MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinispora tropica CNB-440 chromosome

Total Repeats: 124575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009380	CGT	2	6	220036	220041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592756
5002	NC_009380	G	6	6	220055	220060	0 %	0 %	100 %	0 %	145592756
5003	NC_009380	TGG	2	6	220098	220103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592756
5004	NC_009380	CGG	2	6	220182	220187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592756
5005	NC_009380	CTC	2	6	220199	220204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592756
5006	NC_009380	CGC	2	6	220228	220233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592756
5007	NC_009380	TGG	2	6	220275	220280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592756
5008	NC_009380	CGC	2	6	220318	220323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592756
5009	NC_009380	CGA	2	6	220357	220362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592756
5010	NC_009380	CGC	2	6	220381	220386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592756
5011	NC_009380	CGGT	2	8	220428	220435	0 %	25 %	50 %	25 %	145592756
5012	NC_009380	GTTCG	2	10	220493	220502	0 %	40 %	40 %	20 %	145592756
5013	NC_009380	GCC	2	6	220562	220567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592756
5014	NC_009380	CGG	2	6	220572	220577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592756
5015	NC_009380	GTC	2	6	220598	220603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592756
5016	NC_009380	GTC	2	6	220613	220618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592756
5017	NC_009380	CTT	2	6	220654	220659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592756
5018	NC_009380	CCGG	2	8	220660	220667	0 %	0 %	50 %	50 %	145592756
5019	NC_009380	GCCG	2	8	220674	220681	0 %	0 %	50 %	50 %	145592756
5020	NC_009380	GAG	2	6	220721	220726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592756
5021	NC_009380	TCCG	2	8	220734	220741	0 %	25 %	25 %	50 %	145592756
5022	NC_009380	ACG	2	6	220814	220819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592756
5023	NC_009380	GTG	2	6	220859	220864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592756
5024	NC_009380	CGCGAC	2	12	220891	220902	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145592756
5025	NC_009380	GCG	2	6	220939	220944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592756
5026	NC_009380	GA	3	6	220983	220988	50 %	0 %	50 %	0 %	145592756
5027	NC_009380	CGGG	2	8	221047	221054	0 %	0 %	75 %	25 %	145592756
5028	NC_009380	CGT	2	6	221064	221069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592756
5029	NC_009380	GACC	2	8	221078	221085	25 %	0 %	25 %	50 %	145592757
5030	NC_009380	CCGA	2	8	221088	221095	25 %	0 %	25 %	50 %	145592757
5031	NC_009380	GGT	2	6	221101	221106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592757
5032	NC_009380	TGT	2	6	221121	221126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592757
5033	NC_009380	CGG	2	6	221139	221144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592757
5034	NC_009380	CGG	2	6	221148	221153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592757
5035	NC_009380	GCTC	2	8	221158	221165	0 %	25 %	25 %	50 %	145592757
5036	NC_009380	GGC	2	6	221170	221175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592757
5037	NC_009380	TGC	2	6	221187	221192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592757
5038	NC_009380	GGT	2	6	221284	221289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592757
5039	NC_009380	GTG	2	6	221321	221326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592757
5040	NC_009380	TGGG	2	8	221340	221347	0 %	25 %	75 %	0 %	145592757
5041	NC_009380	CTG	2	6	221354	221359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592757
5042	NC_009380	GCG	2	6	221360	221365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592757
5043	NC_009380	GGC	2	6	221376	221381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592757
5044	NC_009380	CCGA	2	8	221387	221394	25 %	0 %	25 %	50 %	145592757
5045	NC_009380	GCT	2	6	221410	221415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592757
5046	NC_009380	CTG	2	6	221480	221485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592757
5047	NC_009380	CGC	2	6	221494	221499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592757
5048	NC_009380	CGGG	2	8	221539	221546	0 %	0 %	75 %	25 %	145592757
5049	NC_009380	TGC	2	6	221565	221570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592757
5050	NC_009380	CGC	3	9	221572	221580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592757
5051	NC_009380	GGTGT	2	10	221621	221630	0 %	40 %	60 %	0 %	145592757
5052	NC_009380	CAC	2	6	221640	221645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592757
5053	NC_009380	CGG	2	6	221754	221759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592757
5054	NC_009380	GCC	2	6	221765	221770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592757
5055	NC_009380	GCTG	2	8	221803	221810	0 %	25 %	50 %	25 %	145592757
5056	NC_009380	CGAGC	2	10	221856	221865	20 %	0 %	40 %	40 %	145592757
5057	NC_009380	CTG	2	6	221927	221932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592757
5058	NC_009380	G	6	6	221980	221985	0 %	0 %	100 %	0 %	145592757
5059	NC_009380	CGC	2	6	221998	222003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592757
5060	NC_009380	CGGTG	2	10	222007	222016	0 %	20 %	60 %	20 %	145592757
5061	NC_009380	GCT	2	6	222070	222075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592757
5062	NC_009380	TGG	2	6	222117	222122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592757
5063	NC_009380	CGC	2	6	222151	222156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592757
