MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 71095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008750	TCAA	2	8	232856	232863	50 %	25 %	0 %	25 %	120597039
3502	NC_008750	GGA	2	6	232949	232954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120597040
3503	NC_008750	GAT	2	6	232968	232973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597040
3504	NC_008750	CAG	2	6	233004	233009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597040
3505	NC_008750	CCT	2	6	233069	233074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120597040
3506	NC_008750	ACC	2	6	233086	233091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597040
3507	NC_008750	ATC	2	6	233103	233108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597040
3508	NC_008750	GCT	2	6	233130	233135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597040
3509	NC_008750	ATC	2	6	233137	233142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597040
3510	NC_008750	TGAA	2	8	233226	233233	50 %	25 %	25 %	0 %	120597041
3511	NC_008750	A	6	6	233290	233295	100 %	0 %	0 %	0 %	120597041
3512	NC_008750	AGC	2	6	233333	233338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597041
3513	NC_008750	TCA	2	6	233352	233357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597041
3514	NC_008750	GC	3	6	233468	233473	0 %	0 %	50 %	50 %	120597041
3515	NC_008750	CGG	2	6	233481	233486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597041
3516	NC_008750	TGA	2	6	233653	233658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597041
3517	NC_008750	TTG	2	6	233686	233691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597041
3518	NC_008750	GCG	2	6	233842	233847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597042
3519	NC_008750	CAGTTA	2	12	233868	233879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	120597042
3520	NC_008750	GCG	3	9	234057	234065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597042
3521	NC_008750	CAG	2	6	234179	234184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597042
3522	NC_008750	TAT	2	6	234200	234205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597042
3523	NC_008750	GT	3	6	234225	234230	0 %	50 %	50 %	0 %	120597042
3524	NC_008750	TCT	2	6	234305	234310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597043
3525	NC_008750	GTT	2	6	234324	234329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597043
3526	NC_008750	GCT	2	6	234376	234381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597043
3527	NC_008750	CGC	2	6	234390	234395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120597043
3528	NC_008750	AAT	2	6	234434	234439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597043
3529	NC_008750	CTT	2	6	234447	234452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597043
3530	NC_008750	ATC	2	6	234572	234577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597043
3531	NC_008750	TGA	2	6	234624	234629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597043
3532	NC_008750	CTT	2	6	234651	234656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597043
3533	NC_008750	GC	3	6	234682	234687	0 %	0 %	50 %	50 %	120597043
3534	NC_008750	A	6	6	234808	234813	100 %	0 %	0 %	0 %	120597043
3535	NC_008750	CGA	2	6	234816	234821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597043
3536	NC_008750	GT	3	6	234873	234878	0 %	50 %	50 %	0 %	120597043
3537	NC_008750	TGA	2	6	234880	234885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597043
3538	NC_008750	TTAT	2	8	235099	235106	25 %	75 %	0 %	0 %	120597044
3539	NC_008750	CCG	2	6	235112	235117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120597044
3540	NC_008750	TAT	2	6	235178	235183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597044
3541	NC_008750	TAG	2	6	235253	235258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597044
3542	NC_008750	CAG	2	6	235307	235312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597044
3543	NC_008750	T	7	7	235353	235359	0 %	100 %	0 %	0 %	120597044
3544	NC_008750	TTGG	2	8	235368	235375	0 %	50 %	50 %	0 %	120597044
3545	NC_008750	TCA	2	6	235825	235830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597045
3546	NC_008750	CTT	2	6	235831	235836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597045
3547	NC_008750	GAA	2	6	235851	235856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597045
3548	NC_008750	TGA	2	6	235877	235882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597045
3549	NC_008750	TGA	2	6	236011	236016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597045
3550	NC_008750	CCT	2	6	236098	236103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120597045
3551	NC_008750	CT	3	6	236102	236107	0 %	50 %	0 %	50 %	120597045
3552	NC_008750	TAA	2	6	236138	236143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597045
3553	NC_008750	TGAG	2	8	236151	236158	25 %	25 %	50 %	0 %	120597045
3554	NC_008750	AGA	2	6	236321	236326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597046
3555	NC_008750	CAT	2	6	236388	236393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597046
3556	NC_008750	T	6	6	236421	236426	0 %	100 %	0 %	0 %	120597046
3557	NC_008750	ACC	2	6	236430	236435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597046
3558	NC_008750	GGC	2	6	236439	236444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597046
3559	NC_008750	GGCTTC	2	12	236583	236594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597046
3560	NC_008750	GGT	2	6	236604	236609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597046
3561	NC_008750	TCT	2	6	236635	236640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597046
3562	NC_008750	TAA	2	6	236689	236694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597046
3563	NC_008750	GCC	2	6	236706	236711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120597046
3564	NC_008750	GAA	2	6	236955	236960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597046
