MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 32125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_009332	AAC	2	6	1220381	1220386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474041
21502	NC_009332	AAC	2	6	1220579	1220584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474041
21503	NC_009332	AAT	2	6	1220601	1220606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474041
21504	NC_009332	AATC	2	8	1220644	1220651	50 %	25 %	0 %	25 %	139474041
21505	NC_009332	CCACG	2	10	1220702	1220711	20 %	0 %	20 %	60 %	139474041
21506	NC_009332	TTGAG	2	10	1220715	1220724	20 %	40 %	40 %	0 %	139474041
21507	NC_009332	CTG	2	6	1220743	1220748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474041
21508	NC_009332	CCG	2	6	1220845	1220850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	139474041
21509	NC_009332	TTTCA	2	10	1220957	1220966	20 %	60 %	0 %	20 %	139474041
21510	NC_009332	TC	3	6	1220983	1220988	0 %	50 %	0 %	50 %	139474041
21511	NC_009332	AGCAT	2	10	1221130	1221139	40 %	20 %	20 %	20 %	139474042
21512	NC_009332	CTC	2	6	1221140	1221145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474042
21513	NC_009332	TTC	2	6	1221191	1221196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474042
21514	NC_009332	GGA	2	6	1221264	1221269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139474042
21515	NC_009332	CTT	2	6	1221280	1221285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474042
21516	NC_009332	TCT	2	6	1221315	1221320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474042
21517	NC_009332	TGT	2	6	1221366	1221371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139474042
21518	NC_009332	GAG	2	6	1221486	1221491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139474043
21519	NC_009332	CTTT	2	8	1221536	1221543	0 %	75 %	0 %	25 %	139474043
21520	NC_009332	CAT	2	6	1221557	1221562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474043
21521	NC_009332	AGT	2	6	1221574	1221579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474043
21522	NC_009332	CTT	2	6	1221587	1221592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474043
21523	NC_009332	GT	3	6	1221623	1221628	0 %	50 %	50 %	0 %	139474043
21524	NC_009332	CA	4	8	1221660	1221667	50 %	0 %	0 %	50 %	139474043
21525	NC_009332	CA	3	6	1221672	1221677	50 %	0 %	0 %	50 %	139474043
21526	NC_009332	AGA	2	6	1221678	1221683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474043
21527	NC_009332	TTTG	2	8	1221799	1221806	0 %	75 %	25 %	0 %	139474043
21528	NC_009332	CTT	2	6	1221987	1221992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474044
21529	NC_009332	T	6	6	1222045	1222050	0 %	100 %	0 %	0 %	139474044
21530	NC_009332	CTG	2	6	1222116	1222121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474044
21531	NC_009332	TGA	2	6	1222145	1222150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474044
21532	NC_009332	CTCAC	2	10	1222151	1222160	20 %	20 %	0 %	60 %	139474044
21533	NC_009332	GCT	2	6	1222238	1222243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474044
21534	NC_009332	AGC	2	6	1222249	1222254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474044
21535	NC_009332	CAA	2	6	1222323	1222328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474044
21536	NC_009332	GTCC	2	8	1222364	1222371	0 %	25 %	25 %	50 %	139474044
21537	NC_009332	TTGG	2	8	1222394	1222401	0 %	50 %	50 %	0 %	139474044
21538	NC_009332	AGCAAA	2	12	1222522	1222533	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	139474044
21539	NC_009332	TCT	2	6	1222556	1222561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474044
21540	NC_009332	CTT	2	6	1222572	1222577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474044
21541	NC_009332	ACG	2	6	1222825	1222830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474044
21542	NC_009332	TCC	2	6	1222864	1222869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474044
21543	NC_009332	CCA	2	6	1222926	1222931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474044
21544	NC_009332	ACG	2	6	1222957	1222962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474044
21545	NC_009332	CGAA	2	8	1223248	1223255	50 %	0 %	25 %	25 %	139474044
21546	NC_009332	CAG	2	6	1223301	1223306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139474044
21547	NC_009332	AAC	2	6	1223314	1223319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474044
21548	NC_009332	ACC	2	6	1223353	1223358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139474044
21549	NC_009332	TAA	2	6	1223397	1223402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474044
21550	NC_009332	GCAT	2	8	1223516	1223523	25 %	25 %	25 %	25 %	139474044
21551	NC_009332	ATT	2	6	1223569	1223574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139474044
21552	NC_009332	CATT	2	8	1223592	1223599	25 %	50 %	0 %	25 %	139474044
21553	NC_009332	T	7	7	1223735	1223741	0 %	100 %	0 %	0 %	139474044
21554	NC_009332	ATGAT	2	10	1223840	1223849	40 %	40 %	20 %	0 %	139474044
21555	NC_009332	CCT	2	6	1223892	1223897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139474044
21556	NC_009332	AAT	2	6	1223935	1223940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474044
21557	NC_009332	T	6	6	1224010	1224015	0 %	100 %	0 %	0 %	139474044
21558	NC_009332	CA	4	8	1224093	1224100	50 %	0 %	0 %	50 %	139474044
21559	NC_009332	TCA	2	6	1224116	1224121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474044
21560	NC_009332	CAAATG	2	12	1224139	1224150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	139474044
21561	NC_009332	TGC	2	6	1224268	1224273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474044
21562	NC_009332	CTA	2	6	1224291	1224296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139474044
21563	NC_009332	ATCC	2	8	1224721	1224728	25 %	25 %	0 %	50 %	161378153
21564	NC_009332	CCA	2	6	1224757	1224762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161378153
21565	NC_009332	TTC	2	6	1224840	1224845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161378153
21566	NC_009332	TCT	2	6	1224854	1224859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161378153
21567	NC_009332	TGA	2	6	1224860	1224865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161378153
21568	NC_009332	TCA	2	6	1224958	1224963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161378153
21569	NC_009332	ACG	2	6	1224969	1224974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161378153
21570	NC_009332	TCT	2	6	1225078	1225083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161378153
21571	NC_009332	GAT	2	6	1225118	1225123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161378153
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21573	NC_009332	CAA	2	6	1225181	1225186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161378153
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21583	NC_009332	TAG	2	6	1227015	1227020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474047
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21589	NC_009332	TAG	2	6	1227247	1227252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139474047
21590	NC_009332	GT	3	6	1227355	1227360	0 %	50 %	50 %	0 %	139474047
21591	NC_009332	TTC	3	9	1227383	1227391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139474047
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21600	NC_009332	TGC	2	6	1228130	1228135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139474047
21601	NC_009332	GAA	2	6	1228144	1228149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139474047
21602	NC_009332	AAC	2	6	1228172	1228177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139474047
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21609	NC_009332	TAA	2	6	1228515	1228520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139474048
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21611	NC_009332	T	6	6	1228816	1228821	0 %	100 %	0 %	0 %	139474049
21612	NC_009332	GCG	2	6	1228846	1228851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139474049
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