5064	NC_009380	GAA	2	6	222168	222173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145592757
5065	NC_009380	GTG	2	6	222191	222196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592757
5066	NC_009380	TGG	2	6	222198	222203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592757
5067	NC_009380	TGC	4	12	222207	222218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592757
5068	NC_009380	CGC	2	6	222223	222228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592757
5069	NC_009380	TGG	2	6	222247	222252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592757
5070	NC_009380	GTG	2	6	222296	222301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592757
5071	NC_009380	GCC	2	6	222302	222307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592757
5072	NC_009380	GGC	2	6	222326	222331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592757
5073	NC_009380	CGG	2	6	222420	222425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592757
5074	NC_009380	TGAT	2	8	222432	222439	25 %	50 %	25 %	0 %	145592757
5075	NC_009380	GCA	2	6	222559	222564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592757
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5078	NC_009380	GCGGTG	2	12	222695	222706	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145592757
5079	NC_009380	GTC	2	6	222713	222718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592757
5080	NC_009380	TGG	3	9	222726	222734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592757
5081	NC_009380	GCT	2	6	222737	222742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592757
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5083	NC_009380	CTCCG	2	10	222782	222791	0 %	20 %	20 %	60 %	145592757
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5086	NC_009380	TGG	2	6	222850	222855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592758
5087	NC_009380	CTGT	2	8	222873	222880	0 %	50 %	25 %	25 %	145592758
5088	NC_009380	GGC	2	6	222890	222895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592758
5089	NC_009380	CGA	2	6	222898	222903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592758
5090	NC_009380	GAG	3	9	222912	222920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592758
5091	NC_009380	GCA	2	6	223000	223005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592758
5092	NC_009380	CGG	3	9	223081	223089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592759
5093	NC_009380	CGC	2	6	223103	223108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592759
5094	NC_009380	GCC	2	6	223119	223124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592759
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5100	NC_009380	GCCG	2	8	223274	223281	0 %	0 %	50 %	50 %	145592759
5101	NC_009380	CTTC	2	8	223312	223319	0 %	50 %	0 %	50 %	145592759
5102	NC_009380	GAG	2	6	223352	223357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592759
5103	NC_009380	TCC	3	9	223368	223376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592759
5104	NC_009380	GCC	2	6	223438	223443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592759
5105	NC_009380	CCA	2	6	223448	223453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592759
5106	NC_009380	ACC	2	6	223467	223472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592759
5107	NC_009380	TCG	2	6	223491	223496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592759
5108	NC_009380	TG	3	6	223537	223542	0 %	50 %	50 %	0 %	145592759
5109	NC_009380	GT	3	6	223596	223601	0 %	50 %	50 %	0 %	145592759
5110	NC_009380	GCG	2	6	223606	223611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592759
5111	NC_009380	CAC	2	6	223625	223630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592759
5112	NC_009380	GTG	2	6	223697	223702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592759
5113	NC_009380	ATG	2	6	223729	223734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592759
5114	NC_009380	CCAC	2	8	223738	223745	25 %	0 %	0 %	75 %	145592759
5115	NC_009380	CA	3	6	223778	223783	50 %	0 %	0 %	50 %	145592759
5116	NC_009380	TGG	2	6	223803	223808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592759
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5119	NC_009380	TCGG	2	8	223885	223892	0 %	25 %	50 %	25 %	145592759
5120	NC_009380	CGG	2	6	223902	223907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592759
5121	NC_009380	GCCC	2	8	223975	223982	0 %	0 %	25 %	75 %	145592759
5122	NC_009380	CGT	2	6	224002	224007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592759
5123	NC_009380	CCT	2	6	224014	224019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592759
5124	NC_009380	CGA	2	6	224031	224036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592759
5125	NC_009380	GCG	2	6	224040	224045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592759
5126	NC_009380	CCA	2	6	224115	224120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592759
5127	NC_009380	CGG	2	6	224167	224172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592759
5128	NC_009380	CTG	2	6	224289	224294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592760
5129	NC_009380	GCG	2	6	224332	224337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592760
5130	NC_009380	GTA	2	6	224374	224379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592760
5131	NC_009380	CGC	3	9	224383	224391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592760
5132	NC_009380	GCGG	2	8	224451	224458	0 %	0 %	75 %	25 %	145592760
5133	NC_009380	ACGAG	2	10	224514	224523	40 %	0 %	40 %	20 %	145592760
5134	NC_009380	TGG	2	6	224558	224563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592760
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5136	NC_009380	TCGGC	2	10	224658	224667	0 %	20 %	40 %	40 %	145592760
