MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 81181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009092	AAGT	2	8	165740	165747	50 %	25 %	25 %	0 %	127511084
3002	NC_009092	AAG	2	6	166005	166010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511085
3003	NC_009092	AAG	2	6	166089	166094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511085
3004	NC_009092	AAG	2	6	166342	166347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511085
3005	NC_009092	TGA	2	6	166369	166374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511085
3006	NC_009092	TTC	2	6	166449	166454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511085
3007	NC_009092	TAT	2	6	166508	166513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511085
3008	NC_009092	CGT	3	9	166581	166589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3009	NC_009092	GCG	2	6	166596	166601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511085
3010	NC_009092	ACT	2	6	166624	166629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511085
3011	NC_009092	TTC	2	6	166653	166658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511085
3012	NC_009092	AAGA	2	8	166680	166687	75 %	0 %	25 %	0 %	127511085
3013	NC_009092	GTG	2	6	166723	166728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511085
3014	NC_009092	CAGC	2	8	166732	166739	25 %	0 %	25 %	50 %	127511085
3015	NC_009092	CAT	2	6	166766	166771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511085
3016	NC_009092	GCC	2	6	166783	166788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511085
3017	NC_009092	GC	3	6	166797	166802	0 %	0 %	50 %	50 %	127511085
3018	NC_009092	ATG	2	6	167091	167096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511085
3019	NC_009092	GCC	2	6	167108	167113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511085
3020	NC_009092	TGC	2	6	167123	167128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3021	NC_009092	CTT	2	6	167150	167155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511085
3022	NC_009092	CGT	2	6	167205	167210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3023	NC_009092	CGATGA	2	12	167219	167230	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	127511085
3024	NC_009092	AGA	2	6	167252	167257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511085
3025	NC_009092	AGA	2	6	167275	167280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511085
3026	NC_009092	GTAACG	2	12	167293	167304	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	127511085
3027	NC_009092	CGA	2	6	167312	167317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3028	NC_009092	ACC	2	6	167323	167328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511085
3029	NC_009092	CGT	2	6	167337	167342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3030	NC_009092	TCGT	2	8	167389	167396	0 %	50 %	25 %	25 %	127511085
3031	NC_009092	GTCT	2	8	167419	167426	0 %	50 %	25 %	25 %	127511085
3032	NC_009092	TTC	2	6	167499	167504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511085
3033	NC_009092	TTC	2	6	167507	167512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511085
3034	NC_009092	AAC	2	6	167538	167543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511085
3035	NC_009092	AC	3	6	167559	167564	50 %	0 %	0 %	50 %	127511085
3036	NC_009092	CGT	2	6	167568	167573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3037	NC_009092	GTC	2	6	167653	167658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3038	NC_009092	CG	3	6	167720	167725	0 %	0 %	50 %	50 %	127511085
3039	NC_009092	GAA	2	6	167814	167819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511085
3040	NC_009092	GTC	2	6	167893	167898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3041	NC_009092	GCA	2	6	167925	167930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3042	NC_009092	CAC	2	6	167953	167958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511085
3043	NC_009092	ATC	2	6	167964	167969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511085
3044	NC_009092	CT	3	6	167981	167986	0 %	50 %	0 %	50 %	127511085
3045	NC_009092	TAG	2	6	168082	168087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511085
3046	NC_009092	GTT	2	6	168129	168134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511085
3047	NC_009092	GTG	2	6	168145	168150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511085
3048	NC_009092	GGTTAA	2	12	168185	168196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511085
3049	NC_009092	AC	3	6	168253	168258	50 %	0 %	0 %	50 %	127511085
3050	NC_009092	TGT	2	6	168294	168299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511085
3051	NC_009092	GTG	2	6	168322	168327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511085
3052	NC_009092	CAC	2	6	168470	168475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511085
3053	NC_009092	CCG	2	6	168538	168543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511085
3054	NC_009092	TGGT	2	8	168634	168641	0 %	50 %	50 %	0 %	127511085
3055	NC_009092	GCT	2	6	168686	168691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3056	NC_009092	CAT	2	6	168767	168772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511085
3057	NC_009092	AAGA	2	8	168855	168862	75 %	0 %	25 %	0 %	127511085
3058	NC_009092	GAA	2	6	168888	168893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511085
3059	NC_009092	ACT	2	6	168974	168979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511085
3060	NC_009092	AGC	2	6	169033	169038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3061	NC_009092	CGC	2	6	169083	169088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511085
