MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 32125

< Previous12...53545556575859606162636465Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32001	NC_009332	TCA	2	6	1833881	1833886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474630
32002	NC_009332	CAT	2	6	1833917	1833922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474630
32003	NC_009332	T	8	8	1833938	1833945	0 %	100 %	0 %	0 %	139474630
32004	NC_009332	TTA	2	6	1833992	1833997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474630
32005	NC_009332	TTTCT	2	10	1834007	1834016	0 %	80 %	0 %	20 %	139474630
32006	NC_009332	CTTTT	2	10	1834023	1834032	0 %	80 %	0 %	20 %	139474630
32007	NC_009332	T	6	6	1834029	1834034	0 %	100 %	0 %	0 %	139474630
32008	NC_009332	CTAT	2	8	1834057	1834064	25 %	50 %	0 %	25 %	139474630
32009	NC_009332	TGA	2	6	1834150	1834155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474630
32010	NC_009332	T	6	6	1834168	1834173	0 %	100 %	0 %	0 %	139474630
32011	NC_009332	CTT	2	6	1834187	1834192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474630
32012	NC_009332	TTC	3	9	1834234	1834242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474630
32013	NC_009332	TTG	2	6	1834246	1834251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474630
32014	NC_009332	TAAA	2	8	1834261	1834268	75 %	25 %	0 %	0 %	139474630
32015	NC_009332	TTA	2	6	1834295	1834300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474630
32016	NC_009332	ATT	3	9	1834313	1834321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474630
32017	NC_009332	TAC	2	6	1834332	1834337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474630
32018	NC_009332	T	6	6	1834357	1834362	0 %	100 %	0 %	0 %	139474630
32019	NC_009332	TGC	2	6	1834454	1834459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474630
32020	NC_009332	CCTA	2	8	1834485	1834492	25 %	25 %	0 %	50 %	139474630
32021	NC_009332	GA	3	6	1834513	1834518	50 %	0 %	50 %	0 %	139474630
32022	NC_009332	AGTT	2	8	1834537	1834544	25 %	50 %	25 %	0 %	139474630
32023	NC_009332	TAC	2	6	1834601	1834606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474630
32024	NC_009332	ATT	2	6	1834640	1834645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474630
32025	NC_009332	TTAT	2	8	1834663	1834670	25 %	75 %	0 %	0 %	139474630
32026	NC_009332	AAAAT	2	10	1834695	1834704	80 %	20 %	0 %	0 %	139474630
32027	NC_009332	TAT	2	6	1834730	1834735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474630
32028	NC_009332	T	6	6	1834765	1834770	0 %	100 %	0 %	0 %	139474630
32029	NC_009332	CT	4	8	1834855	1834862	0 %	50 %	0 %	50 %	139474630
32030	NC_009332	AAG	2	6	1834870	1834875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474630
32031	NC_009332	CAA	2	6	1834947	1834952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474630
32032	NC_009332	T	7	7	1834975	1834981	0 %	100 %	0 %	0 %	139474630
32033	NC_009332	T	7	7	1834990	1834996	0 %	100 %	0 %	0 %	139474630
32034	NC_009332	ATT	2	6	1834997	1835002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474630
32035	NC_009332	CTT	2	6	1835085	1835090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474630
32036	NC_009332	CTA	2	6	1835108	1835113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474630
32037	NC_009332	TAA	2	6	1835129	1835134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474630
32038	NC_009332	AT	3	6	1835160	1835165	50 %	50 %	0 %	0 %	139474630
32039	NC_009332	AAC	2	6	1835187	1835192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474630
32040	NC_009332	A	6	6	1835210	1835215	100 %	0 %	0 %	0 %	139474630
32041	NC_009332	T	7	7	1835225	1835231	0 %	100 %	0 %	0 %	139474630
32042	NC_009332	ACT	2	6	1835243	1835248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474630
32043	NC_009332	ATT	2	6	1835281	1835286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474630
32044	NC_009332	TAT	3	9	1835399	1835407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474630
32045	NC_009332	TAAA	2	8	1835452	1835459	75 %	25 %	0 %	0 %	139474630
32046	NC_009332	TAC	2	6	1835492	1835497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474630
32047	NC_009332	TAG	2	6	1835516	1835521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474630
32048	NC_009332	AACCA	2	10	1835586	1835595	60 %	0 %	0 %	40 %	139474630
32049	NC_009332	CAGC	2	8	1835643	1835650	25 %	0 %	25 %	50 %	139474630
32050	NC_009332	ATATT	2	10	1835782	1835791	40 %	60 %	0 %	0 %	139474630
32051	NC_009332	CAGA	2	8	1835823	1835830	50 %	0 %	25 %	25 %	139474630
32052	NC_009332	AT	3	6	1835844	1835849	50 %	50 %	0 %	0 %	139474630
32053	NC_009332	T	7	7	1835870	1835876	0 %	100 %	0 %	0 %	139474630
32054	NC_009332	GTTT	2	8	1835918	1835925	0 %	75 %	25 %	0 %	139474630
32055	NC_009332	A	6	6	1835930	1835935	100 %	0 %	0 %	0 %	139474630
32056	NC_009332	A	7	7	1836016	1836022	100 %	0 %	0 %	0 %	139474630
32057	NC_009332	A	6	6	1836138	1836143	100 %	0 %	0 %	0 %	139474630
32058	NC_009332	A	6	6	1836153	1836158	100 %	0 %	0 %	0 %	139474630
32059	NC_009332	AGG	2	6	1836164	1836169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139474630
32060	NC_009332	AAAGG	2	10	1836192	1836201	60 %	0 %	40 %	0 %	139474630
32061	NC_009332	CT	3	6	1838486	1838491	0 %	50 %	0 %	50 %	139474631
32062	NC_009332	TGA	2	6	1838567	1838572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474631
32063	NC_009332	T	7	7	1838613	1838619	0 %	100 %	0 %	0 %	139474631
32064	NC_009332	AAT	2	6	1838620	1838625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474631
32065	NC_009332	CCA	2	6	1838645	1838650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474631
