MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 plasmid pSN254

Total Repeats: 2909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009140	T	6	6	150004	150009	0 %	100 %	0 %	0 %	134047217
2502	NC_009140	ATCT	2	8	150044	150051	25 %	50 %	0 %	25 %	134047217
2503	NC_009140	GCT	2	6	150059	150064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047217
2504	NC_009140	TAA	2	6	150169	150174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134047217
2505	NC_009140	CAG	2	6	150183	150188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047217
2506	NC_009140	ATG	2	6	150496	150501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047115
2507	NC_009140	GAA	2	6	150519	150524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047115
2508	NC_009140	AAT	2	6	150532	150537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134047115
2509	NC_009140	GAA	2	6	150610	150615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047115
2510	NC_009140	T	6	6	150671	150676	0 %	100 %	0 %	0 %	134047115
2511	NC_009140	AG	3	6	150679	150684	50 %	0 %	50 %	0 %	134047115
2512	NC_009140	GGTGCT	2	12	150688	150699	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	134047115
2513	NC_009140	TGG	2	6	150710	150715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047115
2514	NC_009140	AAG	2	6	150733	150738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047115
2515	NC_009140	CCA	2	6	150755	150760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047115
2516	NC_009140	CTA	2	6	150812	150817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047115
2517	NC_009140	CTC	2	6	150874	150879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134047115
2518	NC_009140	CAAG	2	8	150888	150895	50 %	0 %	25 %	25 %	134047115
2519	NC_009140	A	6	6	151003	151008	100 %	0 %	0 %	0 %	134047115
2520	NC_009140	TTG	2	6	151022	151027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047115
2521	NC_009140	GCC	2	6	151028	151033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047115
2522	NC_009140	ACG	2	6	151169	151174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047115
2523	NC_009140	CAT	2	6	151497	151502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047119
2524	NC_009140	GAA	2	6	151521	151526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047119
2525	NC_009140	GAG	2	6	151540	151545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047119
2526	NC_009140	AAGGG	2	10	151547	151556	40 %	0 %	60 %	0 %	134047119
2527	NC_009140	CAA	2	6	151766	151771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047119
2528	NC_009140	TG	3	6	151778	151783	0 %	50 %	50 %	0 %	134047119
2529	NC_009140	CAA	2	6	151812	151817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047119
2530	NC_009140	TAC	2	6	151876	151881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047119
2531	NC_009140	TGA	2	6	151896	151901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047119
2532	NC_009140	CGG	2	6	151908	151913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047119
2533	NC_009140	GGC	2	6	151916	151921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047119
2534	NC_009140	CAA	2	6	151999	152004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047119
2535	NC_009140	GAT	2	6	152053	152058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047119
2536	NC_009140	ATG	2	6	152120	152125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047119
2537	NC_009140	GAC	2	6	152132	152137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047119
2538	NC_009140	ATCAC	2	10	152165	152174	40 %	20 %	0 %	40 %	134047119
2539	NC_009140	TCCAGT	2	12	152231	152242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134047119
2540	NC_009140	CTG	2	6	152276	152281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047119
2541	NC_009140	CAGTAC	2	12	152293	152304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134047119
2542	NC_009140	CT	3	6	152392	152397	0 %	50 %	0 %	50 %	134047119
2543	NC_009140	TGG	2	6	152402	152407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047119
2544	NC_009140	GGC	2	6	152632	152637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047119
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2547	NC_009140	CTTC	2	8	152782	152789	0 %	50 %	0 %	50 %	134047119
2548	NC_009140	AACC	2	8	152816	152823	50 %	0 %	0 %	50 %	134047119
2549	NC_009140	AACG	2	8	153036	153043	50 %	0 %	25 %	25 %	134047119
2550	NC_009140	ACG	2	6	153074	153079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047119
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2553	NC_009140	ACG	2	6	153260	153265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047119
2554	NC_009140	TGG	2	6	153278	153283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047119
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2556	NC_009140	GGCT	2	8	153412	153419	0 %	25 %	50 %	25 %	134047119
2557	NC_009140	TGG	2	6	153470	153475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047119
2558	NC_009140	AC	4	8	153509	153516	50 %	0 %	0 %	50 %	134047119
2559	NC_009140	ACG	2	6	153527	153532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047119
2560	NC_009140	CTA	2	6	153642	153647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047119
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2563	NC_009140	ACG	2	6	153848	153853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047119
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2570	NC_009140	TCA	2	6	154309	154314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047119
2571	NC_009140	CTG	2	6	154358	154363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047119
2572	NC_009140	GCTATG	2	12	154385	154396	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134047119
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2579	NC_009140	CAT	3	9	154887	154895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047119
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2583	NC_009140	CCGAC	2	10	155078	155087	20 %	0 %	20 %	60 %	134047119
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2588	NC_009140	TGG	2	6	155503	155508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047119
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2591	NC_009140	GCT	2	6	155617	155622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047189
2592	NC_009140	AGC	2	6	155627	155632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047189
2593	NC_009140	GTC	2	6	155742	155747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047189
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2597	NC_009140	CTGT	2	8	156493	156500	0 %	50 %	25 %	25 %	134047252
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2602	NC_009140	GAT	2	6	156682	156687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047214
2603	NC_009140	AG	3	6	156749	156754	50 %	0 %	50 %	0 %	134047214
2604	NC_009140	ATA	2	6	156772	156777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134047214
2605	NC_009140	ATT	2	6	156833	156838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134047214
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2609	NC_009140	TAC	2	6	157692	157697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047094
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2616	NC_009140	GAT	2	6	158099	158104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047239
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2619	NC_009140	TGGA	2	8	158366	158373	25 %	25 %	50 %	0 %	134047147
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2737	NC_009140	CCAAA	2	10	165527	165536	60 %	0 %	0 %	40 %	134047253
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2865	NC_009140	GAT	2	6	173503	173508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047245
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2869	NC_009140	TGA	2	6	173691	173696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047245
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2872	NC_009140	GA	3	6	173778	173783	50 %	0 %	50 %	0 %	134047245
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