3062	NC_009092	TGA	2	6	169103	169108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511085
3063	NC_009092	GTC	2	6	169189	169194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3064	NC_009092	AGC	2	6	169387	169392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3065	NC_009092	AAG	2	6	169422	169427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511085
3066	NC_009092	GCA	3	9	169451	169459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3067	NC_009092	GAA	2	6	169485	169490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511085
3068	NC_009092	GAAAGA	2	12	169556	169567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511085
3069	NC_009092	GTT	2	6	169619	169624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511085
3070	NC_009092	TACATG	2	12	169671	169682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	127511085
3071	NC_009092	CG	3	6	169718	169723	0 %	0 %	50 %	50 %	127511085
3072	NC_009092	CAG	2	6	169752	169757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3073	NC_009092	TGG	2	6	169781	169786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511085
3074	NC_009092	TGA	2	6	169871	169876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511085
3075	NC_009092	TCG	2	6	169909	169914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511085
3076	NC_009092	TTA	2	6	170107	170112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511086
3077	NC_009092	AGCAA	2	10	170126	170135	60 %	0 %	20 %	20 %	127511086
3078	NC_009092	GAA	2	6	170140	170145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511086
3079	NC_009092	CTGAT	2	10	170177	170186	20 %	40 %	20 %	20 %	127511086
3080	NC_009092	AAG	2	6	170212	170217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511086
3081	NC_009092	GTG	2	6	170339	170344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511086
3082	NC_009092	CGT	2	6	170389	170394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511086
3083	NC_009092	AGCC	2	8	170418	170425	25 %	0 %	25 %	50 %	127511086
3084	NC_009092	TCG	2	6	170528	170533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511086
3085	NC_009092	CTGA	2	8	170575	170582	25 %	25 %	25 %	25 %	127511086
3086	NC_009092	TGA	2	6	170616	170621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511086
3087	NC_009092	GCT	2	6	170658	170663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511086
3088	NC_009092	TCG	2	6	170733	170738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511086
3089	NC_009092	AAG	2	6	170740	170745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511086
3090	NC_009092	CAA	2	6	170790	170795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511086
3091	NC_009092	GAT	2	6	170805	170810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511086
3092	NC_009092	CGC	2	6	170905	170910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511086
3093	NC_009092	AAC	2	6	170923	170928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511086
3094	NC_009092	CAT	2	6	170964	170969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511086
3095	NC_009092	TGC	2	6	170990	170995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511086
3096	NC_009092	GTC	2	6	171026	171031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511086
3097	NC_009092	ACT	2	6	171140	171145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511086
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3099	NC_009092	CTA	2	6	171269	171274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511086
3100	NC_009092	GCT	2	6	171283	171288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511086
3101	NC_009092	AAG	2	6	171289	171294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511086
3102	NC_009092	GT	3	6	171454	171459	0 %	50 %	50 %	0 %	127511086
3103	NC_009092	ATG	2	6	171547	171552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511086
3104	NC_009092	CAA	2	6	171558	171563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511086
3105	NC_009092	TAC	2	6	171628	171633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511086
3106	NC_009092	GGCAT	2	10	171667	171676	20 %	20 %	40 %	20 %	127511086
3107	NC_009092	ACT	2	6	171760	171765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511086
3108	NC_009092	CGT	2	6	171796	171801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511086
3109	NC_009092	TAC	2	6	171810	171815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511086
3110	NC_009092	TGT	2	6	171830	171835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511086
3111	NC_009092	AAG	2	6	171889	171894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511086
3112	NC_009092	TGCCGA	2	12	172059	172070	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	127511086
3113	NC_009092	CCG	2	6	172118	172123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511086
3114	NC_009092	ACA	2	6	172133	172138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511086
3115	NC_009092	CGAA	2	8	172163	172170	50 %	0 %	25 %	25 %	127511086
3116	NC_009092	GAT	2	6	172185	172190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511086
3117	NC_009092	GAA	3	9	172231	172239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511086
3118	NC_009092	ATG	2	6	172267	172272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511086
3119	NC_009092	TGC	2	6	172296	172301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511086
3120	NC_009092	ATC	2	6	172357	172362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511086
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3124	NC_009092	TGT	2	6	172587	172592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511086
3125	NC_009092	TAC	2	6	172642	172647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511086