32066	NC_009332	ATA	2	6	1838651	1838656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474631
32067	NC_009332	T	7	7	1838772	1838778	0 %	100 %	0 %	0 %	139474631
32068	NC_009332	CTT	2	6	1838793	1838798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474631
32069	NC_009332	TCA	2	6	1838849	1838854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474631
32070	NC_009332	T	6	6	1838895	1838900	0 %	100 %	0 %	0 %	139474631
32071	NC_009332	TCTT	2	8	1838929	1838936	0 %	75 %	0 %	25 %	139474631
32072	NC_009332	AGG	2	6	1839238	1839243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139474632
32073	NC_009332	ATT	2	6	1839254	1839259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474632
32074	NC_009332	TAA	2	6	1839265	1839270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474632
32075	NC_009332	AAAT	2	8	1839294	1839301	75 %	25 %	0 %	0 %	139474632
32076	NC_009332	CAA	2	6	1839312	1839317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474632
32077	NC_009332	AAC	2	6	1839335	1839340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474632
32078	NC_009332	TAC	2	6	1839349	1839354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474632
32079	NC_009332	TTA	2	6	1839393	1839398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474632
32080	NC_009332	CTT	2	6	1839414	1839419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474632
32081	NC_009332	GTT	2	6	1839548	1839553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474632
32082	NC_009332	TAA	2	6	1839556	1839561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474632
32083	NC_009332	GTT	2	6	1839617	1839622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474632
32084	NC_009332	TGT	2	6	1839661	1839666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474632
32085	NC_009332	AGATA	2	10	1839679	1839688	60 %	20 %	20 %	0 %	139474632
32086	NC_009332	TTGCTA	2	12	1839738	1839749	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	139474632
32087	NC_009332	A	6	6	1839829	1839834	100 %	0 %	0 %	0 %	139474632
32088	NC_009332	CAA	2	6	1839855	1839860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474632
32089	NC_009332	CAGA	2	8	1839869	1839876	50 %	0 %	25 %	25 %	139474632
32090	NC_009332	TGC	2	6	1839877	1839882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474632
32091	NC_009332	TGG	2	6	1839901	1839906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139474632
32092	NC_009332	TAAT	2	8	1839912	1839919	50 %	50 %	0 %	0 %	139474632
32093	NC_009332	AATT	2	8	1839940	1839947	50 %	50 %	0 %	0 %	139474632
32094	NC_009332	TCT	2	6	1839959	1839964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474632
32095	NC_009332	GTG	2	6	1839990	1839995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139474632
32096	NC_009332	TTA	2	6	1840035	1840040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474632
32097	NC_009332	ATT	2	6	1840043	1840048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474632
32098	NC_009332	AAC	2	6	1840050	1840055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474632
32099	NC_009332	TGG	2	6	1840165	1840170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139474632
32100	NC_009332	GTA	2	6	1840175	1840180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474632
32101	NC_009332	AAGG	2	8	1840190	1840197	50 %	0 %	50 %	0 %	139474632
32102	NC_009332	AGT	2	6	1840283	1840288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474632
32103	NC_009332	A	6	6	1840349	1840354	100 %	0 %	0 %	0 %	139474632
32104	NC_009332	ACT	2	6	1840376	1840381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474632
32105	NC_009332	ATT	2	6	1840505	1840510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474633
32106	NC_009332	TAT	2	6	1840628	1840633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474633
32107	NC_009332	AGTT	2	8	1840663	1840670	25 %	50 %	25 %	0 %	139474633
32108	NC_009332	ACG	2	6	1840679	1840684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474633
32109	NC_009332	A	8	8	1840712	1840719	100 %	0 %	0 %	0 %	139474633
32110	NC_009332	ATC	2	6	1840728	1840733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474633
32111	NC_009332	AAG	2	6	1840734	1840739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474633
32112	NC_009332	CAA	2	6	1840761	1840766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474633
32113	NC_009332	GAA	2	6	1840809	1840814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474633
32114	NC_009332	A	8	8	1840840	1840847	100 %	0 %	0 %	0 %	139474633
32115	NC_009332	AT	3	6	1840874	1840879	50 %	50 %	0 %	0 %	139474633
32116	NC_009332	GAA	2	6	1840953	1840958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474633
32117	NC_009332	CG	3	6	1840979	1840984	0 %	0 %	50 %	50 %	139474633
32118	NC_009332	TGA	2	6	1841003	1841008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474633
32119	NC_009332	CAA	2	6	1841013	1841018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474633
32120	NC_009332	CTCA	2	8	1841025	1841032	25 %	25 %	0 %	50 %	139474633
32121	NC_009332	A	7	7	1841109	1841115	100 %	0 %	0 %	0 %	139474633
32122	NC_009332	CTT	2	6	1841134	1841139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474633
32123	NC_009332	CT	3	6	1841169	1841174	0 %	50 %	0 %	50 %	139474633
32124	NC_009332	ATG	3	9	1841230	1841238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474633
32125	NC_009332	CAA	2	6	1841255	1841260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474633

< Previous12...53545556575859606162636465Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.