MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 32125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_009332	GCT	3	9	1627248	1627256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474449
28502	NC_009332	CTA	2	6	1627284	1627289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474449
28503	NC_009332	TAAAA	2	10	1627343	1627352	80 %	20 %	0 %	0 %	139474449
28504	NC_009332	TCT	2	6	1627449	1627454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474449
28505	NC_009332	CAA	2	6	1627456	1627461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474449
28506	NC_009332	TAG	2	6	1627462	1627467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474449
28507	NC_009332	TCT	2	6	1627497	1627502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474449
28508	NC_009332	TCT	2	6	1627530	1627535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474449
28509	NC_009332	ACTT	2	8	1627579	1627586	25 %	50 %	0 %	25 %	139474449
28510	NC_009332	TCA	2	6	1627668	1627673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474449
28511	NC_009332	ACC	2	6	1627697	1627702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474449
28512	NC_009332	TCC	2	6	1627733	1627738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474449
28513	NC_009332	A	6	6	1627753	1627758	100 %	0 %	0 %	0 %	139474449
28514	NC_009332	T	6	6	1627805	1627810	0 %	100 %	0 %	0 %	139474449
28515	NC_009332	ATA	3	9	1627860	1627868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474449
28516	NC_009332	TTA	2	6	1627873	1627878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474449
28517	NC_009332	ATG	2	6	1627983	1627988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474450
28518	NC_009332	ACC	2	6	1628027	1628032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474450
28519	NC_009332	A	6	6	1628122	1628127	100 %	0 %	0 %	0 %	139474450
28520	NC_009332	ATCA	2	8	1628180	1628187	50 %	25 %	0 %	25 %	139474450
28521	NC_009332	CCT	2	6	1628226	1628231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474450
28522	NC_009332	TTTG	2	8	1628249	1628256	0 %	75 %	25 %	0 %	139474450
28523	NC_009332	ATAA	2	8	1628334	1628341	75 %	25 %	0 %	0 %	139474450
28524	NC_009332	CAT	2	6	1628437	1628442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474450
28525	NC_009332	A	7	7	1628487	1628493	100 %	0 %	0 %	0 %	139474450
28526	NC_009332	A	6	6	1628532	1628537	100 %	0 %	0 %	0 %	139474450
28527	NC_009332	GGC	2	6	1628573	1628578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139474450
28528	NC_009332	AAAAG	2	10	1628600	1628609	80 %	0 %	20 %	0 %	139474450
28529	NC_009332	TTTTCA	2	12	1628620	1628631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	139474450
28530	NC_009332	AAT	2	6	1628670	1628675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474450
28531	NC_009332	TAT	2	6	1628693	1628698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474450
28532	NC_009332	GCTACT	2	12	1628718	1628729	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	139474450
28533	NC_009332	C	7	7	1628730	1628736	0 %	0 %	0 %	100 %	139474450
28534	NC_009332	ACA	2	6	1628739	1628744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474450
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28537	NC_009332	TAG	2	6	1628819	1628824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474451
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28539	NC_009332	AAT	2	6	1628930	1628935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474451
28540	NC_009332	TCA	2	6	1628974	1628979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474451
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28542	NC_009332	TCC	2	6	1629080	1629085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474451
28543	NC_009332	GTTTT	2	10	1629124	1629133	0 %	80 %	20 %	0 %	139474451
28544	NC_009332	TC	3	6	1629184	1629189	0 %	50 %	0 %	50 %	139474451
28545	NC_009332	AAG	2	6	1629243	1629248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474451
28546	NC_009332	CTT	2	6	1629364	1629369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474451
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28548	NC_009332	T	7	7	1629418	1629424	0 %	100 %	0 %	0 %	139474451
28549	NC_009332	CCAT	2	8	1629441	1629448	25 %	25 %	0 %	50 %	139474451
28550	NC_009332	T	7	7	1629485	1629491	0 %	100 %	0 %	0 %	139474451
28551	NC_009332	CAG	2	6	1629786	1629791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474452
28552	NC_009332	AAC	2	6	1629799	1629804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474452
28553	NC_009332	TCT	2	6	1629812	1629817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474452
28554	NC_009332	TGT	2	6	1629925	1629930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474452
28555	NC_009332	CAA	2	6	1629942	1629947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474452
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28557	NC_009332	T	8	8	1630027	1630034	0 %	100 %	0 %	0 %	139474452
28558	NC_009332	AATC	2	8	1630054	1630061	50 %	25 %	0 %	25 %	139474452
28559	NC_009332	TTG	2	6	1630086	1630091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474452
28560	NC_009332	A	6	6	1630230	1630235	100 %	0 %	0 %	0 %	139474453
28561	NC_009332	TAAC	2	8	1630293	1630300	50 %	25 %	0 %	25 %	139474453
28562	NC_009332	GCA	2	6	1630344	1630349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474453
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28564	NC_009332	CAG	2	6	1630363	1630368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474453
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28572	NC_009332	TGA	2	6	1630887	1630892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474454
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28581	NC_009332	ATCA	2	8	1631426	1631433	50 %	25 %	0 %	25 %	139474454
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28589	NC_009332	GCT	2	6	1631775	1631780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474454
28590	NC_009332	ATC	2	6	1631822	1631827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474454
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28592	NC_009332	T	6	6	1631885	1631890	0 %	100 %	0 %	0 %	139474454
28593	NC_009332	TCA	2	6	1631895	1631900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474454
28594	NC_009332	GGTA	2	8	1631905	1631912	25 %	25 %	50 %	0 %	139474454
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28597	NC_009332	CGAAA	2	10	1632010	1632019	60 %	0 %	20 %	20 %	139474454
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28600	NC_009332	GAC	2	6	1632100	1632105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474454
28601	NC_009332	CT	4	8	1632117	1632124	0 %	50 %	0 %	50 %	139474454
28602	NC_009332	TAG	2	6	1632153	1632158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474454
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28604	NC_009332	ATT	2	6	1632356	1632361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474454
28605	NC_009332	GT	3	6	1632509	1632514	0 %	50 %	50 %	0 %	139474454
28606	NC_009332	ATA	2	6	1632570	1632575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474454
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28612	NC_009332	TAG	2	6	1632774	1632779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474454
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28614	NC_009332	GCGA	2	8	1633025	1633032	25 %	0 %	50 %	25 %	139474454
28615	NC_009332	TCA	2	6	1633131	1633136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474454
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