MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 32125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009332	TAA	2	6	185208	185213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473046
3002	NC_009332	ATG	2	6	186175	186180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473047
3003	NC_009332	TTA	2	6	186184	186189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473047
3004	NC_009332	ATT	2	6	186492	186497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473048
3005	NC_009332	ACA	2	6	186523	186528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473048
3006	NC_009332	T	6	6	186538	186543	0 %	100 %	0 %	0 %	139473048
3007	NC_009332	CTG	3	9	186666	186674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473048
3008	NC_009332	A	6	6	186675	186680	100 %	0 %	0 %	0 %	139473048
3009	NC_009332	ATCGGT	2	12	186710	186721	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	139473048
3010	NC_009332	AGC	2	6	186742	186747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473048
3011	NC_009332	GATT	2	8	186748	186755	25 %	50 %	25 %	0 %	139473048
3012	NC_009332	T	6	6	186754	186759	0 %	100 %	0 %	0 %	139473048
3013	NC_009332	ATC	2	6	186762	186767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473048
3014	NC_009332	A	6	6	186965	186970	100 %	0 %	0 %	0 %	139473048
3015	NC_009332	AAG	3	9	186978	186986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473048
3016	NC_009332	AAC	2	6	187052	187057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473048
3017	NC_009332	TGG	2	6	187087	187092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473048
3018	NC_009332	CTG	2	6	187110	187115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473048
3019	NC_009332	TTG	2	6	187121	187126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473048
3020	NC_009332	TGC	2	6	187132	187137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473048
3021	NC_009332	TGC	2	6	187177	187182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473048
3022	NC_009332	TTC	2	6	187195	187200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473048
3023	NC_009332	GCT	2	6	187235	187240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473048
3024	NC_009332	TGG	2	6	187322	187327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473048
3025	NC_009332	TCAC	2	8	187405	187412	25 %	25 %	0 %	50 %	139473048
3026	NC_009332	AAG	2	6	187428	187433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473048
3027	NC_009332	AGA	2	6	187507	187512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473048
3028	NC_009332	CTT	2	6	187583	187588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473048
3029	NC_009332	CA	3	6	187592	187597	50 %	0 %	0 %	50 %	139473048
3030	NC_009332	GGC	2	6	187601	187606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139473048
3031	NC_009332	CTT	2	6	187669	187674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473048
3032	NC_009332	CTT	2	6	187766	187771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473048
3033	NC_009332	CAG	2	6	187797	187802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473048
3034	NC_009332	AAG	2	6	188172	188177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473049
3035	NC_009332	TTC	2	6	188191	188196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473049
3036	NC_009332	GCT	2	6	188256	188261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473049
3037	NC_009332	CAAACT	2	12	188275	188286	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	139473049
3038	NC_009332	AAAC	2	8	188287	188294	75 %	0 %	0 %	25 %	139473049
3039	NC_009332	CTGG	2	8	188344	188351	0 %	25 %	50 %	25 %	139473049
3040	NC_009332	AGATA	2	10	188395	188404	60 %	20 %	20 %	0 %	139473049
3041	NC_009332	AAG	2	6	188430	188435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473049
3042	NC_009332	TGA	2	6	188448	188453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473049
3043	NC_009332	ATTG	2	8	188503	188510	25 %	50 %	25 %	0 %	139473049
3044	NC_009332	TAG	3	9	188635	188643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473049
3045	NC_009332	ATA	2	6	188668	188673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473049
3046	NC_009332	AG	3	6	188706	188711	50 %	0 %	50 %	0 %	139473049
3047	NC_009332	A	6	6	188720	188725	100 %	0 %	0 %	0 %	139473049
3048	NC_009332	TGA	2	6	188846	188851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473049
3049	NC_009332	AAG	2	6	188870	188875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473049
3050	NC_009332	TAAA	2	8	188890	188897	75 %	25 %	0 %	0 %	139473049
3051	NC_009332	ATC	2	6	188917	188922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473049
3052	NC_009332	TCAACA	2	12	189063	189074	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	139473049
3053	NC_009332	A	6	6	189082	189087	100 %	0 %	0 %	0 %	139473049
3054	NC_009332	AAG	2	6	189089	189094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473049
3055	NC_009332	TCTA	2	8	189097	189104	25 %	50 %	0 %	25 %	139473049
3056	NC_009332	T	7	7	189125	189131	0 %	100 %	0 %	0 %	139473049
3057	NC_009332	ATATA	2	10	189184	189193	60 %	40 %	0 %	0 %	139473049
3058	NC_009332	AAT	2	6	189291	189296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473049
3059	NC_009332	GATT	2	8	189364	189371	25 %	50 %	25 %	0 %	139473049
3060	NC_009332	TAA	2	6	189391	189396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473049
3061	NC_009332	A	7	7	189441	189447	100 %	0 %	0 %	0 %	139473049
3062	NC_009332	AATA	2	8	189477	189484	75 %	25 %	0 %	0 %	139473049
3063	NC_009332	TAA	2	6	189492	189497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473049
3064	NC_009332	GTT	2	6	189572	189577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473049
3065	NC_009332	GCT	2	6	189587	189592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473049
3066	NC_009332	CAA	2	6	189616	189621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473049
3067	NC_009332	AAT	2	6	189646	189651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473049
3068	NC_009332	ATA	2	6	189664	189669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473049
3069	NC_009332	TTA	2	6	190267	190272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473051
3070	NC_009332	TGT	2	6	190278	190283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473051
3071	NC_009332	TTA	2	6	190375	190380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473052
