MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS155 chromosome

Total Repeats: 75268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009052	CAA	2	6	59	64	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172258
2	NC_009052	CAG	2	6	98	103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172258
3	NC_009052	ATGG	2	8	137	144	25 %	25 %	50 %	0 %	126172258
4	NC_009052	GTC	2	6	279	284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172258
5	NC_009052	ACG	2	6	365	370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172258
6	NC_009052	AGCCG	2	10	382	391	20 %	0 %	40 %	40 %	126172258
7	NC_009052	GCG	2	6	482	487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172258
8	NC_009052	GGT	2	6	509	514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172258
9	NC_009052	ATT	2	6	526	531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172258
10	NC_009052	TTG	2	6	566	571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172258
11	NC_009052	AAT	2	6	599	604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172258
12	NC_009052	GAA	2	6	683	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172258
13	NC_009052	TAC	2	6	698	703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172258
14	NC_009052	GAT	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172258
15	NC_009052	T	6	6	740	745	0 %	100 %	0 %	0 %	126172258
16	NC_009052	AAG	2	6	765	770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172258
17	NC_009052	CTTG	2	8	793	800	0 %	50 %	25 %	25 %	126172258
18	NC_009052	ATT	2	6	815	820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172258
19	NC_009052	TTGG	2	8	882	889	0 %	50 %	50 %	0 %	126172258
20	NC_009052	CCA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126172258
21	NC_009052	CTT	2	6	991	996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172258
22	NC_009052	CGTG	2	8	1021	1028	0 %	25 %	50 %	25 %	126172258
23	NC_009052	GCC	2	6	1077	1082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172258
24	NC_009052	TAC	2	6	1181	1186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172258
25	NC_009052	TGT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172258
26	NC_009052	TAAC	2	8	1275	1282	50 %	25 %	0 %	25 %	126172258
27	NC_009052	TGG	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172258
28	NC_009052	CAC	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126172258
29	NC_009052	AG	3	6	1372	1377	50 %	0 %	50 %	0 %	126172258
30	NC_009052	AGA	2	6	1390	1395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172258
31	NC_009052	TCT	2	6	1421	1426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172258
32	NC_009052	GT	3	6	1497	1502	0 %	50 %	50 %	0 %	126172259
33	NC_009052	CCT	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126172259
34	NC_009052	AAGT	2	8	1555	1562	50 %	25 %	25 %	0 %	126172259
35	NC_009052	TCAC	2	8	1565	1572	25 %	25 %	0 %	50 %	126172259
36	NC_009052	GAA	2	6	1638	1643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172259
37	NC_009052	TAC	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172259
38	NC_009052	GCT	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172259
39	NC_009052	AAC	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172259
40	NC_009052	ATA	2	6	1729	1734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172259
41	NC_009052	TGC	2	6	1741	1746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172259
42	NC_009052	AGA	2	6	1787	1792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172259
43	NC_009052	TTA	2	6	1904	1909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172259
44	NC_009052	GC	3	6	1949	1954	0 %	0 %	50 %	50 %	126172259
45	NC_009052	CGAC	2	8	1960	1967	25 %	0 %	25 %	50 %	126172259
46	NC_009052	CTA	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172259
47	NC_009052	AAGC	2	8	2238	2245	50 %	0 %	25 %	25 %	126172259
48	NC_009052	CGAA	2	8	2269	2276	50 %	0 %	25 %	25 %	126172259
49	NC_009052	GTG	2	6	2284	2289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172259
50	NC_009052	GAA	2	6	2346	2351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172259
51	NC_009052	ATC	2	6	2361	2366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172259
52	NC_009052	CAA	2	6	2432	2437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172259
53	NC_009052	GAT	2	6	2448	2453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172259
54	NC_009052	GAA	2	6	2508	2513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172259
55	NC_009052	ATGT	2	8	2520	2527	25 %	50 %	25 %	0 %	126172259
56	NC_009052	ATTT	2	8	2877	2884	25 %	75 %	0 %	0 %	126172260
57	NC_009052	CGTT	2	8	2898	2905	0 %	50 %	25 %	25 %	126172260
58	NC_009052	TAA	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172260
59	NC_009052	CGA	3	9	2939	2947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172260
60	NC_009052	GC	3	6	2979	2984	0 %	0 %	50 %	50 %	126172260
61	NC_009052	GTG	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172260
62	NC_009052	TCG	2	6	3212	3217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172260
63	NC_009052	CG	3	6	3412	3417	0 %	0 %	50 %	50 %	126172260
64	NC_009052	ACT	2	6	3446	3451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172260
65	NC_009052	ATT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172260
66	NC_009052	ACA	2	6	3620	3625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172260
67	NC_009052	GAT	2	6	3654	3659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172260
68	NC_009052	TCCG	2	8	3662	3669	0 %	25 %	25 %	50 %	126172260
69	NC_009052	CTG	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172260
70	NC_009052	AC	3	6	3773	3778	50 %	0 %	0 %	50 %	126172260
71	NC_009052	ATA	2	6	3845	3850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172261
72	NC_009052	TTC	2	6	3870	3875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172261
73	NC_009052	CGA	2	6	3942	3947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
74	NC_009052	CAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172261
75	NC_009052	AGT	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172261
76	NC_009052	GAA	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172261
77	NC_009052	GCA	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
78	NC_009052	CGG	2	6	4152	4157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172261
79	NC_009052	CGA	2	6	4164	4169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
80	NC_009052	TCG	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
81	NC_009052	TGAT	2	8	4463	4470	25 %	50 %	25 %	0 %	126172261
82	NC_009052	ACA	2	6	4478	4483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172261
83	NC_009052	GAAT	2	8	4485	4492	50 %	25 %	25 %	0 %	126172261
84	NC_009052	ATT	2	6	4529	4534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172261
85	NC_009052	TAA	2	6	4542	4547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172261
86	NC_009052	CAA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172261
87	NC_009052	CAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172261
88	NC_009052	TGG	2	6	4683	4688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172261
89	NC_009052	CGA	2	6	4788	4793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
90	NC_009052	AGTGA	2	10	4879	4888	40 %	20 %	40 %	0 %	126172261