3565	NC_008750	A	6	6	237024	237029	100 %	0 %	0 %	0 %	120597046
3566	NC_008750	GCC	2	6	237045	237050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120597046
3567	NC_008750	CGG	2	6	237080	237085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597046
3568	NC_008750	TGG	2	6	237152	237157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597046
3569	NC_008750	CA	3	6	237285	237290	50 %	0 %	0 %	50 %	120597046
3570	NC_008750	GCC	2	6	237298	237303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120597046
3571	NC_008750	GCC	2	6	237325	237330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120597046
3572	NC_008750	ACTG	2	8	237396	237403	25 %	25 %	25 %	25 %	120597046
3573	NC_008750	CGG	2	6	237419	237424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597046
3574	NC_008750	CGA	2	6	237473	237478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597046
3575	NC_008750	CGGCTA	2	12	237536	237547	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120597046
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3577	NC_008750	ACC	2	6	237765	237770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597046
3578	NC_008750	GCAGC	2	10	238153	238162	20 %	0 %	40 %	40 %	120597047
3579	NC_008750	TGCCT	2	10	238276	238285	0 %	40 %	20 %	40 %	120597047
3580	NC_008750	AGC	2	6	238428	238433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597047
3581	NC_008750	TGG	2	6	238488	238493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597047
3582	NC_008750	C	6	6	238554	238559	0 %	0 %	0 %	100 %	120597047
3583	NC_008750	TGAT	2	8	238578	238585	25 %	50 %	25 %	0 %	120597047
3584	NC_008750	AGC	2	6	238596	238601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597047
3585	NC_008750	CAG	2	6	238613	238618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597047
3586	NC_008750	CAG	2	6	238646	238651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597047
3587	NC_008750	ATCGA	2	10	238692	238701	40 %	20 %	20 %	20 %	120597047
3588	NC_008750	GTGG	2	8	238865	238872	0 %	25 %	75 %	0 %	120597047
3589	NC_008750	TCAA	2	8	238962	238969	50 %	25 %	0 %	25 %	120597047
3590	NC_008750	CAGG	2	8	239195	239202	25 %	0 %	50 %	25 %	120597047
3591	NC_008750	GGC	2	6	239299	239304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597047
3592	NC_008750	AAC	2	6	239415	239420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597047
3593	NC_008750	CTGCG	2	10	239487	239496	0 %	20 %	40 %	40 %	120597047
3594	NC_008750	TAT	2	6	239518	239523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597047
3595	NC_008750	TGC	2	6	239551	239556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597047
3596	NC_008750	ATG	2	6	239588	239593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597047
3597	NC_008750	GCTT	2	8	239645	239652	0 %	50 %	25 %	25 %	120597047
3598	NC_008750	GGC	2	6	239704	239709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120597047
3599	NC_008750	TGA	2	6	239764	239769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597047
3600	NC_008750	TGC	2	6	239889	239894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597047
3601	NC_008750	GGGTA	2	10	240050	240059	20 %	20 %	60 %	0 %	120597048
3602	NC_008750	TTC	2	6	240090	240095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597048
3603	NC_008750	ACC	2	6	240158	240163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597048
3604	NC_008750	TC	3	6	240168	240173	0 %	50 %	0 %	50 %	120597048
3605	NC_008750	CAT	2	6	240244	240249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597048
3606	NC_008750	TCA	2	6	240270	240275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597048
3607	NC_008750	TA	3	6	240293	240298	50 %	50 %	0 %	0 %	120597048
3608	NC_008750	GCA	2	6	240331	240336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597048
3609	NC_008750	GT	3	6	240371	240376	0 %	50 %	50 %	0 %	120597048
3610	NC_008750	T	7	7	240409	240415	0 %	100 %	0 %	0 %	120597048
3611	NC_008750	GTT	2	6	240553	240558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597048
3612	NC_008750	T	6	6	240602	240607	0 %	100 %	0 %	0 %	120597048
3613	NC_008750	GC	3	6	240608	240613	0 %	0 %	50 %	50 %	120597048
3614	NC_008750	TCA	2	6	240753	240758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597048
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3616	NC_008750	GTTT	2	8	240916	240923	0 %	75 %	25 %	0 %	120597048
3617	NC_008750	A	6	6	240929	240934	100 %	0 %	0 %	0 %	120597048
3618	NC_008750	GAA	2	6	240935	240940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597048
3619	NC_008750	GAT	3	9	240952	240960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597048
3620	NC_008750	TCA	2	6	241072	241077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597048
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3622	NC_008750	TTCC	2	8	241162	241169	0 %	50 %	0 %	50 %	120597048
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3987	NC_008750	TAA	2	6	265490	265495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597072
3988	NC_008750	CAA	2	6	265588	265593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597072
3989	NC_008750	ATC	2	6	265646	265651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597072
3990	NC_008750	GTT	2	6	265690	265695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597072
3991	NC_008750	TAA	2	6	265702	265707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597072
3992	NC_008750	A	6	6	265778	265783	100 %	0 %	0 %	0 %	120597072
3993	NC_008750	GAGT	2	8	265801	265808	25 %	25 %	50 %	0 %	120597072
3994	NC_008750	TAA	2	6	265833	265838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597072
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3997	NC_008750	CTT	2	6	265921	265926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597072
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4000	NC_008750	GTT	2	6	265981	265986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597072

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