_009380	CGG	2	6	48498	48503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592607
1115	NC_009380	GGC	2	6	48557	48562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592607
1116	NC_009380	CCT	2	6	48607	48612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592607
1117	NC_009380	GAA	2	6	48617	48622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592607
1118	NC_009380	CGA	2	6	48649	48654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592607
1119	NC_009380	CAT	2	6	49146	49151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592608
1120	NC_009380	GAG	3	9	49165	49173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592608
1121	NC_009380	TGC	2	6	49184	49189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592608
1122	NC_009380	GGT	2	6	49251	49256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592608
1123	NC_009380	GATC	2	8	49353	49360	25 %	25 %	25 %	25 %	145592608
1124	NC_009380	TC	3	6	49359	49364	0 %	50 %	0 %	50 %	145592608
1125	NC_009380	GTC	2	6	49379	49384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592608
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1251	NC_009380	GCA	2	6	54376	54381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592612
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1254	NC_009380	GTCA	2	8	54525	54532	25 %	25 %	25 %	25 %	145592612
1255	NC_009380	CAC	2	6	54551	54556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592612
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1359	NC_009380	GCC	2	6	58016	58021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592614
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1370	NC_009380	GGCC	2	8	58505	58512	0 %	0 %	50 %	50 %	145592615
1371	NC_009380	GCA	2	6	58556	58561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592615
1372	NC_009380	CCCGG	2	10	58696	58705	0 %	0 %	40 %	60 %	145592615
1373	NC_009380	TCG	2	6	58759	58764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592615
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1500	NC_009380	GAG	2	6	64288	64293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592620

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