MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 124575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009380	GCA	2	6	240925	240930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592777
5502	NC_009380	CGC	2	6	240933	240938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592777
5503	NC_009380	GCAG	2	8	241216	241223	25 %	0 %	50 %	25 %	145592777
5504	NC_009380	TCG	2	6	241278	241283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592777
5505	NC_009380	CGT	2	6	241291	241296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592777
5506	NC_009380	GAG	2	6	241364	241369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592777
5507	NC_009380	GTCGC	2	10	241447	241456	0 %	20 %	40 %	40 %	145592778
5508	NC_009380	GC	3	6	241478	241483	0 %	0 %	50 %	50 %	145592778
5509	NC_009380	CGC	2	6	241711	241716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592778
5510	NC_009380	CAA	2	6	241795	241800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145592778
5511	NC_009380	GTTGA	2	10	241826	241835	20 %	40 %	40 %	0 %	145592778
5512	NC_009380	TGGCGC	2	12	242421	242432	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145592779
5513	NC_009380	GCGGG	2	10	242512	242521	0 %	0 %	80 %	20 %	145592779
5514	NC_009380	CCT	2	6	242646	242651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592779
5515	NC_009380	TCGA	2	8	242681	242688	25 %	25 %	25 %	25 %	145592779
5516	NC_009380	CGG	2	6	242716	242721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592779
5517	NC_009380	GAC	2	6	242726	242731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5518	NC_009380	TTC	2	6	242756	242761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592779
5519	NC_009380	CGA	2	6	242797	242802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5520	NC_009380	TCG	2	6	242816	242821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5521	NC_009380	GAG	2	6	242852	242857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592779
5522	NC_009380	CCA	2	6	242886	242891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592779
5523	NC_009380	CAC	2	6	242933	242938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592779
5524	NC_009380	CCG	2	6	242957	242962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5525	NC_009380	CGG	2	6	243021	243026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592779
5526	NC_009380	TCG	2	6	243036	243041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5527	NC_009380	GGT	2	6	243050	243055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592779
5528	NC_009380	GCC	2	6	243134	243139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5529	NC_009380	GCT	2	6	243142	243147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5530	NC_009380	CGA	2	6	243172	243177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5531	NC_009380	CGC	2	6	243193	243198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5532	NC_009380	GCG	3	9	243209	243217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592779
5533	NC_009380	TCG	2	6	243237	243242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5534	NC_009380	CGC	2	6	243268	243273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5535	NC_009380	CTG	2	6	243278	243283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5536	NC_009380	TGATC	2	10	243295	243304	20 %	40 %	20 %	20 %	145592779
5537	NC_009380	TCC	2	6	243306	243311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592779
5538	NC_009380	CGC	2	6	243325	243330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5539	NC_009380	TGG	2	6	243342	243347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592779
5540	NC_009380	GAC	2	6	243356	243361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5541	NC_009380	ACG	2	6	243435	243440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5542	NC_009380	CTG	2	6	243479	243484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5543	NC_009380	GCT	3	9	243502	243510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5544	NC_009380	GAC	2	6	243521	243526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5545	NC_009380	CGG	2	6	243636	243641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592779
5546	NC_009380	GCT	2	6	243707	243712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5547	NC_009380	GCC	2	6	243718	243723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5548	NC_009380	GCCG	2	8	243727	243734	0 %	0 %	50 %	50 %	145592779
5549	NC_009380	CGC	2	6	243741	243746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5550	NC_009380	ATGG	2	8	243779	243786	25 %	25 %	50 %	0 %	145592779
5551	NC_009380	CCG	2	6	243808	243813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5552	NC_009380	CGGC	2	8	243824	243831	0 %	0 %	50 %	50 %	145592779
5553	NC_009380	GCC	2	6	243859	243864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5554	NC_009380	GGT	2	6	243928	243933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592779
5555	NC_009380	TGG	2	6	243939	243944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592779
5556	NC_009380	GCAAGA	2	12	243948	243959	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	145592779
5557	NC_009380	CGG	2	6	244144	244149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592779
5558	NC_009380	CGC	2	6	244153	244158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5559	NC_009380	CCGGC	3	15	244173	244187	0 %	0 %	40 %	60 %	145592779
5560	NC_009380	CGG	2	6	244215	244220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592779
5561	NC_009380	CGC	2	6	244228	244233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5562	NC_009380	CCG	2	6	244235	244240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5563	NC_009380	TCG	2	6	244244	244249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5564	NC_009380	ATGGC	2	10	244269	244278	20 %	20 %	40 %	20 %	145592779