3072	NC_009332	T	7	7	190581	190587	0 %	100 %	0 %	0 %	139473052
3073	NC_009332	TTG	2	6	190610	190615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473052
3074	NC_009332	TCG	2	6	190622	190627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473052
3075	NC_009332	T	6	6	190650	190655	0 %	100 %	0 %	0 %	139473052
3076	NC_009332	CGT	2	6	190739	190744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473052
3077	NC_009332	TGC	2	6	190758	190763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473052
3078	NC_009332	GTA	2	6	190768	190773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473052
3079	NC_009332	T	6	6	190779	190784	0 %	100 %	0 %	0 %	139473052
3080	NC_009332	TGA	2	6	190850	190855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473052
3081	NC_009332	GTGG	2	8	190903	190910	0 %	25 %	75 %	0 %	139473052
3082	NC_009332	TAT	2	6	190998	191003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473052
3083	NC_009332	TGGT	2	8	191006	191013	0 %	50 %	50 %	0 %	139473052
3084	NC_009332	GT	3	6	191012	191017	0 %	50 %	50 %	0 %	139473052
3085	NC_009332	GTTTT	2	10	191141	191150	0 %	80 %	20 %	0 %	139473053
3086	NC_009332	GAT	2	6	191172	191177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473053
3087	NC_009332	AAG	2	6	191228	191233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473053
3088	NC_009332	CAT	2	6	191261	191266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473053
3089	NC_009332	TCAG	2	8	191329	191336	25 %	25 %	25 %	25 %	139473053
3090	NC_009332	AAT	2	6	191412	191417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473053
3091	NC_009332	CAA	2	6	191456	191461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473053
3092	NC_009332	GAG	2	6	191501	191506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473053
3093	NC_009332	GCA	2	6	191563	191568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473053
3094	NC_009332	TTC	2	6	191574	191579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473053
3095	NC_009332	ATC	2	6	191640	191645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473053
3096	NC_009332	ACA	2	6	191656	191661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473053
3097	NC_009332	CAA	2	6	191675	191680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473053
3098	NC_009332	GAA	2	6	191693	191698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473053
3099	NC_009332	CTA	2	6	191765	191770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473053
3100	NC_009332	TCT	2	6	191839	191844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473053
3101	NC_009332	TTC	2	6	191880	191885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473053
3102	NC_009332	CTT	2	6	191903	191908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473053
3103	NC_009332	CAA	2	6	191936	191941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473053
3104	NC_009332	A	6	6	191980	191985	100 %	0 %	0 %	0 %	139473053
3105	NC_009332	CTG	2	6	191999	192004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473053
3106	NC_009332	AAT	2	6	192009	192014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473053
3107	NC_009332	TCA	2	6	192032	192037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473053
3108	NC_009332	CATT	2	8	192075	192082	25 %	50 %	0 %	25 %	139473054
3109	NC_009332	CAT	2	6	192104	192109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473054
3110	NC_009332	CTTT	2	8	192120	192127	0 %	75 %	0 %	25 %	139473054
3111	NC_009332	TGT	2	6	192164	192169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473054
3112	NC_009332	GTT	2	6	192219	192224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473054
3113	NC_009332	TCT	2	6	192264	192269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473054
3114	NC_009332	CAC	2	6	192277	192282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139473054
3115	NC_009332	GCT	2	6	192438	192443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473054
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3117	NC_009332	AGT	2	6	192559	192564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473054
3118	NC_009332	TGA	2	6	192622	192627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473054
3119	NC_009332	TTC	2	6	192650	192655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473054
3120	NC_009332	TCT	3	9	192711	192719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473054
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3122	NC_009332	ACT	2	6	192780	192785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473054
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3367	NC_009332	TCATGC	2	12	208196	208207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	139473067
3368	NC_009332	CAAAT	2	10	208222	208231	60 %	20 %	0 %	20 %	139473067
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3371	NC_009332	GAA	2	6	208324	208329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473067
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3479	NC_009332	A	6	6	213829	213834	100 %	0 %	0 %	0 %	139473073
3480	NC_009332	TGC	2	6	213873	213878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473073
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3484	NC_009332	CTA	2	6	214244	214249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473073
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3486	NC_009332	A	6	6	214531	214536	100 %	0 %	0 %	0 %	139473074
3487	NC_009332	GCA	2	6	214591	214596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473074
3488	NC_009332	TTGTC	2	10	214628	214637	0 %	60 %	20 %	20 %	139473074
3489	NC_009332	TTG	2	6	214690	214695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473074
3490	NC_009332	TAC	2	6	214728	214733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473074
3491	NC_009332	ATT	2	6	214754	214759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473074
3492	NC_009332	TGG	2	6	214895	214900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473074
3493	NC_009332	CTG	2	6	214978	214983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473074
3494	NC_009332	TTC	2	6	214993	214998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473074
3495	NC_009332	GTG	2	6	215020	215025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473074
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3499	NC_009332	ATG	2	6	215248	215253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473075
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