MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 124575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_009380	CGTT	2	8	279083	279090	0 %	50 %	25 %	25 %	145592810
6502	NC_009380	GCG	2	6	279105	279110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592810
6503	NC_009380	GGC	2	6	279163	279168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592810
6504	NC_009380	GCT	2	6	279172	279177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592810
6505	NC_009380	TCGA	2	8	279185	279192	25 %	25 %	25 %	25 %	145592810
6506	NC_009380	GGT	2	6	279199	279204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592810
6507	NC_009380	GAG	2	6	279209	279214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592810
6508	NC_009380	CAG	2	6	279260	279265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592810
6509	NC_009380	CGA	2	6	279351	279356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592810
6510	NC_009380	CGA	2	6	279358	279363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592810
6511	NC_009380	GGT	2	6	279388	279393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592810
6512	NC_009380	CTG	2	6	279419	279424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592810
6513	NC_009380	GGA	2	6	279445	279450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592810
6514	NC_009380	TCG	2	6	279460	279465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592810
6515	NC_009380	CTC	2	6	279467	279472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592810
6516	NC_009380	CCGAG	2	10	279490	279499	20 %	0 %	40 %	40 %	145592810
6517	NC_009380	AGC	2	6	279516	279521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592810
6518	NC_009380	GGC	2	6	279523	279528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592810
6519	NC_009380	GCTG	2	8	279534	279541	0 %	25 %	50 %	25 %	145592810
6520	NC_009380	GGT	2	6	279559	279564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592810
6521	NC_009380	ATC	2	6	279623	279628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592810
6522	NC_009380	GCT	2	6	279640	279645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592810
6523	NC_009380	GCCG	2	8	279656	279663	0 %	0 %	50 %	50 %	145592810
6524	NC_009380	CGG	2	6	279681	279686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592810
6525	NC_009380	CGA	2	6	279724	279729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592810
6526	NC_009380	CCGC	2	8	279755	279762	0 %	0 %	25 %	75 %	145592810
6527	NC_009380	CCAG	2	8	279816	279823	25 %	0 %	25 %	50 %	145592811
6528	NC_009380	GC	3	6	279830	279835	0 %	0 %	50 %	50 %	145592811
6529	NC_009380	GTC	3	9	279856	279864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592811
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6531	NC_009380	CGGG	2	8	279932	279939	0 %	0 %	75 %	25 %	145592811
6532	NC_009380	GTG	2	6	279941	279946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592811
6533	NC_009380	CAT	2	6	279949	279954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592811
6534	NC_009380	GGC	2	6	279958	279963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592811
6535	NC_009380	CATC	2	8	280008	280015	25 %	25 %	0 %	50 %	145592811
6536	NC_009380	TGC	2	6	280023	280028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592811
6537	NC_009380	GTC	2	6	280067	280072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592811
6538	NC_009380	GCC	2	6	280087	280092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592811
6539	NC_009380	CGG	3	9	280119	280127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592811
6540	NC_009380	CATCG	2	10	280129	280138	20 %	20 %	20 %	40 %	145592811
6541	NC_009380	TCCGC	2	10	280152	280161	0 %	20 %	20 %	60 %	145592811
6542	NC_009380	CGG	2	6	280164	280169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592811
6543	NC_009380	CGT	2	6	280194	280199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592811
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6545	NC_009380	GGAG	2	8	280237	280244	25 %	0 %	75 %	0 %	145592811
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6548	NC_009380	GGTG	2	8	280308	280315	0 %	25 %	75 %	0 %	145592811
6549	NC_009380	CGG	2	6	280329	280334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592811
6550	NC_009380	CGTCG	2	10	280360	280369	0 %	20 %	40 %	40 %	145592811
6551	NC_009380	CCG	2	6	280380	280385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592811
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6554	NC_009380	ATC	2	6	280454	280459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592811
6555	NC_009380	CAG	2	6	280483	280488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592811
6556	NC_009380	TGG	2	6	280623	280628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592811
6557	NC_009380	GC	3	6	280631	280636	0 %	0 %	50 %	50 %	145592811
6558	NC_009380	GTG	2	6	280679	280684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592811
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6560	NC_009380	TCG	2	6	280721	280726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592811
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6572	NC_009380	CGG	2	6	281273	281278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592812
6573	NC_009380	GCCC	3	12	281298	281309	0 %	0 %	25 %	75 %	145592812
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6588	NC_009380	ACCGT	2	10	281764	281773	20 %	20 %	20 %	40 %	145592812
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6591	NC_009380	ATCG	2	8	281814	281821	25 %	25 %	25 %	25 %	145592812
6592	NC_009380	CCGGT	2	10	281838	281847	0 %	20 %	40 %	40 %	145592812
6593	NC_009380	CGG	2	6	282007	282012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592813
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6605	NC_009380	CG	3	6	282410	282415	0 %	0 %	50 %	50 %	145592813
6606	NC_009380	TCG	2	6	282417	282422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592813
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6618	NC_009380	GCCGG	2	10	282710	282719	0 %	0 %	60 %	40 %	145592813
6619	NC_009380	GCCGC	2	10	282748	282757	0 %	0 %	40 %	60 %	145592813
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6621	NC_009380	GGC	2	6	283064	283069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592814
6622	NC_009380	CCA	2	6	283093	283098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592814
6623	NC_009380	GAT	2	6	283133	283138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592814
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6662	NC_009380	CCGGG	2	10	284651	284660	0 %	0 %	60 %	40 %	145592815
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6983	NC_009380	GTTT	2	8	296459	296466	0 %	75 %	25 %	0 %	145592826
6984	NC_009380	CGG	2	6	296513	296518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592826
6985	NC_009380	GCC	3	9	296614	296622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592826
6986	NC_009380	GCCA	2	8	296661	296668	25 %	0 %	25 %	50 %	145592826
6987	NC_009380	GC	3	6	296853	296858	0 %	0 %	50 %	50 %	145592827
6988	NC_009380	GTC	2	6	296897	296902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592827
6989	NC_009380	CGG	2	6	296914	296919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592827
6990	NC_009380	GTTG	2	8	296959	296966	0 %	50 %	50 %	0 %	145592827
6991	NC_009380	GCG	2	6	296975	296980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592827
6992	NC_009380	GGTC	2	8	297006	297013	0 %	25 %	50 %	25 %	145592827
6993	NC_009380	CGA	2	6	297052	297057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592827
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6995	NC_009380	GGC	2	6	297160	297165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592827
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6999	NC_009380	CG	3	6	297249	297254	0 %	0 %	50 %	50 %	145592827
7000	NC_009380	CAT	2	6	297272	297277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145592827

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