5565	NC_009380	CCG	2	6	244296	244301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5566	NC_009380	CGG	2	6	244333	244338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592779
5567	NC_009380	CGG	2	6	244356	244361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592779
5568	NC_009380	GAG	2	6	244373	244378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592779
5569	NC_009380	GCCC	2	8	244391	244398	0 %	0 %	25 %	75 %	145592779
5570	NC_009380	CGG	2	6	244422	244427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592779
5571	NC_009380	CAG	3	9	244428	244436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5572	NC_009380	GGC	2	6	244445	244450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592779
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5575	NC_009380	GCC	2	6	244516	244521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
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5578	NC_009380	GC	3	6	244584	244589	0 %	0 %	50 %	50 %	145592779
5579	NC_009380	CGC	2	6	244605	244610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592779
5580	NC_009380	CGG	2	6	244617	244622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592779
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5582	NC_009380	ACG	2	6	244662	244667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592779
5583	NC_009380	GTG	3	9	244677	244685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592779
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5585	NC_009380	TGAT	2	8	244743	244750	25 %	50 %	25 %	0 %	145592779
5586	NC_009380	GAG	2	6	244775	244780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592779
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5588	NC_009380	GCGGA	2	10	244814	244823	20 %	0 %	60 %	20 %	145592779
5589	NC_009380	CGA	2	6	244825	244830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592779
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5591	NC_009380	GCA	2	6	244949	244954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592780
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5593	NC_009380	GCA	3	9	244979	244987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592780
5594	NC_009380	GGC	2	6	245043	245048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592780
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5596	NC_009380	GGA	2	6	245120	245125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592780
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5600	NC_009380	GGC	2	6	245177	245182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592780
5601	NC_009380	GACC	2	8	245192	245199	25 %	0 %	25 %	50 %	145592780
5602	NC_009380	AGA	2	6	245200	245205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592780
5603	NC_009380	CGGCCT	2	12	245231	245242	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145592780
5604	NC_009380	CGA	2	6	245258	245263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592781
5605	NC_009380	TGTCC	2	10	245352	245361	0 %	40 %	20 %	40 %	145592781
5606	NC_009380	GCT	2	6	245435	245440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592781
5607	NC_009380	GTG	2	6	245509	245514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592781
5608	NC_009380	GTG	2	6	245530	245535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592781
5609	NC_009380	CGG	2	6	245580	245585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592781
5610	NC_009380	GGCGA	2	10	245704	245713	20 %	0 %	60 %	20 %	145592781
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5612	NC_009380	CGA	2	6	245808	245813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592781
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5618	NC_009380	ACG	2	6	246456	246461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592782
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5981	NC_009380	GCCG	2	8	260727	260734	0 %	0 %	50 %	50 %	145592794
5982	NC_009380	TCG	2	6	260767	260772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592794
5983	NC_009380	GGT	2	6	260778	260783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592794
5984	NC_009380	GC	3	6	260786	260791	0 %	0 %	50 %	50 %	145592794
5985	NC_009380	CG	3	6	260854	260859	0 %	0 %	50 %	50 %	145592794
5986	NC_009380	CGG	3	9	260897	260905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592794
5987	NC_009380	CCG	2	6	260948	260953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592794
5988	NC_009380	CCG	2	6	260959	260964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592794
5989	NC_009380	CGA	2	6	260969	260974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592794
5990	NC_009380	CG	3	6	260977	260982	0 %	0 %	50 %	50 %	145592794
5991	NC_009380	CGCCA	2	10	261016	261025	20 %	0 %	20 %	60 %	145592794
5992	NC_009380	CCG	2	6	261032	261037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592794
5993	NC_009380	TGG	2	6	261110	261115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592794
5994	NC_009380	GGAC	2	8	261121	261128	25 %	0 %	50 %	25 %	145592794
5995	NC_009380	TGA	2	6	261161	261166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592794
5996	NC_009380	GGT	2	6	261180	261185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592794
5997	NC_009380	GT	3	6	261184	261189	0 %	50 %	50 %	0 %	145592794
5998	NC_009380	CGAC	2	8	261193	261200	25 %	0 %	25 %	50 %	145592794
5999	NC_009380	CGG	2	6	261213	261218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592794
6000	NC_009380	TGG	2	6	261296	261301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592794

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