MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 124575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_009380	CGG	2	6	297346	297351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592827
7003	NC_009380	CCTT	2	8	297360	297367	0 %	50 %	0 %	50 %	145592827
7004	NC_009380	GTG	2	6	297377	297382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592827
7005	NC_009380	CGG	2	6	297412	297417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592827
7006	NC_009380	CG	3	6	297422	297427	0 %	0 %	50 %	50 %	145592827
7007	NC_009380	GGC	2	6	297437	297442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592827
7008	NC_009380	GCC	2	6	297471	297476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592827
7009	NC_009380	CGCC	2	8	297488	297495	0 %	0 %	25 %	75 %	145592827
7010	NC_009380	CACCG	2	10	297539	297548	20 %	0 %	20 %	60 %	145592827
7011	NC_009380	CGA	2	6	297648	297653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592828
7012	NC_009380	GCCCC	2	10	297656	297665	0 %	0 %	20 %	80 %	145592828
7013	NC_009380	C	6	6	297662	297667	0 %	0 %	0 %	100 %	145592828
7014	NC_009380	TGG	2	6	297719	297724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592828
7015	NC_009380	CCA	2	6	297729	297734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592828
7016	NC_009380	CGC	2	6	297735	297740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592828
7017	NC_009380	TGG	2	6	297763	297768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592828
7018	NC_009380	GGGCG	2	10	297819	297828	0 %	0 %	80 %	20 %	145592828
7019	NC_009380	CTG	2	6	297841	297846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592828
7020	NC_009380	TTC	2	6	297847	297852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592828
7021	NC_009380	CGC	2	6	297855	297860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592828
7022	NC_009380	TTC	2	6	297862	297867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592828
7023	NC_009380	CGC	2	6	297876	297881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592828
7024	NC_009380	CGGC	2	8	297912	297919	0 %	0 %	50 %	50 %	145592828
7025	NC_009380	TCGGC	2	10	297947	297956	0 %	20 %	40 %	40 %	145592828
7026	NC_009380	ATC	2	6	297961	297966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592828
7027	NC_009380	ATGT	2	8	297976	297983	25 %	50 %	25 %	0 %	145592828
7028	NC_009380	CTA	2	6	297984	297989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592828
7029	NC_009380	CTA	2	6	298029	298034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592828
7030	NC_009380	CGGC	3	12	298063	298074	0 %	0 %	50 %	50 %	145592828
7031	NC_009380	CTG	2	6	298156	298161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592828
7032	NC_009380	GCT	2	6	298179	298184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592828
7033	NC_009380	GCCC	2	8	298192	298199	0 %	0 %	25 %	75 %	145592828
7034	NC_009380	CAC	2	6	298203	298208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592828
7035	NC_009380	ACCCTG	2	12	298258	298269	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145592828
7036	NC_009380	TTC	2	6	298375	298380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592828
7037	NC_009380	CCG	2	6	298382	298387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592828
7038	NC_009380	CCG	2	6	298472	298477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592828
7039	NC_009380	TG	3	6	298568	298573	0 %	50 %	50 %	0 %	145592828
7040	NC_009380	GCC	2	6	298648	298653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592828
7041	NC_009380	CAT	2	6	298671	298676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592828
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7044	NC_009380	TCA	2	6	298772	298777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592828
7045	NC_009380	CGTCGC	2	12	298779	298790	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145592828
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7047	NC_009380	CCA	2	6	299300	299305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592829
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7049	NC_009380	TGC	2	6	299483	299488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592829
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7051	NC_009380	CGC	2	6	299585	299590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592829
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7053	NC_009380	GTG	2	6	299641	299646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592829
7054	NC_009380	CCG	2	6	299660	299665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592829
7055	NC_009380	CGC	2	6	299727	299732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592829
7056	NC_009380	CGC	2	6	299736	299741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592829
7057	NC_009380	CCGGG	2	10	299742	299751	0 %	0 %	60 %	40 %	145592829
7058	NC_009380	GGT	2	6	299760	299765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592829
7059	NC_009380	GGT	2	6	299796	299801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592829
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7062	NC_009380	ACG	3	9	299849	299857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592829
