MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 81181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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67002	NC_009092	CTG	2	6	3808801	3808806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514124
67003	NC_009092	ATG	2	6	3808951	3808956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514125
67004	NC_009092	CGG	2	6	3808965	3808970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514125
67005	NC_009092	GCG	2	6	3809077	3809082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514125
67006	NC_009092	CGG	2	6	3809094	3809099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514125
67007	NC_009092	GCG	2	6	3809189	3809194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514125
67008	NC_009092	AT	3	6	3809238	3809243	50 %	50 %	0 %	0 %	127514125
67009	NC_009092	GCG	2	6	3809291	3809296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514125
67010	NC_009092	AGC	2	6	3809417	3809422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514125
67011	NC_009092	CTG	2	6	3809923	3809928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514126
67012	NC_009092	ATG	3	9	3809929	3809937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514126
67013	NC_009092	AG	3	6	3809941	3809946	50 %	0 %	50 %	0 %	127514126
67014	NC_009092	CGA	2	6	3810018	3810023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514126
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67016	NC_009092	GGC	2	6	3810115	3810120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514126
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67019	NC_009092	CGC	2	6	3810240	3810245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127514126
67020	NC_009092	TCA	2	6	3810270	3810275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514126
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67030	NC_009092	GGCG	2	8	3810585	3810592	0 %	0 %	75 %	25 %	127514126
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67052	NC_009092	GC	3	6	3811657	3811662	0 %	0 %	50 %	50 %	127514127
67053	NC_009092	CACCTT	2	12	3811703	3811714	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	127514127
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67230	NC_009092	CAT	2	6	3820318	3820323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514130
67231	NC_009092	T	6	6	3820354	3820359	0 %	100 %	0 %	0 %	127514130
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67458	NC_009092	CAG	3	9	3834515	3834523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514143
67459	NC_009092	ATC	2	6	3834540	3834545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514143
67460	NC_009092	GCCA	2	8	3834551	3834558	25 %	0 %	25 %	50 %	127514143
67461	NC_009092	AGA	2	6	3834588	3834593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127514143
67462	NC_009092	ACG	2	6	3834657	3834662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514143
67463	NC_009092	CGA	2	6	3834751	3834756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514143
67464	NC_009092	ATC	2	6	3834782	3834787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514143
67465	NC_009092	ACA	2	6	3834804	3834809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127514143
67466	NC_009092	CTG	2	6	3834830	3834835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514143
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67468	NC_009092	GCT	3	9	3834856	3834864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514143
67469	NC_009092	CGC	2	6	3835007	3835012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127514143
67470	NC_009092	GCA	2	6	3835119	3835124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514143
67471	NC_009092	ACG	2	6	3835131	3835136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514143
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67473	NC_009092	GCT	2	6	3835213	3835218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514143
67474	NC_009092	GCT	3	9	3835243	3835251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514143
67475	NC_009092	CAT	2	6	3835258	3835263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514143
67476	NC_009092	TGC	2	6	3835356	3835361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514143
67477	NC_009092	GCC	2	6	3835367	3835372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127514143
67478	NC_009092	CAG	2	6	3835418	3835423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127514143
67479	NC_009092	AGGC	2	8	3835439	3835446	25 %	0 %	50 %	25 %	127514143
67480	NC_009092	AAT	2	6	3835467	3835472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127514143
67481	NC_009092	TGC	2	6	3835481	3835486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514144
67482	NC_009092	CGG	2	6	3835508	3835513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514144
67483	NC_009092	GGC	2	6	3835572	3835577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514144
67484	NC_009092	CGCC	2	8	3835619	3835626	0 %	0 %	25 %	75 %	127514144
67485	NC_009092	ATG	2	6	3835753	3835758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514144
67486	NC_009092	CAT	2	6	3835911	3835916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514144
67487	NC_009092	TGA	2	6	3836020	3836025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514144
67488	NC_009092	GGC	2	6	3836100	3836105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127514144
67489	NC_009092	CGCTG	2	10	3836114	3836123	0 %	20 %	40 %	40 %	127514144
67490	NC_009092	TCA	2	6	3836126	3836131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127514144
67491	NC_009092	GCC	2	6	3836143	3836148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127514144
67492	NC_009092	GTA	2	6	3836166	3836171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127514144
67493	NC_009092	CCT	2	6	3836216	3836221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127514144
67494	NC_009092	CTG	2	6	3836268	3836273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514144
67495	NC_009092	ATA	2	6	3836290	3836295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127514144
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67497	NC_009092	CTG	2	6	3836567	3836572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514145
67498	NC_009092	C	6	6	3836583	3836588	0 %	0 %	0 %	100 %	127514145
67499	NC_009092	GCC	2	6	3836690	3836695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127514145
67500	NC_009092	CTG	2	6	3836705	3836710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127514145

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