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3239	NC_009092	GGT	2	6	178628	178633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511090
3240	NC_009092	TTC	2	6	178646	178651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511090
3241	NC_009092	ACA	2	6	178743	178748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511090
3242	NC_009092	GTT	2	6	178757	178762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511090
3243	NC_009092	ATC	2	6	178853	178858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511090
3244	NC_009092	ATC	2	6	179266	179271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511091
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3251	NC_009092	TAC	2	6	179717	179722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511092
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3255	NC_009092	AC	3	6	179970	179975	50 %	0 %	0 %	50 %	127511092
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3349	NC_009092	AAG	2	6	185101	185106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511104
3350	NC_009092	GTG	2	6	185324	185329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511104
3351	NC_009092	GACG	2	8	185416	185423	25 %	0 %	50 %	25 %	127511104
3352	NC_009092	ATC	2	6	185455	185460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511104
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3355	NC_009092	GAA	2	6	185539	185544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511104
3356	NC_009092	ACT	2	6	185702	185707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511105
3357	NC_009092	TGA	2	6	185710	185715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511105
3358	NC_009092	TGC	2	6	185767	185772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511105
3359	NC_009092	GTG	2	6	185868	185873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511105
3360	NC_009092	GCT	2	6	185983	185988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511106
3361	NC_009092	AGTATC	2	12	185994	186005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	127511106
3362	NC_009092	AGA	2	6	186051	186056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511106
3363	NC_009092	AAGCC	2	10	186089	186098	40 %	0 %	20 %	40 %	127511106
3364	NC_009092	GTC	2	6	186164	186169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511106
3365	NC_009092	TGA	2	6	186257	186262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511106
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3373	NC_009092	GTTGGT	2	12	186596	186607	0 %	50 %	50 %	0 %	127511107
3374	NC_009092	CTG	2	6	186693	186698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511107
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3382	NC_009092	AAG	2	6	186918	186923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511108
3383	NC_009092	CA	3	6	186972	186977	50 %	0 %	0 %	50 %	127511108
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3401	NC_009092	CTG	2	6	187873	187878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511110
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3442	NC_009092	CATTG	2	10	190014	190023	20 %	40 %	20 %	20 %	127511114
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3475	NC_009092	CTA	2	6	191658	191663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511117
3476	NC_009092	GCA	2	6	191748	191753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511117
3477	NC_009092	CACG	2	8	191759	191766	25 %	0 %	25 %	50 %	127511117
3478	NC_009092	TAT	2	6	191780	191785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511117
3479	NC_009092	CGTGGT	2	12	191853	191864	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	127511117
3480	NC_009092	GAC	2	6	191898	191903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511117
3481	NC_009092	CG	3	6	191951	191956	0 %	0 %	50 %	50 %	127511117
3482	NC_009092	AGC	2	6	191975	191980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511117
3483	NC_009092	TCG	2	6	192062	192067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511117
3484	NC_009092	TTG	2	6	192103	192108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511117
3485	NC_009092	CAGAA	2	10	192130	192139	60 %	0 %	20 %	20 %	127511117
3486	NC_009092	AGA	2	6	192140	192145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511117
3487	NC_009092	CGA	2	6	192182	192187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511117
3488	NC_009092	AAG	2	6	192300	192305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511117
3489	NC_009092	CCAG	2	8	192378	192385	25 %	0 %	25 %	50 %	127511117
3490	NC_009092	GAC	2	6	192393	192398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511117
3491	NC_009092	GTC	2	6	192463	192468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511118
3492	NC_009092	CAG	2	6	192482	192487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511118
3493	NC_009092	ACT	2	6	192549	192554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511118
3494	NC_009092	TAA	2	6	192595	192600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511118
3495	NC_009092	CGT	2	6	192630	192635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511118
3496	NC_009092	TGG	2	6	192716	192721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511118
3497	NC_009092	TAG	2	6	192787	192792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511118
3498	NC_009092	GTC	2	6	192793	192798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511118
3499	NC_009092	GCT	2	6	192804	192809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511118
3500	NC_009092	GAA	2	6	192819	192824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511118

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