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7065	NC_009380	CGA	2	6	299889	299894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592829
7066	NC_009380	CGTCAA	2	12	299913	299924	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145592829
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7080	NC_009380	GCT	2	6	300321	300326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592829
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7085	NC_009380	CGACC	2	10	300411	300420	20 %	0 %	20 %	60 %	145592829
7086	NC_009380	GCGG	2	8	300516	300523	0 %	0 %	75 %	25 %	145592829
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7108	NC_009380	CGC	3	9	301696	301704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592830
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7110	NC_009380	GATCT	2	10	301780	301789	20 %	40 %	20 %	20 %	145592830
7111	NC_009380	ATG	2	6	301827	301832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592831
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7113	NC_009380	CAC	2	6	302123	302128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592831
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7116	NC_009380	GTCT	2	8	302187	302194	0 %	50 %	25 %	25 %	145592831
7117	NC_009380	TACGCG	2	12	302331	302342	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145592831
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7119	NC_009380	GGC	2	6	302381	302386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592831
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7121	NC_009380	CG	4	8	302545	302552	0 %	0 %	50 %	50 %	145592831
7122	NC_009380	TGC	2	6	302554	302559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592831
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7230	NC_009380	GC	3	6	308261	308266	0 %	0 %	50 %	50 %	145592836
7231	NC_009380	GCA	3	9	308286	308294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592836
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7233	NC_009380	AACC	2	8	308345	308352	50 %	0 %	0 %	50 %	145592836
7234	NC_009380	GGC	2	6	308371	308376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592836
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7237	NC_009380	GCT	2	6	308553	308558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592836
7238	NC_009380	GTC	2	6	308570	308575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592836
7239	NC_009380	CCG	2	6	308655	308660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592836
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7241	NC_009380	CGG	2	6	308710	308715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592836
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7362	NC_009380	CTA	2	6	312317	312322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592838
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7364	NC_009380	CG	3	6	312341	312346	0 %	0 %	50 %	50 %	145592838
7365	NC_009380	TGG	2	6	312349	312354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592838
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7475	NC_009380	GTG	2	6	316354	316359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592840
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7478	NC_009380	AGA	2	6	316463	316468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592840
7479	NC_009380	AGC	2	6	316484	316489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592840
7480	NC_009380	GCG	2	6	316562	316567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592841
7481	NC_009380	GCG	2	6	316571	316576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592841
7482	NC_009380	GGT	2	6	316581	316586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592841
7483	NC_009380	TAC	2	6	316602	316607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592841
7484	NC_009380	CCG	2	6	316648	316653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592841
7485	NC_009380	GCGG	2	8	316660	316667	0 %	0 %	75 %	25 %	145592841
7486	NC_009380	AGT	2	6	316679	316684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592841
7487	NC_009380	GCC	2	6	316737	316742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592841
7488	NC_009380	CGGC	2	8	316775	316782	0 %	0 %	50 %	50 %	145592841
7489	NC_009380	ACGA	2	8	316787	316794	50 %	0 %	25 %	25 %	145592841
7490	NC_009380	CGCGG	2	10	316808	316817	0 %	0 %	60 %	40 %	145592841
7491	NC_009380	CGT	2	6	316899	316904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592841
7492	NC_009380	GCC	2	6	316910	316915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592841
7493	NC_009380	CGGCC	3	15	316994	317008	0 %	0 %	40 %	60 %	145592841
7494	NC_009380	CGG	2	6	317071	317076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592841
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7496	NC_009380	CGCCC	2	10	317094	317103	0 %	0 %	20 %	80 %	145592841
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7499	NC_009380	CG	3	6	317421	317426	0 %	0 %	50 %	50 %	145592841
7500	NC_009380	GTG	2	6	317446	317451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592841

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