91	NC_009052	CTG	2	6	4933	4938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
92	NC_009052	GCG	2	6	5002	5007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172261
93	NC_009052	CGT	2	6	5029	5034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
94	NC_009052	GGT	2	6	5053	5058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172261
95	NC_009052	CTG	2	6	5132	5137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
96	NC_009052	TGT	2	6	5234	5239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172261
97	NC_009052	AAG	2	6	5246	5251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172261
98	NC_009052	CGA	2	6	5292	5297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
99	NC_009052	CAT	4	12	5328	5339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172261
100	NC_009052	CTT	3	9	5388	5396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172261
101	NC_009052	ATTG	2	8	5412	5419	25 %	50 %	25 %	0 %	126172261
102	NC_009052	CCA	2	6	5446	5451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126172261
103	NC_009052	GCAA	2	8	5471	5478	50 %	0 %	25 %	25 %	126172261
104	NC_009052	ACCCA	2	10	5552	5561	40 %	0 %	0 %	60 %	126172261
105	NC_009052	TTG	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172261
106	NC_009052	AGC	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
107	NC_009052	ACC	2	6	5684	5689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126172261
108	NC_009052	TGG	2	6	5762	5767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172261
109	NC_009052	AGC	2	6	5776	5781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
110	NC_009052	CTG	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
111	NC_009052	CTT	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172261
112	NC_009052	GCG	2	6	5935	5940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172261
113	NC_009052	GAA	2	6	5956	5961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172261
114	NC_009052	GGC	2	6	5962	5967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172261
115	NC_009052	AAG	2	6	5993	5998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172261
116	NC_009052	CGT	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
117	NC_009052	TGA	2	6	6153	6158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172261
118	NC_009052	GTT	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172261
119	NC_009052	TCG	2	6	6213	6218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
120	NC_009052	TCT	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172262
121	NC_009052	CAA	2	6	6382	6387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172262
122	NC_009052	TGC	2	6	6447	6452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172262
123	NC_009052	ACA	2	6	6507	6512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172262
124	NC_009052	CAT	2	6	6521	6526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172262
125	NC_009052	CG	3	6	6665	6670	0 %	0 %	50 %	50 %	126172262
126	NC_009052	GCA	2	6	6916	6921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172262
127	NC_009052	AGT	2	6	6985	6990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172262
128	NC_009052	TTGT	2	8	7015	7022	0 %	75 %	25 %	0 %	126172262
129	NC_009052	TAA	2	6	7330	7335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172263
130	NC_009052	AGC	2	6	7434	7439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172263
131	NC_009052	TTG	2	6	7496	7501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172263
132	NC_009052	GCA	2	6	7516	7521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172263
133	NC_009052	ATAA	2	8	7551	7558	75 %	25 %	0 %	0 %	126172263
134	NC_009052	TCG	2	6	7571	7576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172264
135	NC_009052	TTA	2	6	7582	7587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172264
136	NC_009052	CTC	2	6	7666	7671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126172264
137	NC_009052	AT	3	6	7675	7680	50 %	50 %	0 %	0 %	126172264
138	NC_009052	CTG	2	6	7780	7785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172264
139	NC_009052	CAG	2	6	7792	7797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172264
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141	NC_009052	CTT	2	6	7988	7993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172264
142	NC_009052	CAAT	2	8	8009	8016	50 %	25 %	0 %	25 %	126172264
143	NC_009052	AAT	2	6	8019	8024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172264
144	NC_009052	TCA	2	6	8114	8119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172264
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148	NC_009052	GCG	2	6	8301	8306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172264
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151	NC_009052	GCA	2	6	8621	8626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172264
152	NC_009052	AATTG	2	10	8633	8642	40 %	40 %	20 %	0 %	126172264
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155	NC_009052	GTC	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172264
156	NC_009052	GTG	2	6	8778	8783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172264
157	NC_009052	TATT	2	8	8805	8812	25 %	75 %	0 %	0 %	126172265
158	NC_009052	TTA	2	6	9064	9069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172265
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162	NC_009052	TCG	2	6	9662	9667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172267
163	NC_009052	AAT	2	6	9730	9735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172267
164	NC_009052	CTG	2	6	9755	9760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172267
165	NC_009052	TG	4	8	9832	9839	0 %	50 %	50 %	0 %	126172267
166	NC_009052	T	6	6	10011	10016	0 %	100 %	0 %	0 %	126172267
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175	NC_009052	TTA	2	6	10497	10502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172267
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249	NC_009052	TGA	2	6	15295	15300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172271
250	NC_009052	GGA	2	6	15310	15315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126172271
251	NC_009052	ATC	2	6	15365	15370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172271
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256	NC_009052	ACC	2	6	15603	15608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126172271
257	NC_009052	TGATG	2	10	15689	15698	20 %	40 %	40 %	0 %	126172271
258	NC_009052	TCAT	2	8	15929	15936	25 %	50 %	0 %	25 %	126172272
259	NC_009052	TGT	2	6	16067	16072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172272
260	NC_009052	TGG	2	6	16101	16106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172272
261	NC_009052	GCC	2	6	16135	16140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172272
262	NC_009052	AT	3	6	16311	16316	50 %	50 %	0 %	0 %	126172272
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302	NC_009052	ATC	2	6	18438	18443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172273
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500	NC_009052	GGC	2	6	32915	32920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172285

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