5137	NC_009380	GTC	2	6	224693	224698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592760
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5142	NC_009380	GCG	2	6	224939	224944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592760
5143	NC_009380	GGCC	2	8	225124	225131	0 %	0 %	50 %	50 %	145592760
5144	NC_009380	CGC	2	6	225200	225205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592760
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5146	NC_009380	CGG	2	6	225240	225245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592760
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5150	NC_009380	ACCGA	2	10	225395	225404	40 %	0 %	20 %	40 %	145592760
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5152	NC_009380	GGT	2	6	225439	225444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592760
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5154	NC_009380	CGA	2	6	225454	225459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592760
5155	NC_009380	CGA	2	6	225716	225721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592761
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5206	NC_009380	GGCC	2	8	228038	228045	0 %	0 %	50 %	50 %	145592762
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5230	NC_009380	TGG	2	6	229028	229033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592763
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5234	NC_009380	TCG	2	6	229111	229116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592763
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5236	NC_009380	TGGCGC	2	12	229165	229176	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145592763
5237	NC_009380	GGCG	2	8	229202	229209	0 %	0 %	75 %	25 %	145592763
5238	NC_009380	CCG	2	6	229212	229217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592763
5239	NC_009380	GC	3	6	229267	229272	0 %	0 %	50 %	50 %	145592763
5240	NC_009380	CGA	2	6	229394	229399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592763
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5242	NC_009380	CGC	2	6	229479	229484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592763
5243	NC_009380	CGG	3	9	229534	229542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592763
5244	NC_009380	CCG	2	6	229555	229560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145592763
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5345	NC_009380	CATGCC	2	12	233813	233824	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145592769
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5347	NC_009380	CTCG	2	8	233965	233972	0 %	25 %	25 %	50 %	145592769
5348	NC_009380	TC	3	6	233977	233982	0 %	50 %	0 %	50 %	145592769
5349	NC_009380	CGG	2	6	234512	234517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592770
5350	NC_009380	TCG	2	6	234584	234589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592770
5351	NC_009380	AGT	2	6	234615	234620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145592770
5352	NC_009380	GGC	2	6	234664	234669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592770
5353	NC_009380	GAG	2	6	234697	234702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145592770
5354	NC_009380	GGGTC	2	10	234834	234843	0 %	20 %	60 %	20 %	145592770
5355	NC_009380	CTC	2	6	234904	234909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145592770
5356	NC_009380	TCG	2	6	234942	234947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592770
5357	NC_009380	CAC	2	6	234996	235001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592770
5358	NC_009380	AGC	2	6	235013	235018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592770
5359	NC_009380	GGT	2	6	235020	235025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592770
5360	NC_009380	GC	3	6	235026	235031	0 %	0 %	50 %	50 %	145592770
5361	NC_009380	CCA	2	6	235104	235109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592770
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5363	NC_009380	GCGG	2	8	235164	235171	0 %	0 %	75 %	25 %	145592770
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5484	NC_009380	CGT	2	6	240036	240041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592776
5485	NC_009380	CAG	2	6	240055	240060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592776
5486	NC_009380	CTT	2	6	240169	240174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145592776
5487	NC_009380	GTC	2	6	240205	240210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592776
5488	NC_009380	TCG	2	6	240242	240247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145592776
5489	NC_009380	GTG	2	6	240269	240274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145592776
5490	NC_009380	GGC	2	6	240295	240300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592776
5491	NC_009380	GCG	4	12	240305	240316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592776
5492	NC_009380	CGG	2	6	240321	240326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145592776
5493	NC_009380	CAC	2	6	240359	240364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145592776
5494	NC_009380	TCGC	2	8	240372	240379	0 %	25 %	25 %	50 %	145592776
5495	NC_009380	GATC	2	8	240389	240396	25 %	25 %	25 %	25 %	145592776
5496	NC_009380	GTT	2	6	240405	240410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145592776
5497	NC_009380	CGA	2	6	240697	240702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592777
5498	NC_009380	AGC	2	6	240792	240797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145592777
5499	NC_009380	TTCG	2	8	240841	240848	0 %	50 %	25 %	25 %	145592777
5500	NC_009380	GC	3	6	240910	240915	0 %	0 %	50 %	50 %	145592777

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