MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 124575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_009380	CGA	2	6	497187	497192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593000
12002	NC_009380	CGC	2	6	497199	497204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593000
12003	NC_009380	GGT	2	6	497211	497216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593000
12004	NC_009380	CCGG	2	8	497254	497261	0 %	0 %	50 %	50 %	145593000
12005	NC_009380	TGGG	2	8	497389	497396	0 %	25 %	75 %	0 %	145593001
12006	NC_009380	GGA	2	6	497436	497441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593001
12007	NC_009380	ACC	2	6	497449	497454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145593001
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12009	NC_009380	TGC	2	6	497546	497551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593001
12010	NC_009380	TGC	2	6	497582	497587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593001
12011	NC_009380	GGA	2	6	497604	497609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593001
12012	NC_009380	GCC	2	6	497658	497663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593001
12013	NC_009380	CGGT	2	8	497671	497678	0 %	25 %	50 %	25 %	145593001
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12016	NC_009380	GCG	2	6	497772	497777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593001
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12018	NC_009380	GGT	2	6	497854	497859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593001
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12020	NC_009380	GCTCC	2	10	497949	497958	0 %	20 %	20 %	60 %	145593001
12021	NC_009380	TGCG	2	8	497963	497970	0 %	25 %	50 %	25 %	145593001
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12027	NC_009380	CCCGG	2	10	498346	498355	0 %	0 %	40 %	60 %	145593001
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12035	NC_009380	GCG	2	6	498552	498557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593001
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12055	NC_009380	GAC	2	6	499613	499618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593003
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12112	NC_009380	CTA	2	6	501957	501962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145593004
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12114	NC_009380	GCTG	2	8	502014	502021	0 %	25 %	50 %	25 %	145593004
12115	NC_009380	CGC	2	6	502122	502127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145593004
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12119	NC_009380	GCA	2	6	502305	502310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593004
12120	NC_009380	GAG	2	6	502321	502326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593004
12121	NC_009380	TCC	2	6	502337	502342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593004
12122	NC_009380	GGA	2	6	502404	502409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145593004
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12132	NC_009380	TCG	2	6	503239	503244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593005
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12134	NC_009380	GTG	2	6	503274	503279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593005
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12220	NC_009380	CGG	2	6	507177	507182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593010
12221	NC_009380	GCG	2	6	507187	507192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593010
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12230	NC_009380	GGC	2	6	507479	507484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593010
12231	NC_009380	GGC	2	6	507525	507530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593010
12232	NC_009380	CGAG	2	8	507560	507567	25 %	0 %	50 %	25 %	145593010
12233	NC_009380	GAT	3	9	507570	507578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593010
12234	NC_009380	CAG	3	9	507585	507593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593010
12235	NC_009380	CCT	2	6	507638	507643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145593010
12236	NC_009380	GTG	2	6	507667	507672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145593010
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12354	NC_009380	CCGC	2	8	511675	511682	0 %	0 %	25 %	75 %	145593014
12355	NC_009380	GAT	2	6	512166	512171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145593015
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12476	NC_009380	GCG	2	6	516459	516464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593019
12477	NC_009380	GAC	2	6	516491	516496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593019
12478	NC_009380	GGCC	2	8	516506	516513	0 %	0 %	50 %	50 %	145593020
12479	NC_009380	GTC	2	6	516537	516542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593020
12480	NC_009380	CGA	2	6	516545	516550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593020
12481	NC_009380	TGGGCG	2	12	516565	516576	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145593020
12482	NC_009380	GCT	2	6	516584	516589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593020
12483	NC_009380	GAC	2	6	516611	516616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593020
12484	NC_009380	TGC	2	6	516640	516645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593020
12485	NC_009380	G	6	6	516655	516660	0 %	0 %	100 %	0 %	145593020
12486	NC_009380	GCT	2	6	516668	516673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593020
12487	NC_009380	GAC	2	6	516687	516692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593020
12488	NC_009380	TCG	2	6	516778	516783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593020
12489	NC_009380	CGG	2	6	516811	516816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593020
12490	NC_009380	CGG	2	6	516899	516904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593020
12491	NC_009380	TGC	2	6	516907	516912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145593020
12492	NC_009380	GC	3	6	516914	516919	0 %	0 %	50 %	50 %	145593020
12493	NC_009380	AGC	2	6	516994	516999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593020
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12497	NC_009380	GC	3	6	517090	517095	0 %	0 %	50 %	50 %	145593020
12498	NC_009380	CGA	2	6	517109	517114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145593020
12499	NC_009380	CGGC	2	8	517156	517163	0 %	0 %	50 %	50 %	145593020
12500	NC_009380	CGG	2	6	517207	517212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145593020

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